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Replicación del ADN

Gabriela Azofeifa

Vamos a repasar entonces un par de cositas que yo se que ustedes ya vieron en una de
las clases al principio del curso por si acaso no se acuerdan ;en la clase de hoy vamos a
estar muy centrados en estos dos términos que necesito que ustedes se acuerdan bien.
Las diferencias entre las células procariotas y las células eucariotas, se acuerdan cual es
la diferencia principal entre estos dos: compartimentalización y especialmente lo que es
el núcleo, es lo que vamos a centrar hoy, efectivamente las eucariotas tienen diferente
organelas y todo compartí mentalizado dentro de la células y especializado en la
diferentes funciones cada organela, mientras que los procariotas solo tienen una
membrana externa y todo incluido verdad ahí adentro, inclusive el ADN que es lo que
vamos a estar hablando hoy, entonces vamos a tener el ADN disperso ahí, concentrado
en una pequeña región que se le llama nucleoide pero realmente no esta delimitado por
una membrana, entonces no se dice que es un núcleo verdadero, mientras que en las
eucariotas si tenemos una membrana que protege al ADN.

Ejemplos de Eucariotas quienes serian, ¿quienes tienen células eucariotas? Todos los
animales, verdad, ustedes tienen células eucariotas cierto, todas las plantas, desde los
hongos, las levaduras ya son células eucariotas, mientras que los procariotas estamos
hablando en general de las bacterias y entonces hoy vamos a estar hablando de
procesos que se dan en la biología molecular y que son diferentes para las procariotas
y para los eucariotas entonces yo voy a estar enfatizando esto en esta diferencia y Por
eso necesito que recuerden bien el termino, los ácidos nucleicos, ya ustedes recibieron
una clase de esto y ya les hablaron de los componentes y de los ácidos nucleicos,
entonces teníamos las bases nitrogenadas, ¿se acuerdan? verdad que son pequeños
anillos que tienen carbonos y nitrógenos ahí intercalados y tenemos dos tipos ahí las
purinas y las pimidinas y las diferencia es que las purinas van a tener dos anillos
juntos, mientras que las pirimidinas tienen un solo anillo, y los ácidos nucleicos tienen
otro componente que son los azucares, tendremos dos tipos de azucares que componen
los ácidos nucleicos, y que hablamos de la ribosa y la desoxirribosa y ¿cual es la
diferencia entre la ribosa y la desoxirribosa? El OH ¿en que posición? El carbono,
entonces la diferencia va estar en el carbono 2, efectivamente por si empiezan a contar
desde aquí, 1-2-3-4, tenemos un OH extra en el caso de la ribosa y aquí lo que tenemos
es un hidrogeno, verdad, mientras que en la posición 3 ambos tienen un OH, eso
tenemos que tenerlo muy claro ahora ok

El azúcar, algunos azucares de los que se llaman Ribosa tienen OH, están en la posición
2 hasta la posición 3 mientras que las desoxirribosas solo están en la posición 3.

¿Cómo era que juntábamos esas tres moléculas, si ustedes ya estudiaron para tener una
famosa molécula de ADN? Y estas estructuras que ustedes ya vieron, aquí estas que
están en celeste serian los azucares, estos que están como en verde claro las bases
nitrogenadas, y la molécula que une todo eso, verdad, los azucares y las bases
nitrogenadas con otras bases nitrogenadas son los famosos fosfatos, si yo les hablara de
los tres componentes principales de las estructuras químicas que componen el ADN:
bases nitrogenadas fosfato y el azúcar , este que esta puesto aquí ¿que seria?, este tipo
de azúcar, que seria ¿una ribosa o una desoxirribosa? Es desoxirribosa. Perfecto,
entonces el azúcar va a enlazarse en carbono uno, con la base nitrogenada y aquí viene
un punto muy importante que necesitamos tener muy claro hoy, en el carbono 3 se
puede unir un fosfato, pero también en el carbono 5, puede unirse otro fosfato. Ok

Un azúcar de los ácidos nucleicos puede unirse en el carbono 3 a un fosfato y el


carbono 5 puede unirse a un fosfato y ese fosfato a su vez se va a unir con el carbono 3
del siguiente azúcar y así es como se empiezan a afinar todas las bases nitrogenadas y
podemos tener secuencias inmensas. Enlazar un fosfato con el azúcar una azúcar de
vecino pero en la posición 3 y una azúcar en la posición 5. ¿Cómo se llaman esos
enlaces? Entre el azúcar y el fosfato fosfodiéster y ¿los enlaces entre este azúcar y la
base nitrogenada? Glucosídicos Y luego vamos a tener una cadena de estas verdad que
tiene azucares y bases nitrogenadas frente a otra cadena, y eso es lo que hace las doble
hebra del ADN, De forma que las bases nitrogenadas de una interactúan con las bases
nitrogenadas de otra, en este tipo de enlaces que se llaman puentes de hidrógeno ok.
Eso es lo que necesitamos saber para poder ver la clase de hoy.

Que es lo importante aquí:

Una vez que usted ponga cientos de nucleótidos juntos el ultimo nucleótido, digamos
que este fuera el ultimo, va a tener un fosfato pegado en la posición 5 mientras que el
ultimo que va a estar aquí ¿adonde va a estar pegado? En la posición 3

Entonces no es igual un extremo que otro, porque en un extremo el fosfato va a estar


pegado en la posición 5, mientras que en el otro extremo va a estar pegado el fosfato
esta pegado en la posición 3 y entonces decimos que la molécula de ADN tiene
polaridad. No es lo mismo de un lado hacia el otro Y las hebras, una de las hebras
del ADN va a juntarse con otra, con una hebra complementaria, pero que se dice
antiparalelo o antisentido ¿Qué quiere decir eso? Que si aquí termino con 5 la siguiente
es la molécula complementaria va a tener la posición 3 prima es donde va a tener el
fosfato. Ok

Y si aquí también terminaba con 3 , en la posición 3 era donde tenia el fosfato, en la


complementaria la que va a tener es la posición 5 , entonces voy a dibujarlo por aquí, si
tenemos una hebra de ADN, con todos sus azucares, el ultimo azúcar aquí va a tener la
posición libre en el 3 prima, y el primer azúcar que va a estar aquí va ha ser el 5 prima
y la cadena complementaria va a ser al revés antiparalelo si aquí tenia el 5 prima libre y
aquí va a tener el 3 prima, aquí va a tener el 5 prima y ustedes saben que quiere decir
esos 5 prima
Es tener el fosfato pegado en esa posición o tenerlo en esta posición.

Necesito que entiendan toda esta parte primero o que la tengan clara, yo se que ustedes
ya saben. Y bueno lo otro que ustedes ya hablaron fueron las diferencias entre el ADN
Y ARN.

¿Cuales son las diferencias entre ADN Y ARN?

El ADN tiene una doble hélice y el ARN tiene simple banda.


Las diferencias entre las bases nitrogenadas
El azúcar en ARN es una ribosa y en el ADN una desoxirribosa
Cuando nos referimos al genoma de un organismo hablamos de todo el ADN que tenga
su células de un organismo, no importa si codifica si no codifica, si le sirve no importa
que sea, si es ancestral, si es muy evolucionado. Todo ADN de un organismo constituye
su genoma. ¿Cual es la diferencia con un gen? Cual es la diferencia entre el genoma y
el gen? El Gen es solo un pedazo de ese ADN que sirve para producir una proteína y
vamos a centrar nuestra clase en ese proceso. Empezamos a hablar de un pedazo
determinado desde aquí hasta aquí y tiene una tamaño determinado y no todos los
genes son del mismo tamaño cuando hablamos de diferenciación génica ¿a qué nos
referimos?, nos referimos más bien a que las diferentes células del cuerpo cada una
expresa genes diferentes un ser de genes diferentes entonces las células de esos huesos
expresan solo genes que le sean útiles a esos huesos mientras que las células del
páncreas lo que están expresando es insulina pero sus células de huesos no van a
expresar la insulina verdad, no tiene sentido

Eso es lo que se llama diferenciación génica o diferenciación genética, cada célula se


especializa en expresar ciertos tipos de genes que son los que le ayudan a cumplir su
función. Ahora que quiere decir; que las células del páncreas no tienen la información
para ser neuronas, sí, pero no la expresan la tienen silenciada.

Todas las células tienen todo el genoma , todas las células tienen todo el ADN, la
diferencia en que unas células expresan una parte y otras células expresan otra parte,
hay una cosa que los biólogos moleculares le llaman el dogma central de la biología
molecular y esta es la figura que esta en su libro. Finalmente aunque la biología no
tiene dogmas pues este proceso se le llama así incorrectamente hablando, pero que
quiere decir esto, quiere decir como se transmite la información en una célula que lo que
tiene es un montón de adeninas, guaninas, timinas, y citosinas y como logran producir
moléculas funcionales, moléculas como la insulina que ustedes ya han hablado en el
curso muchas veces de la insulina y de todo lo que hace la insulina, verdad.

Entonces como es que pasamos de tener adeninas, guaninas, timinas, y citocinas, ahí
afiladas y eso me sirve para que al final yo tenga una molécula donde, con un montón
de aminoácidos y súper compleja, secundaria y terciaria y todas esas cosas, y dominios
proteicos que ya ustedes saben, como fluye esa información, entonces todas las células
de ese sistema que fluye la información ha sido perpetuado en toda la existencia , eso es
lo que lo hace ser sumamente exitoso e interesante, como es que las células desde las
bacterias hasta , como las plantas y los animales todos usamos sistema de transmisión
¿Y en que se basa ese sistema , ese sistema se basa en 3 partes:

La molécula del ADN, que es la que guarda la información y la que tiene las
instrucciones para generar proteínas, que tienen moléculas activas y que tienen
funciones, participan en el metabolismo y participan en muchos procesos y son
estructurales entonces las moléculas que realmente hacen el trabajo, son las proteínas y
la información que esta en el ADN.

Ahora que pasa cuando uno compra un libro y lo usa todos los días como el libro de
bioquímica de ustedes, que le pasa a ese libro, si yo compro el mismo libro que ustedes
pero yo no estoy llevando el curso, entonces lo dejo guardado en el escritorio y a
diferencia que ustedes compraron el libro y todos los días lo usan , al final del semestre
como va a estar el libro de ella en comparación al mió, usado y gastado verdad,
arrugado, doblado, cierto o no y espero que el de ustedes este muy usado y arrugado
Esto es lo que va a pasar con el ADN muchachos, si el ADN lo estamos leyendo y cada
vez que necesitamos una proteína venimos y accedamos al ADN, y lo leemos y estamos
chequeando las instrucciones para generar la proteína, finalmente ese ADN se nos puede
dañar, y podría empezar a tener daños y mutaciones, a quebrarse y a romperse, entonces
eso seria muy grave para las células, si ustedes el libro de bioquímica se les quema y se
les despedaza no pasan el curso. Que esa no es la idea, por eso lo cuidan mucho.

Por eso la célula tiene sistemas de información pero lo tiene protegido, solo lo consulta
de vez en cuando y en vez de estar consultando el libro siempre sacamos, una fotocopia
y la fotocopia es la que consultamos siempre y esa la rayamos y la dibujamos y le
hacemos manchones y estudiamos con el café a la par y se riega el café y todo lo demás.

Entonces saquemos una fotocopia y usamos la fotocopia y el libro queda bastante bien
eso es lo que es el ARN, todas las células usan ese mecanismo, todas las células tienen
su base de información en el ADN, sin embargo solo lo leen de vez en cuando y sacan
una copia temporal, una copia temporal que es la del ARN , y este ARN es decir muchas
veces lo leemos y lo estamos utilizando para producir proteínas, imaginasen si cada
molécula de glucagón que ustedes necesitaran por cada una , tendrían que acceder al
ADN , ese ADN se va a dañar. Entonces mejor hago una copia en versión ARN y cada
vez que necesito glucagón, entonces si se me daña no importa ¿Por qué que pasa si se
me daña el ARN? Vuelve a copiar el ADN

Y la evolución ha creado un sistema tan inteligente y tan perfecto como este que
custodia la información básica y por eso la tenemos protegido en histonas y no la
consultamos tan a menudo, sino que consultamos la copia entonces al ARN tiene una
vida media más corta que el ADN, es más activo químicamente. El famoso grupo OH en
la posición dos hace que sea más reactivo. El Proceso
Trascripción proceso en el que tomamos una molécula de ADN y lo convertimos en
ARN. El proceso de hacer proteínas traducción. ¿Todo el ADN de mi célula del hígado
se transcribe? No verdad. Lo mismo que hablamos antes solo los genes para que sea
hígado se transcriben. Muchas de nuestras células se dividen las células de la piel, tracto
gastrointestinal se dividen, cada vez que una célula se divide le tiene que heredar el
paquete de genes a sus hijas si usted se va a dividir le tiene que dar el libro original de
bioquímica a sus hijos, y las copias si se pueden deshacer de ellas. Entonces el proceso
en el que una célula se divide y le tiene que dar un paquete de genes a sus hijas se llama
replicación. Hoy vamos a empezar con replicación.

Replicación
Empezamos con una molécula de ADN original y vamos a terminar con una ADN
también.
Replicación y duplicación son sinónimos, depende del libro en el que lo lean. Que
quiere decir el proceso de duplicación, generar una copia basados en una célula original,
y eso es muy fácil. Porque es muy fácil, si yo les doy una secuencia de ADN ustedes me
pueden sacar una copia, si verdad, porque? Por la complementariedad de las bases
entonces quien es complementaria con quien adenina con timina y guanina con citosina,
esas son las bases que son complementarias entonces es muy fácil generar una copia de
una molécula; el ADN se duplica solo cuando la célula va a duplicarse. Las neuronas de
nosotros como no se dividen más normalmente no hacen duplicación, mientras que las
células de su piel constantemente se dividen, entonces tenemos unas bandas originales
que son estas que están en amarillo y vamos a generar una copia. Ahora esa copia podría
seguir tres posibles modelos uno es el conservativo, que la duplicación fuera
conservativa, que quiere decir que fuera conservativa que si este es el ADN original ( el
azul) saquemos una copia (roja) ambas hebras del ADN van a ser nuevas y las hijas se
dejan las copias, esa podría ser una opción. Modelo disperso que quiere decir el modelo
disperso, si las originales fueran las azules yo voy a generar una copia en rojo en este
caso, y ahora intercalo pedazos cambio partes de pronto aquí el pedazo rojo se , o paso
al azul, y las mezclo y eso se llama un modelo disperso en una sola hebra hay pedazos
azules y pedazos rojos, hay pedazos nuevos y pedazos viejos, pedazos que ya existían y
otros que se acaban de sintetizar. La tercera opción es el modelo semi-conservativo y
dice la verdad es que si tengo dos bandas originales, voy a sacar una copia de cada uno
y en una célula dejo una original y una copia, y una original y una copia, y cual es el
mejor modelo, y hace unos setenta años que no se sabía cual era los tres podrían ser
viables, había que demostrar cual era. ¿ que ventajas tendría el modelo conservativo?

In vivo y aquí lo puse el que ocurre es le semi-conservativo, cada célula hija hereda una
hebra original y una hija. Cual ventaja o desventaja le observan al conservativo, por que
la evolución no selecciono este, el problema es que si usted tiene solo unas nuevas y
otras viejas como puede saber si existe error, no tiene la posibilidad de comparar y
corregir. Y este otro disperso que dirían ustedes. Eso de estar cortando y pegando es
muy riesgoso, empezar a pegar cosas incorrectas, de comerme una base de pronto.
Entonces el que ocurre en la naturaleza es el in vivo. Hubo un experimento para
averiguar esto, como en el 58 aún no se sabía cual era, unos señores desarrollaron un
experimento que no lo voy a desarrollar en esta clase pero entonces si quiero que lo
sepan, y voy a dejar una copia para que estudien el experimento.

Ahora si vamos a empezar hablando del proceso de duplicación en procariotas luego


vamos a ver las diferencias con los eucariotas ( no se escucha). Mientras el ADN está
cerrado, la bases nitrogenadas estén con sus puentes de hidrogeno es difícil duplicar ese
ADN, porque como hacemos para leer, necesitamos meternos en el medio y decir mira
esto es una adenina, entonces el primer paso para duplicar el ADN es generar lo que se
llama una horquilla de replicación, es abrir una pequeña burbuja en el ADN, ¿cuales
enlaces se están rompiendo ahí? Puentes de hidrógeno verdad. Ojo que los enlaces
fosfodiéster siguen intactos, los enlaces glucosídicos siguen intactos verdad, igual los
azúcares están unidos a las bases nitrogenadas, lo único que se rompen son puentes de
hidrógeno, y entonces se generan horquillas de replicación, eso es lo que ocurre, es el
primer paso romper el ADN para que quede en simple banda y poder leer la
información, y sacar una copia. Ahora resulta que ese ADN no se puede abrir en
cualquier lugar, hay sitios específicos que se llaman orígenes de replicación (Ori). Un
origen de replicación es una secuencia característica que le dice aquí es donde vamos a
empezar la replicación, y por allá hay otros Ori y también inicia la replicación, dicen
que los Ori son muy ricos en timinas y adeninas debido a que tienen solo dos puentes de
hidrógeno, es más fácil abrir el ADN.

Saben la diferencia entre horquilla de replicación y origen de replicación son dos cosas
diferentes, el origen estamos hablando de la secuencia en sí, y la horquilla del espacio,
la burbuja donde se va a dar la replicación. Que necesitamos para duplicar un ADN, lo
primero que necesitamos es un ADN molde, no ocurre sin el molde, en la célula solo se
peguen adeninas, citosinas, si son complementarias a una secuencia molde.
La enzima encargada de abrir esas horquillas de replicación de romper los puentes de
hidrógeno que están aquí, de abrir espacios para que podamos leer, son las helicasas.
Las helicasas que hacen, rompen los puentes de hidrógeno y permiten abrir la horquilla
de replicación, donde empiezan las helicasas, en los Ori. Las helicasa van a separar la
doble hélice, la helicasa es hexamérica tiene seis dominios, y en los seis dominios se
introducen o organizan alrededor de sto , entonces lo podríamos ver así, las helicasas
son bastante rápidas, podrían abrir hasta mil pares de bases. Entonces lo primero que
necesitamos en la lista fue un ADN molde, lo otro que estamos necesitando para usar
son las helicasas, las helicasa son las que abren. Siguiente.

El tercer requisito que necesitamos para replicar el ADN son unas proteínas que
llamamos ssb, proteínas ssb se les da el nombre por sus siglas en ingles, proteínas de
unión a ADN en simple banda, y se les abrevia como ssb, estas proteínas van detrás de
la helicasas, una vez que la helicas va abriendo aquí, todos estos pedazos que quedan en
simple banda tienden a cerrarse, ayudan a las helicasa ¿ por qué? Si las helicasas irían
abriendo el ADN y este como está en simple banda tendería a doblarse sobre si mismo y
tratar de formar algunos puentes de hidrógeno, entonces la proteína ssb conforme la
helicasa va abriendo este enlace, se van pegando al ADN que está en simple banda y
ayudan a mantener este ADN estirado. Que más necesitamos, si usted va a sintetizar una
cadena de ADN nueva va a necesitar nucleótidos libres (dexosi nucleótidos). La que
necesitamos ahora es la enzima más importante es la ADN polimerasa.

La ADN polimerasa es la que realmente hace todo el trabajo, tiene una especie de canal
donde introduce la molécula de ADN y una vez que están separadas las bandas en
simple hélice lee la banda que está es simple hélice y se fija y dice mira tiene una
adenina y toma una timina y se la pega a la nueva cadena que va creciendo. El trabajo
de la polimerasa es localizar el nucleótido adecuado y pegárselo ala cadena que va
creciendo.

Ahora ¿por qué la polimerasa es una proteína tan importante? Porque si alguien se va a
equivocar son la helicasas, no sería tan dramático, verdad; quien es la que se puede
equivocar y si sería algo grave, la polimerasa. Es por eso que la polimerasa tiene la
función más crítica, verdad; ella es la que se puede equivocar, hay dos opciones que ella
se equivoque al tomar un nucleótido que no le corresponda, entonces esta enzima es
muy compleja y trata de garantizarse que su trabajo va a ser perfecto. Si las polimerasas
de nosotros comenzaran a equivocarse muy a menudo significaría que sus células y sus
células empezarían a mostrar mutaciones, hay familias que tienen polimerasas que
tienden a equivocarse un poquito más a menudo que otras y por eso son familias más
susceptibles a padecer cáncer, es por eso que de lo que dependen es d una polimerasa
que se equivoco más veces y generó más mutaciones y hizo a esa célula que empezara a
duplicarse anormalmente. Es por eso que hay diferentes calidades de polimerasas ( no
se entiende). Entonces la polimerasa para garantizar no equivocarse lo primero que hace
es pegar el nucleótido y lo segundo que hace es que verifica que lo que haya pegado sea
lo correcto. Entonces eso se llama mecanismo de corrección de prueba, antes de hablar
de esto.

La polimerasa siempre sintetiza en dirección de cinco prima a tres prima, que quiero
decir con esto, que la primera base que pegue, que ella ponga aquí va tener un azúcar
pegado y va a pegar un montón más y el ultimo azúcar que ella ponga con su respectiva
base nitrogenada va a tener el extremo tres prima libre., y si yo pregunto como lee la
polimerasa, si ella sintetiza de cinco a tres quiere decir que lo que está leyendo, usando
de molde es de tres a cinco. Esto tiene que tenerlo muy claro, ella sintetiza de cinco a
tres pero lee de tres a cinco, entonces depende de lo que le este preguntando en el
examen, verdad. Si la polimerasa sintetiza de cinco a tres lee de tres a cinco, depende de
lo que les este preguntando.

Entonces la polimerasa sintetizó el primer nucleótido que tenía el extremo cinco libre
luego el segundo, tercero…, y el que acaba de poner tiene el extremo tres prima libre,
de pronto la polimerasa se equivoca, y mete una citosina que tiene un asterisco, que
quiere decir una citosina que estaba mal, que debería a ver puesto hay una timina
verdad, entonces la polimerasa se equivocó, pero yo les dije la polimerasa no solo es
muy selectiva, sino que pone el nucleótido y cuando lo pone se fija para ver si el que
puso lo hizo bien, entonces eso es lo que se llama corrección de prueba, que hace la
corrección de prueba, fijarse en el nucleótido anterior y si esta mal puesto, la polimerasa
lo detecta y lo elimina, y trae el correcto y lo pega.
Entonces se dice que la corrección de prueba es en dirección tres cinco, ¿por qué tres
cinco? Ella va sintetizando cinco tres pero cuando quiere quitar el anterior tiene que
devolverse un paso, así que es tres cinco. La polimerasa siempre hace eso nucleótido
que pega nucleótido que revisa, si esta bien continúa. ( alguien pregunta no se entiende)
La polimerasa tiene subunidades, tiene una que polimerasa, y otra que se llama
exonucleasa, que hace corta, entonces es la misma polimerasa hablamos de una
holoenzima, tiene partes especializadas, una pega otra corta. Corta en tres cinco ya
habíamos dicho la corrección de prueba, cuando hablo de polimerasa sintetizo, cuando
hablo de exonucleasa hablo de cortar. ( no se entiende)
Todas las polimerasas sintetizan de cinco a tres, actividad exonucleasa cinco a tres eso
que quiere decir que quita algo que me este estorbando, solo la tiene la polimerasa I.
La polimerasa tres que características tenía, no podía empezar sola, iba de cinco a tres,
si puede revisar hacia tres prima, ella solita la podemos dividir en subunidades, pero no
lo vamos a hacer. Hay una subunidad que se llama complejo gamma que le ayuda a la
polimerasa para que una vez que está unido al ADN no se despegue, eso se dice que
mejora la procesividad. Les dije entonces, como lo vimos en el cuadro que todas las
polimerasa sintetizan de cinco a tres, ninguna que sintetizara de tres a cinco, cierto;
entonces tenemos un problema, porque una de mis hebras sintetiza de cinco a tres pero
la otra yo necesitaría un extremo tres prima, cual sería una solución tener una
polimerasa que sintetice de tres a cinco, pero no la tenemos, entonces necesitamos otra
solución, que hace la naturaleza sintetiza de esta forma, una polimerasa se une aquí,
luego de que una helicasa rompe los puentes de hidrógeno, se une aquí al extremo tres
prima y comienza a sintetizar, muy bien, esa no tiene problema, la otra banda que me
proporciona un extremo cinco prima no permite la síntesis, la polimerasa va al revés,
esta banda se llama la banda rezagada, se sintetiza por partes, la otra que si se puede
sintetizar en un solo movimiento se le llama la cadena líder.
La cadena rezagada se va a sintetizar por pedazos, siempre siguiendo la dirección
cinco tres, entonces hacia acá al revés. Cada uno de esos pedacitos de la cadena
rezagada se llaman fragmentos de okasaki, porque los descubrió un señor okasaki.
( varias personas preguntan).
La polimerasa no puede empezar sola, necesita que aquí halla un azúcar, que le de un
extremo tres prima, luego puede sintetizar, que quiero decir con esto que la polimerasa
no puede poner el primer nucleótido, el segundo, tercero si pero el primero no.
Cómo hace la célula para solucionar esto, la célula tiene una enzima diferente llamada
primasa, la primasa si puede poner el primer nucleótido. Entonces está el ADN en
simple banda ya que las helicasas lo abrieron y viene la primasa y pega el primer
nucleótido, ella si puede, cual es el inconveniente que tiene la primasa que lo que
sintetiza es ARN, quiere decir que los azúcares que está poniendo aquí tienen un OH
aquí. El defecto que tiene la primasa, la primas es muy buena porque puede sintetizar el
primer nucleótido, pero es ARN, tenemos un pedazo de ARN, pero viene la polimerasa
y comienza a sintetizar.

Entonces que pasa en los fragmento de okasaki que teniamos aquí, cada fragmento de
okasaki necesito de un extremo entonces la cadena rezagada tiene muchos pedacitos de
ARN ahí pegados, uno por cada fragmento de okasaki, mientras que la cadena líder solo
el primero. Vean lo que necesitamos hacer ahora, ya tenemos un ADN duplicado,
tenemos una banda original y una copia el problema que tengo ahora es que ya tengo la
cadena duplicada pero con unos pedacillos de ARN, que es lo que debería hacer,
cambiar esos pedazos de ARN a ADN necesito a alguien que pueda sintetizar y quitar
esos nucleótidos, quién será, una polimerasa para que me ponga los pedazos nuevos y
además que actividad exonucleasa, es decir que quite, y que quite para que lado, para
cinco verdad.

Quien tenía eso, se acuerdan que yo les dije que algunas polimerasas tenían las tres
actividades, la polimerasa I, que hace la polimerasa, primero vino la primasa y sintetizó
ARN, vino la polimerasa tres tomo ese extremo tres prima y sintetizo de ahí en adelante,
tenemos ese ARN que está estorbando, viene está polimerasa, que características tenía,
no puede comenzar a sintetizar sola, importa? Aquí no ella quita los pedazos de ARN y
a la vez va sintetizando los que si son ADN, así corrige el error. Además tiene actividad
de prueba el pedacito que está corrigiendo lo revisa. A veces se dice que la está
polimerasa tiene todas las actividades, y que el dominio que quita los que está adelante
es una ARNasa. La polimerasa corrige los pedazos de ARN pero todavía no hemos
unido los fragmentos de okasaki, por qué? Vino la priamasa y sintetizó 5 nucleotidos de
ARN luego la polimerasa sintetizo un montón ( fragmentos de okasaki) cuál es le
problema? Que el primero que sintetizó la primasa y el último que sintetizó la
polimerasa no están unidos. Que molécula une estos dos, que falta un fosfato porque
estos pedazos fueron sintetizados por moléculas diferentes, entonces no hay ese fosfato,
no importa por ahora. Entonces viene la polimerasa I y corrige ( no se entiende).
Cual es el problema, un fosfato por ahí, viene una enzima más la ligasa, usa una
molécula de ATP, y pone un fosfato que hacia falta ahí, ahora tenemos una cadena
continua, esa es la ligasa. Se gasta un ATP por cada fosfato. El fosfato solito no
reacciona con el OH necesita el ATP.

Unió el extremo tres prima del okasaki con el cinco, topoisomerasa son las que faltan.
La función de la topoisomerasa no es en la burbuja de replicación, antes o después
donde el ADN está en doble banda, aún no han llegado las helicasas, que es lo que pasa
entonces si usted tiene una hélice y abre una burbuja que es lo que va a pasar en los
lados, se empieza a concentrar tensión , y los cromosomas son inmensos verdad, y no
podemos abrir un cromosoma del principio hasta el final, sino lo que se abre son
pequeños pedazos, entonces va a generar tensión siempre a los lados, las moléculas
topoisomerasas se paran en esos lados que todavía están en doble banda y generan
pequeños cortes una topoisomerasa ataca aquí, y genera un pequeño corte, ese pequeño
corte permite que el ADN gire sobre si mismo, y que una de las bandas libere tensión.
Entonces la función de las topoisomerasas es liberar tensión en las bandas que todavía
están en doble banda, a los lados de la horquilla de replicación.
Se tiene que duplicar una copia completa de ADN, aunque sea una célula del páncreas y
no vaya a necesitar otra información, igual necesitamos un set completo.
Resumimos rápidamente, hablamos de horquillas de replicación, primero hablamos de
un Ori que es una secuencia característica en el ADN, se abre la burbuja, abrimos la
horquilla en un Ori, quien abre la horquilla, las helicasas verdad; van rompiendo
puentes de hidrógeno, detrás de las helicasas vienen las proteínas ssb, que se pegan en
las partecitas que están en simple banda, después que las proteínas ssb actuaron, la
primasa viene, en la cadena rezagada pone varios pedazos de ARN ese es el problema, y
un pequeño pedazo en la cadena líder, después actua la polimerasa III, va ha pegarse en
el extremo tres prima y sintetiza todo lo que sigue hasta toparse con un …….., después
que la polimerasa tres ya sintetizó quien sigue, la polimerasa I, y que hace, quita ARN y
ademas corrige y sintetiza un verdadero ADN, cual es el problema que tenemos ahora
tenemos uno huecos, quien los soluciona, la ligasa, habian otras proteínas más que
cortan unas partes y desenrollan, son las topoisomerasas.
La cadena líder va a ir sintetizando de cinco a tres y la otra también, entonces las
polimerasas se van a ir alejando, pero eso no pasa en la naturaleza, van juntas, entonces
lo que hace la célula, la cadena rezagada la dobla, entonces la polimerasa va
sintetizando en cinco tres pero, así mantiene el orden.

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