UNIVERSIDAD DEL VALLE DE MÉXICO

CAMPUS CHAPULTEPEC

BIOQUÍMICA I

EXPOSICIÓN

“SÍNTESIS DE MOLÉCULAS ELEMENTALES Y ORIGEN DE LA

VIDA” “ BIOELEMENTOS Y LAS MACROMOLÉCULAS
BIOLÓGICAS”
 BIOMOLÉCULAS
 La bioquímica tiene como objetivo explicar las estructuras y
funciones biológicas en términos químicos.

 A principios del s. XIX resultaba claro para los químicos que

la composición de la materia viva era sorprendentemente
diferente de la del mundo inanimado. Antoine Lavoisier
(1743-1794) observó la relativa simplicidad del “mundo
mineral” y la contrastó con la complejidad de los “mundos
vegetal y animal”; estos últimos estaban formados por
compuestos ricos en los elementos carbono, oxígeno,
nitrógeno y fósforo. La química orgánica se desarrollo con
anterioridad a la bioquímica y le proporcionó más tarde
información muy valiosa.
 COMPOSICIÓN QUÍMICA
La materia viva se compone principalmente de
los elementos más ligeros

 Tan sólo alrededor de 30 de los más de 90

elementos químicos presentes en la naturaleza
son esenciales para los organismos vivos. La
mayoría de los elementos de la materia viva
tiene números atómicos relativamente bajos;
tan sólo 5 de ellos tienen números atómicos
superiores al del selenio 34.
 Los cuatro elementos más abundantes en los organismos vivos, en
términos de porcentaje sobre el número total de átomos, son el
hidrógeno, el oxígeno, el nitrógeno y el carbono, que en conjunto
representan más del 99% de la masa de la mayor parte de las células.
Son los elementos más ligeros capaces de formar 1, 2, 3 y 4 enlaces
covalentes, respectivamente. En general, los elementos más ligeros
forman los enlaces más fuertes.
 Seis de los elementos más importantes en el cuerpo humano se
encuentran además entre los 9 elementos más abundantes en el agua
de mar, mientras que varios de los elementos abundantes en el cuerpo
humano son componentes de la atmósfera y se encontraban también
probablemente presentes en la atmósfera previa a la aparición de la
vida en la Tierra.
 La primitiva agua de mar fue con toda probabilidad el medio líquido
en el que aparecieron los primeros organismos, mientras que la
atmósfera primitiva fue probablemente una fuente de metano,
amoniaco, agua e hidrógeno, los materiales de partida para la
evolución de la vida.
ABUNDANCIA DE LOS ELEMENTOS EN EL AGUA DE MAR, EL CUERPO HUMANO Y
LA CORTEZA TERRESTRE

Agua del mar (%) Cuerpo Humano (%) Corteza Terrestre (%)

H 66 H 63 O 47

O 33 O 25.5 Si 28

Cl 0.33 C 9.5 Al 7.9

Na 0.28 N 1.4 Fe 4.5

Mg 0.033 Ca 0.31 Ca 3.5

S 0.017 P 0.22 Na 2.5

Ca 0.0062 Cl 0.08 K 2.5

K 0.0060 K 0.06 Mg 2.2

C 0.0014 ♆ Los valores se expresan en porcentaje sobre el

número total de átomos.
Los oligoelementos representan una fracción minúscula de peso del cuerpo
humano, pero todos ellos son absolutamente esenciales para la vida, generalmente
a causa de que resultan totalmente necesarios para la función de enzimas
específicas.

LAS FUNCIONES BIOLÓGICAS DE ALGUNOS OLIGOELEMENTOS

Elemento Ejemplo de función biológica
Fe Transportador electrónico en reacciones de óxido-reducción.
Cu Componente de la oxidasa mitocondrial
Mn Cofactor de la arginasa o otras enzimas
Zn Cofactor de las deshidrogenadas
Co Componente de la Vitamina B12
Mo Componente de la enzima fijadora de N2
Se Componente de la enzima glutatión peroxidasa
V Cofactor de la enzima Nitrato Reductasa
Ni Cofactor de la enzima Ureasa
I Componente de la hormona tiroidea
Mg Cofactor de la fotosíntesis.
 Las biomoléculas son compuestos de Carbono
 La química de los organismos vivos se organiza alrededor del
elemento carbono, que representa más de la mitad del peso seco
de las células.
 La capacidad de los átomos de Carbono de compartir pares de
electrones entre ellos para dar lugar a enlaces simples carbono-
carbono de gran estabilidad resulta de gran trascendencia en
biología. Cada átomo de carbono puede formar enlaces simples
con 1, 2, 3 o 4 átomos de carbono diferentes. Dos átomos de
Carbono pueden compartir también 2 (o tres) pares de
electrones, dando lugar a enlaces carbono-carbono dobles (o
triples).
 Los átomos de carbono unidos covalentemente
pueden formar cadenas lineales, cadenas ramificadas
y estructuras cíclicas y en forma de celda. A estos
esqueletos carbonados se les unen otros grupos de
átomos, denominados grupos funcionales, que
confieren propiedades químicas específicas a la
molécula. Las moléculas que contienen esqueletos
carbonados unidos covalentemente se denominan
compuestos orgánicos; el número de ellos y su
variedad son casi limitados.
 La mayor parte de biomoléculas son compuestos
orgánicos; podemos por tanto deducir que la
versatilidad de enlace del carbono constituyó un
factor decisivo en la selección de los compuestos de
carbono para la maquinaria molecular de las células
durante el origen y la evolución de los organismos
vivos.
 Los compuestos orgánicos tienen
dimensiones y formas específicas
 Los 4 enlaces
simples covalentes
que pueden formar
un átomo de carbono
se distribuyen
tetraédricamente, con
n ángulo de 109.5º
entre ellos y una
longitud media de
0.154nm
 Existe libertad de rotación alrededor de cada enlace simple
Carbono-carbono a no ser que ambos átomos de carbono
estén unidos a grupos muy voluminosos o cargados, en cuyo
caso la rotación puede estar restringida. Un enlace doble C-C
es más corto (aprox. 0.134nm) y rígido, y prácticamente no
permite rotación alrededor de su eje
 Ningún otro elemento químico puede constituir moléculas con
formas y tamaños tan diferentes o con tanta variedad de
grupos funcionales
 Los grupos funcionales determinan
las propiedades químicas
 Puede considerarse que la mayor parte de las biomoléculas son
derivados de los hidrocarburos, compuestos que tienen un
esqueleto de átomos unidos covalentemente a los que solo se
unen átomos de hidrógeno. Los esqueletos de hidrocarburo son
muy estables. Los átomos de hidrógeno pueden ser
reemplazados por una amplia gama de grupos funcionales para
dar lugar a las diferentes familias de compuestos orgánicos.
 Las familias más comunes de compuestos orgánicos son los
alcoholes, con uno o más grupos hidroxilo, las aminas, que
tienen grupos amino, los aldehídos y las cetonas, con grupos
carbonilo y los ácidos carboxílicos, que tienen unidos grupos
carboxilo.
 Muchas biomoléculas son polifuncionales y
contienen 2 o más tipos diferentes de grupos
funcionales, cada no con sus propiedades
características químicas y su reactividad propia.
 Los aminoácidos, una importante familia de
biomoléculas que actúan principalmente como
subunidades monoméricas de las proteínas
contienen como mínimo 2 tipos diferentes de
grupos funcionales: uno amino y un grupo
carboxílico. La capacidad de un aminoácido para
condensarse con otros aminoácidos para formar las
proteínas depende de las propiedades químicas de
estos 2 grupos funcionales.
 ESTRUCTURA
TRIDIMENSIONAL
 Los enlaces covalentes y los grupos funcionales de las
biomoléculas, a pesar de tener gran importancia
central con vistas a su función, no son los únicos
factores a tener en cuenta. También resulta de crucial
importancia la distribución de los átomos de una
biomolécula en el espacio tridimensional.
 Los compuestos de carbono pueden existir a menudo
en 2 o más formas tridimensionales químicamente
indistinguibles, de las cuales solamente una es
biológicamente activa. Esta especificad por una
configuración molecular particular es una
característica universal de las interacciones
biológicas. Toda la bioquímica es tridimensional.
MOLECULAS ELEMENTALES
 AMINOACIDOS

 BASES AROMATICAS

 AZUCARES

 ACIDO GRASO
 AMINOACIDOS
 20 AMINOACIDOS,
SUBUNIDADES
FORMADORAS
(MONOMEROS DE
TODAS LAS
PROTEINAS).
 5 BASES AROMATICAS
BASES AROMATICAS,
2 PURICAS (ADENINA Y GUANINA) Y 3
PIRIDIMICAS (CITOSINA, URACILO,Y
TIMINA), AL ESTAR UNIDAS ALGUNAS DE
LAS BASES CON EL AZUCAR RIBOSA
FOSFATO O EL AZUCAR DESOXIRRIBOSA
FOSFATO FORMAN LOS NUCLEOTIDOS,
UNIDADES MONOMERICAS DEL ACIDO
RIBONUCLEICO ARN Y EL ACIDO
DESOXIRRIBONUCLEICO
 AZUCARES
 DOS AZUCARES LA D-GLUCOSA
PRODUCTO PRINCIPAL DE LA
FOTOSINTESIS DE LAS PLANTAS Y UN
INTERMEDIARIO CENTRAL EN EL
METABOLISMO Y LA D-RIBOSA, ES EL
PRECURSOR DE LOS AZUCARES
FOSFATO DE LOS NUCLEOTIDOS
 ACIDOS GRASOS
 UN ACIDO GRASO, EL TRIALCOHOL
GLICEROL, Y LA AMINA COLINA
CONSTITUYEN LAS MOLECULAS DE
LOS DEPOSITOS DE GRASA Y CERA EN
LOS ORGANISMOS DE MUCHAS OTRAS
ESTRUCTURAS DE INTERES EN LA
VIDA
 En las células se dan cinco tipos
de transformaciones químicas
1. oxidaciones y reducciones
2. reacciones de reordenación de la estructura de enlaces
alrededor de uno o mas átomos de carbono
3. reacciones en las que se forman o rompen enlaces carbono-
carbono
4. y reacciones en las que se produce condensación de dos
moléculas, con la eliminación de una molécula de agua
En muchas reacciones bioquímicas se dan interacciones entre
nucleofilos, grupos funcionales ricos en electrones y capaces
de donarlos, y electrofilos, grupos funcionales deficitarios en
electrones que se comportan como aceptores.
LAS MACROMOLECULAS Y SUS
SUBUNIDADES MONOMÉRICAS
La síntesis de la macromoléculas es una de las
actividades celulares que mas energía
consume. La macromoléculas pueden formar
posteriormente estructuras
supramacromoleculares, dando lugar a las
unidades funcionales del tipo de los
ribosomas, las membranas y los orgánulos.
 Las macromoléculas son los
constituyentes principales de los
organismos
Prácticamente toda la materia
sólida de cualquier tipo de
células es orgánica y se halla
presente en cuatro formas:
proteínas, ácidos nucleicos,
polisacáridos y lípidos.
 Las proteínas, largos polímeros de aminoácidos,
constituyen, el agua aparte, la fracción celular mas
importante. Las proteínas son quizá las más versátiles
de las biomoléculas. Los ácidos nucleicos, DNA y
RNA, son polimeros de nucleicos. Participan en el
almacenaje, transmisión y traducción de la
información genética. Los polisacaridos, polímeros de
azucares simples como la glucosa, tienen dos
funciones principales: sirven como almacén de
combustibles energéticos y como elementos
estructurales extracelulares. Los lípidos, derivados
hidrocarbonados grasos o aceitosos, sirven de
componentes estructurales de las membranas y de
reserva de combustible rico en energía, además de
cumplir otras funciones.
 Las macromoléculas se construyen a
partir de subunidades monoméricas
 Las subunidades monoméricas simples a
partir de las que se construyen todas las
proteínas y todos los ácidos nucleicos son
muy pocas y además son idénticas en todas
las especies vivas. Las proteínas y los ácidos
nucleicos son macromoléculas informativas;
cada una de ellas posee una secuencia de
subunidades características y rica en
información.
 Las subunidades monoméricas
tienen estructuras simples
Las subunidades monoméricas de las
proteinas son 20 aminoacidos diferentes;
todos ellos possen un grupo amino y un
grupo carboxilo unido al mismo átomo de
carbono, denominado por convención el
carbono alfa.

Las unidades estructurales que se repiten en

los acidos nucleicos son ocho nucleótidos
diferentes; cuatro tipos constituyen las
unidades estructurales del DNA, mientras
otros cuatro lo son del RNA.

Los lípidos se forman también a partir de un

número relativamente pequeño de
subunidades.
 La condensación de subunidades
produce orden y requiere energía
Para dar lugar a la síntesis de macromoléculas a partir de sus
subunidades monoméricas debe suministrarse energía libre al
sistema.
El desorden de los componentes de un sistema químico se expresa com
entropía (S). cualquier variación en el grado de desorden de un
sistema equivales a la variación de entropía, ΔS, que adopta valores
positivos cuando aumenta el desorden. El contenido de energía libre
de cualquier sistema aislado puede definirse en base a tres
magnitudes: entalpía (H), entropía (S), y temperatura absoluta (T).
La definición de energía libre es G=H-TS. Si una reacción química
ocurre a temperatura constante, la variación de energía libre viene
determinada por ΔH, lo que refleja el tipo y la cantidad de enlaces
químicos e interacciones no covalentes que se rompen y forman, y
ΔS, la variación en el grado de desorden del sistema:
 ΔG = ΔH -T ΔS
 Existe una jerarquía en la
estructura celular
En las proteínas, ácidos nucleicos y polisacaridos, las
subunidades individuales se encuentran unidas por
enlaces covalentes. En cambio, en los complejas
supramoleculares, las diferentes macromoléculas se
mantienen unidas por interacciones no covalentes –
mucho más débiles, individualmente, que los enlaces
covalentes-.
Las subunidades monoméricas de las macromoléculas
influyen en la forma y en la función de éstas, a pesar de
ser mucho más pequeñas que las células y los orgánulos.
Jerarquía estructural en la organización molecular de las celulas. El núcleo de esta
célula vegetal, por ejemplo, contiene varios tipos de complejos supramoleculares,
incluyendo los cromosomas. Los cromosomas están formados por macromoléculas
– DNA y muchas proteinas diferentes de subunidades simples – el DNA, por
ejemplo, a partir de desoxirribonucleicos.
 Bibliografía:
PRINCIPIOS DE BIOQUÍMICA
Albert L. Lehninger et al.
Segunda edición
Ediciones Omega, S.A
Barcelona 1993
p.p 56- 80