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BIOQUMICA Ao 2013
GLS
POLISACRIDOS
GLICRIDOS
GLUCOSA
GLICEROL + AG
2 Etapa
PIRUVATO
ACETIL-CoA
ADP + Pi
ENERGA en ATP
- O2 + O2
Fermentacin a Alcohol en levaduras
- O2
Fermentacin a Lactato en esfuerzos musculares, eritrocitos, otras clulas y algunos microorganismos
Reacciones individuales.
Estequiometra y rendimiento energtico.
Regulacin.
Glicosilacin Acilacin
1. 2. 3. 4. 5.
(-)
Piruvato
Translocasas
Es el final de la glucolisis Es un punto de inicio para la gluconeognesis. En la fermentacin es convertido a lactato , etanol, AGV. Algunos AA se degradan a Piruvato, y a estos les da origen: alanina, cisteina, glicina, serina, treonina, y triptofano.
Las Enzs que actan s/ el Piruvato son:
Piruvato Quinasa
Piruvato Descarboxilasa Piruvato Deshidrogenasa
Lactato Deshidrogenasa
Piruvato
Cosustrato prosttico
Sustrato soluble
Coenzima A NAD+
CH2 CH2OH
+
H3C S CH2 N N
N H3C
Piruvato Deshidrogenasa
Fuente de acetil-CoA para el ciclo del cido ctrico
Piruvato + NAD
Todo el complejo puede inactivarse con compuestos con arsnico que se unen a sulfhidrilos (como en dihidrolipoamida)
-O
As
OH OH
HS
-O
As
S S R
Arsenito
HS
HS R R As R
R-As=O
Arsenical orgnico
S S
HS
La actividad del complejo Pir-DH es coordinada por la proporcin de Coenzima A acetilada y libre.
E2 (componente transacetilasa)
Es inhibida por acetil-CoA y activada por CoA-SH.
Regulacin
En mamferos, E1 del complejo piruvato dehidrogenasa es susceptible de modificacin covalente. + Fosforilacin de Ser en eucariotas
Pir-DH-kinasa (+) y Pir-DH-Fosfatasa (-)
E3 (componente Dihidrolipoamida-DH)
Es inhibida por NADH y activada por NAD+.
[NADH]/[NAD] y [acetil-CoA]/[CoA]
Acetil-CoA
El enlace tioester posee una alta energa libre de hidrlisis
Se origina en: Glucosa, cidos grasos y aminocidos. Es precursor de: cidos grasos, colesterol, aminocidos y se oxida en el Ciclo de KREBS
Aporta los dos C que se van a oxidar en el ciclo
Bicarbonato
Piruvato
Piruvato Carboxilasa
Estrategia General y objetivos del Ciclo del Acido Ctrico (C. de Krebs) En cada vuelta se introducen 2 carbonos (Acetil-CoA), y su equivalente ser totalmente oxidado. Se liberan 2 molculas de CO2. La energa libre de la oxidacin se conserva en forma de coenzimas reducidas (NADH y FADH2) y GTP. Los intermediarios se reciclan y pueden dar AA, AG, Colesterol, Glc, Porfirinas, oxidar esqueletos de AA.
1 - CITRATO SINTASA
Adicin de un grupo acetilo (transportado por HS-CoA) al Oxalacetato = Citrato
2 - ACONITASA
Cambio de un grupo -OH del Citrato de la posicin 3 a la 2, dando Isocitrato
3 - ICDH + NAD+:
Deshidrogenacin y descarboxilacin. Oxidacin del -OH del Isocitrato de la posicin 2, debilitacin y prdida del -COO- central, dando Oxalosuccinato (alfa-cetoglutarato)
4 - -CETOGLUTARATO DH + NAD+:
Deshidrogenacin , descarboxilacin y sntesis (Similar a reaccin de Piruvato-DH) Por la oxidacin se debilita y pierde el COO- . Ingresa 1 HS-CoA que transporta el Succinato, central, dando Oxalosuccinato (alfa-cetoglutarato)
5 - SUCCINIL-CoA SINTETASA:
Hidrlisis del Succinil-CoA, c/liberacin de suficiente E p/sntesis de GTP
6 - SUCCINATO DH + FAD+:
Oxidacin con insaturacin del Succinato
7 - FUMARASA + H2O:
Hidratacin del Fumarato
8 - MALATO DH + NAD+:
Oxidacin del Malato en su grupo alcohol (a carbonilo) reconstituyendo Oxalacetato.
EC 2.3.3.1. EC 4.2.1.3.
[[Cis-Aconitato]
EC 1.1.1.37.
EC 1.1.1.41/42.
EC 4.2.1.2.
EC 6.2.1.4. EC 1.3.99.1.
Molculas: Simtrica
Asimtricas (quiral)
Balance
180 g (1 mol) Glucosa son oxidados por 192 g (6 moles) de oxgeno y se forman 264 g (6 moles) de CO2
Glucosa + Oxgeno => Dixido de Carbono + Agua + Energa o bien, C6H12O6 + 6O2=> 6CO2 + 6H2O G = -686 kcal/mol
Formacin de ATP en la Gluclisis, descarboxilacin oxidativa del Piruvato, Ciclo de Krebs y Sistema acoplado de Cadena Respiratoria-Fosforilacin Oxidativa.
Sustratos
Glucosa Fructosa-6-P 2 Gliceraldehidos-1,3-diP 2 1,3-diP-Gliceratos 2 PEP 2 Piruvatos 2 Isocitratos Glc-6-P Fru-1,6-diP
Productos
-1ATP -1ATP 2NADH 2 ATP 2 ATP 2 NADH 2 NADH
*ATP
-1 -1 3,5 2 2 5 5
2 -Cetoglutaratos 2 Succinil-CoA
2 Succinatos 2 Malatos TOTAL
2 Succinil-CoA 2 Succinatos
2 Fumaratos 2 Oxaloacetatos
5 2
3 5 30-32
Calculando segn: 2,5 ATP por NADH y 1,5 ATP por FADH2.
2 ATP
La velocidad de la Gluclisis y la del Ciclo de Krebs (que consume AcetilCoA) estn integrados (bajo condiciones normales) por:
a) Inhibicin por altos niveles de ATP y NADH (componentes comunes de ambas vas); y b) Por la concentracin de Citrato (producido en Krebs que inhibe la Fosfofructoquinasa de la Gluclisis) Se metaboliza tanta Glc requiera el Ciclo de Krebs
Las reacciones de transaminacin y desaminacin de AA son reversibles, por lo que su direccin vara en funcin de la demanda metablica.
biosinttico
ahorro de energa Remocin de intermediarios puede saturarse. nica va enzimtica saturable azcares cidos grasos
TERMODINAMICA Y BIOENERGTICA
Bioenergtica: leyes de la termodinmica -Estudia las transformaciones de energa que tienen lugar en la clula.
Auttrofos: Pueden utilizar el CO2 como fuente de C (bacterias, vegetales). Hetertrofos: obtienen C de molculas orgnicas complejas (animales,
microorganismos).
CLULA ANIMAL
Energa qumica para realizar trabajo proviene de la oxidacin de sustancias incorporadas como alimentos (carbohidratos, grasas).
Metabolismo:
suma de las reacciones qumicas que ocurren en la clula
(organizadas en series de reacciones catalizadas) =
rutas metablicas
Fase de degradacin
Fase de sntesis
ATP ADP NADPH+H+ NADP+
Catabolismo:
Anabolismo:
En una transformacin qumica, gralmente se rompen enlaces y el contenido de energa (E) de las molculas aumenta o disminuye (G aumenta o disminuye).
A n a l o g a s
N a t u r a l e s
Beta-Oxidacin y Krebs
NADH, NADPH y FADH2
son los principales transportadores de electrones, ya que sufren oxidaciones y/o reducciones reversibles.
Sus reducciones, permiten la conservacin de la Energa Libre que se produce en la oxidacin de los sustratos
DEFINICIONES
ENERGA: Es la capacidad para producir un trabajo. SISTEMA: toda porcin del universo que se somete a estudio MEDIO: es lo que rodea al sistema
EQUILIBRIO QUMICO
Para cada reaccin qumica, el valor de la Keq es caracterstico a una T dada. Si Keq >1, la reaccin se encuentra desplazada hacia
PRINCIPIOS DE LA TERMODINMICA
PRIMER PRINCIPIO: LA ENERGA TOTAL DEL UNIVERSO PERMANECE CONSTANTE Equivale a decir: la energa del universo no se crea ni se destruye, permanece invariante. Solo se transforma.
SEGUNDO PRINCIPIO: LA ENTROPA DEL UNIVERSO AUMENTA Equivale a decir que el grado de desorden en el universo aumenta.
DEFINICIONES
ENTALPA (H): es la energa en forma de calor, liberada o consumida en un sistema a ,T y P constantes. ENTROPA (S): energa no degradada, no utilizada para realizar trabajo. ENERGA LIBRE (G): Representa la energa intercambiada en una reaccin qumica. Es la energa disponible para realizar trabajo.
De acuerdo a la termodinmica, la direccin preferencial para una reaccin est determinada por el compromiso entre las tendencias hacia enlaces ms fuertes y mayor desorden.
Se dice, entonces, que la diferencia entre H y TS equivale a una cierta cantidad de energa til para hacer trabajo, la que se denomina como energa libre y se simboliza con la letra G. Esta propiedad del sistema se conoce comnmente como la energa libre de Gibbs.
Fundamentalmente slo hay dos razones por la que ocurre una reaccin qumica: (1) la tendencia a lograr el mnimo de energa (2) la tendencia a lograr el mximo desorden Medir el contenido de energa de un sistema es muy difcil, generalmente se mide el cambio de energa entre dos estados.
1 A 2 B
Matemticamente: G = H -TS
PROCESO
PROCESO PROCESO
G = Gfinal Ginicial
G < 0 (FACTIBLE y EXERGNICO) G = 0 (ISOERGNICO-en equilibrio) G > 0 (NO FACTIBLE y ENDERGNICO)
REACCIONES CON:
Glucosa-6-fosfto
(-13.8)
Es el compuesto de alta energa de mayor importancia en la clula. El ATP a pH fisiolgico se encuentra como ATP4-. Las 4 cargas negativas se encuentran prximas y originan tensiones intramoleculares que desaparecen al hidrolizarse en ADP+Pi o AMP+PPi.
ATP
Adems los productos de la hidrlisis se solvatan mejor y se estabilizan por resonancia contribuyendo a disminuir G y desplazando la reaccin hacia
Desde el punto de vista energtico, una reaccin con un G positivo no podra ocurrir a no ser que exista un aporte de energa que la haga posible. Dicho aporte, lo proveen compuestos de alto contenido energtico, que se caracterizan por tener enlaces que al romperse liberan una alta cantidad de energa. Este proceso se llama acoplamiento.
MOLECULAS DE ALTA ENERGIA : ATP, Acetil-CoA, Creatina Fosfato, Fosfoenol Piruvato, por ejemplo.
Las Enzimas pueden combinar reacciones exergnicas con endergnicas para resultar en una reaccin acoplada que en conjunto es exergnica (reaccin espontnea).
Una reaccin altamente exergnica puede hacer que otra endergnica ocurra si ambas se acoplan.
G(kcal/mol)
-7,3
AMP + P
adenosina
-7,7
-3,4
+ P
Este principio explica por que una reaccin termodinmicamente desfavorable puede ocurrir, si se acopla a otra reaccin que sea exergnica, a travs de un intermediario comn
ACTIVACION
Es la unin de molculas biolgicas de modo tal que, la ruptura de ese enlace qumico formado, tiene un G <0
Ejs: 1) A + COENZIMA
A-COENZIMA + B
2) FOSFORILACION
A-COENZIMA
AB + COENZIMA
G<0
Estructura qumica de la Acetil CoA. El grupo acetilo aparece a la izquierda de la figura, unido al azufre (S)
La Al
Coenzima A es un transportador de grupos acilo. grupo sulfhidrilo terminal, se unen los grupos acilo mediante un enlace tioester.
La
hidrlisis de un tioester es muy favorable termodinmicamente, lo que hace que esta molcula tenga un alto potencial de transferencia de grupos acilo.
CoA es un transportador de acilos activado igual que el ATP es un transportador de P activado.
La