Organizao Gnica dos Seres Vivos

Genes e Genomas de Procariotos e Eucariotos

Prof. Henrique Santana Costa, M.Sc.

OS SERES VIVOS

OS SERES VIVOS

Todo genoma (eucarioto ou procarioto) possui a funo de servir como repositrio replicativo da informao codificada pelo DNA que o constitui.

Genomas procariticos, contudo, so relativamente mais simples que genomas eucariticos.

PROCARIOTO X EUCARIOTO
Tamanho do genoma. Estrutura molecular. Distribuio de genes.

CARACTERSTICAS PROCARIOTO
Cromossomo nico dsDNA circular

Replicon

Excees Lineares

Streptomyces lividans

Rhodococcus fasciens

Espiroquetas (Borrelia)

CARACTERSTICAS PROCARIOTO
Tamanho do Genoma

~9,5x106pb

Mycoplasma genitalium

Saccharomyces cerevisiae

~0,6x106pb

~13x106pb Myxococcus xanthus

PROCARIOTO
Cromossomo de E. coli
Molcula de DNA fita dupla circular de 4,2 X 10 pb. Por ser capaz de se auto-duplicar, o cromossomo bacteriano considerado um replicon. Sua estrutura compacta dedica-se quase que exclusivamente codificao de protenas (genes estruturais).

CARACTERSTICAS PROCARIOTO

Superposio de genes
Organizao gnica que permite que uma mesma seqncia codifique duas protenas diferentes.

Fenmeno freqente em vrus, bactrias e organelas celulares (mitocndrias).

CARACTERSTICAS PROCARIOTO
Cdon de Iniciao (Start Codon) Alternativo.

CARACTERSTICAS PROCARIOTO
Alterao do Quadro de Leitura.

CARACTERSTICAS PROCARIOTO

Colinearidade
Equivalncia entre a seqncia nucleotdica do gene e a seqncia de aminocidos da protena.

Eucariotos possuem nucleotdicas.

interrupes

em

suas

seqncias

CARACTERSTICAS PROCARIOTO
Colinearidade: Gene Protena

3n nucleotdeos n aminocidos

GENES EUCARIOTO X PROCARIOTO

5 3

GENOMA EUCARIOTO X PROCARIOTO

CARACTERSTICAS PROCARIOTO
Ausncia diplide. de complemento

Praticamente
seqncias redundantes.

sem

Genoma E. coli

Colinearidade entre genes e produtos proticos. Quase todo genoma codificao e regulao.

Unidades acessrias.

genticas

Seqncias codificantes em ambas as fitas.

CARACTERSTICAS PROCARIOTO
Organizao dos genes em operons
Genes que codificam produtos com funes (componentes de uma mesma rota metablica). relacionadas

Responsveis pelo controle da expresso gnica.

Mostram-se presentes apenas em procariotos. Seus produtos so regulados pela presena de substrato.

CARACTERSTICAS PROCARIOTO
Unidades transcricionais policistrnicas (Operons).

Regies intercistrnicas 1 a 30 pb (at 40 pb)

CARACTERSTICAS PROCARIOTO

Coorientao da transcrio e da replicao de genes

A fim de evitar colises entre a RNA-polimerase e o aparato protico da replicao, as unidades transcricionais mais ativas esto orientadas em relao origem de replicao. Replicao bidirecional avanam em direes opostas ao longo do cromossomo (encontrando-se num stio de terminao).

CARACTERSTICAS PROCARIOTO

Posicionamento de genes evolutivamente relacionados em stios opostos do mapa gentico

Padro de organizao explicado (supostamente) por uma prvia duplicao do genoma. Genes que codificam protenas envolvidas numa mesma rota metablica.

CARACTERSTICAS PROCARIOTO

Localizao preferencial dos genes em stios prximos origem de replicao

Maior concentrao de genes prxima ao ponto no qual a replicao do DNA inicia do que prxima ao trmino da mesma. Aumento do nvel de expresso gnica.

CARACTERSTICAS PROCARIOTO

Elementos genticos mveis

Todo genoma de procarioto est contido num nico cromossomo. Exceo elementos genticos mveis.

CARACTERSTICAS PROCARIOTO

1. Bacterifagos. 2. Plasmdeos.

3. Transposons.

CARACTERSTICAS PROCARIOTO
Plasmdeos
Elementos extra-cromossomais com capacidade de replicao constitudos por uma molcula de DNA fita dupla circular. autnoma

Sua seqncia nucleotdica tem pouca ou nenhuma homologia com o cromossomo da clula hospedeira (elemento estranho a bactria).

Conferem vantagens adaptativas s bactrias que os possuem.

produo de toxinas
produo de pilinas produo de adesinas Conferem resistncia a mltiplos antibiticos (tornam problemtico o tratamento quimioterpico de determinadas infeces.)

CARACTERSTICAS PROCARIOTO
Plasmdeos
Elementos extra-cromossomais com capacidade de replicao constitudos por uma molcula de DNA fita dupla circular. autnoma

Sua seqncia nucleotdica tem pouca ou nenhuma homologia com o cromossomo da clula hospedeira (elemento estranho a bactria).

Conferem vantagens adaptativas s bactrias que os possuem.

produo de toxinas
produo de pilinas produo de adesinas Conferem resistncia a mltiplos antibiticos (tornam problemtico o tratamento quimioterpico de determinadas infeces.)

CARACTERSTICAS PROCARIOTO
Bacterifagos
No possuem uma maquinaria prpria (incapazes de se multiplicarem na ausncia de um hospedeiro). Elementos extra-cromossomais que ganharam a capacidade de sintetizar um capsdeo protico. Podem apresentar genomas de RNA, ssDNA circular ou dsDNA linear (colifagos).

Virulentos multiplicam-se dentro da clula hospedeira dando origem a outros que so liberados aps a lise celular (ciclo ltico). Temperados podem se integrar no genoma bacteriano (linhagem lisognica), ou entrar em ciclo ltico.

CARACTERSTICAS PROCARIOTO

Bacterifagos replicons potencialmente letais.

Plasmdeos replicons no letais (dentro de suas clulas hospedeiras). Etapas da infeco coliso, adsoro e injeo do cido nuclico. Ciclo ltico O genoma do fago expressado. Protenas estruturais so sintetizadas e o genoma viral encapsidado (produo de novas partculas virais). Ciclo lisognico O genoma do fago se integra, por recombinao, no genoma bacteriano. O genoma do fago pode eventualmente ser liberado (sendo capaz de iniciar um ciclo ltico). # Lisgena Bactria que carrega uma cpia do genoma viral integrada ao seu cromossomo.

CARACTERSTICAS PROCARIOTO
Transposons
seqncias de DNA inseridas em novos stios genmicos (catalisadas a partir de enzimas especficas - transponsases).
envolvem processos de recombinao e replicao gerando 2 novas cpias do elemento gentico transponvel original.

# uma que permanece no stio parental.

# outra que aparece num determinado stio alvo. Alterao da integridade de seus stios-alvo.

1. ativao de genes inativos 2. delees, inverses e fuses cromossmicas * Conferem significativa plasticidade gentica nos genomas que as possuem.

CARACTERSTICAS PROCARIOTO

Classificao
Transposons simples (IS) carregam apenas a informao gentica essencial para a transposio. Transposons complexos carregam, tambm, informaes no relacionadas a transposio .

# resistncia a antibiticos # capacidade de movimentao entre bactrias

CARACTERSTICAS PROCARIOTO
Cromossomo nico dsDNA circular

Replicon

Excees Lineares

Streptomyces lividans

Rhodococcus fasciens

Espiroquetas (Borrelia)

CARACTERSTICAS PROCARIOTO
Tamanho do Genoma

~9,5x106pb

Mycoplasma genitalium

Saccharomyces cerevisiae

~0,6x106pb

~13x106pb Myxococcus xanthus

PROCARIOTO X EUCARIOTO

97% dos genes so de regulao.

3% dos genes so de regulao.

3% So seqncias no codantes 97% So (inter-espaadores gnicos). codantes gnicos).

seqncias no (inter-espaadores

cpia nica (0 30 pb)

GENOMA EUCARIOTO X PROCARIOTO

PROCARIOTO X EUCARIOTO

COMPARAES EUCARIOTO
Nmero de Genes
70000

60000 50000 50000

Nmero de Genes

45000

40000 30000 30000 19000 13600 10000 4288 517 0 Mycoplama E. coli Levedura Drosofila Ascaris Humano Arroz Milho 6340

20000

Genes no interrompidos X interrompidos

COMPARAES EUCARIOTO

COMPARAES EUCARIOTO

Tamanho dos genes em kb

PARADOXO DO VALOR DE C

CARACTERSTICAS EUCARIOTO
Existncia de mltiplas cpias de algumas seqncias.
Presena de complemento diplide. Abundncia de seqncias redundantes.

Quase todo genoma: no codificao e regulao.

Seqncias codificantes em apenas uma das fitas.

Raramente apresenta unidades genticas acessrias.

CARACTERSTICAS EUCARIOTO
No h Colinearidade: Gene Protena

3n nucleotdeos n aminocidos

CARACTERSTICAS EUCARIOTO
No h Operons.

Exceo

Caenorhabditis elegans Nematdeo: 25% dos genes

CARACTERSTICAS EUCARIOTO

1. DNA de (45%).

cpia

nica

2. DNA Moderadamente Repetitivo (30%). 3. DNA Altamente Repetitivo (25%).

GENOMA NUCLEAR HUMANO

Caractersticas
dsDNA. Genoma Linear. 23 cpias (46 Cromossomos).

GENOMA DE ORGANELAS
Caractersticas
dsDNA.
Genoma Circular. Vrias cpias por organela.

GENOMA HUMANO
Genoma Humano

Genoma Nuclear 3300Mb

30.000 - 50.000 genes ~25% Genes e seqncias gene-relacionadas nicas ou moderadamente repetitivas ~10% ~90% DNA codificador DNA nocodificador ~75% DNA extragnico

Genoma Mitocondrial 16,6kb 37 genes

Dois genes de rRNA ~60%

22 genes de tRNA

13 genes codificadores de polipeptdeos ~40%

nico ou baixo nmero de cpias

Moderado a altamente repetitivo

Pseudogenes

Fragmentos de genes

ntrons, seqncias notraduzidas etc.

Repetido em tandem ou repeties agrupadas

Repeties dispersas

CARACTERSTICAS EUCARIOTO
Famlias Funcionalmente Similares
Relacionados mas no idnticos Globina

CARACTERSTICAS EUCARIOTO
Famlias gnicas codificadoras de RNA
Genes de rRNA 5 agrupamentos de 50 repeties em tandem. Genes de Trna grande famlia dispersa (40 subfamlias). Genes de snRNA grande famlia dispersa.

CARACTERSTICAS EUCARIOTO
Famlias Funcionalmente Idnticas Histonas
Replicao dependente restrito a fase S. Replicao independente nvel basal em todo CC.

Replicao tecido-especfico.

H1 H1

CONCLUSO

Existem diferenas significativas entre genomas procariotos e eucariotos.

Procariotos genomas pequenos, circulares, poucos genes, operons e unidades genticas acessrias. Eucariotos genomas grandes, lineares, muitos genes, sem operons e sem unidades genticas acessrias. Eucariotos apresentam procariotos. genomas mais complexos que os