DNA , R NA and Fl ow

of
Geneti c Inf ormat ion
(C hapter 5)
 James Watson (L) and Francis Crick (R),
and the model they built of the structure
of DNA.
 Nucleoside­ a base is bonded to a 
sugar ( N1 of pyrimidine→C1’ of 
sugar or N9 of purine →C1’ 

Nucleotide is a nucleoside joined to one or 
more phosphate s by an ester bond
 A Pair of Nucleic Acid 
Chains with Complementary 
Sequences Can Form Double 
Helical Structure
Rosalind Franklin and Maurice Wilkins­ 
discovered the existence of specific base­
pairing interaction.
 Supercoiling of Prokaryotic DNA

Schematic Representation of circular and supercoiled DNA
Electron micrograph of supercoiled DNA
2 Types of Supecoiling
• Negatively supercoiled­ a right handed helix acquires an extra­
helical twist
• Positively supercolied­ there is overwinding of the closed double 
helix

2 Enzymes which are involved in the  regulation of 
conversion 
• Topoisomerase­ an enzyme that hydrolyze a phosphodiester 
bond in one strand, relax the supercoiling by rotating in one 
strand, then reseal the break
• DNA gyrase­ induce a negative supercoling in relaxed, closed­
circular DNA
Supercoiling in Eukaryotic DNA

 Eukaryotic DNA is complex with DNA 
(chromatin)
Histones­ principal proteins, H1, H2A, H2B, H3 
and H4
Chromatin resembles beads on a string.
Nucleosome­ consist of a DNA wrap around a 
histone core
 The Double Helix Facilitates the 
Accurate Transmission of Hereditary 
Information
The Double Helix Can Be 
Reversibly Melted
Three kinds of RNA
2. m­RNA (messenger RNA)­ is the template 
for protein synthesis or translation
3. t­RNA (transfer RNA)­ carries amino acid 
in an activated form to the ribosome for 
peptide bond formation, in a sequence 
dictated by the m­RNA template
4. r­RNA (ribosomal RNA)­ the major 
component of ribosome, plays both a 
catalytic and structural role in protein 
synthesis
 Messenger RNA (m­RNA)
 least abundant of the three RNAs
The sequences of bases in mRNA specify the order 
of amino acids in proteins
 turn over most rapidly in the cell
Heteregenous in size
No intrachain folding, very likely an open chain 
structure
Synthesized in the nucleus during the process of 
transcription
After transcription, mRNA passes to the ribosomes 
where it serves as the template for the seqeuntial 
ordering of a.a. during synthesis
TRANSFER DNA
 smallest of the three RNAs
Single stranded polynucleotide chain, usually about 80 nucleotides 
and generally having a MW of about 25,000 daltons
INTRACHAIN H­bonding­ occurs  in tRNA, forming A­U and G­C 
base pairs.
Molecule folds back on itself to form a cloverleaf structure
STEMS­ hydrogen bonded structure, LOOPS­ non­hydrogen 
bonded position, contain modified bases
At one end of the polynucleotide chain, all t­RNA’s contain a 
guanylic acid residue, linked by its 3’­hydroxyl group to the 
penultimate nucleotide residue.
The other side of the chain contains a common trinucleotide 
sequence namely pCpCpA.
Ribosomal RNA
 forms a complex with protein to form ribosome

Prokaryotic ribosome : 70 S→ 50 S and 30 S
Eukaryotic ribosome: 73S to 80S → 60S and 
40S
 QUIZ on
WEDNESDAY!