Bioqumica

- Carboidratos; - Lipdios; - Aminocidos e protenas; - Metabolismo.

Carboidratos
So compostos de funo mista; Polialcool-aldedos ou Polialcool cetona ou outros compostos que por hidrlise, do polialcooisaldedos e/ou polialcoois-cetonas. O H2C CH CH CH CH C Glicose (polialcool-aldedo) OH OH OH OH OH H

H2C CH CH CH C CH2 OH OH OH OH O OH

Frutose (polialcool-cetona)

Carboidratos
So constituintes orgnicos mais abundantes das plantas; Servem como fonte de energia qumica para os organismos vivos (acares e amido); Servem tambm como constituintes importantes de tecidos de sustentao (celulose encontrada na madeira, no algodo);

Equao de transformao de carboidratos em energia

Frmulas Estruturais
Cadeia Aberta: CHO H OH HO H H OH H OH CH2 OH

Glicose

Formas Cclicas
Os carboidratos existem como anis de seis membros e em vrios casos de cinco membros. A nomenclatura vem dos nomes de heterocclicos , pirano e furano + oses.

Pirano

Furano

Classificao
Segundo critrios de ocorrncia ou no de hidrlise: Monossacardeos: no podem ser hidrolisados em carboidratos mais simples; Dissacardeos: carboidratos que sofrem hidrlise para produzir duas molculas de monossacardeos; Trissacardeos: carboidratos que monossacardeos, e assim por diante; produzem 3 molculas de

Oligossacardeos: carboidratos que se hidrolisam para produzir 2-10 molculas de monossacardeos;

Polissacardeos: carboidratos que produzem um grande nmero de molculas de monossacardeos(> 10)

Exemplos
a) Dissacardeo: C 12 H22 O11 + H2O C 6 H12 O 6 + C 6 H12 O 6 Sacarose Glicose Frutose

b) Polissacardeo: (C 6 H10 O5)n + n H2O n C 6 H12 O 6 Amido Glicose

Lipdios
So compostos de origem biolgica que se dissolvem em solventes apolares. O nome lipdios vem da palavra grega lipos, que significa gordura. So vulgarmente conhecidos como gorduras. Os lipdios se encontram distribudos em todos os tecidos, principalmente nas membranas celulares e nas clulas de gordura. Juntamente com as protenas, cidos nuclicos e carboidratos, os lipdios so componentes essenciais das estruturas biolgicas, e fazem parte de um grupo conhecido como biomolculas. Diferentemente de carboidratos e protenas, que so definidos em termos de suas estruturas,

Os lipdios so definidos pela operao fsica que utilizamos para isol-lo

Portanto os lipdios incluem uma variedade de tipos de estruturas:

Mentol

Ao contrrio das demais biomolculas, os lipdios no so polmeros, isto , no so repeties de uma unidade bsica. Embora possam apresentar uma estrutura qumica relativamente simples, as funes dos lipdios so complexas e diversas, atuando em muitas etapas cruciais do metabolismo e na definio das estruturas celulares.

Os qumicos podem separar os lipdios de uma amostra biolgica atravs de uma tcnica conhecida como extrao;

Um solvente orgnico adicionado a uma soluo aquosa da amostra e, com um auxlio de um funil de separao, obtm-se a fase orgnica rica em lipdios.
Com a evaporao do solvente orgnico obtm-se o lipdio. desta maneira que, em escala industrial, se obtm o leo vegetal.

 Na literatura existem vrias formas de organizar os lipdios. Para melhor ented-lo, classifica-o em dois grandes grupos: Aqueles que possuem cidos graxos em sua composio e aqueles que no possuem. a) Lipdios com cidos graxos: 1- Triacilgliceris: cidos graxos + glicerol; 2- Ceras: cidos graxos + lcool mono-hidroxlico; 3- Fosfolipdios : cidos graxos + fosfato; 4- Esfingolipdios: cidos graxos + esfingosina; 5- Glicolipdios: cidos graxos + glicerol + acar.

Glicerol

b) Lipdios que no contm cidos graxos: 1-Terpenos; possuem unidades isoprenides como unidades bsicas. As vitaminas E e K so os representantes mais importantes, alm de vrios leos aromticos de vegetais.

2-Esterides- o ncleo ciclo-pentano-per-hidro-fenantreno a estrutura bsica. O colesterol (e seus derivados) e a vitamina D so os mais importantes representantes deste grupo.
3) Carotenides: um tipo de terpeno, geralmente lcool. A vitamina A o representante mais importante deste tipo de lipdio. 4) Prostaglandinas, tromboxanas e leucotrienos: so eicosanides derivados do cido araquidnico. Estes lipdios no desempenham funes estruturais, mas so importantes componentes em vrios processos metablicos e de comunicao intercelular.

cidos graxos: So cidos carboxlicos de cadeia longa, em geral superior a 10 carbonos. Exemplos: cido Oleico

cido Lurico
Este o grupo mais abundante de lipdios nos seres vivos, e so compostos derivados dos cidos carboxlicos.

Triacilgliceris: cidos graxos + glicerol

So leos de vegetais e gorduras de origem animal. Ex: leo de amendoim, de soja, de milho, manteiga, banha e o sebo. Gorduras : constituem-se de triacilglicerol em grande parte de cidos graxos saturados que ponto de fuso altos e so slidos temperatura ambiente. leos : triacilgliceris que contm alta proporo de cidos graxos insaturados e poliinsaturados, tem ponto de fuso mais baixos, so lquidos a temperatura ambiente.

Triacilgliceris: cidos graxos + glicerol

3H2O

Glicerol
Triacilglicerol

cidos graxos

Os triacilgliceris podem ser: Simples: os trs grupos acilas so os mesmos; Misturados: grupos acilas so diferentes (mais comum)

Propriedades dos triacilgliceris:

a) Hidrogenao Os leos submetidos a hidrogenao transformam-se em gorduras e recebem o nome de margarina.

catalisador
+

H2

Gordura insaturada

Gordura saturada margarina

b) Saponificao; A hidrlise alcalina dos triacilglicerid, produz glicerol e uma mistura de sais de cidos graxos de cadeia longa.

3 NaOH

Glicerol Triacilglicerol Sabo carboxilato de sdio

Sais de cidos carboxlicos de cadeia longa so sabes e essa reao de saponificao maneira pela qual muitos sabes so fabricados.

AMINOCIDOS E PROTENAS

PROTENAS: So molculas orgnicas mais abundantes e importantes na clulas; Perfazem 50% ou mais de seu peso seco; So fundamentais na estrutura, no funcionamento e na reproduo de todas clulas; So macromolculas com massas moleculares que vo de 5000 a alguns milhes de u.; Todas contm C, H, N e O, quase todas S, e algumas contm P, Fe, Zn e Cu; So polmeros biolgicos (poliamidas), e suas unidades compreendidas por aproximadamente de 20 - aminocidos. monomricas so

AMINOCIDOS: So compostos que apresentam funes amino e cido e grupo amino na posio .
Estrutura geral dos aminocidos:

Exemplos:

Glicina

R uma cadeia lateral no C 2 que determina a identidade do aminocido

Caderno: parte de uma molcula de protena

A hidrlise de protena com cido ou base produz uma mistura de aminocidos ( em torno de 20 aminocidos diferentes).

Aminocidos essenciais: So os aminocidos que os animais superiores no podem sintetizar Devem ser ingeridos atravs dos alimentos Para o homem existem oito aminocidos essenciais: leucina, isoleucina, lisina, valina, treonina, metionina, fenil-alanina, triptofano.

Polipeptdios e Protenas
Os aminocidos so polimerizados nos sistemas vivos pelas enzimas que formam unies de amida; Ligaes peptdicas ou unies peptdicas so unies do grupo amino (NH2) de um aminocido com o grupo carboxila de outro aminocido, atravs da formao de uma amida; Exemplo caderno

Peptdio uma molcula formada por unio de aminocidos.

Resduo de aminocido cada aminocido nos peptidios. Os peptdios so chamados: Dipeptdios contm 2 aminocidos; Tripeptdios contm 3 aminocidos; Oligopeptdios contm 3-10 aminocidos; Polipeptdios contm mais de 10 aminocidos; Exemplo caderno

CLASSIFICAO DAS PROTENAS

-Quanto a composio: Protenas Simples- Por hidrlise liberam apenas aminocidos, Protenas Conjugadas- Por hidrlise liberam aminocidos mais um radical no peptdico, denominado prosttico,ex: lipoprotenas. -Quanto ao nmero de cadeias polipeptdicas: Protenas Monomricas- formadas por apenas uma cadeia polipeptdica; Protenas Oligomricas- formadas por mais de uma cadeia polipeptdica, so protenas de estrutura e funo mais complexa.

-Quanto a forma: Protenas Fibrosas- so formadas por longas molculas mais ou menos retilneas e paralela ao eixo da fibra; Protenas de estrutura.Ex: queratina dos cabelos. Protenas Globulares- de estrutura espacial mais complexas, so mais ou menos esfricas. Protenas ativas, como a hemoglobina(transportadores).

Estruturas das protenas

Estrutura Primria - somente a sequncia dos aminocidos; o nvel estrutural mais simples e mais importante, pois dele deriva todo o arranjo espacial da molcula.
As interaes intermoleculares entre os aminocidos das protenas fazem com assuma uma estrutura secundria e, algumas vezes, uma estrutura terciria. que a cadeia protica

Estrutura Secundria o arranjo espacial de aminocidos prximos entre si na sequncia primria da protena; o ltimo nvel de organizao das protenas fibrosas, mais simples estruturalmente. uma funo dos ngulos formados pelas ligaes peptdicas que ligam os aminocidos. A conformao espacial mantida graas as interaes intermoleculares (ligao hidrognio) entre os hidrognios dos grupos amino e os tomos de oxignio dos outros aminocidos.

Estrutura terciria Dada pelo arranjo espacial de aminocidos distantes entre si na seqncia polipeptdica. a forma tridimensional como a protena se "enrola (Relaciona-se com os loopings e dobraduras da cadeia protica sobre ela mesma). Ocorre nas protenas globulares, mais complexas estrutural e funcionalmente.

Estrutura quaternria: Muitas protenas so constitudas por mais de uma cadeia polipeptdica. A estrutura quaternria descreve a forma com que as diferentes subunidades se agrupam e se ajustam para formar a estrutura total da protena. Ocorre nas protenas Oligomricas. Por exemplo, a molcula da hemoglobina humana, mostrada abaixo, composta por quatro subunidades.

Exerccios no caderno

Enzimas
As enzimas so protenas especializadas em catalisar reaes biolgicas, ou seja aumentam a velocidade de uma reao qumica sem interferir no processo.

Praticamente todas as reaes que caracterizam o metabolismo celular so catalisadas por enzimas.

Nomenclatura
Cada enzima recebe dois nomes: 1) Nome recomendado: (mais simples) Tem o sufixo ase unido ao substrato da reao; Exemplos: glicosidase, urease, sacarase, etc... Conveniente para o uso no dia-a-dia.

2) Nome sistemtico: (mais complexo)

O sufixo ase unido a uma descrio razoavelmente completa da reao qumica catalisada. Exemplo: ATP-Glicose-Fosfo-Transferase

Propriedades das Enzimas

a) Stio ativo: - Bolso ou fenda especial; - Contm aminocidos cujas cadeias laterais criam uma superfcie tridimensional complementar ao substrato; - O stio ativo liga-se ao substrato (S), formando um complexo enzima-substrato(ES); - O ES convertido a enzima-produto(EP), que se dissocia-se em enzima e produto: E + S <==> [ES] ==> E + P E= enzima, S = substrato; ES=complexo enzima-substrato

b) Eficincia cataltica: - As reaes catalisadas por enzimas so altamente eficientes, ocorrendo 103 a 108 vezes mais rpido que as reaes no-catalisadas; -Tipicamente, cada molcula de enzima capaz de transformar 100 a 1000 molculas de substrato em produto a cada segundo. c) Especificidade: As enzimas so altamente especficas, interagindo com um ou alguns substratos especficos e catalisando somente um tipo de reao.

d) Cofatores Um componente no protico que as enzimas requerem para suas atividades; Podem ser ons metlicos (Fe2+, Mg2+, Mn2+ e Zn2+ ) ou pequenas molculas orgnicas. e) Regulao As enzimas podem ser reguladas: Podem ativadas ou inibidas de modo que a velocidade de formao do produto responda as necessidades das clulas.

Como funcionam as enzimas : O mecanismo da ao enzimtica pode ser encarado de duas perspectivas diferentes: a) A catlise em termos de alteraes de energia que ocorrem durante a reao; b) O stio ativo facilita quimicamente a catlise.

Fatores que afetam a velocidade de reao

a)Concentrao do substrato: Quanto maior a concentrao do substrato, maior a velocidade da reao, at atingir uma velocidade mxima; b) Temperatura: Quanto maior a temperatura, maior a velocidade da reao, at se atingir a temperatura tima; a partir dela, a atividade volta a diminuir, por desnaturao da molcula; c) pH: o pH timo varia para diferentes enzimas, a velocidade da reao diminui a medida que o pH se afasta desse valor timo.

Classificao
Classificao xidosredutoras Transferases Tipo de catalisam reao que Exemplos Modo de atuao Remove hidrognio Adiciona oxignio Transfere grupos metil Transfere grupos amina

Reaes de xido-reduo Desidrogenase Oxidades Transferncia de grupos funcionais Metiltransferase Transaminase

Hidrolases

Reaes de hidrlise

Carboidrase Esterase Lipase Fosfatase Protease

Quebra carboidratos Quebra steres Quebra lipdios Quebra steres fosfricos Quebra ligaes peptdicas
Remove gs carbnico Quebra aldedos

Liases Isomerases

Quebra de ligaes duplas Descarboxilase Aldolase Isomerizaes

Ligases

Formaes de ligaes

Cis-trans isomerase Converte formas cis e trans Mutase Transferncia intramolecular Sintetase Combina dois grupos

Aplicaes
Na produo de alimentos e bebidas; No processamento de fibras txteis; Na indstria de polpa e papel; Na produo de etanol; Na indstria de cosmticos; Medicamentos e diagnsticos; Sntese orgnica;

 Catlise ambiental: - Tratamento de efluentes e resduos industriais; - biorremediao

Metabolismo
Conjunto de mecanismos qumicos que permitem clula transformar e utilizar as substncias adquiridas e sintetizadas. Pode ser dividido em duas etapas Anabolismo: Fase Construtiva Ocorre produo de substncias que constituem a matria viva do organismo. Catabolismo: Fase Destrutiva Ocorre a degradao dos compostos orgnicos, Com liberao de energia utilizada no desempenho das diversas atividades vitais.

Conceitos Fundamentais
NAD (Nicotinamida-adenina dinucleotdeo); FAD (Flavina adenina dinucleotdeo); ATP (Adenosina-trifosfato)

So compostos orgnicos de importncia fundamental para a converso de uma forma de energia em outra.

NAD e FAD- Aceptores de eltrons Durante os processos de sntese e degradao de substncias orgnicas, h muitas reaes com liberao de tomos de hidrognio. Funo receber eltrons e tomos de hidrognio e transferi-los de uma substncia para outra.

NAD

FAD

ATP- Molcula armazenadora de energia Composto orgnico formado por adenosina, ribose e trs fosfatos. As ligaes fosfato-fosfato so altamente energticas. Funciona dentro da clula como moeda energtica, que pode ser gasta em qualquer momento que a clula necessitar.

ATP

Fermentao e Respirao
Processos atravs dos quais ocorre a liberao de energia armazenada nas ligaes qumicas dos compostos orgnicos.

Fermentao
A glicose degradada na ausncia de oxignio em substncias mais simples. Saldo de apenas de 2 molculas de ATP. realizada por algumas bactrias, alguns protozorios e fungos e por clulas do tecido muscular.

Fermentao ltica Glicose cido ltico + 2 ATP 6C 3C

Fermentao alcolica Glicose lcool etlico + CO2 + 2ATP 6C 2C

Ocorre em algumas bactrias, em leveduras(fungos microscpicos) e tambm em clulas de tecidos vegetais superiores.

Fermentao actica

Glicose cido actico + CO2 + 2 ATP 6C 2C

realizada por bactrias denominadas cetobactrias, Fabricao de vinagre, Responsvel pelo azedamento de vinhos e sucos de frutas.

APLICAES cido ltico indstrias qumica, farmacutica e de alimentos. utilizado como: acidulante, conservante de bebidas e alimentos; curtumes, na indstria txtil e de lavanderia; indstria de panificao, como suplementao em rao animal e em preparaes farmacuticas ; produo de plsticos biodegradveis; produtos qumicos oxigenados; reguladores do crescimento de plantas; solventes no poluentes e intermedirios para sntese qumica; o cido ltico tem se tornado um importante monmero na indstria de plsticos, sendo facilmente polimerizado em plstico biodegradvel utilizado para confeco de embalagens, incluindo embalagens para alimentos

lcool Etlico

Solvente na fabricao de tintas, vernizes e perfumes; Preparao de produtos farmacuticos; Desinfeco; Uma das mais importantes fontes de energia renovvel;
A importncia do uso de biocombustveis est em abaixar os nveis de monxido de carbono (CO) liberados pela combusto incompleta da gasolina. CO o gs causador da poluio fotoqumica, ele surge a partir da queima de combustveis fsseis, sendo assim, o Etanol no entra na lista dos responsveis pela emisso desse poluente.

cido Actico:

Aplicado em diversos ramos da industria:

Produo de acetato de celulose (conhecido como simplesmente acetato), Produo de PET (politereftalato de etileno, um polmero impermevel a gases e por isso utilizado na fabricao de garrafas para refrigerantes) Limpeza e desinfeco. Nas indstrias pesqueiras, assim como nos barcos de pesca que no possuem condies de armazenar seus produtos sob refrigerao, a utilizao de solues de cido actico muito recomendada e eficiente. Uma concentrao de cerca de 1000 - 5000 mg /kg de produto permite a reduo de at 10 vezes a flora microbiana presente no produto no tratado, assim como permite a estocagem por at 36 horas sem uso do frio.

RESPIRAO CELULAR
A glicose completamente degradada (utiliza oxignio), formando gs carbnico e gua.

Glicose + O2 CO2 6C 1C

+ H2O + 38 ATP

Ocorre em trs etapas:

Gliclise - quebra da glicose produzindo dois cidos pirvicos

Ciclo de Krebs - ocorrem desidrogenao e descarboxilao do cido pirvico

Cadeia respiratria - ocorre fosforilao oxidativa (formao de ATP).

GLICLISE
Definio: oxidao da glicose em cido pirvico (quebra da glicose);
Cada reao mediada por uma enzima especfica!

FASE PREPARATRIA

Primeiro ocorre quebra da glicose (C6H12O6) em duas molculas de trs carbonos cada; Estes acares so oxidados, repassando os eltrons para NAD. A coenzima NAD reduzida a NADH; Durante este processo inicial ocorre gasto de 2 ATP para fosforilao dos acares de trs carbonos; Esta fosforilao gera duas molculas de gliceraldedo 3-fosfato.

GLICLISE
FASE DE CONSERVAO DE ENERGIA As duas molculas de gliceraldedo 3-fosfato so acopladas a uma enzima especfica que realiza duas reaes: 1) oxidao das molculas com reduo de 2 NAD para 2 NADH; 2) fosforilao a nvel de substrato para formao de duas molculas de cido 1,3-difosfoglicrico; O cido 1,3-difosfoglicrico desfosforilado para formao cido pirvico com ganho de 4 molculas de ATP;

BALANO FINAL: gasto = 2 ATP; ganho = 4 ATP + 2 NADH.

SALDO = 2 ATP + 2 NADH por molcula de glicose quebrada.

GLICLISE

Ciclo de Krebs: incio

Constitui-se de uma srie de reaes bioqumicas (mediadas por enzimas especficas) em que uma grande quantidade de energia qumica potencial liberada passo a passo; Neste ciclo uma srie de oxidaes e redues transferem a energia potencial, em forma de eltrons, para coenzimas transportadoras (NAD e FAD); Incio: cido pirvico descarboxilado (perda de CO2) e oxidado (perda de eltrons) formao de NADH; O subproduto desta reao, o acetil, ligado a coenzima A acetil COA. Essa molcula a chave de inguinio do ciclo.

Ciclo de Krebs: processo

Quando acetil COA entra no ciclo, a COA desliga-se do grupo acetil; O grupo acetil far reao de sntese com o cido oxalactico para formao do cido ctrico; A energia necessria para a reao de sntese provem da quebra da ligao entre o grupo acetil e a coenzima A; A partir do cido ctrico ocorre uma srie de reaes qumicas: 1) reaes de descarboxilao em dois pontos da via = 4 CO2; 2) reaes de oxido-reduo em quatro pontos da via, originando 6 NADH + 2 FADH2; 3) fosforilao a nvel de substrato = 2 ATP; BALANO FINAL: 4 CO2 + 6 NADH + 2 FADH2 + 2 ATP

reaes de oxido-reduo

reaes de descarboxilao reaes de oxido-reduo

fosforilao

Cadeia respiratria
Definio: consiste em uma sequncia de molculas transportadoras que so capazes realizar oxidao e reduo. A medida que os eltrons passam pela cadeia h uma gradual liberao de energia, que utilizada para a formao do ATP; A oxidao final IRREVERSVEL = quando os eltrons passam para o O2, que reduzido. Nos eucariotos(tem ncleo celular) a cadeia de transporte de eltrons encontra-se na membrana interna das mitocndrias; Nos procariotos (no tem ncleo celular), localiza-se na membrana plasmtica

 Respirao: processo de gerao de ATP (energia) em que molculas so oxidadas e o aceptor de eltrons , quase sempre, o O2.
Respirao aerbia aceptor final de eltrons = O2 Respirao anaerbia aceptor final de eltrons = NO3-, SO42-, CO32-, etc.

RESPIRAO ANAERBIA: outros aceptores de eltrons que no o O2. Nitrato Desnitrificao - NO3- + Fonte de carbono N2 + CO2 + H2O + OHMicroorganismos desnitrificantes: Alcaligenes, Achromobacter, Micrococcus, Pseudomonas. (nem todos so capazes de transformar completamente at N2) Aplicao: tratamento de efluentes industriais e domsticos. A remoo de N evita a eutrofizao (produo de algas e aumento da DQO do efluente)

30 mg N/L produzem 600 ppm de DQO

DQO tpico de esgoto domstico: 400 ppm. 2NH4+ + O2 2NO2- + 4H+ + 2H2O (Nitrosomonas) 2NO2- + O2 2NO32NH4+ + 2O2 2NO3- + 4H+ + 2H2O (Nitrobacter)

Nitrificao -

Respirao anaerbia: sulfato como aceptor de e

Dessulfatao - 2CH2O + SO42- + H+ HS- + 2H2O + 2CO2

Utilizado pelas bactrias redutoras de sulfato (BRS), amplamente distribudas na natureza; maioria anaerbia obrigatria.

H2S (sulfeto de hidrognio) = produto da reduo do sulfato e do enxofre elementar.

Respirao anaerbia: CO2 como aceptor de eltron Metanognese CO2 + 4H2 CH4 + 2H2O

Habitats de metanognicos: sedimentos anxicos (charcos, pntanos, aterros midos), fontes geotermais, digestores de lodo de esgoto, rmen e intestino de mamferos. Metonognese- 2CH2O CH3COO- + H2O CH4 + HCO3(acetato) (metano) H2 + 1/4 HCO3(hidrognio) + 1/4 H+ 1/4 CH4 + 3/4 H2O (metano)

HCOO- + 1/4 H2O + 1/4 H+ (formiato)

1/4 CH4 + 3/4 HCO3(metano)

Catabolismo de outras molculas

cido pirvico