MICROBIOLOGIA DEL

SUELO
Liliana Prez M.Sc.
Microbiologa Ambiental

EL SUELO
Es el principal medio en el que crecen las plantas.

Es el soporte fsico que continuamente les
proporciona:

Los nutrientes inorgnicos
El agua
El entorno gaseoso adecuado para los
sistemas radicales.
EL SUELO
Se define como un sistema dinmico, de evolucin
permanente, formado por una determinada
combinacin de sus factores formadores:
Factores Formadores
ROCA
Determina la composicin mineralgica del suelo: Los
nutrientes inorgnicos que utilizan las plantas

Aquellas rocas que contengan abundantes minerales
inestables evolucionaran fcil y rpidamente para formar
suelos

Las rocas se dividen en tres grupos segn su origen y
formacin: gneas,
Sedimentarias
Metamrficas

Distribucin de tipos de roca
en el planeta
Formacin del suelo
Meteorizacin
Es un proceso de alteracin fsico, qumico y
biolgico de las rocas como consecuencia del
contacto e interacciones con la atmosfera, biosfera e
hidrosfera.

Es una adaptacin de los minerales a condiciones
distintas a la de su formacin que implica destruccin
y sntesis.
Procesos de meteorizacin

desintegracin fsica y descomposicin qumica de los
minerales y las rocas superficiales

producen los materiales inorgnicos que formarn los
suelos
La meteorizacin implica procesos:
Fisicos
congelamiento y descongelacin
calentamiento y enfriamiento,
Qumicos
El agua se introduce entre las partculas, y los
materiales solubles se disuelven en ella.
Biolgicos
CO2 de la respiracin y otras sustancias
descomponen las rocas
Meteorizacin mecnica
El agua y el viento transportan fragmentos
de roca a grandes distancias desgaste que
las fracciona en partculas ms pequeas
Meteorizacin qumica
Disuelven
materiales
menos solubles
H2O + NO2 (NO3)
H2O + SO2

cidos

Meteorizacin orgnica-biolgica
Los cidos producidos por plantas y los
microorganismos pueden afectar las rocas.
Efecto fsico
La formacin del suelo puede ocurrir en:

El mismo sitio donde la roca es meteorizada
Pueden ser transportados a otros sitios por :
La gravedad
El viento
El agua
Los glaciares.
Horizontes del suelo
Horizonte A: Capa superior y expuesta del
suelo, actividad fsica qumica y biolgica,
materia orgnica en descomposicin
Horizonte B: Contiene mucho menos
material orgnico y est menos
meteorizado que el horizonte superior. Hay
pocos microorganismos
Horizonte C: Fragmentos de meteorizacin
de la roca madre
Horizonte D: Roca madre sin alterar
Y cual es el papel de los
microorganismos en el suelo?
Solubilizar los minerales no disponibles
para las plantas
Fijar nitrgeno atmosfrico
Realizar la mineralizacin de la materia
orgnica ( ciclaje de los elementos
esenciales para la vida)
Materia orgnica del suelo
Origen de la materia orgnica del suelo:
Bacterias, hongos, algas, lquenes,
musgos y plantas que crecen sobre o
entre los minerales y las rocas
erosionadas
Plantas y animales muertos
Composicin del suelo
Los suelos estn
formados de
materia slida y
espacio poroso
El espacio poroso
es ocupado por
diferentes
proporciones de
aire y agua,
dependiendo de
las condiciones de
humedad.
Arcilla
Materia orgnica
Pelcula de Agua
Bacterias
Hifa
Arena
Poro
CO2,
H2S,
CH4
O2
Intercambio de catinico
Los nutrientes
inorgnicos para
microorganismos
y plantas estn
presentes en la
solucin del
suelo como
iones.
Arcilla -

Na
+


Na
+


Na
+


H
+


Ca
+ +

Ca
+ +

K
+


K
+


Na
+


Cl
-


Cl
-


NO
3
-

SO
4
-2

HCO
3
-

OH
-

OH
-

OH
-

SO
4
-2

HCO
3
-

NO
3
-

HCO
3
-
Microorganismos autctonos y
alctonos
Autoctonos
Microorganismos normales de
la microbiota del suelo, que se
mantienen constantes a pesar
de las fluctuaciones en la
cantidad de materia orgnica
fermentable.

Llevan a cabo papeles
funcionales en su habitat
denominado nicho ecologico


Alctonos :
Alcanzan el habitat del suelo de
diferentes formas:
Desde el aire o desde la hidrosfera
En asociacin con material vegetal
o animal.
Patgenos por tejido vegetal
infectado
Por excremento de animales y
aguas residuales

Normalmente estas bacterias son
rpidamente eliminadas del suelo pero
pueden sobrevivir largos periodos de
tiempo en estado de latencia,
(endoesporas)
Comunidades microbianas del
suelo
El suelo es un hbitat favorable para el crecimiento de los
microorganismos , en las partculas que lo forman se
desarrollan colonias.

La concentracin de alta materia orgnica favorece el
crecimiento de microorganismos hetertrofos

En este hbitat los microorganismos son mucho mas
abundantes que en ambientes acuticos. En es suelo se
encuentran de 106 a 108 bacterias por gramos de suelo

Los microorganismos aislados del suelo comprenden:
Virus , Bacterias, Algas y Protozoos




Comunidades microbianas del
suelo
La presencia de muchos microorganismos en el suelo se debe
a deferentes caractersticas adaptativas desarrolladas:

Los suelos presentan muchos microhabitats y en una
localizacin particular que generan diferentes situaciones
microambientales que favorecen a diferentes poblaciones
microbianas.


Microhabitats
Textura de los suelos
Determinada por la proporcin
de partculas de diferente
tamao: arcilla, arena, etc

La textura determina el rea
de superficie disponible como
hbitat para el crecimiento de
los microorganismos
> composicin en arcilla= >
rea de superficie disponible
Atmosfera del suelo
Existe en los espacios porosos entre
las partculas del suelo que ocupados
por el aire .

En ocasiones los poros se llenan de
agua desplazando el aire generando
de esta forma capas de suelo
anoxigenico.

El contenido de oxigeno determinara
el tipo de metabolismo y las
transformaciones de qumicas de los
microorganismos.

En los suelos anoxigenicos, se
generan gases como CH4 y H2S



Gneros bacterianos de los
suelos
En los suelos predominan las
bacterias Gram negativas

La proporcin de bacterias Gram
negativas es mayor en suelos
que en hbitats acuticos.

Actinomicetes, representan el 10% y
33% de las bacterias del suelo.

Cianobacterias: bacterias
fotoautotrofas
Genero Porcentaje
Arthrobacter
5 60
Bacillus
7 67
Pseudomonas
3 15
Agrobacterium
1- 90
Alcaligenes
1- 20
Flavobacterium
1- 20
Corynebacterium
2 - 12
Micrococcus
2 - 10
Staphylococcus
< 5
Xanthomonas
< 5
Mycobacterium
< 5
Proporciones relativas de gneros bacterianos aerobios y anaerobios
facultativos encontrados en suelos
Actinomicetes
Generos: Streptomyces, Nocardia,
Micromonospora, Actinomyces.

Son Gram positivas

Son alctonos de los suelos

Son resistentes a la desecacin.

Viven en pH alcalino o neutro,
sensibles a pH acido.

Forman agradados filamentosos

Son saprofitos aunque algunas
variedades son patogenas
Descomposicin de los residuos
animales y vegetales con liberacin
de cidos orgnicos de los
compuestos carbonados y
amoniaco de las sustancias
nitrogenadas.

Secrecin de sustancias
antibiticas como estreptomicina,
tetraciclina , antagnismo
especficos hacia los componentes
de la microflora bacteriana.

Accin fitopatgena ejercida por
algunas especies sobre plantas de
inters agrcola.

Cianobacterias
Especies: Anabaena, Calothrix,
Chroococus, Nostoc, Microcoleus

Realizan fotosintesis

Fijan nitrgeno atmosfrico

La fijacin de nitrgeno suele ser
superior a la realizada por bacterias
no fotosintticas

Forman asociaciones simbioticas
con las plantas: Azolla- Anabaena

Forman costras en la superficie de
los suelos desnudos contribuyendo a
su estabilidad
Hongos
Constituyen la proporcin mas
elevada de biomasa microbiana en
el suelo.

Principalmente se encuentran como
organismos autoctonos pero a
veces como formas alctonas.

Se presentan como
microorganismos de vida libre o en
asociacin microrrcicas en las
raices de algunas plantas

Se encuentran en los 10 cm
superiores el suelo y raramente por
debajo de los 30 cm
Su mayor abundancia se da en
suelos cidos y bien aireados.

La mayora son oportunistas
(zimgeno)crecen y llevan un
metabolismo activo cuando las
condiciones son favorables,
pero cuando las condiciones
cambian se inactivan, entran
en un letargo hasta por
dcadas conservando su
viabilidad (esporas)
Hongos
En el suelo se presenta un
efecto inhibidor conocido como
fungistasia sobre la
germinacin de las esporas.

La adicin de materiales
orgnicos de fcil degradacin
invierte el efecto.

La fungistasia parece estar
relacionado con la actividad
microbiana. (eliminado con la
esterilizacin)


Aspergillus
Geortrichum
Penicillium
Trichoderma
Rhizopus
Mucor
Fusarium
Cladosporium
Phoma
Amanita
Morchella
Candida
Rhodotorula
Cryptococcus

Algas
Diferentes gneros de algas
habitan el en suelo,
encontrndose tanto en la
superficie como en el interior
En su mayoria son
unicelulares y de pequeo
tamao

Compenden: clorfitos,
rodoftos, euglenfitos,
crisfitos.

En los mm superiores el
posible encontrar hasta 106
Cel/g

Las algas autctonas de la
superficie del suelo pueden
descender hasta horizontes
inferiores donde son
alctonos y son consumidas
por otro organismos.




Protozoos
De vida libre

Baja diversidad y de
tamaos muy pequeos

Antes de designar un
protozoo como forma del
suelo, es necesario hallarlo
en forma vegetativa.

Ya que los quistes de
protozoos que no son del
suelo suelen penetrar dicho
habitat
Su mayor abundancia suelo
darse cerca de la superficie
del suelo, en una capa de
15cm.

Requieren en su mayora
concentraciones
relativamente altas de
oxigeno.

Son importantes
depredadores de algas y
bacterias en el suelo