Fire Blight: Applied Genomic Insights of the Pathogen and Host.

Mickael Malnoy,1 Stefan Martens,1 John L. Norelli,2 Marie-Anne Barny,3 George W. Sundin,4 Theo H.M. Smits,5 and Brion Duffy.

Nombre: J. David Villacreses. Profesor: Dra. Carolina Snchez

Fuego Bacteriano.
Fitopatogeno Erwinia amylovora.
Tejidos de infeccin. Flores Brotes Races.

Erwinia amylovora.

Erwinia amylovora.
Controles de Cultivo. Poda. Remocin del material daado. Antibiticos: - Estreptomicina. - Oxitetraciclina. - Antagonistas bacterianos. - Kasugamicina. - Prohexadiona de calcio.

Otros cultivos susceptibles: Peras.

Vas de Secrecin/Translocacin de protenas.

Ams, Hrp T3SS.

Mutantes.
Hrp T3SS: sin respuesta elicitora. sin dao necrtico.

AMS: Genera reacciones elicitoras.

Ams, Hrp T3SS.

Efectores T3SS.
DspA/E: central para el desarrollo de la enfermedad. induce necrosis. bloquea la deposicin callosa. reprime la expresin de PR1. inhibicin de vas metablicas dependientes de SA.
SAR
Genes relacionados con inmunidad dependiente de SA.
Genes: PR. WRKY.

Efectores T3SS.
HrpN + HrpW : relacionada con translocacin de efectores. contiene seales n-terminal de translocacin tipo 3. activa PTI ( inmunidad gatillado por PAMP). produce activacin de MAPK.

Nota: La induccin de stress oxidativo es indirecta y depende de la translocacin dependiente de HrpN de otros efectores T3.
HrpK + HrpJ: participan en conjunto a HrpN para formar aparato traslocador.

Genmica en Erwinia amilovaran.

CFBP1

Ea273

Rubus

Maloideae

Rubus

Genmica en Erwinia amilovaran.

Maloideae: Familia Roscea.
Cepas de genoma monomorfico con 99.9% de
similitud. Diferencias: VNTR (numero variable de repeticiones en tndem). CRR (regiones repetidas CRISPP) CRISPP (regiones palindromicas cortas regularmente intercaladas en grupos).

Rubus: mayor divergencia genmica.

similitud con cepas Maloidea 98,5%. contradice descripcin monomrficas.

Genmica en Erwinia amilovaran.

Genmica en Erwinia amilovaran.

Plsmidos:
pEU30

pEL60 pEA29 pEAR5,2 pEAR4,3 pE170

Rubus.

pEA29: genes thiOSGF codifican la biosntesis tiamina. fortalecen patognesis. plsmido ubiquitinico.

Perspectiva Genmica de hospedero de E. amylovora.

interaccin

planta-

E. amylovora: induce peroxidaccion lipdica

fuga electroltica. modulacin de estatus oxidativa del
husped. SAR: reforzamiento pared celular. acumulacin de fitoalexinas. activacin de genes PR PR2, PR5, PR8.

Transcriptoma.
Anlisis de microarrays. - 184000 EST 33,824 genes predichos.

- primera etapa de infeccin de flores de manzana con E. Amylovora. RNA-seq: la disposicin de WGS de Malus nos entrega un enfoque alternativo. Anlisis transcriptomico de infeccin: - enzimas de vas metablicas. - factores de trascripcin - componentes de sealizacin. - protenas relacionadas con defensa. - transportadores. - identificacin de genes candidatos a resistencia (QTL).

Identificacin de genes candidatos a resistencia (QTL).

QTL:
resistencia cuantitativa. varios QTL identificados. Genes de resistencia.

Concentracin de muchos genes en un loci.

Un gen de resistencia de mayor tamao.

Genmica en Malus.

Identificacin de genes candidatos a resistencia (QTL).

QTL: Desarrollo de marcadores MAB. SNP: identificar alelos asociados a resistencia.

- parentales. - resistentes. - susceptibles.

MAB: marcadores e asistencia de Breeding.

Aplicacin genmica para el manejo del fuego bacteriano.

Biocontrol uso de antagonistas.
Biocontrol. Antibiosis.

P. vagans

P. agglomerans

Plsmidos.

pPag2.

Aplicaciones.
Produccin de proteicas microbiales. Inhibicin de factores bacteriales de patognicos. Alterar expresin de genes que interactan con efectores. Aumentar expresin de flavonoides. Cisgenia de QTL. Uso de marcadores MAB para seleccin de mejores resistencias en cultivares.

FIN.