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Taller de Snomed CT
Aproximacin a la terminologa mdica
Jess Cceres Tello Madrid, 22/06/2011
ndice
01 Las preguntas que nos debemos hacer 02 Lneas generales 03 comprendiendo Snomed CT
Introduccin a Snomed CT
El contenido de Snomed ha sido desarrollado por clnicos durante ms de 3 dcadas El contenido de Snomed CT posibilita la transferencia de conocimiento entre diferentes profesionales de la salud.
Introduccin a Snomed CT
Introduccin a Snomed CT
00. Definicin
Terminologa clnica de referencia completa cuyo contenido y expresividad facilitan el diseo de documentacin clnica y el proceso de informacin en el mbito de la salud. Permite que mdicos, investigadores y pacientes compartan datos comparables. Es esencial para la recoleccin, recuperacin, agregacin y reutilizacin de datos mdicos as como favorecer el intercambio de informacin. Compuesta por conceptos, trminos y relaciones.
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Almacn de datos (warehouse). Sistema de diagnstico departamental Sistema de soporte para la toma de decisiones Sistema para la creacin de consultas Un sistema de codificacin que vincula conceptos codificados con SNOMED CT a agrupaciones o clasificaciones administrativas, DRG o CIE10. Sistema de soporte para el diseo o implementacin de mensajes
Mecanismo de Historial
Posibilitan la actualizacin de las publicaciones de Snomed, guardan informacin sobre cambios en los datos
Mecanismo de Subconjuntos
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relacionada con Snomed Identificacin de forma separada los mdulos reutilizables y los reemplazables Permite la comparticin de un nico servidor de terminologa Reduccin del mantenimiento y el coste asociado de cada instalacin Alineacin garantizada de las publicaciones de Snomed CT Coherencia entre interfaz de usuario y las diferentes aplicaciones en lo relativo a su acceso a Snomed CT
Enfoque de integracin
Independencia de desarrollos
realizados por terceros Acceso personalizado a Snomed CT adatado a las necesidades de los usuarios
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sct1_Concepts_Core_INT_20100131.txt
390.023 Conceptos Cada fila representa a un concepto mdico Cada concepto tiene un identificador nico y una descripcin completas que especifica la naturaleza del concepto
sct1_Descriptions_es_INT_20100430.txt:
1.053.939 Descripciones Cada fila asocia a un trmino con un concepto mdico, este trmino puede utilizarse para representar al concepto Cada descripcin tiene su identificador nico y adems, el texto de un trmino y el identificador del concepto que puede representar Debe utilizarse conjuntamente con la tabla de subconjunto de idioma.
sct1_Relationships_Core_INT_20100131.txt:
1.420.532 Relaciones Cada fila representa una relacin entre dos conceptos El tipo de relacin se identifica por la referencia a otro concepto
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der1_Subsets_es_INT_20100430.txt
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Cada fila de la tabla describe una publicacin de un subconjunto Incluye los subconjuntos de Snomed CT que se agrupan en la tabla de miembros
der1_SubsetMembers_es_INT_20100430.txt:
Cada fila representa un miembro de un subconjunto El miembro puede ser un concepto o una descripcin. Se pueden agrupar uno o ms subconjuntos.
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conceptStatus
0 10
fullySpecifiedName
Entire tuberculum sellae (body structure) DUOVAC -M (product)
CTV3ID
XS10s XU07K
snomedID
T-D1463 C-D2631
isPrimitive
1 1
fullyspecifiedName: frase nica que describe al concepto. Relacionado con Term en la tabla de descripciones CTV3ID: Cdigo asignado en Clinical Terms Version 3 (Cdigos Read) snomedID: identificador Snomed RT isPrimitive: Indica si un concepto es primitivo (son relaciones is a) o completamente definido
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descriptionSta tus
0
ConceptID
283815003
Term
mordedura de animal en la espalda (trastorno)
InitialCapi talStatus
0
Description Type
3
LanguageCo de
es
129754601 6
283816002
es
conceptId: Identificador nico del concepto Term: Indica el texto que describe el concepto InitialCapitalStatus: (0: Falso; 1: Verdadero) descriptionType: Indica el tipo de descripcin definida:
0: No especificado 1: Preferido 2: Sinnimo 3: FullSpecifiedName
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conceptID 1
101763002 101764008
relationShipType
116680003 116680003
conceptID 2
370126003 370126003
characteristicType
0 0
Refinability
0 0
relationShipGroup
0 0
relationShipID: Identificador nico de la relacin conceptID1: Indentificador del primer concepto (rol hijo) relationShiptype: Identificador nico del concepto que representa el tipo de relacin entre los conceptos relacionados characteristicType: seala si una relacin especifica una caracterstica definitoria del concepto origen o una posible caracterstica calificativa de ese concepto:
0: relacin definitoria
CTV3ID: Cdigo asignado en Clinical Terms Version 3 (Cdigos Read) snomedID: identificador Snomed RT isPrimitive: Indica si un concepto es primitivo (son relaciones is a) o completamente definido
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Esquema general
Edicin Internacional de Snomed CT
Instalacin Actualizacin
Bsqueda de Frases
Distribucin de la Extensin
Instalacin Actualizacin
Aplicacin de Subconjuntos
Obtencin de conceptos
Obtencin de historial
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A p l i c a c i n
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Hallazgo clnico Procedimiento Entidad observable Estructura corporal Organismo Sustancia Prod. Farmacutico/biolgico Espcimen Conceptos especiales Objeto fsico
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Fuerza fsica Evento Ambiente o localiz. geogrfica Contexto social Situacin con contex. Explcito Estadificaciones y escalas Conceptos de enlace Calificadores Elementos de registro
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Introduccin
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Usuarios y proveedores deben participar en los controles de calidad Las barreras para la adopcin y uso de la terminologa deben ser mnimas.
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La gramtica de Snomed CT
Creada para la representacin de expresiones de Snomed CT. Utilizada para propsitos de demostracin
Legibilidad para humanos y procesable por las mquinas
Ejemplos:
31978002 | fracture of tibia 417662000 | past history of clinical finding| :246090004 | associated finding| =(31978002 | fracture of tibia| : 272741003 | laterality| =7771000 | left| )
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Free
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Registration required
x
Webbased
x
Notes
Data is Australian national release (with medicines terminology) and is restricted to Australian IP addresses. HealthTerm also contains modules for request submission, concept modelling, qualification, distribution, subset extraction, translation and mapping. Athens account required Available for download in Android Market and runs on Android 2.2 Platform
HealthTerm
http://www.carecom.dk/Joomla/index.php?opti on=com_content&task=view&id=12&Itemid=27
HLi LExPlorer MedTalk Minnow Mycroft NCI Terminology Browser OpenKnoME 5.4d and ClaW Workbench Protg SNOB SnoFlake Virginia Tech Browser
http://www.snomed.cfh.nhs.uk/lexplorer
http://www.pyebrook.com/2010/11/medtalk%E 2%84%A2-snomed-ct%C2%AE-browser/
http://www.ict.csiro.au/downloads.php?swid=1 7&title=Snapper+-++Minnow+Edition
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http://protege.stanford.edu
http://snob.eggbird.eu
http://snomed.dataline.co.uk
Java-based, extensible, plug and play environment Multi-lingual interface, users can edit and add descriptions Users must work in a healthcare organization that has a SNOMED CT license. Browses current SNOMED CT release (typically updates data within a few days of the release)
http://terminology.vetmed.vt.edu/SCT/menu.cf m
Visual Read
http://www.visualread.com
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Unidad de Investigacin en Telemedicina y e-Salud Avda. Monforte de Lemos, 5 28029 - Madrid. Espaa
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