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Introduction to Information Retrieval

Introduction to
Information Retrieval
Information Retrieval
CS276: Information Retrieval and Web Search
Christopher Manning and Prabhakar Raghavan

Lecture 4: Index Construction

1
Introduction to Information Retrieval

Plan
Pl
ƒ Last lecture:
Last lecture:
ƒ Dictionary data structures a-hu
hy-m
n-z

ƒ Tolerant retrieval
ƒ Wildcards
ƒ Spell correction
$m mace madden
ƒ Soundex
mo among amortize

ƒ This time: on abandon among

ƒ Index construction

2
Introduction to Information Retrieval Ch. 4

I d
Index construction
t ti
ƒ How
How do we construct an index?
do we construct an index?
ƒ What strategies can we use with limited main 
memory?

3
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.1

H d
Hardware basics
b i
ƒ Many
Many design decisions in information retrieval are 
design decisions in information retrieval are
based on the characteristics of hardware
ƒ We begin by reviewing hardware basics
g y g

4
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.1

H d
Hardware basics
b i
ƒ Access
Access to data in memory is much
to data in memory is much faster than access 
faster than access
to data on disk.
ƒ Disk seeks: No data is transferred from disk while the 
disk head is being positioned.
ƒ Therefore: Transferring one large chunk of data from 
g g
disk to memory is faster than transferring many small 
chunks.
ƒ Disk I/O is block‐based: Reading and writing of entire 
blocks (as opposed to smaller chunks).
ƒ Block sizes: 8KB to 256 KB.
5
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.1

H d
Hardware basics
b i
ƒ Servers
Servers used in IR systems now typically have several 
used in IR systems now typically have several
GB of main memory, sometimes tens of GB. 
ƒ Available disk space is several (2–3) orders of 
p ( )
magnitude larger.
ƒ Fault tolerance is very expensive: It’s much cheaper 
y p p
to use many regular machines rather than one fault 
tolerant machine.

6
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.1

H d
Hardware assumptions
ti
ƒ symbol  statistic 
symbol statistic value
ƒ s average seek time  5 ms = 5 x 10−3 s
ƒ b
b  transfer time per byte
transfer time per byte  0 02 μs = 2 x 10−8 s
0.02 μs = 2 x 10
ƒ processor’s clock rate 109 s−1
ƒ p low level operation
low‐level operation  0 01 μs = 10−88 s
0.01 μs = 10
(e.g., compare & swap a word)
ƒ size of main memory 
size of main memory several GB
several GB
ƒ size of disk space 1 TB or more

7
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.2

RCV1 O
RCV1: Our collection for this lecture
ll ti f thi l t
ƒ Shakespeare’s
Shakespeare s collected works definitely aren
collected works definitely aren’tt large 
large
enough for demonstrating many of the points in this 
course.
ƒ The collection we’ll use isn’t really large enough 
either, but it’s publicly available and is at least a more 
plausible example.
ƒ As an example for applying scalable index 
construction algorithms, we will use the Reuters 
l h ll h
RCV1 collection.
ƒ This is one year of Reuters newswire (part of 1995 
Thi i fR t i ( t f 1995
and 1996) 8
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.2

A R t RCV1 d
A Reuters RCV1 document
t

9
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.2

R t RCV1 t ti ti
Reuters RCV1 statistics
ƒ symbol statistic 
statistic value
ƒ N  documents 800,000
ƒ L
L  avg. # tokens per doc
avg. # tokens per doc  200
ƒ M terms (= word types)  400,000
ƒ avg. # bytes per token
avg. # bytes per token  6
(incl. spaces/punct.)
ƒ avg. # bytes per token 4.5
(without spaces/punct.)
ƒ avg. # bytes per term 7.5
ƒ non‐positional postings 100,000,000
4.5 bytes per word token vs. 7.5 bytes per word type: why? 10
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.2

Term Doc #

R ll IIR 1 i d
Recall IIR 1 index construction
t ti I
did
1
1
enact 1
julius 1

ƒ Documents
Documents are parsed to extract words and these 
are parsed to extract words and these caesar
I
1
1
are saved with the Document ID. was 1
killed 1
i' 1
the 1
capitol 1
brutus 1
killed 1
me 1
Doc 1 Doc 2 so 2
let 2
it 2
be 2
I did enact Julius So let it be with with 2

Caesar I was killed C


Caesar. Th
The noble
bl
caesar
the
2
2
i' the Capitol; Brutus hath told you noble
brutus
2
2
Brutus killed me. Caesar was ambitious hath 2
told 2
you 2
caesar 2
was 2
11
ambitious 2
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.2

K
Key step
t Term
T
I
did
D
Doc #
1
1
Term
T
ambitious
be
D #
Doc
2
2
enact 1 brutus 1
julius 1 brutus 2
ƒ After
After all documents have been 
all documents have been caesar
I
1
1
capitol
caesar
1
1
parsed, the inverted file is  was
killed
1
1
caesar
caesar
2
2
sorted by terms.  i' 1 did 1
the 1 enact 1
capitol 1 hath 1
brutus 1 I 1
killed 1 I 1

We focus on this sort step. me


so
1
2
i'
it
1
2

W have
We h 100M iitems to sort. let
it
2
2
julius
killed
1
1
be 2 killed 1
with 2 let 2
caesar 2 me 1
tthe
e 2 noble 2
noble 2 so 2
brutus 2 the 1
hath 2 the 2
told 2 told 2
you 2 you 2
caesar 2 was 1
was 2 was 2
ambitious 2 with 2

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Introduction to Information Retrieval Sec. 4.2

S li i d
Scaling index construction
t ti
ƒ In‐memory
In memory index construction does not scale.
index construction does not scale.
ƒ How can we construct an index for very large 
collections?
ƒ Taking into account the hardware constraints we just 
learned about . . .
ƒ Memory, disk, speed, etc.

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Introduction to Information Retrieval Sec. 4.2

S t b di d
Sort‐based index construction
t ti
ƒ As we build the index, we parse docs one at a time.
, p
ƒ While building the index, we cannot easily exploit 
compression tricks   (you can, but much more complex)
ƒ The final postings for any term are incomplete until the end.
ƒ At 12 bytes per non‐positional postings entry (term, doc, 
freq) demands a lot of space for large collections
freq), demands a lot of space for large collections.
ƒ T = 100,000,000 in the case of RCV1
ƒ So … we can do this in memory in 2009, but typical 
y , yp
collections are much larger.  E.g. the New York Times 
provides an index of >150 years of newswire
ƒ Thus: We need to store intermediate results on disk.
Th W dt t i t di t lt di k

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Introduction to Information Retrieval Sec. 4.2

U th
Use the same algorithm for disk?
l ith f di k?
ƒ Can
Can we use the same index construction algorithm 
we use the same index construction algorithm
for larger collections, but by using disk instead of 
memory?
ƒ No: Sorting T = 100,000,000 records on disk is too 
slow – too many disk seeks.
ƒ We need an external sorting algorithm.

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Introduction to Information Retrieval Sec. 4.2

B ttl
Bottleneck
k
ƒ Parse
Parse and build postings entries one doc at a time
and build postings entries one doc at a time
ƒ Now sort postings entries by term (then by doc 
within each term))
ƒ Doing this with random disk seeks would be too slow 
– must sort T=100M records

If every comparison took 2 disk seeks, and N items could be


sorted with N log
g2N comparisons,
p , how long
g would this take?

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Introduction to Information Retrieval Sec. 4.2

BSBI: Blocked sort‐based Indexing 
(S ti
(Sorting with fewer disk seeks)
ith f di k k)
ƒ 12 byte (4+4+4) records (term, doc, freq).
12‐byte (4+4+4) records (term, doc, freq).
ƒ These are generated as we parse docs.
ƒ Must now sort 100M such 12‐byte
Must now sort 100M such 12 byte records by term.
records by term
ƒ Define a Block ~ 10M such records
ƒ Can easily fit a couple into memory.
Can easily fit a couple into memory
ƒ Will have 10 such blocks to start with.
ƒ Basic idea of algorithm:
Basic idea of algorithm:
ƒ Accumulate postings for each block, sort, write to disk.
ƒ Then merge the blocks into one long sorted order.

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Introduction to Information Retrieval Sec. 4.2

18
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.2

S ti 10 bl k f 10M
Sorting 10 blocks of 10M records
d
ƒ First, read each block and sort within: 
First, read each block and sort within:
ƒ Quicksort takes 2N ln N expected steps
ƒ In our case 2 x (10M ln 10M) steps
ƒ Exercise: estimate total time to read each block from 
disk and and quicksort it.
ƒ 10 times this estimate – gives us 10 sorted runs of 
10M records each.
ƒ Done straightforwardly, need 2 copies of data on disk
ƒ But can optimize this

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Introduction to Information Retrieval Sec. 4.2

20
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.2

H t
How to merge the sorted runs?
th t d ?
ƒ Can do binary merges, with a merge tree of log
y g , g g210 = 4 layers.
y
ƒ During each layer, read into memory runs in blocks of 10M, 
merge, write back.

1
1 2
2 Merged run.
run
3 4
3

4
Runs being
merged
merged.
Disk
21
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.2

H t
How to merge the sorted runs?
th t d ?
ƒ But it is more efficient to do a n‐way merge, where you are 
y g , y
reading from all blocks simultaneously
ƒ Providing you read decent‐sized chunks of each block into 
memory and then write out a decent‐sized output chunk, 
d th it t d t i d t t h k
then you’re not killed by disk seeks

22
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.3

Remaining problem with sort‐based 
algorithm
l ith
ƒ Our
Our assumption was: we can keep the dictionary in 
assumption was: we can keep the dictionary in
memory.
ƒ We need the dictionary (which grows dynamically) in 
y( g y y)
order to implement a term to termID mapping.
ƒ Actually, we could work with term,docID postings 
y p g
instead of termID,docID postings . . .
ƒ . . . but then intermediate files become very large. 
(We would end up with a scalable, but very slow 
index construction method.)

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Introduction to Information Retrieval Sec. 4.3

SPIMI: 
Si l
Single‐pass in‐memory indexing
i i d i
ƒ Key
Key idea 1: Generate separate dictionaries for each 
idea 1: Generate separate dictionaries for each
block – no need to maintain term‐termID mapping 
across blocks.
ƒ Key idea 2: Don’t sort. Accumulate postings in 
postings lists as they occur.
ƒ With these two ideas we can generate a complete 
inverted index for each block.
ƒ These separate indexes can then be merged into one 
big index.

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Introduction to Information Retrieval Sec. 4.3

SPIMI I
SPIMI‐Invert
t

ƒ Merging of blocks is analogous to BSBI. 25
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.3

SPIMI C
SPIMI: Compression
i
ƒ Compression makes SPIMI even more efficient.
Compression makes SPIMI even more efficient.
ƒ Compression of terms
ƒ Compression of postings
ƒ See next lecture

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Introduction to Information Retrieval Sec. 4.4

Di t ib t d i d i
Distributed indexing
ƒ For web
For web‐scale
scale indexing (don
indexing (don’tt try this at home!):
try this at home!):
must use a distributed computing cluster
ƒ Individual machines are fault‐prone
p
ƒ Can unpredictably slow down or fail
ƒ How do we exploit such a pool of machines?
p p

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Introduction to Information Retrieval Sec. 4.4

G
Google data centers
l d t t
ƒ Google
Google data centers mainly contain commodity 
data centers mainly contain commodity
machines.
ƒ Data centers are distributed around the world.
ƒ Estimate: a total of 1 million servers, 3 million 
p
processors/cores (Gartner 2007)
ƒ Estimate: Google installs 100,000 servers each 
quarter.
ƒ Based on expenditures of 200–250 million dollars per year
ƒ This would be 10% of the computing capacity of the 
world!?!
28
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.4

G
Google data centers
l d t t
ƒ If
If in a non
in a non‐fault‐tolerant
fault tolerant system with 1000 nodes, 
system with 1000 nodes,
each node has 99.9% uptime, what is the uptime of 
the system?
ƒ Answer: 63%
ƒ Calculate the number of servers failing per minute 
gp
for an installation of 1 million servers.

29
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.4

Di t ib t d i d i
Distributed indexing
ƒ Maintain
Maintain a master
a master machine directing the indexing job 
machine directing the indexing job
– considered “safe”.
ƒ Break up indexing into sets of (parallel) tasks.
p g (p )
ƒ Master machine assigns each task to an idle machine 
from a pool.
p

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Introduction to Information Retrieval Sec. 4.4

P ll l t k
Parallel tasks
ƒ We will use two sets of parallel tasks
We will use two sets of parallel tasks
ƒ Parsers
ƒ Inverters
ƒ Break the input document collection into splits
ƒ Each split is a subset of documents (corresponding to 
p ( p g
blocks in BSBI/SPIMI)

31
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.4

P
Parsers
ƒ Master
Master assigns a split to an idle parser machine
assigns a split to an idle parser machine
ƒ Parser reads a document at a time and emits (term, 
doc) pairs
)p
ƒ Parser writes pairs into j partitions
ƒ Each partition is for a range of terms
Each partition is for a range of terms’ first letters
first letters
ƒ (e.g., a‐f, g‐p, q‐z) – here j = 3.
ƒ Now to complete the index inversion
o o co p e e e de e so

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Introduction to Information Retrieval Sec. 4.4

I
Inverters
t
ƒ An
An inverter collects all (term,doc) pairs (
inverter collects all (term,doc) pairs (= postings) 
postings)
for one term‐partition.
ƒ Sorts and writes to postings lists
p g

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Introduction to Information Retrieval Sec. 4.4

D t fl
Data flow
assign Master assign
Postings

P
Parser a f g-p
a-f g p q-z
qz I
Inverter
t a-ff

Parser a-ff g
a g-p
p q
q-z
z
Inverter g-p

splits Inverter q-z


Parser a-f g-p q-z

Map Reduce
Segment files
phase phase 34
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.4

M R d
MapReduce
ƒ The
The index construction algorithm we just described is 
index construction algorithm we just described is
an instance of MapReduce.
ƒ MapReduce (Dean and Ghemawat 2004) is a robust 
p ( )
and conceptually simple framework for distributed 
computing …
ƒ … without having to write code for the distribution 
part.
ƒ They describe the Google indexing system (ca. 2002) 
as consisting of a number of phases, each 
i l
implemented in MapReduce.
t di M R d
35
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.4

M R d
MapReduce
ƒ Index
Index construction was just one phase.
construction was just one phase.
ƒ Another phase: transforming a term‐partitioned 
index into a document‐partitioned index.
p
ƒ Term‐partitioned: one machine handles a subrange of 
terms
ƒ Document‐partitioned: one machine handles a subrange of 
documents
ƒ As
As we discuss in the web part of the course) most 
we discuss in the web part of the course) most
search engines use a document‐partitioned index … 
better load balancing, etc.
better load balancing, etc.

36
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.4

Schema for index construction in 
M R d
MapReduce
ƒ Schema of map and reduce functions
p
ƒ map: input → list(k, v)     reduce: (k,list(v)) → output
ƒ Instantiation of the schema for index construction
ƒ map: web collection → list(termID, docID)
ƒ reduce: (<termID1, list(docID)>, <termID2, list(docID)>, …) → 
(postings list1 postings list2 )
(postings list1, postings list2, …)
ƒ Example for index construction
ƒ map: d2 : C died. d1 : C came, C c
map: d2 : C died d1 : C came C c’ed ed. → (<C, d2>, <died,d2>, 
→ (<C d2> <died d2>
<C,d1>, <came,d1>, <C,d1>, <c’ed, d1>
ƒ reduce: (<C,(d2,d1,d1)>, <died,(d2)>, <came,(d1)>, 
<c’ed,(d1)>)  →  (<C,(d1:2,d2:1)>, <died,(d2:1)>, 
<came,(d1:1)>, <c’ed,(d1:1)>)
37
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.5

D
Dynamic indexing
i i d i
ƒ Up
Up to now, we have assumed that collections are 
to now, we have assumed that collections are
static.
ƒ They rarely are: 
y y
ƒ Documents come in over time and need to be inserted.
ƒ Documents are deleted and modified.
ƒ This means that the dictionary and postings lists have 
to be modified:
ƒ Postings updates for terms already in dictionary
ƒ New terms added to dictionary

38
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.5

Si l t
Simplest approach
h
ƒ Maintain “big”
Maintain big  main index
main index
ƒ New docs go into “small” auxiliary index
ƒ Search across both merge results
Search across both, merge results
ƒ Deletions
ƒ Invalidation
Invalidation bit
bit‐vector
vector for deleted docs
for deleted docs
ƒ Filter docs output on a search result by this invalidation 
bit‐vector
ƒ Periodically, re‐index into one main index

39
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.5

I
Issues with main and auxiliary indexes
ith i d ili i d
ƒ Problem of frequent merges –
q g yyou touch stuff a lot
ƒ Poor performance during merge
ƒ Actually:
ƒ Merging of the auxiliary index into the main index is efficient if we 
keep a separate file for each postings list.
ƒ Merge is the same as a simple append.
ƒ But then we would need a lot of files – inefficient for O/S.
ƒ Assumption for the rest of the lecture: The index is one big 
file.
file
ƒ In reality: Use a scheme somewhere in between (e.g., split 
very large postings lists, collect postings lists of length 1 in one 
file etc.)
40
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.5

L
Logarithmic merge
ith i
ƒ Maintain
Maintain a series of indexes, each twice as large as 
a series of indexes, each twice as large as
the previous one.
ƒ Keep smallest (Z
p ( 0)) in memoryy
ƒ Larger ones (I0, I1, …) on disk
ƒ If Z
If Z0 gets too big (> n), write to disk as I
gets too big (> n), write to disk as I0
ƒ or merge with I0 (if I0 already exists) as Z1
ƒ Either write merge Z
Either write merge Z1 to disk as I
to disk as I1 (if no I
(if no I1)
ƒ Or merge with I1 to form Z2
ƒ etc.
etc
41
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.5

42
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.5

L
Logarithmic merge
ith i
ƒ Auxiliary
Auxiliary and main index: index construction time is 
and main index: index construction time is
O(T2) as each posting is touched in each merge.
ƒ Logarithmic merge: Each posting is merged O(log T) 
g g p g g ( g )
times, so complexity is O(T log T)
ƒ So logarithmic merge is much more efficient for 
g g
index construction
ƒ But query processing now requires the merging of 
O(log T) indexes
ƒ Whereas it is O(1) if you just have a main and auxiliary 
i d
index

43
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.5

F th i
Further issues with multiple indexes
ith lti l i d
ƒ Collection‐wide
Collection wide statistics are hard to maintain
statistics are hard to maintain
ƒ E.g., when we spoke of spell‐correction: which of 
several corrected alternatives do we present to the 
p
user?
ƒ We said, pick the one with the most hits
ƒ How do we maintain the top ones with multiple 
indexes and invalidation bit vectors?
ƒ One possibility: ignore everything but the main index for 
such ordering
ƒ Will see more such statistics used in results ranking
Will see more such statistics used in results ranking
44
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.5

D
Dynamic indexing at search engines
i i d i t h i
ƒ All
All the large search engines now do dynamic 
the large search engines now do dynamic
indexing
ƒ Their indices have frequent incremental changes
q g
ƒ News items, blogs, new topical web pages
ƒ Sarah Palin, …
ƒ But (sometimes/typically) they also periodically 
reconstruct the index from scratch
ƒ Query processing is then switched to the new index, and 
the old index is then deleted

45
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.5

46
Introduction to Information Retrieval Sec. 4.5

Oth
Other sorts of indexes
t fi d
ƒ Positional indexes
Positional indexes
ƒ Same sort of sorting problem … just larger Why?
ƒ Building character n‐gram indexes:
g g
ƒ As text is parsed, enumerate n‐grams.
ƒ For each n‐gram, need pointers to all dictionary terms 
containing it – the “postings”.
ƒ Note that the same “postings entry” will arise repeatedly 
in parsing the docs need efficient hashing to keep track 
in parsing the docs – need efficient hashing to keep track
of this.
ƒ E.g., that the trigram uou occurs in the term deciduous will be 
d
discovered on each text occurrence of deciduous
d h f d id
ƒ Only need to process each term once
47
Introduction to Information Retrieval Ch. 4

R
Resources for today’s lecture
f t d ’ l t
ƒ Chapter
Chapter 4 of IIR
4 of IIR
ƒ MG Chapter 5
ƒ Original publication on MapReduce: Dean and 
Original publication on MapReduce: Dean and
Ghemawat (2004)
ƒ Original publication on SPIMI: Heinz and Zobel (2003)
Original publication on SPIMI: Heinz and Zobel (2003)

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