CAPITULO 8 Enzimas http://booksmedicos.blogspot.com En todo ser vivo se producen constantemen- te innusnerables reacciones quimicas. Muchas de ellas tienden a transformar las sustancias intro: ducidas con los alimentos a fin de obtener ener- gia y materia prima para la sintesis de nuevas estructuras moleculares, Dicha sfntesis, asf como la degradacién de los componentes celulares una vez cumplida su vida til, son también resultado de miiltiples reacciones. La velocidad y eficiencia con las cuales se rea- lizan las transformaciones bioqusmicas son no- tables. Si se pretendiese repetitlas en el laborato- rio, se comprabarfa que s6lo oeurren si se sumi- nistra calor, o pH extremos, 0 grandes presiones, etc., recursos todos incompatibles con la subsis- tencia de las células, En las condiciones reinan- tes en el organismo: temperatura de alrededor de 37°C en seres homeotermos, temperatura ambien- te en poiquilotermos, pH proxitno a la neutrali- dad, presign constante, etc., lamayor parte de las reacciones transcurritfa muy lentamente © no se prodiicirfa en absoluto Las reacciones quimicas se realizan en los se- res vivientes_a gran velocidad, en.condiciones muy moderadas de temperatura, pH, presion, et. gracias a la existencia de catalizadores Las enzimas son catalizadores biolégicos Un catalizador es un agente capaz de acele- rar una reaccién quimica, sin formar parte de los productos finales ni desgastarse en el proceso. En Jos medios biolégicos se desempefian como cata- lizadores macromoléculas denominadas enzimas. Como todo catalizador, las enzimas actéan disminuyendo la energia de activacidn (E,) de una seacci6n, En este sentido, son mds efectivas que la mayoria de catalizadores inorgénicos. Por otra parte, las enzimas muestran mayor especificidad. Los catalizadores inorgdnicos suelen actuat ace- lerando reacciones quimicas muy diversas, mien: tras las enzimas sdlo catalizan una reaccién gt mica determinada, Algunas enzimas actdan so- bre sustancias distintas, pero en general se trata de compuestos homélogos y la reaccisn catalizada es Siempre de} mismo tipo Las sustancias sobre Jas cuales actian las enzimas reciben el nombre genérico de sustratos. La especificidad de una enzima le permite dis- tinguir con gran selectividad entre diferentes sus- tancias y aun entre isémeros Gpticos. Por ejem- plo, la glucoquinasa, enzima que cataliza una re- accion de fosforilacién de D-ghucosa, no actiia frente a L-glucosa. Nomenclatura y clasificacién de enzimas Las enzimas suelen designarse agregando el sufijo asa.al nombre del sustrato sobre e) cual actian. Por ejemplo, amilasa, reasa y tirosinasa son enzimas que catalizan reacciones con almi- dén, area y tirosina respectivamente. También se denominan las enzimas segtin el tipo de reaccién catalizada, por ejemplo, deshidrogenasas y descar- boxilasas catalizan la sustraccidn de hidrégenos y casboxilo del sustrato respectivamente Por otra parte, viertas enzimas conocidas des- de hace mucho tiempo tienen nombres arbitra- rios. Entre ellas, ptialina salival, pepsina de jugo g: trico, tripsina y quimotripsina de jugo pancreatico. La confusién creada por el uso de nombres segiin distintos criterios, llev6 a la Union Inter- nacional de Bioquimica y Biologia Molecular (IUBMB en las siglas inglesas) a proponer un sis- tema de clasificacién, con normas para asignar a cada enzima un nombre descriptivo y un ntimero que permite ubicarla inequivocamente. En esta clasificacién se consideran seis clases principa- les segiin el tipo de reaccién catalizada, Las di- S teacciones bioquimicas pueden agrupar-126 QUIMICA BIOLOGICA se en esas seis categorias. Cada una de las clases se divide en subclases y subsubclases. El cédigo numérico utilizado para identificar las enzimas consta de cuatro componentes: el primer mime ro corresponde a [a clase principal; el segundo, a la Subclase, el {ercero, a la subsubelase (estos niimeros son asignados teniendo en cuenta la naturaleza de los grupos de dtomos comprometi- dos en la reaccidn) y el cuarto es el ntimero de orden de la enzima en su subsubclase. Periédica- mente la IUBMB publica la nomenclatura de las enzimas conocidas. En ella se asigna el nombre sistematico, en el cual se mencionan sustratos utilizados y tipo de reaccién catalizada; se indica también el nombre comin o trivial mas recomen- dable y se da el ntimero de cddigo. En todo tra- bajo en el cual se mencione una enzima debe con- signarse ese ntimero a fin de identificarla con exactitud. En este texto se utilizar por lo general ei nombre trivial recomendado por la IUBMB, salvo en algunos casos en los cuales el uso ha sancionado otra denominacién Los seis grandes grupos de la clasificacién inter- nacional son: (_Oxidorreductasas. Catalizan reacciones de oxidorreduccién. Estin asociadas.a coenzimas (ver més adelante). Cuando el sustrato es donante de hidrégeno, las enzimas son designadas con el nom- bre del sustrato antepuesto a deshidrogenasa. Con menor frecuencia, cuando Ia reaccién se indica en el sentido inverso, al nombre del sustrato se agrega reductasa. Se denominan, axidasas lay enzimas que atalizan reacciones en las cuales el aceptor de hi- drdgeno es el O, y el de oxigenasas s61a cuando la molécula de O, es incorporada al sustrato. Peroxi- dasas son Jas enzimas gue utilizan H,0, como aceptor de hidiégeno. Como ejemplo citaremos a la lactato deshidro- genasa, que cataliza la oxidacién de lactato a. piru vato.y también la reaccin inversa (reduccin de piruvaio a lactato). La enzima utiliza NAD como coenzima. La reaccién catalizada es cf 9 CH.OH + NAD* = C=O +NADH + H* | | CcO.O7 Cco.07 Lactato. Piruvato E] nombre sistemiatico es L-lactato; NAD oxido- reeductasa: nombre trivial recomendado, lactato deshidrogenasa y némero de cddigo 1.1.1.27 2. Transferasas. Catalizan la transferencia de un grupo de dtomos, como amina, carboxilo, carbonilo, Metilo, acilo, glicosilo, fosforilo, desde un sustrato considerado donante, a otro compuesto aceptor. Por ejemplo, aminotransferasas 0 transaminasas. que catalizan la cesién del grupo amina de un compues- to a otto, La reaccién: §° Oo Goo He CH +) CH, | | *H,N-C—H c=0 Il i co. coo" L-aspartato 2-oxoglutarato 0 d-cetaglutarata go oO CO. Ghe 1 = Che + gh c=0 *H,N-C-H 1 | CcO.0- co.0- Oxaloacetato L-glutamato es catalizada por una enzima cuyo nombre sistema- tico es L-aspartato: 2-oxoglutarato‘aminotransfera nombre trivial secomendado, aspartato amino- ansferasa y-nimero de cédigo, 2.6.1.1 3, Hidrolasas. Catalizan la roptura de enlaces .C-N.C-S y O-P por adicién de agua. El nom- dre recomendado se forma con el det sustrato y el sufijo asa. Pertenecen a este grupo acetilcolines terasa y ribonucleasa, que hideolizan la unin éster ent to y colina de acetilcolina y las unjones entre nucledtidos en ARN respectivamente. Otro ejemplo es la arginasa, que cataliza la hidrélisis de arginina para formar urea: we c 1 NH (Cas + HO —- *H,N-C-H I 60.07 CH,-NH# L-arginina i CH NH, i? —-o=c + CH, X NH y | HjN-C -H i CO.07 Urea L-ornitina El nombre sistemitico es L-arginina amidino hidrolasa; nombre trivial, arginasa y ntimero de cédigo, 3.5.3.14, Liasas, Catalizan la ruptura de uniones C-C, C28 y CN (excluyendo uniones pepiidicas) de la molécula del sustrato. por un proceso distinto al de isis. Algunas eliminan grupos del sustrato y an dobles Jigaduras o.ciclos. o agregan grupos a enlaces dobles. Los nombres recomendados in- cluyen, por ejemplo, los de desearboxilasas, deshidratasas, aldolasas, cuando eliminan CO3, agua 0. aldehido respectivamente. En los casos en los cuales la reaccién inversa (incorporaci6n de un grupo) sea la mds importante, se utiliza la denomina- cin sintasa (no sintetasa), a fin de destacar la fina- {iad de sintesis de la reaccién. Un ejemplo de siasa es Ia aldolasa, que divide fructosa-1,6-bisfosfato en dos triosas fosfato. O. P)—O-H,C CH,-O—(P) ‘OH OH Fructosa-1,6-bisfosfato Degliceraldehido- Dilhidvoxiacetonafosfato 3-fosfato El nombre sistemdtico es fructosa-1,6-bisfosfato: D.gliveraldehfdo-3-fostato liasa; nombre trivial re- comendado, fructosa-bisfosfato aldotasa y némero de cédigo, 4.1.2.3, _S, Isomerasas. interconvierten isémeros de cual quier tipo, Spticos, geométricos o de posicién. Al gunas de ellas reciben nombres triviales, como epimerasa, racemasa, cis-trans isomerasas, ciclo- isomerasas, tautomerasas, Ejemplos, fosfoginco: isomerasa, cataliza la interconversion glucosa-6- fosfato = fructosa-6-fosfato; {riosafosfato isomexasa, que cataliza la reaccién: / Cc I I —O-PO} CH,-O—PO; Dit droxiacetonafostato D-gliceraldehido-3-fosfato ENZIMAS 127 El nombre sistemético es D-gliceraldehido-3- rasa; nombre trivial recomenda~ omerasa: Mimero de cédigo, alizan 1a unin de dos moléculas, wa con Ia hidrélisis de un enlace de alta ener- gia de_nucledsidos ti La designacién Sinferasa, que suele asignatse a estas enzimas, debe reservarse para las que tesponden estrictamente a Ja definicién precedente; no confundir con sintusa. Para evitar errores, se recomienda Hamar ligasas a enzimas de este grupo. Por ejemplo, la gluta- mato:amonfaco igasa. nlimero de cddigo 6.3.1.2, tam- bién Hamada glutamina sintetasa, acttia en la reac~ cidn entre Acido glutémico y amonfaco para for- maf glutamina. La energia nécesaria para Ja sintesis es provista por hidrolisis de ATP: go Oo” qh CH + NHS + ATP = *H.N-C-H Amonio do.0- L-glutamato GO-NHe CH — Ch, + ADP +P, *HN-C-H coo L-glutamina Naturaleza quimica de las enzimas En 1926, Sumner purificé y cristaliz6 por pri- meta vez una enzima, wreasa, que cataliza la hidrdlisis de wrea a amonfaco y bidxido de carbo- no. Se comprobé entonces su naturaieza proteinica Posteriormente se han obtenido muchas enzimas. al estado puro y estudiado muy cuidadosamente su constitucién. Como consecuencia de esos es- tudios, hasta hace pocos aitos estaba firmemen- te arraigado un concepio: todas las enzimas son proteinas. Sin embargo, se han aislado molécu- las_dé_acido ribonucleico (ARN) con actividad catalitica, las Hamadas ribozimas (pig. 373) Las técnicas actual mente disponibles para el estudio de macromoléculas han permitido cono- cer.con exactitud la estructura de numerosas enzimas y construir modelos precisos de las mis-