Programacin de clases

GLS - Lu 05/04/2010 Intr.Terica UT 1: Bioqumica: definiciones e importancia. Comp. Inorgnicos y Orgnicos de la Matriz Vital. Agua. Bioelementos. Clase ulica: UT 1 y 2: Practicas s/Bioseguridad, Materiales de laboratorio, Ambiente celular.

Unidad Temtica N 1: BIOQUMICA Y BIOMOLCULAS Delimitar el campo que abarca la Bioqumica, conocer sus implicancias, su importancia en Medicina Veterinaria, la terminologa que emplea y los mtodos de estudio. Comprender la importancia del ambiente acuoso en los procesos bioqumicos que tienen lugar en la matriz vital y el rol de los compuestos inorgnicos y orgnicos.

Unidad Temtica N 1 BIOQUMICA Y BIOMOLCULAS a) Definicin, alcances como disciplina y como ciencia interdisciplinaria. Bioqumica descriptiva y bioqumica dinmica. Objeto e importancia de la Bioqumica actual. Fuentes bibliogrficas. Bioqumica y Medicina Veterinaria. Terminologa cientfica. Mtodos de estudio. Bioseguridad. b) Elementos que constituyen la materia orgnica, bioelementos. Clasificacin y funciones de los principales bioelementos. Composicin qumica de los seres vivos. Biomolculas. Organizacin de la materia viva. Jerarqua de la organizacin molecular de las clulas. Biomolculas presentes en orgnulos de clulas procariotas y eucariotas. Medios extra e intracelular. Agua y electrolitos. Estructuras molecular y macromolecular del agua; rol en los sistemas biolgicos, accin como disolvente, ionizacin de la molcula y participacin en el equilibrio inico. Distribucin del agua en el organismo animal; proporciones en los diferentes tejidos.

BIOQUMICA
Es la ciencia que se ocupa del estudio de las diversas molculas, reacciones qumicas y procesos que ocurren en las clulas y microorganismos vivientes.
La Bioqumica es la ciencia que estudia los seres vivos a nivel molecular mediante tcnicas y mtodos fsicos, qumicos y biolgicos

Bioqumica descriptiva: estudia cada uno de los constituyentes de los seres vivos, para lo cual exige identificacin, separacin y purificacin, determinacin de estructuras y propiedades. Bioqumica dinmica: se ocupa de las reacciones qumicas que acontecen en los sistemas biolgicos, estudio del metabolismo. Objetivos: Comprensin integra, a nivel molecular, de todos los procesos qumicos relacionados con las clulas vivas.

Qu es la Vida?
Unidad dentro de la diversidad Todos organismos vivos Se componen de las misma clase de molculas (molculas biolgicas)
Funcionan de manera semejante Responden a las mismas leyes Fsicas y Qumicas que rigen el Universo La vida es compleja y dinmica La vida se organiza y mantiene a s misma

Organizacin jerrquica Necesita de aporte de energa y materia Metabolismo y homeostasis

Qu es la Vida?
La clula es la unidad fundamental organizacin y funcionamiento de la vida La vida necesita informacin biolgica
Necesaria para su organizacin, funcionamiento y replicacin Es una informacin estructural

de

Secuencia de los genes --> protenas -->

funciones La vida no es esttica: se adapta y evoluciona
Todas las formas de vida tienen un origen comn

Sistema (aparato digestivo)

rgano (hgado)

Organizacin Jerrquica de Organismos Multicelulares

Tejido (Tejido heptico)

Clula (hepatocito)

Orgnulo (ncleo)

Molcula (DNA) tomo (carbono)

Clula
Orgnulos

Ncleo Mitocondria Cloroplasto Cuerpos de Golgi

Asociaciones Supramoleculares

Ribosomas Complejos enzimticos Sistemas contrctiles Microtbulos

peso de partcula 106 - 109

Jerarqua de la organizacin molecular de las clulas

Clula
Intermediarios

Clula
Macromolculas

peso molecular 103 - 109

Unidades sillares estructurales

cidos nucleicos Protenas Polisacridos Lpidos Nucletidos Aminocidos Monosacridos cidos grasos Glicerina

Piruvato

peso molecular 50 - 250

Citrato
Malato Gliceraldehdo 3fosfato

Precursores del entorno

Dixido de carbono Agua Oxgeno

peso molecular 100 - 350

peso molecular 18 - 44

Amonaco
Nitrgeno

Jerarqua en la Estructura Celular

Objeto de estudio de la Bioqumica:

Las sustancias qumicas constituyentes de los seres vivos
Separacin y caracterizacin. En qu concentracin se encuentran? Cules son sus propiedades? Cmo y por qu se transforman? Cmo obtienen la energa y la utilizan? Por qu son estructuras muy ordenadas? Cmo se transmite la informacin gentica? Cmo se expresa y controla la informacin gentica?

Mtodos de estudio en Bioqumica

La Bioqumica utiliza leyes de Fsica, Qumica General, Mineral y Orgnica. Por ello las experiencias se efectan 1ro. In vitro; luego se integran p/aproximarse ms a las clulas, rganos y organismos; y, por ltimo, se desarrollan in vivo. Anlisis:
Cualitativo con tcnicas de preparacin y purificacin y mtodos de determinacin de estructuras.

Cuantitativo con tcnicas de valoracin y estudio del metabolismo en animales, a veces en el hombre o las que intentan reconstituir in vitro los fenmenos que se producen in vivo.

Principales mtodos usados en laboratorios bioqumicos.

Mtodos p/Separar y Purificar Biomolculas:

Fraccionamiento salino (ej., precipit. de protenas c/sulfato de amonio) Cromatografa: Papel; intercambio inico; afinidad; capa fina; gas-lquido; lq.alta-presin; filtracin en gel

Electroforesis: Papel; alto-voltage; agarosa; acetato de celulosa; geles de almidn y poliacrilamida; etc
Ultracentrifugacin

Principales mtodos usados en laboratorios bioqumicos. Mtodos p/determinar estructuras de Biomolculas:

Anlisis elemental
UV, visible, infrarrojo y espectroscopa (NMR) Hidrlisis cida o alcalina p/degradar la biomolcula en sus constit. Bsicos Uso de 1 batera de enzimas de conocida especificidad p/ degradar la biomolc. bajo estudio (ej, proteasas, nucleasas, glicosidasas) Espectorometra de masa Mtodos de secuenciacin especficos (ej, p/protenas y cs. nucleicos) Cristalografa de rayos X

Principales mtodos usados en laboratorios bioqumicos.

Preparaciones p/estudios de procesos bioqumicos Animal intacto rganos perfundidos aislados

Cortes de tejidos
Clulas intactas Homogeneizados Organelas celulares aisladas Subfracciones de organelas Metabolitos y enzimas purificados Genes aislados (incluyendo reacc. en cadena de polimerasa, etc.)

Tcnicas ms utilizadas en la investigacin Bioqumica

Tcnicas de separacin: electroforesis,
cromatografa.

Tcnicas analticas: espectrometra,

fluorimetra, difraccin de rayos X, resonancia magntica nuclear (RMN), etc.

El anlisis qumico de la materia viva revela que est formada por una serie de elementos y compuestos qumicos. Estos se denominan bioelementos; y, en los seres vivos, forman biomolculas, que se pueden clasificar en:
Inorgnicas Agua 50-95% Sales minerales Iones (Na+, K+, Mg++, Ca++ ) =1% Algunos gases: O2, CO2, N2,
...

Orgnicas
(c/C,H,O,S,P)

Glcidos
Lpidos

Protenas
cidos Nucleicos

Biomolculas
Inorgnicas
Agua 50-95% Iones (Na+, K+, Mg2+, Ca2+, ...) 1%

Orgnicas
Derivados de hidrocarburos

Combinaciones de carbono (principal), hidrgeno, oxgeno, nitrgeno, fsforo y azufre.

Forman enlaces covalentes estables Importancia del carbono:

Puede participar hasta en 4 enlaces covalentes fuertes (Complejidad y estabilidad estructural) Permite formar cadenas largas lineales o ramificadas

Races Relacin con otras ciencias: * Acidos nucleicos- Gentica * Funcin corporal- Fisiologa * Tcnicas bioqumicas y planteamiento inmunolgicosInmunologa * Metabolismo de drogas (reaccin enzimtica)Farmacologa * Venenos que alteran raecciones o procesos bioqumicosToxicologa * Inflamacin, lesin celular, cncer- Patologa * Planteamientos bioqumicos- Zologos y Botnicos Terminologa cientfica

Importancia de la Bioqumica en las ciencias de la salud

Todas las enfermedades (excepto las traumticas), tienen un componente molecular. Los modernos mtodos de diagnstico y las nuevas terapias han sentado las bases de la Patologa Molecular.

BIOELEMENTOS Y BIOMOLCULAS

Elementos que integran los seres vivos = bioelementos o elementos biogenticos. tomos c/ partculas subatmicas: protones, neutrones y electrones, que se caracterizan bsicamente por su masa y por su carga:
El ncleo es casi 10.000 veces ms chico que el tomo pero contiene casi toda su masa. Tiene cargas + = Protones y neutras = Neutrones

|------------10-10m--------------| tomo: Los electrones se ubican fuera en una nube alrededor del ncleo

http://www.lenntech.com/espanol/tabla -periodica.htm

nmero atmico = nmero de protones nmero de masa atmica = nmero de protones + neutrones

El nmero de electrones en un tomo neutro = al nmero atmico

En general, los tomos de los elementos se representan con dos ndices que preceden al smbolo especfico, donde:

X es el smbolo del elemento qumico

Z es el nmero de protones o nmero atmico A es la masa atmica
A Z

El nmero de neutrones ser la diferencia (A-Z). En la tabla peridica de los elementos, stos se ordenan en funcin de su numero atmico.

PROPIEDADES

ELEMENTOS
Las unidades ms pequeas son Son las formas bsicas de

TOMOS
Las subatmicas incluyen

MATERIA
Se combinan p/formar

NEUTRONES

PROTONES

ELECTRONES

MOLCULAS
Se mantienen unidos por C/2 ms diferentes elementos

Ncleo

Combinados para el

Determinan el

Discurren en las

UNIONES QUMICAS
Pueden ser
COVALENTES

COMPUESTOS
Se forman y se rompen en INICAS
Reacciones qumicas

NMERO MSICO
Vara en

NMERO ATMICO
Constante p/ c/elemento

CAPAS CON ELECTRONES

Capa externa llamada

Comparte electrones

Istopos

Elemento

Capa de Valencia

Transfiere electrones

P/completar Octeto

UNIONES QUMICAS

COVALENTES

ELECTROVALENTES

Grupos Funcionales

Elementos ms abundantes en la materia de la corteza terrestre y cuerpo humano.

Carbono 18%

Varios tomos (iguales o distintos) que se unen entre s, forman las molculas (porcin ms pequea de materia que conserva las propiedades qumicas). Son cuerpos simples los formados por molculas con tomos iguales entre s (O2). Si estn formadas por tomos distintos, se trata de cuerpos compuestos(H2O).

Abundancia de los elementos en el agua de mar, el cuerpo humano y la corteza terrestre

Agua de mar % Cuerpo Humano % Corteza Terrestre %

H O Cl Na Mg S Ca

66 33 0.33 0.28 0.033 0.017 0.0062

H O C N Ca P Cl

63 25.5 9.5 1.4 0.31 0.22 0.08

O Si Al Fe Ca Na K

47 28 7.9 4.5 3.5 2.5 2.5

K
C

0.006
0.0014

0.06

Mg

2.2

Los valores se expresan como porcentaje sobre el nmero total de tomos

En cualquier ser vivo se pueden encontrar alrededor de 70 elementos qumicos, pero no todos son indispensables ni comunes a todos los seres.

Composicin de los seres vivos

Solo unos 30 elementos qumicos de los ms de 90 presentes en la naturaleza son esenciales para los seres vivos La mayora c/nro atmico bajo, por debajo de 34. Los ms abundantes son: H, O, C, N (los 4 constituyen ms del 99% de la masa celular), Ca, P, S, Na, K, Cl.

Oligoelementos: Fe, Mn, Mg, Zn, Mo, Se, etc. Imprescindibles para la actividad de ciertas protenas.

Por su abundancia se pueden clasificar en: a) Bioelementos primarios, en promedio 96% en la materia viva, y son C, O, H, N, P y S. Propiedades que los hacen adecuados para la vida: Forman entre ellos enlaces covalentes muy estables, compartiendo pares de electrones.

C, O y N pueden formar enlaces dobles o triples.

Facilitan la adaptacin de los seres vivos al campo gravitatorio terrestre, ya que son los elementos ms ligeros de la naturaleza.

 b) Bioelementos secundarios, proporcin prxima al 3,3%. Son: Ca, Na, K, Mg y Cl, c/ funciones de vital importancia en fisiologa celular.
c) Oligoelementos, micro constituyentes, o elementos vestigiales, proporcin inferior al 0,1%, siendo tambin esenciales para la vida: Fe, Mn, Cu, Zn, F, I, Bo, Si, V, Co, Se, Mo y Sn. Su carencia puede acarrear graves trastornos para los organismos.

Biomolculas La mayora son compuestos orgnicos

(esqueleto carbonado). Ej. Hidratos de
carbono, protenas, lpidos y cidos nucleicos

Los C pueden formar cadenas lineales,

ramificadas y ciclos. Al esqueleto carbonado se le aaden

Hidroxilo Carbonilo Carboxilo Amino Sulfhidrilo Fosfato

grupos de otros tomos, llamados grupos funcionales.

Los grupos funcionales determinan las

propiedades qumicas.

Biomolculas

Las biomolculas son las que naturalmente se encuentran en los sistemas biolgicos donde cumplen funciones especficas. Entre ellas se encuentran:

H2O Protenas Lpidos Glcidos

Nucletidos y cidos nucleicos.

Fosfatos, bicarbonato, nitratos, cidos orgnicos. Gases como CO2 y O2.

COMPOSICIN QUMICA DEL TEJIDO OSEO Y MUSCULAR

Compuesto AGUA GLCIDOS LPIDOS PROTENAS OTRAS SUST.ORGNICAS OTRAS SUST.INORGNICAS

Msculo 75 % 1% 3% 18 % 1% 1%

Hueso 22 Escaso Escaso 30 Escaso 45

Biomolculas inorgnicas:
*El agua *Slidos minerales: fosfato de calcio insolubles (formacin de tejidos duros huesos y dientes) *Iones (disueltos en lquidos corporales y protoplasma celular) esenciales para funciones vitales