La fijacin de carbono es una va importante para los auttrofos que viven en diferentes ambientes.

Las plantas y las cianobacterias fijar CO2 en forma de compuestos orgnicos utilizando la energa solar, principalmente por el ciclo de las pentosas fosfato reductora (tambin llamado ciclo de Calvin, el ciclo de Calvin-Benson o ciclo de Calvin-Benson-Bassham) [MD: M00165]. Hay, al menos, cinco fijaciones de carbono de vas adicionales sabe que existen en bacterias auttrofas y arqueas, que se diferencian en la reduccin de los compuestos, fuente de energa, y la sensibilidad de oxgeno de las enzimas. (I) El ciclo reductor del cido ctrico (ciclo de Arnon -Buchanan) [MD: M00173] se encuentra en microaerfilos y anaerobios, tales como las bacterias verdes del azufre. En una vuelta completa de este ciclo, cuatro molculas de CO2 son fijados por las enzimas que son sensibles al oxgeno, lo que resulta en la produccin de una molcula de oxaloacetato, que a su vez es un producto intermedio del ciclo. (Ii) La reductora acetil-CoA va (Wood-Ljungdahl va) [MD: M00377] se encuentra en las bacterias anaerobias estrictas y arqueas (Planctomycetes Proteobacteria, espiroquetas y Euryarchaeota), algunos de los cuales son el metano de formacin. Una enzima bifuncional, monxido de carbono deshidrogenasa / acetil-CoA sintetasa, cataliza la reaccin de CO2 con el CO y el CO2 a un grupo metilo, a continuacin, para generar acetil -CoA. (Iii) La bicicleta de 3 hydroxypropionate [MD: M00376] se encuentra en algunos verdes no del az ufre bacterias de la familia Chloroflexaceae. En una vuelta completa de la bicicleta, tres molculas de bicarbonato se convierten en una molcula de piruvato. Adems, esta bicicleta es el beneficio secundario de productos intermedios tiles para la biosnt esis de: acetil-CoA, glioxilato, y succinil-CoA. (Iv) El ciclo de hydroxypropionate -hidroxibutirato [MD: M00375] se encuentra en condiciones aerbicas Crenarchaeota, Acidianus, Metallosphaera y Sulfolobales. Algunos de los productos intermedios y las reacciones de carboxilacin son los mismos que en la bicicleta de 3 hydroxypropionate. Una vuelta completa de este ciclo genera dos molculas de acetil -CoA, una de las cuales se

(II)

(III)

(IV)

reutiliza en el ciclo y el otro se retira de la biosntesis de material celular.

(V)

(V) El ciclo de dicarboxilato-hidroxibutirato [MD: M00374] fue nombrado despus de sus intermedios: succinato (una especie de dicarboxilato) y hidroxibutirato. Este ciclo se ha encontrado slo en los hospitales Ignicoccus, un archaea hipertermfilas estric tamente anaerobias. Estudio reciente sugiere que el genoma de este ciclo pueden existir en Desulforococcales (a la que pertenece Ignicoccus) y Thermoproteales (un taxn cerca del origen de las archaea). La primera mitad del ciclo, a partir de acetil -CoA a succinato-CoA, se corresponde con el ciclo del cido ctrico y reduccionista de la segunda mitad del ciclo, a partir de succinato -CoA a dos molculas de acetil-CoA, se corresponde con el ciclo de hydroxypropionate hidroxibutirato .

Vas de fijacin de carbono en los procariotas Descripcin fijacin de carbono es una va importante para los auttrofos que viven en diferentes ambientes. Las plantas y las cianobacterias fijar CO2 en forma de compuestos orgnicos utilizando la energa solar, principalmente por el ciclo de las pentosas fosfato reductora (tambin llamado ciclo de Calvin, el ciclo de CalvinBenson o ciclo de Calvin-Benson-Bassham) [MD: M00165]. Hay, al menos, cinco fijacin de carbono de vas adicionales sabe que existen en bacterias auttrofas y arqueas, que se diferencian en la reduccin de los compuestos, fuente de energa, y la sensibilidad de oxgeno de las enzimas. (I) El ciclo reductor del cido ctrico (ciclo de Arnon-Buchanan) [MD: M00173] se encuentra en microaerfilos y anaerobios, tales como las bacterias verdes del azufre. En una vuelta completa de este ciclo, cuatro molculas de CO2 son fijados por las enzimas que son sensibles al oxgeno, lo que resulta en la produccin de una molcula de oxaloacetato, que a su vez es un producto intermedio del ciclo. (Ii) La reductora acetil-CoA va (WoodLjungdahl va) [MD: M00377] se encuentra en las bacterias anaerobias estrictas y arqueas (Planctomycetes Proteobacteria, espiroquetas y Euryarchaeota), algunos de los cuales son el metano de formacin. Una enzima bifuncional, monxido de carbono deshidrogenasa / acetil-CoA sintetasa, cataliza la reaccin de CO2 con el CO y el CO2 a un grupo metilo, a continuacin, para generar acetil-CoA. (Iii) La

bicicleta de 3 hydroxypropionate [MD: M00376] se encuentra en algunos verdes no del azufre bacterias de la familia Chloroflexaceae. En una vuelta completa de la bicicleta, tres molculas de bicarbonato se convierten en una molcula de piruvato. Adems, esta bicicleta es el beneficio secundario de productos intermedios tiles para la biosntesis de: acetil-CoA, glioxilato, y succinil-CoA. (Iv) El ciclo de hydroxypropionate-hidroxibutirato [MD: M00375] se encuentra en condiciones aerbicas Crenarchaeota, Acidianus, Metallosphaera y Sulfolobales. Algunos de los productos intermedios y las reacciones de carboxilacin son los mismos que en la bicicleta de 3 hydroxypropionate. Una vuelta completa de este ciclo genera dos molculas de acetil-CoA, una de las cuales se reutiliza en el ciclo y el otro se retira de la biosntesis de material celular. (V) El ciclo de dicarboxilatohidroxibutirato [MD: M00374] fue nombrado despus de sus intermedios: succinato (una especie de dicarboxilato) y hidroxibutirato. Este ciclo se ha encontrado slo en los hospitales Ignicoccus, un archaea hipertermfilas estrictamente anaerobias. Estudio reciente sugiere que el genoma de este ciclo pueden existir en Desulforococcales (a la que pertenece Ignicoccus) y Thermoproteales (un taxn cerca del origen de las archaea). La primera mitad del ciclo, a partir de acetil-CoA a succinato-CoA, se corresponde con el ciclo del cido ctrico y reduccionista de la segunda mitad del ciclo, a partir de succinato-CoA a dos molculas de acetil-CoA, se corresponde con el ciclo de hydroxypropionate-hidroxibutirato .

compuesto

Nombre citrato; El cido ctrico; 2-hidroxi-1,2,3-cido propanotricarboxlico; 2-cido Hydroxytricarballylic frmula C6H8O7 La masa exacta 192.027 Mol peso 192.1235 estructura

compuesto

Nombre (3S)-Citryl-CoA frmula C27H42N7O22P3S La masa exacta 941.1316 Mol peso 941.6424 estructura Reaccin R00354 R01322 R01323 Va ko00720 vas fijacin de carbono en los procariotas ko01120 metabolismo microbiano en ambientes diversos Enzima 2.8.3.10 4.1.3.34 6.2.1.18 Otros PubChem DB: 3845 ChEBI: 15459 3DMET: B04701 NIKKAJI: J2.729.701C

compuesto

Nombre cis-aconitato; cis-cido acontico

frmula C6H6O6 La masa exacta 174.0164 Mol peso 174.1082 estructura

isocitrato; Isoctrico cido; 1-Hydroxytricarballylic cido; 1-hidroxipropano-1 ,2,3-tricarboxlico cido frmula C6H8O7 La masa exacta 192.027 Mol peso 192.1235 estructura

compuesto

Nombre 2-oxoglutarato; cido Oxoglutaric; 2-cetoglutrico; alfa-cetoglutrico frmula C5H6O5 La masa exacta 146.0215

Mol peso 146.0981 estructura

compuesto

Nombre succinil-CoA; Succinil coenzima A frmula C25H40N7O19P3S La masa exacta 867.1313 Mol peso 867.6069 estructura

compuesto

Nombre succinato; El cido succnico; cido Butanedionic; cido Ethylenesuccinic frmula C4H6O4 La masa exacta 118.0266 Mol peso 118,088 estructura

compuesto

Nombre fumarato; cido fumrico; cido trans-butenodioico frmula C4H4O4 La masa exacta 116.011 Mol peso 116.0722 estructura

compuesto

Nombre (S)-malato; L-Malato; cido L-Apple; L-cido mlico; cido L-2-Hydroxybutanedioic; malato; El cido mlico frmula C4H6O5 La masa exacta 134.0215 Mol peso 134.0874 estructura

compuesto

Nombre oxaloacetato; cido oxalactico; cido oxalactico; 2-Oxobutanedioic cido; cido Oxosuccinic; ceto-oxaloacetato frmula C4H4O5 La masa exacta 132.0059 Mol peso 132.0716 estructura

compuesto

Nombre fosfoenolpiruvato; Fosfoenolpirvico cido; PEP frmula C3H5O6P La masa exacta 167.9824 Mol peso 168,042 estructura

compuesto

Nombre piruvato; cido pirvico; 2-Oxopropanoate; 2-Oxopropanoic cido; cido Pyroracemic frmula C3H4O3 La masa exacta 88,016 Mol peso 88.0621 estructura

compuesto

Nombre de CO2; dixido de carbono frmula de CO2 La masa exacta 43,9898 Mol peso 44.0095 estructura

compuesto

Nombre Methylcorrinoid; Protena Methylcorrinoid; Co2 Corrinoid protena +-CH3 frmula C20H3CoN4R21 estructura

C06021 Compuesto

Nombre Corrinoid; Protena Corrinoid; Co protena Corrinoid + frmula C19CoN4R21 estructura

compuesto

Nombre tetrahidrofolato; 5,6,7,8-tetrahidrofolato; Tetrahidroflico; THF; (6S)-tetrahidrofolato; (6S)-tetrahidroflico, cido; (6S)-THFA frmula C19H23N7O6 La masa exacta 445.171 Mol peso 445.4292 estructura

compuesto

Nombre formiato; cido metanoico; cido frmico frmula CH2O2 La masa exacta 46,0055 Mol peso 46.0254 estructura

compuesto

Nombre 5-metiltetrahidrofolato frmula C20H25N7O6 La masa exacta 459.1866 Mol peso 459.4558 estructura

compuesto

Nombre de 5,10-metilentetrahidrofolato; (6R)-metilentetrahidrofolato -5,10; 5,10-metileno-THF frmula C20H23N7O6 La masa exacta 457.171 Mol peso 457.4399 estructura

compuesto

Nombre de 5,10-Methenyltetrahydrofolate frmula C20H22N7O6 La masa exacta 456.1632 Mol peso 456,432 estructura

compuesto

Nombre de 10 formyltetrahydrofolate; 10-formil-THF frmula C20H23N7O7 La masa exacta 473.1659 Mol peso 473.4393 estructura

compuesto

Nombre Glioxilato; glioxalato; glioxlico frmula C2H2O3 La masa exacta 74,0004 Mol peso 74.0355 estructura

compuesto

Nombre (3S)-3-carboxi-3-hydroxypropanoyl-CoA; (3S)-3-carboxi-3-hydroxypropionyl-CoA; L-Malyl-CoA; Malyl-CoA frmula C25H40N7O20P3S La masa exacta 883.1262

Mol peso 883.6063 estructura

compuesto

Nombre de acetil-CoA; Acetil coenzima A frmula C23H38N7O17P3S La masa exacta 809.1258 Mol peso 809.5708 estructura

compuesto

Nombre de acetato; cido actico; cido actico frmula C2H4O2 La masa exacta 60,0211 Mol peso 60.052 estructura

compuesto

Nombre acetil fosfato frmula C2H5O5P La masa exacta 139.9875 Mol peso 140.0319 estructura

compuesto

Nombre del malonil-CoA; Malonil coenzima A frmula C24H38N7O19P3S La masa exacta 853.1156 Mol peso 853.5803 estructura

Compuesto

Nombre 3-Oxopropanoate; malonato semialdehdo Frmula C3H4O3 La masa exacta 88016 Mol peso 88.0621 Estructura

compuesto

Nombre 3-hidroxipropanoato; 3-hidroxipropanoico cido; 3-Hydroxypropionate; 3-hidroxipropinico; cido Hydracrylic frmula C3H6O3 La masa exacta 90,0317 Mol peso 90.0779 estructura

compuesto

Nombre 3-Hydroxypropionyl-CoA; 3-Hydroxypropionyl coenzima A; 3-Hydroxypropanoyl-CoA; 3-Hydroxypropanoyl coenzymeA;

beta-Hydroxypropionyl-CoA frmula C24H40N7O18P3S La masa exacta 839.1363 Mol peso 839.5968 estructura

compuesto

Nombre Propenoyl-CoA; Acriloilo-CoA; Acrylyl-CoA frmula C24H38N7O17P3S La masa exacta 821.1258 Mol peso 821.5815 estructura

compuesto

Nombre propanolo-CoA; Propionil-CoA; Propionil coenzima A frmula C24H40N7O17P3S La masa exacta 823.1414

Mol peso 823.5974 estructura

compuesto

Nombre (S)-metilmalonil-CoA; (S)-metilmalonil-coenzima A; (2S)-metilmalonil-CoA; D-metilmalonil-CoA frmula C25H40N7O19P3S La masa exacta 867.1313 Mol peso 867.6069 estructura

compuesto

Nombre HCO3-; bicarbonato; hidrogenocarbonato; carbonato cido frmula HCO3 La masa exacta 60,9926 Mol peso 61.0168 estructura

compuesto

Nombre (R)-metilmalonil-CoA; L-metilmalonil-CoA frmula C25H40N7O19P3S La masa exacta 867.1313 Mol peso 867.6069 estructura

compuesto

Nombre (R)-metilmalonil-CoA; L-metilmalonil-CoA frmula C25H40N7O19P3S La masa exacta 867.1313 Mol peso 867.6069 estructura

compuesto

Nombre succinato semialdehdo; Semialdehdo succnico; 4-oxobutanoato frmula C4H6O3 La masa exacta 102.0317 Mol peso 102.0886 estructura

compuesto

Nombre de 4 hidroxibutanoico cido; 4-hidroxibutanoato; 4-hidroxibutrico frmula C4H8O3 La masa exacta 104.0473 Mol peso 104.1045 estructura

compuesto

Nombre de 4 hidroxibutiril-CoA; 4-Hydroxybutanoyl-CoA

frmula C25H42N7O18P3S La masa exacta 853.152 Mol peso 853.6234 estructura

compuesto

Nombre Vinylacetyl-CoA; 3-Butenoyl-CoA; Pero-3-enoil-CoA frmula C25H40N7O17P3S La masa exacta 835.1414 Mol peso 835.6081 estructura

compuesto

Nombre Crotonoyl-CoA; Crotonil-CoA; 2-Butenoyl-CoA; trans-but-2-enoil-CoA; Pero-2-enoil-CoA frmula C25H40N7O17P3S La masa exacta 835.1414

Mol peso 835.6081 estructura

compuesto

Nombre (S)-3-Hydroxybutanoyl-CoA; (S)-3-hidroxibutiril-CoA frmula C25H42N7O18P3S La masa exacta 853.152 Mol peso 853.6234 estructura

compuesto

Nombre acetoacetil.CoA; Acetoacetil coenzima A; 3-acetoacetil.CoA frmula C25H40N7O18P3S La masa exacta 851.1363 Mol peso 851.6075 estructura

compuesto

Nombre L-eritro-3-Methylmalyl-CoA; beta-Methylmalyl-CoA frmula C26H42N7O20P3S La masa exacta 897.1418 Mol peso 897.6329 estructura

compuesto

Nombre Mesaconyl-CoA; Mesaconyl-C1-CoA frmula C26H40N7O19P3S La masa exacta 879.1313 Mol peso 879.6176 estructura

compuesto

Nombre Mesaconyl-C4-CoA frmula C26H40N7O19P3S La masa exacta 879.1313 Mol peso 879.6176 estructura

compuesto

Nombre (3S)-Citramalyl-CoA; L-Citramalyl-CoA frmula C26H42N7O20P3S La masa exacta 897.1418 Mol peso 897.6329 estructura

compuesto

Nombre piruvato; cido pirvico; 2-Oxopropanoate;

2-Oxopropanoic cido; cido Pyroracemic frmula C3H4O3 La masa exacta 88,016 Mol peso 88.0621 estructura