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mircoles, 16 de febrero del 2011 | la voz de la escuela

La dcada prodigiosa de la genmica

La secuenciacin del genoma humano hace diez aos propici nuevos descubrimientos y revolucion la gentica
La secuencia del genoma humano ha cumplido diez aos. Fue el 26 de septiembre del 2000 cuando el presidente de EE. UU. y el primer ministro britnico anunciaron que los dos consorcios de secuenciacin, el pblico y el privado, haban completado el proyecto. En aquella archifamosa rueda de prensa Bill Clinton dijo cosas como que con este profundo nuevo conocimiento, la humanidad est a punto de conseguir un inmenso nuevo poder para curar. Revolucionar la diagnosis, la prevencin y el tratamiento de muchas, si no de todas, las enfermedades humanas. Adems, la nota que difundi la Casa Blanca deca que comenzaba la nueva era de la medicina molecular, una era que traera nuevas formas de prevenir, diagnosticar, tratar y curar las enfermedades. Sin embargo, diez aos despus, la revolucin mdica anunciada no est ni se la espera. Pecaron de excesivo optimismo Bill Clinton y los responsables de Celera Genomics y del Human Genome Project? Derrocharon el dinero de los contribuyentes y los accionistas en un proyecto multimillonario de cuestionable utilidad? Qu ha resultado nalmente de todo aquello?

> Francisco J. Franco del Amo

pacofranco2@gmail.com

Una gran aventura

Para valorar el proyecto Genoma en sus justos trminos habra que comenzar diciendo que ha sido una de las aventuras cientcas ms inuyentes de la historia. Con ocasin del dcimo aniversario de la secuencia, la revista Nature realiz una encuesta en la que participaron centenares de cientcos de diferentes pases. El 69% de los encuestados dijo que el proyecto les haba inspirado, bien para ser cientcos o bien para variar el rumbo de sus investigaciones. El 90% opinaron que su propia investigacin se haba beneciado de los resultados y una tercera parte confesaron que utilizaban la secuencia a diario. Unas cifras realmente impresionantes. Nature tambin utiliz la encuesta para evaluar cmo se PAUL HEBERT (PLOS BIOLOGY) enfrentaban los investigadores a la enorme cantidad de informa- La pulga de agua (Daphnia pulex), rcord de genes del mundo animal cin sobre su propio genoma que estaban recibiendo. El 15% dijeron que se haban p53 tiene cientos de ellas); o la epigentica, una hecho un anlisis gentico y un 13% confesaron que disciplina que trata de descifrar el papel gentico haban secuenciado parte de su propio ADN. Al de las modicaciones qumicas que sufre el ADN preguntar si se haran la prueba si tan solo costase durante la vida de las clulas (de ah su nombre, 70 euros, un 60% respondieron armativamente. que signica literalmente encima de los genes). Por ejemplo, recientemente se descubri que las Y DE PREMIO, MS INCGNITAS Y UNA REVOLUCIN clulas embrionarias recuerdan cul es su destino Por otro lado, como ya ha sucedido tantas otras en el individuo adulto gracias a que ciertas molveces en la historia de la ciencia, para los investi- culas, como las histonas o el CH3, se pegan a los gadores del proyecto Genoma llegar a la meta no genes y actan como una memoria qumica. Estas signic resolver el problema, sino encontrar una molculas permanecen en su sitio incluso cuando buena coleccin de nuevos enigmas. La primera los cientcos reprograman las clulas adultas para gran sorpresa fue que el nmero de genes de los convertirlas de nuevo en clulas embrionarias, humanos era ms bien bajo en comparacin con por lo que la memoria qumica del genoma es un el de otras especies: se esperaba que tuviramos asunto que tendrn que afrontar si quieren tener 100.000 genes, pero solo se descubrieron 21.000. xito en utilizar las famosas clulas embrionarias Hace poco se ha sabido que el animal con ms inducidas (iPS) para regenerar tejidos enfermos. genes es la pulga de agua (Daphnia pulex); tiene Curiosamente, en la poca posgenoma los genes 31.000, lo que le permite superar al hombre en han tenido que compartir el trono de la gentica. un 50%. Hasta hace poco se crea que la actividad del geAs pues, completar la secuencia de nuestro ge- noma estaba regulada por protenas fabricadas noma permiti descubrir que la base gentica por genes, pero ahora se sabe que los pequeos de nuestra humanidad no estaba en los propios fragmentos de ARN fabricados por la parte no-gen genes, sino quiz en la forma en que estos funcio- tambin manejan el cotarro. La parte no-gen es lo nan y en esa otra parte del genoma que no est que antes se llamaba ADN basura y representa compuesta por genes. Este descubrimiento dio entre el 74% y el 93% del genoma. Todava se desimpulso a nuevas ramas de la biologa, como la conoce gran parte de su funcin, por lo que viene protemica, que estudia las distintas funciones a ser algo as como el equivalente biolgico a la que puede llegar a tener una protena humana (la materia oscura del universo.

Secuenciacin del ADN reproducida a tamao extragigante en la Domus de A Corua

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Valor aadido
Al igual que sucedi con la aventura lunar, la secuenciacin del genoma humano impuls el nacimiento y desarrollo de nuevas tecnologas. Las actuales mquinas de secuenciar ADN funcionan a velocidades de vrtigo si las comparamos con las de hace diez aos. Adems, el coste de secuenciar un genoma es hoy 14.000 veces menor que hace diez aos. Por otro lado, la biologa computacional ha desarrollado herramientas informticas que sirven para analizar y comparar enormes cantidades de informacin gentica. Ambas tecnologas han permitido afrontar nuevos proyectos de secuenciacin a gran escala e iniciar la segunda fase de la genmica humana, que est centrada en estudiar la gentica a nivel personal para, por ejemplo, establecer el origen de las diferentes respuestas a los medicamentos o la susceptibilidad a ciertas enfermedades. Uno de los proyectos ms interesantes en este sentido es el International Cancer Genome Consortium (www.icgc. org), cuyo objetivo es realizar estudios genticos de los 50 tipos de cncer ms importantes a nivel clnico y social en diferentes partes del mundo. Se pretenden estudiar ms de 25.000 genomas cancergenos, para luego compararlos y establecer cuales son las mutaciones oncognicas. Varios centros de investigacin espaoles participan en este megaproyecto secuenciando el genoma de la leucemia linfoctica crnica. Tambin se est tratando de averiguar qu mutaciones provocan la esclerosis

ALBERTO ESTVEZ / EFE

Sensores miniaturizados que en pocos minutos permiten secuenciar el ADN

mltiple secuenciando y comparando los genomas de dos gemelos idnticos, uno enfermo y otro sano. Y durante la fase piloto del proyecto 1.000 Genomas (www.1000genomes.org) se han secuenciado y comparado los genomas completos de 179 personas. Como resultado se ha obtenido un catlogo de 9 millones de pequeas alteraciones en la secuencia. Ahora se trata de establecer la relacin entre esas variaciones y las enfermedades hereditarias y otros rasgos importantes desde el punto de vista mdico. Es muy posible que esta parte de la genmica tenga un rpido desarrollo, porque secuenciar nuestro propio genoma va a ser relativamente barato (se calcula que pronto una secuencia completa cos-

tar en torno a los 900 euros) y los datos se acumularn con rapidez. Por ltimo, proyectos como la Enciclopedia de los elementos del ADN (http://www.genome. gov/10005107 ) tratan de localizar todos los genes del genoma y determinar cules se apagan o encienden en cada tejido. Y los avances no se restringen a los seres humanos. Ya se ha completado la secuencia del genoma de 14 mamferos y de muchos otros vertebrados, invertebrados, plantas, hongos y microorganismos. En total, existen 3.800 genomas completamente secuenciados. Esto ha permitido que la genmica comparativa se haya convertido en una herramienta fundamental para comprender la evolucin de las especies.

> RECURSOS
La revista Nature celebr el dcimo aniversario de la secuenciacin del genoma humano con un nmero especial y una magnfica pgina web (www.nature. com/news/specials/humangenome ) que contiene artculos, pelculas y archivos sonoros. Adems, aconseja libros que se pueden consultar para saber ms sobre el genoma. Nature incluso cre una aplicacin gratuita para el iPad que permite el acceso a estos contenidos. La ilustracin de la portada de la revista recurre a la imagen de la bombilla, de la que surge la doble hlice de ADN, y destaca el ttulo: El futuro es brillante.

EDGE.ORG

Segn J. Craig Venter, el reto de la genmica es relacionar la variacin gentica humana con ciertas enfermedades

El futuro
As pues, est claro que, aunque la secuencia de nuestro genoma no trajo consigo la revolucin biomdica inmediata, s produjo un profundo impacto en el progreso cientco. Francis Collins, director entre 1993 y el 2008 del consorcio pblico de secuenciacin del genoma humano, cree que la genmica obedece a la primera ley de la tecnologa, que dice que invariablemente sobrestimamos el impacto a corto plazo de las nuevas tecnologas y subestimamos su impacto a largo plazo. Entonces, qu viene a continuacin? Segn el propio Collins quiz la consecuencia ms profunda a largo plazo de la revolucin genmica ser el desarrollo de terapias basadas en la comprensin molecular detallada de la patognesis, es decir, que quiz en un futuro no muy lejano veremos medicamentos preparados especcamente para cada uno de nosotros, una vez analizado nuestro genoma del mismo modo que hoy realizamos un anlisis de sangre rutinario. Por su parte, Craig Venter, fundador y director en el 2000 de Celera Genomics, opina que el prximo reto de la genmica ser conseguir relacionar la variacin gentica humana con ciertas enfermedades y caractersticas siolgicas. Para lograrlo, habr que utilizar superordenadores que comparen miles de genomas individuales con bibliotecas de datos fenotpicos. Tambin cree que, en un futuro ms lejano an, se obtendr el genoma no de una persona, sino de un cierto tipo de clulas de esa persona, lo que permitir seleccionar clulas saludables para utilizar en la reparacin de tejidos daados por la enfermedad.

FUCO REI