GENTICA Tema No. 2: El genoma humano y su estudio.

Dr. Wilmer Delgado Luengo

Magster en Gentica Mdica Doctor en Ciencias Mdicas Prof. Titular

El genoma humano y su estudio.

DEFINICIONES

Genoma: Conjunto total del material gentico hereditario presente en una clula, tanto nuclear como extranuclear, codificante o no.
Clase de material gentico: cido Desoxirribonucleico (ADN): la > de los organismos. cido Ribonucleico (ARN): algunos virus. Tipo de material gentico: Codificante: Genes.
Codifica toda la informacin celular (metabolismo, fisiologa, morfologa, comportamiento, embriognesis, crecimiento y desarrollo fsico y mental, reproduccin, entre otras).

No Codificante: intergnico e intragnico. Ubicacin del material gentico (Eucariotas):

Nuclear Mitocondrial 2

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Organismos Procariotas:
Eubacterias y arqueobacterias Clulas pequeas (0,2-5 m) Membrana plasmtica + pared celular. Carecen de compartamentalizacin celular (membrana nuclear, orgnulos). Genoma pequeo y sencillo. Un cromosoma circular de ADN, suspendido en el citoplasma. Plsmidos: material gentico de ADN extra, circular, no esencial.
Resistencia a los antibiticos o materiales txicos. Replicacin autnoma, sin coordinacin con la divisin celular.

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Organismos Eucariotas:
Multicelulares: animales y plantas. Unicelulares y multicelulares simples: Protozoarios, hongos y algas. Membrana celular, pared celular (plantas), citoesqueleto. Compartamentalizacin celular.

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Ncleo:
Doble membrana nuclear. Genoma Nuclear
Ciclo celular:
Interfase: Cromatina.Filamentoso y disperso. Divisin Celular: Cromosoma.

Contiene ~ 90% del ADN. Organizado en cromosoma, en tamao y n variable, segn la especie. Magnitud del genoma:
En n de cromosomas: Haploides: n Diploides: 2n En longitud: pb (pares de bases) nt (nucletidos) 5

LEPTOTENO ZIGOTENO PAQUITENO DIPLOTENO DIACINSIS

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COMPARACIN DEL GENOMA NUCLEAR Y MITOCONDRIAL
G Nuclear G Mitocondrial

Tamao
N de Mol Dif. Forma

3000 Mb
24 (X,Y) Lineal

16,6 Kb
1 Molcula Circular

N total de Mol

23 cromosomas (haploides) 46 cromosomas (diploides)

Histonas

Miles

Proteinas asociadas

Ninguna

N de genes

<30000

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G Nuclear ADN repetitivo Transcripcin Intrones ADN Codificante Recombinacin Abundante Individual Presentes 1,5 % Presente G Mitocondrial Escaso Policistrnica Ausentes 95 % Ausente

Herencia

Mendeliana

Materna

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CONSTITUCIN Azcares: 2-Desoxiribosa Ribosa cido Fosfrico: Monofosfato Difosfatos Trifosfatos

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Cdigo Gentico:
Cuatro Nucletidos: A, G, C y T (U). Codn o Triplete: lectura de la secuencia de ADN o ARN de tres en tres nucletidos. Combinaciones posibles de tres nucletidos = 64 codones. 64 Codones: 61 codones: codifican para 20 aminocidos biolgicamente importantes. 3 codones de Terminacin (paro o sin sentido): UAA, UAG y UGA. No codifican para ningn aminocidos. Origina la finalizacin de la sntesis de protenas. Codn de Inicio: AUG: Codifica nicamente para Metionina (Met) La sntesis, de la mayora de las protenas, se inicia con Metionina.

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CDIGO GENTICO: Degenerado: Un aminocido puede ser codificado por mas de un codn (codones sinnimos). Disminuye la posibilidad de que mutaciones puntuales puedan provocar la incorporacin de un aminocido distinto, y por ende, prdida de la funcin proteica. Universalidad: Inicialmente se crea que exista una correspondencia entre codones y aminocidos, independiente del organismo estudiado. Casi universal: Hay excepciones, pocas, a la regla. Los procariotas, eucariotas y mitocondrias de plantas, comparten el mismo cdigo gentico. Un antepasado comn. 20

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Niveles de Organizacin (Condensacin, Empaquetamiento) del ADN.

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Niveles de Organizacin (Condensacin, Empaquetamiento) del ADN.

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Niveles de Organizacin (Condensacin, Empaquetamiento) del ADN.

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Heterocromatina:
Aspecto: Se tie intensa/. Condensacin: mxima Clasificacin: Constitutiva: Permanente/ condensada en todo el ciclo celular, a excepcin durante su replicacin. Ej: Centromeros y telomeros. Facultativa: Puede pasar a eucromatina bajo ciertos estmulos. Ej: Cromos. X. Al final de la fase G2 toda la cromatina esta como heterocromatina. Transcripcionalmente inaccesible.

Eucromatina:
Aspecto: Se tie debilmente y de manera difusa. Condensacin: menos condensada. Transcripcionalmente accesible: la molcula de ADN es accesible a protenas (factores de transcripcin, ADN polimerasas, ARN polimerasas, entre otras). Expresin gnica.

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Clasificacin del genoma Humano segn su organizacin:
ADN de copia nica: Secuencias nucleotdicas (exones) presentes una vez o muy pocas veces en el genoma. ADN repetitivo: Secuencias nucleotdicas (intrones) repetidas en nmero variable.

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ADN repetitivo: repeticiones de cientos a millones de veces en el genoma. Clasificacin:
ADN disperso:
20 % del genoma Repeticin regular: cada 4 Kb. Ejemplos: secuencia Alu (familia Alu), secuencia

Kpn, (familia Kpn),

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ADN satlite: 10 % del genoma Secuencias repetidas en tandem. Clasificacin: ADN--satlite: unidad de repeticin de 171 pb. Repeticiones en millones de veces en el genoma. ADN minisatlite o VNTR: Unidad de repeticin entre 10 y 70 pb, Repeticiones de miles de veces en el genoma. ADN microsatlite, o STR: unidad de repeticin 2 - 4 nucletidos. Repeticiones: cientos de veces en el genoma.
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Homocigoto: ambos alelos de un par de cromosomas homlogos son idnticos. Heterocigoto: ambos alelos de un par de cromosomas homlogos son diferentes.
Heterocigoto simple. Heterocigoto compuesto. Hemicigoto: El hombre por tener un (01) solo cromosoma X y un (01) cromosoma Y es Hemicigoto para casi todos los alelos de los cromosomas X y Y, a excepcin de los alelos localizados en las regiones pseudoautosmicas.

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Genotipo: la constitucin genmica de un organismo.
Fenotipo: conjunto de rasgos o caracteres INTERNOS O EXTERNOS (morfolgicos, anatmicos, fisiolgicos, bioqumicos y moleculares) resultantes de la expresin del genotipo. El trmino implica la interaccin entre el genotipo y el medio ambiente. Medio Ambiente: conjunto de factores internos y externos al organismos que influyen sobre su genotipo con la consiguiente expresin fenotpica.
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OMIM ntry Statistics:

Number of Entries in OMIM (Updated 23 July 2012) : Autosomal X Linked Y Linked Mitochondrial

Prefix * Gene description + Gene and phenotype, combined # Phenotype description, molecular basis known % Phenotype description or locus, molecular basis unknown Other, mainly phenotypes with suspected mendelian basis Totals

Totals

13,241 142

643 5

48 0

35 2

13,967 149

3,240

262

28

3,534

1,627

135

1,767

1,779

125

1,906

20,029

1,170

59

65

21,323

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Mutacin:
Alteracin o cambio en la secuencia del ADN:
Genoma Nuclear o Miticondrial Codificable (gen estructural) o no codificable (regulacin de la expresin gnica) Heredable (clulas germinales) o no (clulas somticas). Principal causa de variabilidad gentica. Importancia:
Evolucin de las especies. Identidad gentica de un individuo.
Heredobiolgicas Identificacin de individuos. Pruebas forenses. Migraciones humanas.

Diagnstico de enfermedades:
Propsito. Dx Prenatal.

Tratamiento de enfermedades:
Cncer. Clulas madres.
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La reaccin en cadena de la polimerasa (PCR) Obtencin millones de copias de un fragmento mediante la amplificacin selectiva in vitro de ADN, basada en las propiedades de desnaturalizacin, renaturalizacin e hibridacin del ADN.
Primers Taq polimerasa Desnaturaliz acin 95C
n ciclos

dntp s

Alineacin 45C

Extensin 72C

2 nuevas copias

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Tecnologa del ADN Recombinante: Enzimas de Restriccin Clonaje Molecular Vectores de Clonacin
Plasmidos Bacterifagos YACs (Plsmido de gran tamao) Cosmidos (Plsmidos + Fago)

ER
AGTTGTACCTCACTTGGAAAAA TCAACATGGAGTGAACCTTTTT AGTTGTA TCAACAT CCTCACTTGGAAAAA GGAGTGAACCTTTTT

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ANEMIA FALCIFORME

A: S:

CCT pro CCT pro CCT pro

GAG GAG glu glu GTG val AAG lys GAG glu GAG glu
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C:

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Diagnstico Molecular Distrofia Muscular Duchenne/Becker

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Diagnstico Molecular Fibrosis Qustica: F508
cN cH feto cF508

98 pb 95 pb

Alelo Normal: 98 pb Alelo Mutado: 95 pb

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CASO DE PATERNIDAD: D1S80

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GRACIAS

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