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�cido ribonucleico

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�ARN� redirige aqu�. Para otras acepciones, v�ase ARN (desambiguaci�n).
�RNA� redirige aqu�. Para otras acepciones, v�ase RNA (desambiguaci�n).

ARN mensajero.
El �cido ribonucleico (ARN o RNA) es un �cido nucleico formado por una cadena de
ribonucle�tidos. Est� presente tanto en las c�lulas procariotas como en los
eucariotas, y es el �nico material gen�tico de ciertos virus (virus ARN).

El ARN se puede definir como la mol�cula formada por una cadena simple de
ribonucle�tidos, cada uno de ellos formado por ribosa, un fosfato y una de las
cuatro bases nitrogenadas (adenina, guanina, citosina y uracilo). El ARN celular es
lineal y monocatenario (de una sola cadena), pero en el genoma de algunos virus es
de doble hebra.1?

En los organismos celulares desempe�a diversas funciones. Es la mol�cula que dirige


las etapas intermedias de la s�ntesis proteica; el ADN no puede actuar solo, y se
vale del ARN para transferir esta informaci�n vital durante la s�ntesis de
prote�nas (producci�n de las prote�nas que necesita la c�lula para sus actividades
y su desarrollo). Varios tipos de ARN regulan la expresi�n g�nica, mientras que
otros tienen actividad catal�tica. El ARN es, pues, mucho m�s vers�til que el ADN.

�ndice
1 Descubrimiento e historia
2 Bioqu�mica del ARN
2.1 Apareamiento doble
3 Estructura
3.1 Estructura primaria
3.2 Estructura secundaria
3.3 Estructura terciaria
3.3.1 H�lice A
4 Bios�ntesis
5 Clases de ARN
5.1 ARN implicados en la s�ntesis de prote�nas
5.1.1 ARN mensajero (ARNm)
5.1.2 ARN de transferencia (ARNt)
5.1.3 ARN ribos�mico o ribosomal (ARNr)
5.2 ARN reguladores
5.2.1 ARN de interferencia
5.2.2 Micro ARN
5.2.3 ARN interferente peque�o
5.2.4 ARN asociados a Piwi
5.2.5 ARN antisentido
5.2.6 ARN largo no codificante
5.2.7 Riboswitch
5.3 ARN con actividad catal�tica
5.3.1 Ribozimas
5.3.2 Espliceosoma
5.3.3 ARN peque�o nucleolar
6 ARN mitocondrial
7 Genomas de ARN
8 Hip�tesis del mundo de ARN
9 V�ase tambi�n
10 Referencias
11 Enlaces externos
Descubrimiento e historia
Los �cidos nucleicos fueron descubiertos en 1867 por Friedrich Miescher, que los
llam� nucle�na ya que los aisl� del n�cleo celular.2? M�s tarde, se comprob� que
las c�lulas procariotas, que carecen de n�cleo, tambi�n conten�an �cidos nucleicos.
El papel del ARN en la s�ntesis de prote�nas fue sospechado en 1939.3? Severo Ochoa
gan� el Premio Nobel de Medicina en 1959 tras descubrir c�mo se sintetizaba el
ARN.4?

En 1965 Robert W. Holley hall� la secuencia de 77 nucle�tidos de un ARN de


transferencia de una levadura,5? con lo que obtuvo el Premio Nobel de Medicina en
1968. En 1967, Carl Woese comprob� las propiedades catal�ticas de algunos ARN y
sugiri� que las primeras formas de vida usaron ARN como portador de la informaci�n
gen�tica tanto como catalizador de sus reacciones metab�licas (hip�tesis del mundo
de ARN).6?7? En 1976, Walter Fiers y sus colaboradores determinaron la secuencia
completa del ARN del genoma de un virus ARN (bacteri�fago MS2).8?

En 1990 se descubri� en Petunia que genes introducidos pueden silenciar genes


similares de la misma planta, lo que condujo al descubrimiento del ARN
interferente.9?10? Aproximadamente al mismo tiempo se hallaron los micro ARN,
peque�as mol�culas de 22 nucle�tidos que ten�an alg�n papel en el desarrollo de
Caenorhabditis elegans.11? El descubrimiento de ARN que regulan la expresi�n g�nica
ha permitido el desarrollo de medicamentos hechos de ARN, como los ARN peque�os de
interferencia que silencian genes.12?
En el a�o 2016 se tiene pr�cticamente por comprobado que las mol�culas de ARN
fueron la primera forma de vida propiamente dicha en habitar el planeta Tierra
(Hip�tesis del mundo de ARN).

Bioqu�mica del ARN

Estructura qu�mica del RNA.

Comparativa entre ARN y ADN.


Como el ADN, el ARN est� formado por una cadena de mon�meros repetitivos llamados
nucle�tidos. Los nucle�tidos se unen uno tras otro mediante enlaces fosfodi�ster
cargados negativamente.

Cada nucle�tido est� formado por tres componentes:

Un monosac�rido de cinco carbonos (pentosa) llamada ribosa


Un grupo fosfato
Una base nitrogenada, que puede ser
Adenina (A)
Citosina (C)
Guanina (G)
Uracilo (U)
Comparaci�n entre el ARN y el ADN
ARN ADN
Pentosa Ribosa Desoxirribosa
Purinas Adenina y Guanina Adenina y Guanina
Pirimidinas Citosina y Uracilo Citosina y Timina
Los carbonos de la ribosa se numeran de 1' a 5' en sentido horario. La base
nitrogenada se une al carbono 1'; el grupo fosfato se une al carbono 5' y al
carbono 3' de la ribosa del siguiente nucle�tido. El pico tiene una carga negativa
a pH fisiol�gico lo que confiere al ARN car�cter poliani�nico. Las bases p�ricas
(adenina y guanina) pueden formar puentes de hidr�geno con las pirimid�nicas
(uracilo y citosina) seg�n el esquema C=G y A=U.13? Adem�s, son posibles otras
interacciones, como el apilamiento de bases14? o tetrabucles con apareamientos
G=A.13? Muchos ARN contienen adem�s de los nucle�tidos habituales, nucle�tidos
modificados, que se originan por transformaci�n de los nucle�tidos t�picos; son
caracter�sticos de los ARN de transferencia (ARNt) y el ARN ribos�mico (ARNr);
tambi�n se encuentran nucle�tidos metilados en el ARN mensajero eucari�tico.15?
Apareamiento doble

Apareamiento entre guanina y uracilo


La interacci�n por puentes de hidr�geno descrita por Watson y Crick16? forma pares
de bases entre una purina y una pirimidina. A este patr�n se le conoce como
apareamiento Watson y Crick. En �ste, la adenina se aparea con el uracilo (timina,
en ADN) y la citosina con la guanina. Sin embargo en el ARN se presentan muchas
otras formas de apareamiento, de las cuales la m�s ubicua es el apareamiento wobble
(tambi�n apareamiento por balanceo o apareamiento titubeante) para la pareja G-U.
�ste fue propuesto por primera vez por Crick para explicar el apareamiento cod�n-
anticod�n en los tRNAs y ha sido confirmado en casi todas las clases de RNA en los
tres dominios filogen�ticos.17?

Estructura
Estructura primaria
Se refiere a la secuencia lineal de nucle�tidos en la mol�cula de ARN. Los
siguientes niveles estructurales (estructura secundaria, terciaria) son
consecuencia de la estructura primaria. Adem�s, la secuencia misma puede ser
informaci�n funcional; �sta puede traducirse para sintetizar prote�nas (en el caso
del mRNA) o funcionar como regi�n de reconocimiento, regi�n catal�tica, entre
otras.

Estructura primaria de tRNAPhe


Estructura secundaria

Estructura secundaria de ARN de transferencia: tRNAPhe de S. cerevisiae.


El ARN se pliega como resultado de la presencia de regiones cortas con apareamiento
intramolecular de bases, es decir, pares de bases formados por secuencias
complementarias m�s o menos distantes dentro de la misma hebra. La estructura
secundaria se refiere, entonces, a las relaciones de apareamiento de bases: �El
t�rmino �estructura secundaria� denota cualquier patr�n plano de contactos por
apareamiento de bases. Es un concepto topol�gico y no debe ser confundido con alg�n
tipo de estructura bidimensional�.18? La estructura secundaria puede ser descrita a
partir de motivos estructurales que se suelen clasificar de la siguiente manera:

Elementos estructurales comunes19?


H�lice
(tallo, stack)

Regi�n con bases apareadas


Bucle
(ciclo, loop)

Regi�n incluida en una h�lice en donde las bases no est�n apareadas RNA
Secondary Structure-Loop.jpg
Bucle en horquilla
(tallo y bucle, hairpin loop)

Estructura en donde regiones cercanas de bases complementarias se aparean,


separadas por una regi�n no apareada que permite que la secuencia se doble para
formar una h�lice. RNA Secondary Structure-Hairpin Loop.jpg
Bucle interno
(internal loop)

Estructura en donde hay regiones no apareadas en ambos lados de la hebra. Puede ser
sim�trico o asim�trico. RNA Secondary Structure-Internal Loop.jpg
Protuberancia
(buldge)
Estructura en donde hay una regi�n no apareada en un solo lado de la hebra. RNA
Secondary Structure-Buldge.jpg
Bucle m�ltiple
(helical junction)

Regi�n en donde se juntan m�ltiples h�lices. RNA Secondary Structure-Helical


Junction.jpg
Pseudonudo Variaci�n de bucle en donde s�lo una parte del bucle s� est� apareada.
El pseudonudo m�s simple consiste de una regi�n libre del RNA apareada con un
bucle. RNA Secondary Structure-Pseudoknot.jpg
Estructura terciaria

Estructura terciaria de dos ARN de transferencia: tRNAPhe y tRNAAsx


La estructura terciaria es el resultado de las interacciones en el espacio entre
los �tomos que conforman la mol�cula. Algunas interacciones de este tipo incluyen
el apilamiento de bases y los apareamientos de bases distintos a los propuestos por
Watson y Crick, como el apareamiento Hoogsteen, los apareamientos triples y los
zippers de ribosa.

H�lice A

H�lice A de RNA
A diferencia del ADN las mol�culas de ARN suelen ser de cadena simple y no forman
dobles h�lices extensas, no obstante, en las regiones con bases apareadas s� forma
h�lices como motivo estructural terciario. Una importante caracter�stica
estructural del ARN que lo distingue del ADN es la presencia de un grupo hidroxil
en posici�n 2' de la ribosa, que causa que las dobles h�lices de ARN adopten una
conformaci�n A, en vez de la conformaci�n B que es la m�s com�n en el ADN.20? Esta
h�lice A tiene un surco mayor muy profundo y estrecho y un surco menor amplio y
superficial.21? Una segunda consecuencia de la presencia de dicho hidroxilo es que
los enlaces fosfodi�ster del ARN de las regiones en que no se forma doble h�lice
son m�s susceptibles de hidr�lisis qu�mica que los del ADN; los enlaces
fosfodi�ster del ARN se hidrolizan r�pidamente en disoluci�n alcalina, mientras que
los enlaces del ADN son estables.22? La vida media de las mol�culas de ARN es mucho
m�s corta que las del ADN, de unos minutos en algunos ARN bacterianos o de unos
d�as en los ARNt humanos.15?

Bios�ntesis
Art�culo principal: Transcripci�n gen�tica
La bios�ntesis de ARN est� catalizada normalmente por la enzima ARN polimerasa que
usa una hebra de ADN como molde, proceso conocido con el nombre de transcripci�n.
Por tanto, todos los ARN celulares provienen de copias de genes presentes en el
ADN.

La transcripci�n comienza con el reconocimiento por parte de la enzima de un


promotor, una secuencia caracter�stica de nucle�tidos en el ADN situada antes del
segmento que va a transcribirse; la doble h�lice del ADN es abierta por la
actividad helicasa de la propia enzima. A continuaci�n, la ARN polimerasa progresa
a lo largo de la hebra de ADN en sentido 3' ? 5', sintetizando una mol�cula
complementaria de ARN; este proceso se conoce como elongaci�n, y el crecimiento de
la mol�cula de ARN se produce en sentido 5' ? 3'. La secuencia de nucle�tidos del
ADN determina tambi�n d�nde acaba la s�ntesis del ARN, gracias a que posee
secuencias caracter�sticas que la ARN polimerasa reconoce como se�ales de
terminaci�n.23?

Tras la transcripci�n, la mayor�a de los ARN son modificados por enzimas. Por
ejemplo, al pre-ARN mensajero eucariota reci�n transcrito se le a�ade un nucle�tido
de guanina modificado (7-Metilguanosina) en el extremo 5' por medio de un puente de
trifosfato formando un enlace 5'? 5' �nico, tambi�n conocido como "capucha" o
"caperuza", y una larga secuencia de nucle�tidos de adenina en el extremo 3' (cola
poli-A); posteriormente se le eliminan los intrones (segmentos no codificantes) en
un proceso conocido como splicing.

En virus, hay tambi�n varias ARN polimerasas ARN-dependientes que usan ARN como
molde para la s�ntesis de nuevas mol�culas de ARN. Por ejemplo, varios virus ARN,
como los poliovirus, usan este tipo de enzimas para replicar su genoma.24?25?

Clases de ARN
El ARN mensajero (ARNm) es el tipo de ARN que lleva la informaci�n del ADN a los
ribosomas, el lugar de la s�ntesis de prote�nas. La secuencia de nucle�tidos del
ARNm determina la secuencia de amino�cidos de la prote�na.26? Por ello, el ARNm es
denominado ARN codificante.

No obstante, muchos ARN no codifican prote�nas, y reciben el nombre de ARN no


codificantes; se originan a partir de genes propios (genes ARN), o son los intrones
rechazados durante el proceso de splicing. Son ARN no codificantes el ARN de
transferencia (ARNt) y el ARN ribos�mico (ARNr), que son elementos fundamentales en
el proceso de traducci�n, y diversos tipos de ARN reguladores.27?

Ciertos ARN no codificantes, denominados ribozimas, son capaces de catalizar


reacciones qu�micas como cortar y unir otras mol�culas de ARN,28? o formar enlaces
pept�dicos entre amino�cidos en el ribosoma durante la s�ntesis de prote�nas.29?

ARN implicados en la s�ntesis de prote�nas

Ribosoma 50S mostrando el ARNr (amarillo), las prote�nas (azul) y el centro activo,
la adenina 2486 (rojo).
ARN mensajero (ARNm)
El ARN mensajero (ARNm o RNAm) lleva la informaci�n sobre la secuencia de
amino�cidos de la prote�na desde el ADN, lugar en que est� inscrita, hasta el
ribosoma, lugar en que se sintetizan las prote�nas de la c�lula. Es, por tanto, una
mol�cula intermediaria entre el ADN y la prote�na y apelativo de "mensajero" es del
todo descriptivo. En eucariotas, el ARNm se sintetiza en el nucleoplasma del n�cleo
celular y donde es procesado antes de acceder al citosol, donde se hallan los
ribosomas, a trav�s de los poros de la envoltura nuclear.

ARN de transferencia (ARNt)


Los ARN de transferencia (ARNt o tRNA) son cortos pol�meros de unos 80 nucle�tidos
que transfiere un amino�cido espec�fico al polip�ptido en crecimiento; se unen a
lugares espec�ficos del ribosoma durante la traducci�n. Tienen un sitio espec�fico
para la fijaci�n del amino�cido (extremo 3') y un anticod�n formado por un triplete
de nucle�tidos que se une al cod�n complementario del ARNm mediante puentes de
hidr�geno.27? Estos ARNt, al igual que otros tipos de ARN, pueden ser modificados
post-transcripcionalmente por enzimas. La modificaci�n de alguna de sus bases es
crucial para la descodificaci�n de ARNm y para mantener la estructura
tridimensional del ARNt.30?

ARN ribos�mico o ribosomal (ARNr)


El ARN ribos�mico o ribosomal (ARNr o RNAr) se halla combinado con prote�nas para
formar los ribosomas, donde representa unas 2/3 partes de los mismos. En
procariotas, la subunidad mayor del ribosoma contiene dos mol�culas de ARNr y la
subunidad menor, una. En los eucariotas, la subunidad mayor contiene tres mol�culas
de ARNr y la menor, una. En ambos casos, sobre el armaz�n constituido por los ARNm
se asocian prote�nas espec�ficas. El ARNr es muy abundante y representa el 80 % del
ARN hallado en el citoplasma de las c�lulas eucariotas.31? Los ARN ribos�micos son
el componente catal�tico de los ribosomas; se encargan de crear los enlaces
pept�dicos entre los amino�cidos del polip�ptido en formaci�n durante la s�ntesis
de prote�nas; act�an, pues, como ribozimas.

ARN reguladores
Muchos tipos de ARN regulan la expresi�n g�nica gracias a que son complementarios
de regiones espec�ficas del ARNm o de genes del ADN.

ARN de interferencia
Los ARN interferentes (ARNi o iRNA) son mol�culas de ARN que suprimen la expresi�n
de genes espec�ficos mediante mecanismos conocidos globalmente como
ribointerferencia o interferencia por ARN. Los ARN interferentes son mol�culas
peque�as (de 20 a 25 nucl�otidos) que se generan por fragmentaci�n de precursores
m�s largos. Se pueden clasificar en tres grandes grupos:32?

Micro ARN
Los micro ARN (miARN o RNAmi) son cadenas cortas de 21 o 22 nucle�tidos hallados en
c�lulas eucariotas que se generan a partir de precursores espec�ficos codificados
en el genoma. Al transcribirse, se pliegan en horquillas intramoleculares y luego
se unen a enzimas formando un complejo efector que puede bloquear la traducci�n del
ARNm o acelerar su degradaci�n comenzando por la eliminaci�n enzim�tica de la cola
poli A.33?34?

ARN interferente peque�o


Los ARN interferentes peque�os (ARNip o siARN), formados por 20-25 nucle�tidos, se
producen con frecuencia por rotura de ARN virales, pero pueden ser tambi�n de
origen end�geno.35?36? Tras la transcripci�n se ensambla en un complejo proteico
denominado RISC (RNA-induced silencing complex) que identifica el ARNm
complementario que es cortado en dos mitades que son degradadas por la maquinaria
celular, bloquean as� la expresi�n del gen.37?38?39?

ARN asociados a Piwi


Los ARN asociados a Piwi40? son cadenas de 29-30 nucle�tidos, propias de animales;
se generan a partir de precursores largos monocatenarios (formados por una sola
cadena), en un proceso que es independiente de Drosha y Dicer. Estos ARN peque�os
se asocian con una subfamilia de las prote�nas "Argonauta" denominada prote�nas
Piwi. Son activos las c�lulas de la l�nea germinal; se cree que son un sistema
defensivo contra los transposones y que juegan alg�n papel en la gametog�nesis.41?
42?

ARN antisentido
Un ARN antisentido es la hebra complementaria (no codificadora) de un hebra ARNm
(codificadora). La mayor�a inhiben genes, pero unos pocos activan la
transcripci�n.43? El ARN antisentido se aparea con su ARNm complementario formando
una mol�cula de doble hebra que no puede traducirse y es degradada
enzim�ticamente.44? La introducci�n de un transgen codificante para un ARNm
antisentido es una t�cnica usada para bloquear la expresi�n de un gen de inter�s.
Un mARN antisentido marcado radioactivamente puede usarse para mostrar el nivel de
transcripci�n de genes en varios tipos de c�lulas. Algunos tipos estructurales
antisentidos son experimentales, ya que se usan como terapia antisentido.

ARN largo no codificante


Muchos ARN largos no codificantes (ARNnc largo o long ncARN) regulan la expresi�n
g�nica en eucariotas;45? uno de ellos es el Xist que recubre uno de los dos
cromosomas X en las hembras de los mam�feros inactiv�ndolo (corp�sculo de Barr).46?
Diversos estudios revelan que es activo a bajos niveles. En determinadas
poblaciones celulares, una cuarta parte de los genes que codifican para prote�nas y
el 80 % de los lncRNA detectados en el genoma humano est�n presentes en una o
ninguna copia por c�lula, ya que existe una restricci�n en determinados ARN.47?

Riboswitch
Un riboswitch es una parte del ARNm (�cido ribonucleico mensajero) al cual pueden
unirse peque�as mol�culas que afectan la actividad del gen.48?49?50? Por tanto, un
ARNm que contenga un riboswitch est� directamente implicado en la regulaci�n de su
propia actividad que depende de la presencia o ausencia de la mol�cula
se�alizadora. Tales riboswitchs se hallan en la regi�n no traducida 5' (5'-UTR),
situada antes del cod�n de inicio (AUG), y/o en la regi�n no traducida 3' (3'-UTR),
tambi�n llamada secuencia de arrastre,15? situada entre el cod�n de terminaci�n
(UAG, UAA o UGA) y la cola poli A.50?

ARN con actividad catal�tica

Transformaci�n de uridina en pseudouridina, una modificaci�n com�n del ARN.


Ribozimas
Art�culo principal: Ribozima
El ARN puede actuar como biocatalizador. Ciertos ARN se asocian a prote�nas
formando ribonucleoprote�nas y se ha comprobado que es la subunidad de ARN la que
lleva a cabo las reacciones catal�ticas; estos ARN realizan las reacciones in vitro
en ausencia de prote�na. Se conocen cinco tipos de ribozimas; tres de ellos llevan
a cabo reacciones de automodificaci�n, como eliminaci�n de intrones o autocorte,
mientras que los otros (ribonucleasa P y ARN ribos�mico) act�an sobre substratos
distintos.15? As�, la ribonucleasa P corta un ARN precursor en mol�culas de
ARNt,51? mientras que el ARN ribos�mico realiza el enlace pept�dico durante la
s�ntesis proteica ribosomal.

Espliceosoma
Los intrones son separados del pre-ARNm durante el proceso conocido como splicing
por los espliceosomas, que contienen numerosos ARN peque�os nucleares (ARNpn o
snRNA).52? En otros casos, los propios intrones act�an como ribozimas y se separan
a s� mismos de los exones.53?

ARN peque�o nucleolar


Los ARN peque�os nucleolares (ARNpno o snoRNA), hallados en el nucl�olo y en los
cuerpos de Cajal, dirigen la modificaci�n de nucle�tidos de otros ARN;27? el
proceso consiste en transformar alguna de las cuatro bases nitrogenadas t�picas (A,
C, U, G) en otras. Los ARNpno se asocian con enzimas y los gu�an apare�ndose con
secuencias espec�ficas del ARN al que modificar�n. Los ARNr y los ARNt contienen
muchos nucle�tidos modificados.54?55?

ARN mitocondrial
La mitocondrias tienen su propio aparato de s�ntesis proteica, que incluye ARNr (en
los ribosomas), ARNt y ARNm. Los ARN mitocondriales (ARNmt o mtARN) representan el
4 % del ARN celular total. Son transcritos por una ARN polimerasa mitocondrial
espec�fica.15?

Genomas de ARN
El ADN es la mol�cula portadora de la informaci�n gen�tica en todos los organismos
celulares, pero, al igual que el ADN, el ARN puede guardar informaci�n gen�tica.
Los virus ARN carecen por completo de ADN y su genoma est� formado por ARN, el cual
codifica las prote�nas del virus, como las de la c�pside y algunos enzimas. Dichos
enzimas realizan la replicaci�n del genoma v�rico. Los viroides son otro tipo de
pat�genos que consisten exclusivamente en una mol�cula de ARN que no codifica
ninguna prote�na y que es replicado por la maquinaria de la c�lula hospedadora.56?

Hip�tesis del mundo de ARN


Art�culo principal: Hip�tesis del mundo de ARN
La hip�tesis del mundo de ARN propone que el ARN fue la primera forma de vida en la
Tierra, desarrollando posteriormente una membrana celular a su alrededor y
convirti�ndose as� en la primera c�lula. Se basa en la comprobaci�n de que el ARN
puede contener informaci�n gen�tica, de un modo an�logo a como lo hace el ADN, y
que algunos tipos son capaces de llevar a cabo reacciones metab�licas, como
autocorte o formaci�n de enlaces pept�dicos.

Durante a�os se especul� en qu� fue primero, el ADN o las enzimas, ya que las
enzimas se sintetizan a partir del ADN y la s�ntesis de ADN es llevada a cabo por
enzimas. Si se supone que las primeras formas de vida usaron el ARN tanto para
almacenar su informaci�n gen�tica como realizar su metabolismo, se supera este
escollo. Experimentos con los ribozimas b�sicos, como el ARN viral Q-beta, han
demostrado que las estructuras de ARN autorreplicantes sencillas pueden resistir
incluso a fuertes presiones selectivas (como los terminadores de cadena de
quiralidad opuesta).57?

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