PARTIR DEL CUL PURIFICAR LA ENZIMA QUE NECESITA Se debe tener en cuenta: las condiciones (pH y temperatura) en las cuales trabajar la enzima una vez purificada. Si hay abundancia de enzima en el organismo o tejido con el cual se trabajar.
Cmo eligira usted esta fuente de enzima? Presencia de actividad enzimtica Cmo se determina la actividad enzimtica? Presencia de actividad enzimtica La enzima es exportada de la clula (hongos, bac- Terias y levaduras) Determinacin cuantitativa
Determinacin cualitativa centrifugacin Presencia de actividad enzimtica La enzima se encuentra en el interior de la clula
Liberar la enzima rompiendo pared y membrana
Determinacin cuantitativa centrifugacin Identificacin de las Protenas (Cuantificacin)
Cunta protena tengo?
Mtodos Espectrofotomtricos Electroforesis 1-D y 2-D Absorbancia de luz UV Colorimetra Biuret Lowry Bradford Fluorescamina deteccin Electroblot Azul de Coomassie Plata deteccin Amido black Fierro Oro Anticuerpos (western blot) La identificacin se realiza empleando la espectrofotometra Porcentaje de transmitancia. Es la razn entre la intensidad de la luz luego de atravesar la sustancia y la intensidad de la luz antes de atravesar la sustancia multiplicado por 100. T = i/I x 100 Absorbancia.. Es el logaritmo de la transmitancia Ley de Lambert-Beer A=ebc Donde: - A es la absorbancia - b es la longitud del paso de luz (1 cm) - c es la concentracin de la sustancia e es el coeficiente de extincin Mtodos espectrofotomtricos para detectar protenas Absorbancia de luz ultavioleta (280nm) Mide aminocidos aromticos VENTAJAS: - Rpido y directo - La muestra no se pierde Desventajas: - Slo sirve para cuantificar si se conoce el coeficiente de extincin de la protena Reacciones colorimtricas: Un reactivo se une a la protena o a los aminocidos de la protena resultando un producto coloreado. Biuret El cobre en el reactivo de Biuret se une estequiometri camente dando un color violeta (mg de protena) Unin del cobre del reactivo de Biuret a los grupos amino que forman parte del enlace peptdico en las protenas Bradford (mg de protena) El colorante azul de coomasie G reacciona con los aminocidos bsicos y aromticos de la protena. Otros mtodos que detectan mg de protena : -Lowry (El reactivo de Folin Ciocalteau reacciona con los residuos de tirosina de las protenas y el reactivo de cobre alcalino de la misma manera que en Biuret
-cido Bicinchnico Ninhidrina (ng de protena) Fluorescamina (pg de protena) Cuantificacin de la protena presente en una muestra Ley de Lambert-Beer A= e bc Absorbancia 545 nm Albmina mg/ml 0.1 0.5 0.2 1.0 0.3 1.5 0.4 2.5 0.5 5.0 0.6 10.0 0.7 25.0 Curva estndar de albmina Cuantificacin de Concentracin de protenas con actividad enzimtica Relacionando cantidad de protena con la actividad enzimtica Una unidad de actividad enzimtica (Internacional) es la cantidad de protena que convierte un micromol de sustrato a producto por minuto a 25C y a pH ptimo. Ureasa: una unidad (UI) liberar 1.0 mmol de amoniaco de la rea por minuto a pH 7 y a 25C. (equivalente a 1.0 UI) Una unidad de actividad especfica Es el nmero de micromoles de sustrato convertidos por minuto por miligramo de protena. Esto es, Unidades de actividad enzimtica por miligramo de protena. Una unidad de actividad molecular Es el nmero de unidades de actividad enzimtica por micromol de enzima. Cuando la enzima es citoslica, se rompe la clula para tenerla libre mediante homogenizacin Tipos de homogenizacin Sonicacin Bajas temperaturas y presin o trituracin Congelacin y descongelacin Homogenizadores de vidrio manuales o acoplados a un motor Detergentes (enzimas asociadas a membranas) Sonicador Mortero Homogenizador de vidrio Potter- Elvejem Dounce Mezclador Waring blendor Agitador batidor Para separar las membranas y paredes celulares rotas, ncleos y partculas subcelulares del citosol se realiza una centrifugacin. Luego de centrifugar, se recoge el sobrenadante que es un preparado crudo de enzimas citoslicas Centrifugacin Principios fsicos de la centrifugacin Centrifugacin diferencial Centrifugacin por reparticin zonal Tipos de rotores F c = m (1-vr) w 2 r Donde: V= volumen especfico de la partcula r= densidad de la solucin w= radianes/s= 2p/60 x RPM r= distancia de la partcula desde el centro del rotor m= masa de la partcula Centrifugacin diferencial Centrifugacin por reparticin zonal Rotor de ngulo fijo COMO PURIFICAR ENZIMAS Se proceder a aislar la enzima de las otras molculas del medio, utilizando diferentes mtodos:
- cromatografa - precipitacin fraccionada - dilisis y ultrafiltracin Siempre debe acordarse que: En el extracto crudo y despus de cada etapa en una purificacin, se debe medir la cantidad de protena y la actividad enzimtica para poder evaluar la purificacin realizada. Precipitacin fraccionada
Fundamentos Precipitacin por sales (sales empleadas) Solventes orgnicos (etanol absoluto) Punto isoelctrico Por calor Fuerza inica pH Dilisis y Ultrafiltracin
Dilisis: Objetivo Bolsas de dilisis:tipos Ultrafiltracin: Objetivos Tipos de ultrafiltracin Bolsas de dilisis Lmite de Exclusin: 12,400 Da. 2,000 Da. (benzoiladas) Sistemas de Ultrafiltracin Sistemas de Ultrafiltracin Referencias bibliogrficas para la prxima clase: J. M. Gonzles de Buitrago Tcnicas y Mtodos de Laboratorio Clnico. Elsevier Masson. Barcelona, Espaa. 2010.
M.D. Trevan, S. Boffey, K.H. Biotecnologa: Principios Biolgicos. Editorial Goulding y P. Stanbury. Arancibia. Zaragoza, Espaa. 1990.
D.L. Nelson AND M.M. Cox Principles of Biochemistry. 5 th ed. W. H. Freeman Publishers and Company, New York. 2008.
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