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O papel da Bioinformtica na pesquisa agropecuria Eduardo Fernandes Formighieri Podemos entender a Bioinformtica, de uma maneira simplificada, como a aplicao de cincia da computao resoluo de problemas das reas biolgicas. Ampliando um pouco, temos a Bioinformtica como uma rea multidisciplinar da cincia, envolvendo tecnologia da informao, biologia, matemtica, estatstica, qumica, fsica e outras disciplinas visando resolver problemas das cincias da vida, sendo principalmente aplicada a questes da biologia molecular. Como ela surgiu? O conhecimento cientfico aumenta em quantidade e qualidade a cada dia, e algumas pocas de grandes descobertas se tornam marcos. A genmica surgiu num desses momentos de mudana, e a gerao de quantidades de dados biolgicos cada vez maiores levou ao desenvolvimento de uma rea especfica de conhecimento, que permitisse manipulao confivel e rpida de grande quantidade de dados e que viabilizasse e ampliasse o potencial das pesquisas. Portanto, a bioinformtica suporta e potencializa muitas das tecnologias mais modernas na fronteira do conhecimento, como sequenciamento e fenotipagem de alta quantidade de dados (high throughput). Se, do ponto de vista do bioinformata, estamos falando de constante evoluo e de integrao de diferentes reas do conhecimento, do ponto de vista do usurio a bioinformtica essencialmente uma importante ferramenta, em alguns casos imprescindvel. E se uma ferramenta, bom lembrar que para o melhor resultado preciso utilizar a ferramenta correta da maneira correta. Como no exemplo da estatstica, em que a pesquisa deve incluir essa disciplina desde o planejamento do experimento, o bioinformata deve estar presente nas discusses de todas as fases dos projetos. Embora o estatstico e o bioinformata possam extrair informaes dos dados que tiverem em mos, a falta de planejamento correto pode prejudicar a otimizao dos resultados, podendo inclusive inviabilizar o cumprimento de metas. Como a complexidade dos sistemas e processos estudados pela bioinformtica gera muitos comportamentos imprevistos e/ou no controlveis para ser estudados nas pesquisas, podemos dispensar fatores adversos adicionais. Conceitos apresentados, vamos prtica. Como a bioinformtica se insere no contexto da agropecuria? Ou, onde e como pode ser aplicada e qual sua importncia? Utilizemos um exemplo da Embrapa Agroenergia, unidade da Embrapa que nasceu h poucos anos e que inclui o Laboratrio de Anlises de Bioinformtica (LAB) no prdio que ser sua base de atividades e que est em construo, com trmino previsto para o final deste ano. A pesquisa em Agroenergia inclui diversos aspectos (www.cnpae.embrapa.br), e entre eles est conhecer e melhorar as espcies potencialmente utilizveis como fontes renovveis de energia. Muitas destas linhas de pesquisa, como caracterizao molecular, melhoramento gentico, engenharia gentica ou mesmo conhecimento bsico sobre mecanismos moleculares das espcies, tem a alta produtividade e a obteno de resultados vinculadas aplicao de novas tecnologias e de bioinformtica. O sequenciamento de grande parte de um genoma pode ser feito em poucos dias, e a estrutura e as anlises de bioinformtica possibilitam que este tipo de informao seja organizado e disponibilizado de forma a facilitar a interpretao dos resultados, direcionando os prximos passos e auxiliando as concluses no final da pesquisa. A Bioinformtica no substitui a pesquisa de bancada e no cria informaes do nada. Os bioinformatas utilizam o conhecimento prvio e fazem comparaes e anlises especficas atravs de ferramentas computacionais, com velocidade e capacidade muito superiores s anlises feitas manualmente. Sendo assim, podemos dizer que a bioinformtica reduz enormemente o trabalho manual, direcionando o mesmo para casos especficos em que ele seja realmente necessrio e

acelerando e facilitando tomadas de deciso. Em outras palavras, a genmica e a bioinformtica, representando aqui tecnologias modernas de alta capacidade, direcionam as pesquisas para que os esforos fiquem concentrados nos casos em que seja mais provvel encontrar as melhores solues, potencializando o desenvolvimento. O Brasil j capaz de utilizar tecnologias de ponta em pesquisas de interesse nacional e mundial, o que motivo de orgulho. Seja em culturas como pinho manso, palma e cana-de-acar ou em florestas energticas e tratamento de resduos, seja em outras diversas reas de pesquisa agropecuria, existem pesquisas em andamento ou sendo planejadas onde a utilizao correta da bioinformtica imprescindvel para a obteno de bons resultados. Numa outra oportunidade trataremos de exemplos especficos de aplicao.

Eduardo Fernandes Formighieri possui graduao em Engenharia Agronmica pela Universidade de So Paulo (1998) , mestrado em Cincias (Energia Nuclear na Agricultura) pela Universidade de So Paulo (2002) e doutorado em Biologia Funcional e Molecular pela Universidade Estadual de Campinas (2006) . Atualmente Pesquisador A da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuria, Embrapa Agroenergia, Braslia (DF). Tem experincia na rea de Bioqumica , com nfase em Biologia Molecular. Atuando principalmente nos seguintes temas: genomas, sequenciamento, protenas. Contato: eduardo.formighieri@embrapa.br

Reproduo autorizada desde que citado a autoria e a fonte Dados para citao bibliogrfica(ABNT):
FORMIGHIERI, E.F.. O papel da Bioinformtica na pesquisa agropecuria

2010. Artigo em Hypertexto. Disponvel em:

<http://www.infobibos.com/Artigos/2010_3/bioinformatica/index.htm>. Acesso em:

22/12/2010

Publicado no Infobibos em 16/09/2010