TRADUCCION

Jorge Carlos Vzquez Snchez.

 Cdigo

gentico. Activacin AA. Carga AA al RNAt Inicio Traduccin: procariotas. Elongacin Terminacin. Traduccin eucariota

ndice

Cdigo gentico.
El

cdigo gentico es la relacin entre la secuencia de bases en el DNA y la secuencia de aminocidos en las protenas.
42 = 16(no son suficientes 20 Aminocidos

A,T,G,C

para)

43

= 64 combinaciones diferentes

Caractersticas del Cdigo gentico.

a)

Tres nucletidos codifican un aminocido El cdigo no se solapa El cdigo no tiene puntuacin

b)

c)

d)

El cdigo gentico esta degenerado

Tres nucletidos codifican un aminocido

El cdigo no se solapa

Con solapamiento ABC BCD CDE DEF Sin solapamiento.

ABC EFG IJK MNO

El cdigo no tiene puntuacin

Suponiendo

la Q como una coma QABCQDEFQGHIQJKLQ

Este

no es el caso.

ABDCDEFGHIJKLMNOP

El cdigo gentico esta degenerado

El balanceo permite que algunos tRNA reconozcan mas de un codn

Hiptesis de balanceo.

Las 2 primeras bases de un codn del mRNA siempre forman pares de bases fuertes, con las bases correspondientes del anti codn del tRNA y son responsables de la mayor parte de la especificidad del cdigo.

La primera base del anti codn ledo en direccin (5--3; esta se aparea con la 3 base del codn) determina el numero de codones que pueden ser reconocidos por el tRNA.
Cuando un aminocido es especificado por varios codones diferentes, los codones que difieren en cualquiera de las 2 primeras bases requieren tRNA diferentes. Para que se pueda producir la traduccin total de los 61 codones se requiere de 32 tRNA (31 se utilizan para codificar los aminocidos y 1 para el inicio

Elementos para la sntesis de protenas: RNAm El ribosoma

El sitio A El sitio P El sitio E

RNAt

(RNA de transferencia) Codones Anticodones Aminocidos

RNA mensajero

El RNAm proporciona informacin sobre el orden de los aminocidos con su secuencia de nucletidos. Se produce en el ncleo y sale al citosol, en otros se producen en mitocondrias y cloroplastos. En la secuencia de nucletidos es 5- 3.

RNA mensajero

Los puntos de inicio y final de la traduccin esta bien definido con tripletes de iniciacin y STOP. El triplete de iniciacin codifica el primer aminocido, y el triplete de parada esta despus del que especifica el ltimo aminocido.

La parte no codificante se une al ribosoma proporcionando estabilidad.

Ribosomas

Son complejos de ribo nucleoprotenas. Consisten de dos subunidades: una pequea y otra mayor.

La subunidad ribosmica pequea

Tiene una unidad de sedimentacin 30s en procariotes y 40s en eucariotes. Contiene un solo RNAr (16s en procariotes y 18s en eucariotes).
El nmero de protenas varia de 21 en procariotes y 33 o ms en eucariotes.

La subunidad ribosmica mayor

La subunidad ribosomal (50S) de E. coli contiene 34 proteinas y dos RNAr: 5S y 23S. El 23S RNAr es el agente cataltico en la formacin del enlace peptdico Ambas molculas de RNAr adoptan una estructura compacta.

La subunidad mayor

La subunidad (60S) del ribosoma eucariote contiene aproximadamente 50 proteinas y 3 molculas de RNAr: 28S, 5.8S y 5S. Los RNAr 28S y 5.8S estn relacionados al rRNA 23S bacteriano.

RNA transferencia

En el ribosoma se lleva a cabo el proceso de traduccin. El ARNt funciona como adaptador entre aminocidos y ARNm.
Los aminocidos han de ser complementarios de los tripletes, por lo que es necesario que esta molcula adaptadora, es un cido nucleico porque debe ser capaz de reconocer codones y complementarlos.

Caractersticas del RNAt

Los RNAt son secundaria.

muy

pequeos,

estructura

Es especfico para un aminocido pero puede decodificar ms de un codn. Son 31 RNAt y se clasifican de acuerdo al aminocido que cargan RNAt isoaceptores: pegan el mismo aminoacidos pero difieren en su estructura , en el anticodn, por lo que interactan con diferentes codones.

Biosntesis de las protenas

Tiene 1.

2.
3. 4. 5.

lugar en 5 etapas. Activacin de los Aminocidos. Inicio. Elongacin. Terminacin y liberacin. Plegamiento y modificacin pos traduccin

Activacin AA

La sntesis de un polipeptido de secuencia definida exige el cumplimiento de 2 requerimientos fundamentales. El grupo carboxilo de cada aminocido debe ser activado para facilitar la formacin del enlace peptdico. Cada nuevo aminocido debe ser incorporado de acuerdo con la informacin contenida en el mRNA

1.

2.

Carga AA al RNAt
Fase 1 las aminoacil-tRNA sintetasas unen los aminocidos correctos a sus tRNA

La aminoacilacion del tRNA consigue 2 objetivos: 1. La activacin de un aminocido para formar un enlace peptdico. 2. La unin del aminocido a un tRNA adaptador que asegura la Colocacin apropiada del aminocido a una cadena polipeptidica En crecimiento

Inicio Traduccin : Procariotas

El mRNA portador del cdigo del polipeptido que se ha de sintetizar se une a la menor de las 2 subunidades ribosmicas y al aminoacil iniciador. La subunidad ribosmica mayor se une a continuacin para formar el complejo de inicio

Este proceso requiere GTP, es promovido por protenas Cistlicas denominadas factores de inicio

La sntesis de protenas empieza con un aminocido especifico

Codn de inicio AUG(Especifica un residuo de Metionina)

Procariotas

Requiere Formil metRNAt, NTPs, GTP y factores proteicos

Se separan las subunidades

La regin 5 no traducida Shine Dalgarno (SHD) interacta con la subunidad 30 S del ribosoma Pueden existir varios SHD (AGGAGG) por eso RNAs son policistrnicos

iniciacin
Para que el ARNm se traduzca correctamente, el ribosoma debe estar colocado en la ubicacin correcta para el inicio. Por ello la seal de inicio es precedida por un segmento de ARNm rico en purina llamado secuencia de Shine-Dalgarno (SHD) 5-GGAGGU-3 Esta se une a una secuencia rica en pirimidina sobre el ARNr 16s que forma parte de la subunidad 30s y lo alinea para la traduccin correcta. Para procariotas: GUG tanto como AUG y raramente UUG.

Elongacin.

La cadena polipeptidica naciente se alarga mediante la unin covalente de sucesivas unidades de aminocidos, transportada cada una al ribosoma y posicionada correctamente por su tRNA.

Terminacin.

La finalizacin de la cadena polipeptidica esta sealada por un codn de terminacin del mRNA. A continuacin, la cadena polipeptidica se desprende del ribosoma con ayuda de protenas denominadas factores de liberacin.

Plegamiento y modificacin pos traduccin

Para adoptar su forma biologicamente activa, el nuevo polipeptido ha de plegarse en su conformacion tridimensional adecuada

Traduccin Eucariotas

El ribosoma y sus subunidades son mas grandes (40S + 60S 80S).

Los RNAr son mayores y hay mas protenas por subunidad ribosomica.
La subunidad mayor contiene los RNAr 28S y 5S, pero adems una 5.8S adicional que no existe en procariontes. El ribosoma no tiene sitio E. El RNAm es diferente y sus elementos distintivos son importantes.

 Durante el viaje al citoplasma, el RNAm puede adquirir una estructura secundaria que el ribosoma tiene que eliminar antes de traducirlo. El codn de iniciacin es siempre AUG y no hay secuencias Dalgarno.

La Met iniciadora no esta formilada.

El RNAm tiene que prepararse para interaccionar con el ribosoma. Los factores de traduccion son distintos (aunque muchos tienen funciones analogas) y se nombran comenzando por e.

Traduccin, Eucariota

Las clulas eucariotas requieren por lo menos 12 factores de inicio que incluyen un total de mas de 25 cadenas polipeptidicas

Iniciacin en Eucariotas
Paso1:

ensamblaje de un complejo 43s de pre inicio.

Metionina se une al ARNt (iniciador). Este complejo es llevado a la subunidad 40s con GTP e eIF2. El 40s se enlaza con eIFIA y eIF3.
El

ARNt se enlaza al ribosoma sin la presencia del ARNm.

iniciacin en Eucariotas
Paso2:

se recluta el ARNm, el sombrero 5 orienta al ribosoma al UAG correcto a travs de lo que se denomina mecanismo de escaneo, impulsado por la hidrolisis de ATP. El eIF4 es una protena de enlace con sombrero que forma un complejo con varios eIF. Una protena de enlace poli A enlaza la cola poli A con el eIF4G.

 El

complejo eIF-40s se posiciona inicialmente cadena arriba respecto al primer AUG que encuentre. Secuencias de Kozak

Secuencias de kozak: algunas bases que rodena al codn de inicio y determinan el contexto correcto. Es una secuencia consenso (-3ACCAUGG+4)

 Paso

3: la subunidad 60s es reclutado para formar el complejo de iniciacin 80s. El GTP se hidroliza y los factores de iniciacin se liberan.

Elongacin:
Objetivo: adicin de aminocidos al extremo carboxilo de la cadena. Consiste en el alargamiento de la cadena proteica. Al inicio de un nuevo ciclo: o sitio P tiene un peptidil-aminoacil-tRNA o sitio A est vacio Se inicia cuando un segundo aminoacil-ARNt, cuyo anticodn es complementario al codn situado a continuacin del iniciador, entra en el ribosoma y ocupa el sitio A libre.

Elongacin:

El siguiente paso es la formacin de un enlace peptdico entre el aminocido que ocupa el sitio P (que suele ser metionina o N-formil metionina) y el nuevo aminocido que ocupa el sitio A. La reaccin de formacin del enlace peptdico est catalizada por el enzima peptidil-transferasa.

 Elongacin:

Peptidil transferasa (ribozima): es una molcula de ARNr con actividad cataltica y componente de la subunidad mayor del ribosoma. Funcin: Formacin de enlaces peptidcos.

Como consecuencia de la formacin de este enlace peptdico, el segundo ARNt queda unido por un extremo al dipeptido formado y por el otro a su codn complementario.

 Elongacin:
En

PROCARIOTAS: es importante la presencia de los siguientes factores de elongacin: EF-Tu (colabora en la incorporacin del aatRNA al ribosoma) EF-Ts (ayuda a regenerar la forma activa, Tu:GTP) EF-G (facilita el desplazamiento del ribosoma a lo largo del mRNA).

 Elongacin:

A continuacin se produce la translocacin del ribosoma. La translocacin implica el desplazamiento del ribosoma a lo largo del ARNm en sentido 5- 3. Como este desplazamiento es exactamente de tres bases, el primer ARNt abandona el ribosoma, y el peptidil-ARNt, que todava se mantiene unido a su codn, pasa a ocupar el sitio P, quedando el sitio A libre. Para la translocacin se requiere otro GTP y otro factor de elongacin, EF-G (translocasa) Termina con la hidrlisis de GTP a GDP + Pi y la liberacin del EF-G.

Elongacin:

En estas condiciones, otro aminoacil-ARNt se puede incorporar al sitio A, de manera que el proceso de alargamiento de la cadena proteica puede continuar, repitindose el ciclo.

Elongacin:
En EUCARIOTAS: Hay dos factores de elongacin:
eEF1 sustituye a EF-Ts y EF-G. eEF2 sustituye a EF-G.

Terminacin:

Tiene lugar cuando el ribosoma llega a un lugar del ARNm donde se encuentra en codn de terminacin (UAA, UGA O UAG), que no es reconocido por ningn ARNt.

Pero s por factores de liberacin: o Se sitan en el sitio A o Hacen que la peptidil-transferasa separe, por hidrlisis, la cadena polipeptdica del ARNt.

A su vez se separan las subunidades del ribosoma. Finalmente el tRNA y los factores de liberacin se disocian. Se hidroliza una molcula de GTP.

Terminacin:
En PROCARIOTAS: Estn implicadas tres factores de liberacin o factores de terminacin RF. Unin de los factores de liberacin: o RF1 reconoce UAA y UAG. o RF2 reconoce UAA y UGA. Actun en el sitio A de ribosoma. Un tercer factor de liberacin, RF3 estimula la unin de RF1 y RF2. En EUCARIOTAS: El factor de liberacin que acta es el eRF

medida que se va sintetizando, las protenas adquieren la estructura secundaria y terciaria que le corresponde, mediante la formacin de enlaces de hidrgeno y enlaces disulfuro entre los aminocidos que la forman.

 Tanto

en procariotas como en eucariotas, si el ARNm que se tiene que traducir es lo suficientemente largo, puede ser ledo por ms de un ribosoma a la vez, formndose un polirribosoma o polisoma.

Procariotas

Eucariotas

envoltura nuclear y la La traduccin es simultnea a la La maduracin que sufren los ARNm transcripcin. impiden su traduccin inmediata. El ARNm es "ledo" despus de que haya abandonado el ncleo a travs de los poros nucleares.

El ribosoma y sus subunidades son El ribosoma y sus subunidades son ms pequeas. ms grandes. 30S, 50S 40S, 60S Una molcula de ARNm contiene Una molcula de ARNm slo muchos lugares de iniciacin. presenta un lugar de iniciacin.

El codn de iniciacin es AUG y el El codn de iniciacin es siempre aminocido que comienza la AUG y no hay secuencias Shinesntesis es la metionina pero en Dalgarno. ocasiones es GUG (valina). La Met iniciadora si esta formilada. F. Iniciacin: IF1, IF2, IF3 F. elongacin: EF-Tu, EF-Ts F. translocacin: EF-G F. liberacin RF1, RF2, RF3 La Met iniciadora no est formilada. F. iniciacin: e1F+CBP1+CBP2 nueve factores

F. elongacin: eEF1 F. translocacin: eEF2 F. liberacin: eRF

Traduccin, Eucariota.

Los mRNA eucarioticos estan unidos al ribosoma formando un complejo con un conjunto especifico de proteinas de union. Varias de estas proteinas unen los extremos 5 y 3 del mensajero. En el extremo 3 se une a una proteina, denominada poli A

Bibliografa.
Lehinger,

principios de bioquimmica. Luber Styer, Bioquimica 6ta edicion Geral kap, Biologia Celular y Molecular