Abstrak Kemampuan bioakumulasi logam berat untuk menyebabkan toksisitas dalam sistem biologis —

manusia, hewan, mikroorganisme, dan tanaman — adalah masalah penting bagi kesehatan dan keselamatan
lingkungan. Pendekatan bioteknologi terkini untuk bioremediasi meliputi biomineralisasi (sintesis mineral oleh
organisme hidup atau biomaterial), biosorpsi (mikroba mati dan biomassa pertanian terbarukan), fitostabilisasi
(imobilisasi pada akar tanaman), hiperakumulasi (konsentrasi logam luar biasa pada tunas tanaman),
dendroremediasi (penanaman pohon di tanah yang tercemar), biostimulasi (merangsang populasi mikroba
hidup), rhizoremediasi (tanaman dan mikroba), mikoremediasi (merangsang jamur hidup / ultrafiltrasi miselia),
sianoremediasi (merangsang massa alga untuk remediasi). Pemulihan lingkungan yang memadai membutuhkan
kerja sama, integrasi dan asimilasi dari kemajuan bioteknologi semacam itu bersama dengan kearifan tradisional
dan etis untuk mengungkap misteri alam di bidang bioremediasi yang muncul. Tinjauan ini menyoroti
pemahaman yang lebih baik tentang masalah yang terkait dengan toksisitas logam berat terhadap ekosistem
yang terkontaminasi dan teknologi bioremediasi yang layak, berkelanjutan dan ramah lingkungan, terutama
mekanisme fitoremediasi logam berat bersama dengan beberapa studi kasus di India dan luar negeri. Namun,
tantangan (penilaian keamanan hayati dan polusi genetik) yang terlibat dalam mengadopsi inisiatif baru untuk
membersihkan ekosistem yang terkontaminasi logam berat baik dari sudut pandang ekologis maupun hijau tidak
boleh diabaikan.

Kata Kunci Biomineralization Bioremediasi, Biostimulasi, Sianoremediasi, Detoksifikasi, Genoremediasi,

Myoremediasi, Fitoremediasi, Rhizememediasi

pengantar

Kemajuan bioteknologi adalah proses minat biosains yang menghasilkan konfigurasi ulang dasar ilmu
pengetahuan dan perannya dalam masyarakat (Kastenhofer 2007). Bioteknologi menggunakan kimia organisme
hidup sebagai alat melalui manipulasi sel untuk mengembangkan metode alternatif dan inovatif yang ditujukan
untuk cara yang murni dan lebih efektif untuk menghasilkan produk tradisional dan pada saat yang sama
menjaga lingkungan alam. Selama abad kedua puluh hingga dua puluh satu, para peneliti telah melihat
serangkaian kemajuan teknologi yang telah memfasilitasi manfaat signifikan bagi manusia dalam hal kesehatan,
produksi makanan, transportasi, perumahan dan pariwisata. Kegiatan antropogenik menuntut pengembangan
bahan kimia baru, bahan, dan energi dalam jumlah besar, mengeksploitasi sumber daya alam dan menciptakan
limbah dalam jumlah besar, yang telah menghasilkan dan terus mengakibatkan pencemaran lingkungan. Karena
pembuangan logam berat dari oven metalurgi (Lee et al. 2006; Govarthanan et al. 2013), radionuklida (Mclean
dan Abbe 2008), lumpur limbah / air limbah (dari asal industri, kota dan domestik) (Deng et al. 2007 ; Kumar
dan Mani 2010; Mapanda et al. 2005; Robinson et al. 2011) dan pendekatan tidak higienis dengan cepat
populasi yang terus bertambah, lingkungan telah menderita bermacam-macam efek yang merugikan. Situasi saat
ini menuntut tindakan segera untuk mengembalikan berfungsinya siklus biogeokimia, yang merupakan kekuatan
pendorong di belakang kehidupan di planet kita. Siklus biogeokimia didorong oleh aktivitas metabolisme
komunitas mikroba yang mampu mencegah polutan mencapai biosfer (Li et al. 2013). Namun, potensi
fungsional yang dikodekan dalam genom mikroba kurang dipahami (Jeffries et al. 2012).

Ekosistem yang terkontaminasi menyebabkan dampak pada tanaman, mikroorganisme, organisme akuatik
dan fungsi pendukung kehidupan seperti imobilisasi, mineralisasi dan nitrifikasi yang pada akhirnya
mempengaruhi kesehatan manusia serta kesehatan ekosistem (Batayneh 2012). Para ilmuwan mencapai
pada konsensus untuk mengurangi pelepasan polutan dan untuk memperbaiki efek mereka yang dimediasi
oleh organisme hidup seperti tanaman, sebuah pendekatan yang dikenal sebagai fitoremediasi (Conesa et
al. 2012; Pilon-Smits 2005), atau oleh mikroba yang digabungkan di bawah istilah bioremediasi umum.
Telah diamati sebagai solusi ideal untuk pengendalian polusi dan teknologi inovatif paling efektif yang
menggunakan sistem biologis untuk perawatan kontaminan (Cardenas et al. 2008; Dua et al. 2002).
Bioremediasi adalah teknik yang baik secara ekologis dan canggih yang menggunakan proses biologis
alami untuk sepenuhnya menghilangkan kontaminan beracun. Ini dapat berupa proses apa pun yang
menggunakan mikroorganisme, jamur, tanaman hijau atau enzim mereka untuk mengembalikan
lingkungan alami yang diubah oleh kontaminan ke kondisi aslinya (Chakraborty et al. 2012; Kensa 2011).
Akhir 1980-an dan awal 1990-an mewakili era keemasan untuk bioremediasi. Tindakan fisik akar tanaman,
penambahan bahan organik, pembubaran CaCO3 dan serapan tanaman garam dalam reklamasi tanah
salin-sodik terutama dilaporkan (Helalia et al. 1990). Kemudian, penelitian (dibahas di bawah sub-judul
yang berbeda) pada isolasi dan identifikasi mikroba, seperti Candidatus akumulibakter, mampu menyimpan
polifosfat di pabrik pengolahan air limbah, seperti yang sebelumnya dianggap bandel, mampu
mendegradasi polutan dalam sistem yang diaktifkan dilakukan. (Seviour et al. 2003). Secara kronologis,
penggambaran jalur katabolik untuk degradasi polutan, penerapan teknik molekuler untuk memahami
ekologi mikroba, dan konstruksi genom mikroba rekombinan yang disesuaikan dengan degradasi polutan
diselidiki (Siezen dan Galardini 2008; Ramos et al. 2011).

Baru-baru ini, pendekatan integratif atau pendekatan sistem biologi untuk bioremediasi (Brunk et al. 2011;
Chakraborty et al. 2012; Checa et al. 2012; Singh et al. 2011; Tully et al. 2012), memberikan wawasan tentang
efek samping positif dan negatif , yang mencakup beberapa aspek lingkungan, sedang dilaksanakan untuk
perlindungan dan pemulihan ekosistem yang terkontaminasi. Namun, karakterisasi lebih lanjut dan penilaian
keamanan hayati kritis

berbagai ekosistem yang terkontaminasi seperti lumpur limbah, limbah nuklir, ranjau darat, air limbah
permukaan / air tanah sub-permukaan dan tanah pertanian harus diperhitungkan (Achal et al. 2011; Choudhary
dan Sar 2011; Nouri et al. 2008; Rajaganapathy et al 2011; Robinson et al. 2011; Wang et al. 2012). Pada saat
yang sama, pencemaran genetik ekosistem yang disebutkan di atas melalui bakteri transgenik tidak boleh
diabaikan (Singh et al. 2011).

Tinjauan ini memberikan deskripsi canggih tentang kemajuan bioremediasi bersama dengan referensi khusus
untuk fitoremediasi logam berat; membahas, pada tingkat mendasar, bidang ilmiah dan teknologi luas yang unik
dengan tema pemulihan lingkungan secara berkelanjutan. Konten tersebut memadukan pengetahuan para
kontributor akademik, pertanian, industri, pemerintah, dan internasional; dan memberikan pandangan kritis
tentang kesenjangan pengetahuan dan keterbatasan dalam strategi dan pendekatan aplikasi lapangan seperti
biomineralisasi, biosorpsi, mikoremediasi, sianoremediasi, biostimulasi, phytoextraction / phostostabilization,
dendroremediasi, detoksifikasi, hiperakumulasi, rhizoremediasi, genoremediasi, dan phytemation.
Toksisitas logam berat pada sistem biologis

Semua logam, terlepas dari apakah mereka penting atau tidak penting, dapat menunjukkan efek toksik pada
konsentrasi tinggi. Toksisitas logam untuk suatu organisme dapat didefinisikan sebagai potensi intrinsik atau
kemampuan logam untuk menyebabkan efek negatif pada organisme hidup dan tergantung pada ketersediaan
hayati logam (Rasmussen et al. 2000). Ancaman logam berat terhadap kesehatan manusia dan hewan diperburuk
oleh kegigihan jangka panjang mereka di lingkungan. Misalnya, Pb, salah satu logam yang paling persisten,
memiliki waktu retensi tanah 150–5.000 tahun. Waktu paruh biologis rata-rata Pb diperkirakan 18, dan 10 tahun
sekali dalam tubuh manusia (Gisbert et al. 2003). Beberapa elemen yang tidak esensial (mis., As, F, Cd, Hg, dan
Pb) sangat beracun bagi biota bahkan pada konsentrasi yang sangat rendah (KLHK 2011; Wang et al. 1997).
Begitu polutan masuk ke dalam organisme hidup dan mencapai situs targetnya, ia mungkin menunjukkan
tindakan yang merugikan. Oleh karena itu, efek polutan adalah fungsi dari konsentrasinya pada lokus aksinya.
Toksisitas logam menjadi lebih parah di media asam, ekosistem yang kekurangan nutrisi dan kondisi fisik yang
buruk (Mukhopadhyay dan Maiti 2010). Baru-baru ini, Jiang et al. (2012a) mengevaluasi toksisitas Cr, Ni dan
Pb yang terbatas pada Teluk Zhushan, Teluk Meiliang, di sebuah danau eutrofik Taihu di Tiongkok.

Mukherjee et al. (2008) melaporkan emisi industri merkuri dari pembakaran batu bara, industri besi dan baja,
pabrik metalurgi non-ferrous dan pabrik klor-alkali di India. Unsur merkuri dapat menjadi masalah karena itu

teroksidasi menjadi Hg2? oleh sistem biologis dan kemudian larut ke lahan basah, saluran air dan muara. Selain
itu, merkuri dapat terakumulasi pada hewan sebagai metil merkuri, dimetil merkuri atau garam organomercury
lainnya.
Tingkat arsenik yang tinggi dalam air menimbulkan risiko besar bagi hewan, tumbuhan, dan kesehatan manusia
(Wang et al. 2012; Yin et al. 2012). Sawah yang terendam banjir menciptakan lingkungan yang mengurangi atau
stres oksidatif dan mengakumulasi As III tingkat tinggi (Meharg et al. 2009). Air tanah yang terkontaminasi
arsenik digunakan untuk air minum, persediaan air rumah tangga dan irigasi banyak tanaman, terutama padi
(Oryza sativa L), di anak benua India (Ravenscroft et al. 2009). Dalam sebuah penelitian, yang dilakukan di
Chinese Academy of Sciences, Xinjiang, Cina, 10 mg L-1 As III secara signifikan menghambat sintesis klorofil
a, evolusi oksigen dalam fotosistem II dan sintesis karoten dari Microcystis aeruginosa setelah 48 jam perawatan
(Wang et al . 2012). Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) telah mengamati kontaminasi arsenik dari lebih dari
70 negara yang mempengaruhi kesehatan sekitar 150 juta orang di seluruh dunia. Situasi ini mengkhawatirkan
di Bangladesh dan negara-negara bagian timur India, dan WHO menyebut situasi ini sebagai peristiwa
'keracunan massal terburuk' dalam sejarah manusia (Hassan 2005). Wang et al. (1997) melaporkan konsentrasi
arsen hingga 880 lg / l dari tubewells dari daerah Kuitan Xinjiang, sebuah kota yang terletak di bagian barat
Cina. Banyak penduduk menderita arsenisme, penyakit yang disebabkan oleh keracunan arsenik (As), setelah
mengonsumsi air sumur yang mengandung 0,12 mg As / l selama 10 tahun dengan tingkat prevalensi 1,4% dari
populasi kota. Namun, pada penduduk yang mengkonsumsi air yang mengandung 0,6 mg As / l hanya 6 bulan,
tingkat prevalensi meningkat menjadi 47%, dan pasien menunjukkan gejala yang lebih parah.

Logam berat dapat terakumulasi dalam jaringan tanaman ke tingkat yang mempengaruhi pertumbuhan dan
perkembangannya, karena logam ini mengganggu fungsi metabolisme pada tanaman, termasuk proses fisiologis
dan biokimiawi, penghambatan fotosintesis dan respirasi, degenerasi organel sel utama, yang meliputi
pertumbuhan terhambat, klorosis, berkurangnya hasil panen, keterlambatan berkecambah, penuaan, jatuhnya
daun prematur, lesi biokimia, hilangnya aktivitas enzim, bahkan menyebabkan kematian tanaman (Liu et al.
2008; Mohanty et al. 2012).

Remediasi logam berat

Sangat diinginkan untuk menerapkan pendekatan perbaikan yang sesuai untuk tanah yang tercemar, yang dapat
mengurangi risiko kontaminasi logam. Remediasi dapat dilakukan melalui langkah-langkah perbaikan
konvensional seperti pengisian dan pencucian lahan, penggalian dan penguburan atau pencucian tanah (Wuana
et al. 2010; Vesely et al. 2012). Penggunaan ekstensif tempat pembuangan sampah padat untuk pembuangan
kota dan industri

limbah serta penggunaan agro-kimia yang tidak tepat telah menghasilkan sejumlah besar lindi yang
menyebabkan pencemaran air tanah (Nouri et al. 2008), dan potensi kontaminasi air tanah oleh lindi telah
diperlukan untuk penemuan desain teknik baru untuk tempat pembuangan sampah (Sivakumar 2012 ).

Remediasi ekosistem yang tercemar logam berat dapat dilakukan dengan menggunakan proses fisikokimia
seperti pertukaran ion, presipitasi, reverse osmosis, penguapan dan pengurangan bahan kimia (Tang et al. 2007).
Namun, karena masalah seperti pengotoran membran, biaya tinggi, kebutuhan energi tinggi dan efisiensi
pemindahan rendah, proses ini menunjukkan sedikit relevansi dalam industri. Secara umum, penerapan teknis,
efektivitas biaya dan kesederhanaan tanaman adalah faktor kunci dalam memilih metode perawatan yang paling
cocok untuk menghilangkan logam berat (seperti tembaga, arsenik, timbal dan seng) dan sianida dari ekosistem
yang terkontaminasi (Acheampong et al. 2010) . Namun, teknologi terbaru seperti reduksi fotokatalitik,
membran berbasis surfaktan, membran cair dan kompleks permukaan lebih efisien untuk menghilangkan logam
berat dari ekosistem yang terkontaminasi (Malaviya dan Singh 2011; Xu et al. 2012).

Chen dan Lin (2010) menyelidiki proses bioleaching untuk menghilangkan logam berat dari
tanah yang terkontaminasi logam. Mereka memperoleh pelarutan logam maksimum pada
1% (b / v) kandungan padatan tanah dan 0,1% (b / v) dosis sulfur, dan efisiensinya lebih
tinggi dari 80%. Mereka juga mengamati bahwa tanah yang diolah stabil dan sisa logam
berat tidak lagi berbahaya bagi lingkungan setelah proses bioleaching. Bakteri pengoksidasi
sulfur, Acidithiobacillus thiooxidans, diisolasi dari pabrik pengolahan limbah lumpur, Jinshan,
Fuzhou, Cina, ditemukan mampu mengoptimalkan proses bioleaching pada konsentrasi
padat 2%, konsentrasi sulfur 5 g / L dan konsentrasi sel 10%. Efisiensi penghapusan Cr, Cu,
Pb dan Zn adalah 43,65, 96,24, 41,61 dan 96,50% dalam periode 4-10 hari di bawah kondisi
optimal, masing-masing (Wen et al. 2010). Namun, kerugian utama dari proses ini adalah
kinetika yang lambat dalam pelarutan logam, yang dapat membatasi aplikasi praktis dari
proses bioleaching. Meskipun proses pelarutan logam telah ditingkatkan, menggunakan
katalis seperti ion besi (Chen et al. 2003), proses tersebut masih tetap kurang ekonomis
atau kurang menguntungkan yang memiliki risiko lebih tinggi terhadap kontaminasi air tanah
(Batayneh 2012; Hazen 2010; Nouri et al. 2008) . Metode biologis, terutama
fitobioremediasi, telah dianggap sebagai alternatif yang efisien, ramah lingkungan dan
hemat biaya dibandingkan dengan teknologi pengolahan fisikokimia untuk remediasi
ekosistem yang terkontaminasi. Penelitian telah menunjukkan bahwa tanaman memiliki
potensi genetik untuk menghilangkan banyak logam beracun dari ekosistem tanah-air yang
terkontaminasi (Lyyra et al. 2007; Memon dan Schroder 2009; Pilon-Smits 2005; Pilon-Smits
2005; Pilon-Smits dan LeDuc 2009; Mani et al. 2012a). Namun, dekontaminasi tanah yang
tercemar melalui penerapan enzim mikroba amobil dan menggunakan mikroorganisme
resisten seperti bakteri, jamur, ganggang dan mikoriza arbuskula vesikular (Purakayastha
dan Chhonker 2001) secara ekologis dan ekonomis sehat. Untuk menyelesaikan paradoks
menggabungkan hyperaccumulator tanaman dan jamur mikoriza arbuskular (AMF) untuk
tujuan bioremediasi pasca-industri karena perbedaan perilaku toleransi stres ekologis dan
evolusi masing-masing, upaya telah dilakukan (Juwarkar dan Singh 2010; Audet 2013) ).

Prinsip bioremediasi

Keuntungan utama bioremediasi adalah mengurangi biaya remediasi bila dibandingkan dengan teknik
konvensional seperti pengerukan (pemindahan fisik lapisan sedimen yang terkontaminasi), capping (menutupi
permukaan sedimen yang terkontaminasi dengan bahan bersih, sehingga mengisolasi sedimen) dan insinerasi
(pengolahan limbah) teknologi yang melibatkan pembakaran zat organik yang terkandung dalam bahan limbah).
Bioremediasi dapat dilakukan di lokasi, sehingga mengurangi risiko paparan bagi personel pembersihan, atau
potensi paparan yang lebih luas sebagai akibat dari kecelakaan transportasi. Selain keuntungan di atas,
bioremediasi lebih murah, menghilangkan limbah secara permanen, menghilangkan kewajiban jangka panjang
dan dapat digabungkan dengan teknologi pengolahan fisik atau kimia. Selain itu, ini adalah teknik non-invasif,
meninggalkan ekosistem utuh (Vidali 2001). Namun, tidak mudah untuk memprediksi laju pembersihan untuk
latihan bioremediasi karena beberapa faktor lingkungan terlibat dalam menentukan nasib bioremediasi, dan
hingga saat ini, para ilmuwan sedang mencari aturan untuk memprediksi laju degradasi kontaminan di berbagai
komponen lingkungan (Machackova et al. 2012).

faktor-faktor yang mempengaruhi bioremediasi

Parameter terpenting untuk bioremediasi adalah: (1) Nutrisi — nutrisi tidak mencukupi untuk metabolisme sel
dan pertumbuhan mikroorganisme di lokasi yang terkontaminasi. Karena, di situs yang terkontaminasi, karbon
organik tinggi dan ini dapat habis selama metabolisme mikroba. Dengan demikian, menambah nutrisi seperti
nitrogen, fosfat, dan kalium ke situs yang terkontaminasi dapat merangsang metabolisme sel dan pertumbuhan
mikroorganisme yang menambah bioremediasi. Kebutuhan nutrisi rasio karbon-ke-nitrogen (C: N) adalah 10: 1,
dan rasio karbon-ke-fosfor adalah 30: 1 untuk bioremediasi. Namun, mikroba
pertumbuhan untuk biodegradasi terjadi di tanah yang terkontaminasi dengan rasio C: N (25: 1) yang jauh lebih
tinggi (Atagana et al. 2003);

(2) Sifat polutan — polutan adalah (a) padat, semi padat, cair, sifatnya mudah menguap, (b) beracun atau tidak
beracun

polutan organik dan anorganik, (c) logam berat,

(d) hidrokarbon aromatik polisiklik, pestisida, pelarut terklorinasi, dll .; (3) Struktur Tanah — struktur tanah
mengandung tekstur yang berbeda mulai dari pasir, lanau dan tanah liat yang rendah hingga tinggi. Tanah
granular dan terstruktur dengan baik dapat memfasilitasi pengiriman udara, air dan nutrisi yang efektif ke
mikroorganisme untuk bioremediasi in situ; (4) pH — berkisar antara 5,5–8,0, yang merupakan kisaran optimal
untuk pertumbuhan mikroba dan untuk menghancurkan kontaminan (Vidali 2001); (5) Kadar air — air adalah
faktor utama dalam menentukan konstanta dielektrik tanah dan medium lainnya. Kadar air tanah umumnya
berkisar antara 25 hingga 28% (Vidali 2001);

(6) Keragaman Mikroba — keanekaragaman mikroba dari situs seperti Pseudomonas, Aeromonas,
Flavobacteria,

Chlorobacteria, Corynebacteria, Acinetobacter, Mycobacteria, Streptomyces, Bacilli, Arthrobacter, Aeromonas

dan Cyanobacteria, dll .; (7) Keragaman Macrobenthos — konsorsium tanaman air E. crassipes, S. molesta, C.
demersum dengan hewan air A. woodiana dan L. hoffmeisteri memiliki potensi tinggi untuk degradasi
kekeruhan, BOD, COD, amonia, nitrit dan nitrat dalam

air limbah domestik (Mangunwardoyo et al. 2013); (8) Temperatur — berkisar antara 15–45 LC. Suhu

mempengaruhi laju reaksi biokimia dan laju dua kali lipat untuk setiap kenaikan suhu 10 LC; dan (9) Oksigen
— oksigen terutama digunakan untuk pemecahan awal hidrokarbon di lokasi yang terkontaminasi. Juga, jumlah
oksigen yang tersedia akan menentukan apakah bioremediasi dilakukan dalam kondisi aerobik atau anaerob
(Thapa et al. 2012). Adalah fakta bahwa meskipun pengetahuan yang relevan telah diperoleh di bidang
bioremediasi - melalui penelitian laboratorium intensif - eksploitasi inovasi ini belum sepenuhnya terwujud
(Ramos et al. 2011).

Strategi untuk bioremediasi

Bioremediasi adalah opsi yang menawarkan kemungkinan untuk menghancurkan atau membuat berbagai
kontaminan yang tidak berbahaya menggunakan aktivitas biologis alami (Gupta dan Mahapatra 2003). Ketika
bioremediasi muncul dengan sendirinya, bioremediasi dikenal sebagai atenuasi alami; ketika melibatkan
mikroorganisme bersama dengan pupuk tambahan, itu disebut biostimulasi; ketika degradasi terjadi di rhizosfer,
ia dikenal sebagai rhizodegradasi; ketika tanaman mengekstraksi logam dari tanah dan melepaskannya ke
atmosfer melalui penguapan, ia dikenal sebagai fitovolatilisasi; ketika akar tanaman menyerap atau
mengadsorpsi logam dari larutan berair, ia dikenal sebagai

rhizofiltrasi; ketika semai menyerap atau menyerap polutan dari larutan berair, ia dikenal sebagai blastofiltrasi;
dan ketika polutan diimobilisasi di zona akar, ia dikenal sebagai fitostabilisasi. Proses rizosfer gabungan (zona
akar) yang berkontribusi terhadap bioremediasi telah disebut sebagai rhizoremediasi (Prasad dan Freitas 2003;
Sarma 2011; Dhankher et al. 2011). Pemanfaatan paralel dari berbagai polutan karena kapasitas degradatifnya
yang fleksibel dengan komunitas mikroba dikenal sebagai ko-metabolisme. Aklimatisasi, merupakan langkah
tambahan, telah dimasukkan untuk mengolah lumpur air limbah di pabrik pengolahan. Pengenalan
mikroorganisme yang dimodifikasi secara genetik (Paliwal et al. 2012) dan bakteri laut yang tahan logam
(Poirier et al. 2013) juga dapat digunakan sebagai teknik bioremediasi lanjutan.