Microbiologa del suelo

El suelo:
Un biotopo, prcticamente ignorado

EL SUELO
Es el principal medio en el que

crecen las plantas.

Es el soporte fsico que

continuamente les proporciona:

Los nutrientes inorgnicos El agua El entorno gaseoso adecuado para los sistemas radicales.

Los nutrientes inorgnicos

que utilizan las plantas provienen de la atmsfera y de la meteorizacin de las rocas de la corteza terrestre.

Meteorizacin de la corteza terrestre

Los minerales son compuestos

inorgnicos que normalmente estn formados por dos o ms elementos en proporciones de peso determinadas
Ejemplo:
El cuarzo( SiO2 ) La calcita (CaCO3).

 Las rocas se dividen en tres grupos

segn su origen y formacin:

gneas
Granito, basalto, cuarzo, feldespato

Sedimentarias
esquistos, areniscas, piedra caliza

Metamrficas
Areniscascuarcita,

Esquisto pizarra
Piedra caliza mrmol

Procesos de meteorizacin desintegracin fsica y descomposicin qumica de los minerales y las rocas superficiales producen los materiales inorgnicos que formarn los suelos

 Los suelos tienen diferente origen y

composicin

Por lo tanto la microfauna asociada a

ellos tambin

La meteorizacin implica procesos:

Mecnicos

congelamiento y descongelacin calentamiento y enfriamiento,

Qumicos

El agua se introduce entre las partculas, y los materiales solubles se disuelven en ella.
Biolgicos

CO2 de la respiracin y otras sustancias descomponen las rocas

Meteorizacin mecnica

El agua y el viento transportan fragmentos de roca a grandes distancias desgaste que las fracciona en partculas ms pequeas

Meteorizacin qumica (corrosin)

Disuelven cidos materiales H2O + NO2 (NO3) menos solubles

H2O + SO2

Meteorizacin orgnica-biolgica

Los cidos producidos por

plantas y las bacterias pueden afectar las rocas.

La formacin del suelo puede ocurrir en:

El mismo sitio donde la roca es

meteorizada
Pueden ser transportados a otros sitios

por :
La gravedad El viento El agua Los glaciares.

Materia orgnica del suelo

Origen de la materia orgnica del suelo:

Bacterias, hongos, algas, lquenes, musgos y plantas que crecen sobre o entre los minerales y las rocas erosionadas Plantas y animales muertos

Los microbios en el suelo

Contribuyen a la Controlan la formacin de materia disponibilidad de orgnica muchos nutrientes importantes para la convierten en cido las plantas carbnico o cidos orgnicos disuelven rocas.

 La actividad

microbiana es limitada por el agua (sequa,humedad ) y estado de los nutrientes

La actividad

microbiana es clave en la productividad de los suelos.

 Los microbios pueden existir varios

cientos de metros por debajo de la superficie de la Tierra

Los mecanismos de sobrevivencia

an no se conocen

 Seccin vertical del suelo:

Variaciones en el color Cantidad de materia orgnica viva o muerta (incluye microorganismos) Porosidad Estructura Grado de meteorizacin.

Horizontes del suelo

Horizonte A
Horizonte B Horizonte C

Horizonte A:
Capa superior del

Contiene la mayor

suelo La regin ms superficial y de mayor actividad fsica qumica y biolgica.

parte del material orgnico del suelo, vivo o muerto:

Grandes cantidades de partes de plantas y hojas muertas Insectos y otros artrpodos pequeos Lombrices de tierra Organismos descomponedores Nemtodos

O2, N2, CO2

Desechos orgnicos Lluvia O2, NH3, CH4, H2S

Inorgnicos granulados Residuos orgnicos, humus Agua (inundado, mojado) Gases (disueltos y difusos)

Suelo: Horizonte A Rocas, silicatos

Capa de agua

Sistemas biolgicos (races, insectos, microobios)

En un gramo de suelo del horizante A pueden haber:

2500 millones de bacterias
+ medio milln de hongos

+
50 000 algas

+
30 000 protozoos

Horizonte B:

Regin de acumulacin

El horizonte B:
Contiene mucho

Algunos materiales

menos material orgnico y est menos meteorizado que el horizonte superior. Hay pocos microorganismos

del horizonte A, llegan al B por filtracin del agua a travs del suelo:
xido de hierro Partculas arcillosas Pequeas cantidades de material orgnico

Horizonte C:

Compuesto por rocas y

minerales fragmentados y meteorizados de los cuales se ha formado el suelo verdadero de los horizontes superiores. Los microorganismos son escasos.

Composicin del suelo

Los suelos estn
Poro Pelcula de Agua

formados de materia slida y espacio poroso El espacio poroso es ocupado por diferentes proporciones de aire y agua, dependiendo de las condiciones de humedad.

Materia orgnica
O2 CO2, H2S, CH4

Arena

Arcilla

Hifa Bacterias

 Los fragmentos de roca y minerales en el

suelo varan en tamao:

Partcula

Dimetro en micrmetros Arena gruesa >200 - 2000 Arena fina >20 - 200 Limo 2 - 20 Arcilla <2

 Los suelos estn divididos segn su

textura:
Arenoso arcillosos: 35% o ms de

arcilla y 45% o ms de arena

Limo-arcillosos: 40% de arcilla y 40%

o ms de limo
Margosos o francos: contienen igual

proporcin de arena, limo y arcilla. Ideales para la agricultura.

 La textura del suelo influye en las

comunidades de microorganismos porque de ella depende la aireacin y la disponibilidad de agua

Intercambio de catinico
Los nutrientes

Cl inorgnicos para Cl HCO3 microorganismos + NO 3 + K + Na Na y plantas estn SO4-2 OH presentes en la Ca+ + Arcilla - Na+ solucin del OH + + -2 suelo como Ca SO4 Na+ iones. K+ H+
HCO3NO3- HCO3-

OH-

Intercambio catinico: Los cationes apresados por las partculas de arcilla Partculas de pueden: arcilla: Ser reemplazados por componentes otros cationes esenciales de Ser liberados a la los suelos solucin del suelo para productivos. ser tomados por plantas y microorganismos.

 Los aniones (NO3-,

El fosfato, no puede

SO4-2, HCO3-, y OH-) son lixiviados del suelo ms rpidamente que los cationes ya que no pueden fijarse a las partculas de arcilla.

ser arrastrado, ya que:

Forma precipitados insolubles Es absorbido o adsorbidoen la superficie de compuestos que contienen hierro, aluminio y calcio.

 La acidez o

Los suelos varan

basicidad del suelo est relacionada con la disponibilidad de nutrientes inorgnicos para el crecimiento de plantas y microbios.

mucho en su pH, y muchos microorganismos tienen un estrecho margen de tolerancia.

 La gente desconoce que cuando

tiene un gramo de tierra en el hueco de la mano, tiene entre un milln y mil millones de seres vivos en esa mano.

Una muestra de suelo contiene: Insectos pteros Arcnidos Sobretodo filamentos de hongos y de bacterias.

 La cuenta de

La riqueza de

grmenes por suspensindilucin muestra ms de un milln de grmenes por gramo de tierra arable

especies y la complejidad de la delgada capa cultivable condicionan la vida sobre la tierra, del mismo modo que la fotosntesis.

Ciclo de la materia orgnica

CO2

Fotosntesis

Restos vegetales desaparecen bajo la accin de la microfauna y la Cada de ramas, microflora del hojas, frutos.. suelo
Microfauna del suelo

Microorganismos del suelo

Mineralizacin Humificacin

CO2

Fotosntesis

Amontonamiento de

acculas de varios centmetros.

Cada de ramas, hojas, frutos.. Acidez frena actividad microbiana Acumulacin Microfauna del suelo

Mineralizacin

Descomponedores casi ausentes: hongos y bacterias

Humificacin

Papel de la microfauna del suelo:

Disgregacin de la materia orgnica Diseminacin de la microflora

Disgregacin de la materia orgnica

Reutilizacin por otros organimos Multiplicacin de la microflora de las heces Heces

microfauna

Seleccionan los alimentos para los microbios Aumentar las superficies de ataque para los microbios.

Diseminacin pasiva Transporte accidental en la superficie del cuerpo

Invasin por los microbios del suelo

Reincorporacin de microorganismos al suelo

Diseminacin activa ELECCIN con las heces de la TRFICA: microflora Rgimen intestinal alimentario

 Plantas y

Los residuos

microflora: organismos complementarios, en la mineralizacin de la materia orgnica

orgnicos no consumidos van a ser degradados por la microflora. Son los hongos, en primer lugar, los que van a atacar a la materia orgnica fresca, y en el siguiente orden

Mineralizacin de la materia orgnica

Descomposicin de hojas (Sucesin) Tiempo (las fases pueden ser simultneas)

Hongos: Hongos glucfilos celulolticos: utilizacin de metabolismo las de la celulosa sustancias hidrosolubles

Hongos lignolticos : degradacin de la lignina

Bacterias: transforman residuos fngicos y productos no consumidos por las hifas.

 Plantas y microorganismos

son complementarios: unos fabrican materias carbonadas, otros liberan minerales

CAPA VEGETAL DEL SUELO Materia inorgnica Materia orgnica

Microorganismos CO2 Hojas de las plantas Fotosntesis H 2O

Material mineral no utilizado por los microorganismos

Races de las plantas

Proteccin de los microorganismos ante desequilibrios ambientales

Cuando se aade materia orgnica a

los suelos agrcolas, las bacterias consumen todo el carbono disponible. Consecuencia: rarefaccin, e incluso desaparicin, de los microorganismos.
Para estos casos, la naturaleza ha

creado sistemas de proteccin para que los microorganismos Mara Cecilia Arango Jaramillo sobrevivan

Estructuras de proteccin de los hongos

Clamidospora: clula latente, con

pared gruesa y cuyo contenido es rico en reservas Esclerote: esfera cuyo envoltorio externo est constituido de hifas muertas de pared gruesa, y el centro de filamentos vivos ricos en reservas, en estado latente.

Estructuras de proteccin delas bacterias

Las (Gram+) Las Gram- estn

Susceptibles Forman agregados

forman endosporas.

desprovistas de mecanismos de resistencia

de sobrevivir biolgicos cuando las condiciones son muchos aos en condiciones desfavorables La actividad celular y las desfavorables. divisiones, se hacen ms lentas.

 Numerosos

procariotas para las condiciones protegerse exudan ambientales llegan a en su superficie ser desfavorables polisacridos que se adhieren a lminas de arcilla. Desaparecen cuando las condiciones Son estructuras pedolgicas vuelven que permiten la a ser adecuadas supervivencia de las bacterias

Se forman cuando

 Estas formaciones tienen un dimetro

que vara de 10 a 1000 mm y pueden contener varios miles de grmenes.

Los polisacridos tienen varias funciones:

La superficie de bacterias y arcillas tienen

cargas elctricas negativas, mientras que los azcares son neutros, tienen por tanto un papel aislante. agua, evitan evaporacin en perodos secos.

Los azcares tienen tendencia a retener

Constituyen reservas. En ausencia de alimentos, las bacterias toman el carbono necesario para el mantenimiento de las funciones vitales esenciales. Mara Cecilia Arango Jaramillo

 Para los microorganismos

del suelo vivir en el espacio interagregado (poros) y el agregado mismo (granos) tiene implicaciones importantes

 Este es el

En el espacio interagregado las condiciones son drsticas: La humedad y la aireacin varan muy rpidamente.

microhabitat colonizado por las bacterias Gram+, que poseen la facultad de producir endosporas. hongos y las de los actinomicetos, son muy resistentes a la desecacin.

Las esporas de los

 Por el

condiciones de contrario, el anaerobiosis. agregado En este medio tan mismo es estable viven o recorrido slo sobreviven las bacterias por finos Gram-. capilares de alrededor 2 Aunque sensibles a las mm de modificaciones dimetro, que ambientales, permanecen slo permiten vivas en suelos secos una circulacin durante ms de un ao lenta de aire y gracias a la proteccin de de agua. los agregados

Aparecern rpidamente

La composicin qumica y fsica de los agregados es variable.

El suelo es un medio muy

heterogneo

Est constituido de un

mosaico de microhabitats cuya composicin biolgica vara cualitativa y cuantitativamente en funcin del tiempo, y de la fuente trfica disponible.

 Unos agregados

pueden formarse alrededor de citina, desarrrollndose en su seno los llamados citinolticos. Otros encerrarn residuos de lignina permitiendo el crecimiento de los ligninolticos.

Los microorganismos

que colonizan estos microhabitats difieren igualmente tanto por su morfologa, como por sus requerimientos ecologicos.

Influencia del ambiente del suelo en las poblaciones de microorganismos

Nunca se dan condiciones Aunque los ambientales idnticas: microorganismos Las que favorecen la son ubicuos, en reproduccin de un pocas situaciones microorganismo, o existen poblaciones permiten la iguales. sobrevivencia de otro, pueden ser desfavorables para la existencia continuada de un tercero.

 El suelo de un pinar
Los suelos

cultivados y de jardn tienen abundancia de oxgeno y agua y son ricos en nutrientes aportados por las fertilizaciones

suele ser muy cido y su contenido en principios nutritivos es bajo Los terrenos pantanosos estn inundados, tienen poco oxgeno y contienen abundante materia orgnica en descomposicin.

Estas diferencias se reflejan en la microflora

 Para comprender la influencia de

los factores que afectan la microflora del suelo es necesario: Conocer las condiciones normales de crecimiento de los microorganismos Los efectos que las condiciones extremas ejercen sobre los distintos grupos.

Factores que afectan en mayor grado a las

poblaciones de microorganismos
pH DEL SUELO AcidezAlcalinidad TEMPERATURA

POBLACIONES DE MICROORGANISMOS

DISPONIBILIDAD DE OXGENO, AGUA Y SUSTANCIAS NUTRITIVAS

TCNICAS DE MANEJO DEL SUELO

Consideremos estos factores separadamente, pero deberemos tener en cuenta que de ordinario son interdependientes.

Temperatura (Psicrfilos, Mesfilos y

Termfilos).
TEMPERATURA DE CRECIMIENTO DE LOS MICROORGANISMOS Tipo de microorganismo Psicrfilas Alrededor 20o C 25 a 37o C 5a30o C Achromobacter Temperatura Temperatura ptima s lmite Ejemplo de microorganismo

Mesfilas

5 a 45o C

Staphylococcus , Mayora de los hongos.

Termfilas

Superior a 45o C

40 a 80o C

Desulfovibrio, Thermoactinomyce s, Algunas algas verdes azules

Fermentacin del estircol: La temperatura puede elevarse hasta 65 o C, destruyendo todos los microorganismos, excepto a los termfilos, como el Bacillus calfactor , Thermoactinomyces spp y los hongos termfilos.

 En suelos del piso trmico tropical y

premontano son ms frecuentes: Fusarium, Aspergillus y Rhizopus

Penicillium crece mejor en suelos ms

fros.

REQUERIMIENTOS NUTRITIVOS
Utilizacin de energa lumnica Oxidacin quimioautotrfica de

materias inorgnicas Respiracin hetertrofa de materia orgnica Fermentacin de materia orgnica

 Existe competencia entre

los microorganismos por utilizacin de los nutrientes orgnicos e inorgnicos.

 En el suelo la materia orgnica fcilmente

utilizable por los microorganismos es ordinariamente reducida, lo que limita su velocidad de multiplicacin.

Al aadir al suelo materiales frescos, estircol o desechos vegetales

el nmero de microorganismos aumenta rpidamente los nutrientes se agotan poblacin de microorganismos vuelva nivel anterior.

Como un microorganismo determinado no puede utilizar igualmente todos los substratos su incidencia y proporcin varan de acuerdo con las situaciones

 Opionibacterium

acta como barrendero de medios nutritivos parcialmente degradados por microorganismos.

En el rumen utiliza

cido lctico y glucosa producidos por las bacterias celulticas y las del cido lctico.

 Lactobacillus

compite eficazmente cuando existen Crece bien en la carbohidratos leche y en el rumen simples pero es pero no en el suelo. incapaz de metabolizar sustancias como lignina.

Otros microorganismos degradan lignina y Pero no en leche, celulosa donde compiten con microorganismos sobrevivien en el suelo como Bacillus y y en el manto en Lactobacillus descomposicin de los bosques

 En una poblacin mixta solo unos pocos

microorganismos son capaces de metabolizar una sustancia determinada, como insecticidas y herbicidas, estos microbios se ven libres de competencia.

 Los auttrofos no

compiten por nutrientes orgnicos con otros microorganismos. Slo compiten por luz.

Desarrollo de

Nitrosomonas y Nitrosobacter es limitado por compuestos nitrogenados apropiados.

OXGENO
Los requerimientos de oxgeno de los microorganismos varan:
Aerobios

Anaerobios
Microanaerobios Anaerobios

facultativos

 El oxgeno determina el desarrollo de

poblaciones de microorganismos detrimento de otras.

en

 En el ensilado, los forrajes son

comprimidos y recubiertos para: Establecer condiciones de anaerobiosis con el fin de promover el crecimiento de microorganismos anaerobios tiles o microaerfilos como Lactobacillus Mientras se impide el desarrollo de los que tienden a descomponer el forraje (pudricin).

 En suelos poco aireados

hay competencia por el uso del oxgeno El oxgeno es disponible y ello puede esencial para llevar a un descenso en la muchos microorganismos proporcin de microorganismos aerobios fijadores de En consecuencia nitrgeno. disminuye la fijacin de nitrgeno y tambin de la velocidad de degradacin de la materia orgnica.

 El nivel de aporte de oxgeno

tambin determina la forma de metabolizacin de los nutrientes.

Los anaerobios facultativos metabolizan los

polisacridos aerobicamente en presencia de oxgeno, descomponiendolos hasta dixido de carbono y agua con alta liberacin de energa. Cuando no hay oxgeno lo hacen anaerobicamente, mediante el proceso de fermentacin, en el cual la degradacin slo es parcial y con poca liberacin de energa.