cidos nucleicos:

Bases, nuclesidos y nucletidos

F. Miescher (1865)
- Estudia la composicin qumica del pus: encuentra
una fraccin precipitable por cido diludo que denomina
nuclena

- Encuentra un material parecido a la nuclena en la
esperma de salmn, y lo fracciona en una componente
proteico (protamina) y un componente que contiene P,
de carcter cido, que Altmann denomina cido nucleico
- Estudios posteriores a Miescher demuestran la existencia
de dos tipos de cido nucleico: uno abundante en la levadura,
que recibe el nombre de cido zimonucleico y otro, abundante
en el timo, llamado cido timonucleico.

- Posteriormente se comprueba que en la composicin del
llamado zimonucleico entra la ribosa, y por eso pasa a llamarse
cido ribonucleico (RNA, ARN), mientras que el timonucleico
contiene desoxirribosa, por lo que pasa a llamarse cido
desoxirribonucleico (DNA, ADN)
Experimento de Avery (1944)
El neumococo tipo R (rough, rugoso) (colonias a la izda.) puede
ser transformado en neumococo tipo S (smooth, liso) (colonias
a la dcha.) por el DNA del neumococo S. Esta transformacin
se transmite a la descendencia.
La hidrlisis qumica completa de un cido nucleico da lugar a
una mezcla equimolar de:
A. Una base nitrogenada heterocclica, purina o pirimidina

B. Una pentosa, ribosa o desoxirribosa

C. Ortofosfato
La hidrlisis enzimtica completa de un cido nucleico da lugar
a una mezcla de nucletidos

Los cidos nucleicos son polmeros (de altsimo peso molecular)
cuyos monmeros son los nucletidos.
DNA de Escherichia coli
Una sola molcula circular
cuya circunferencia mide
1 mm
Tiene un peso molecular de
aproximadamente 10
9

O
N
N
N
N
NH
2
OH OH
CH
2
O P
-
O
O
O
-
H
H H
Pentosa
Base
Nuclesido
Fosfato
Nucletido
O
N
N
N
N
NH
2
OH
CH
2
O P
O
-
O
N
N
N
N
NH
2
OH
CH
2
O P
O
-
O
N
N
N
N
NH
2
OH
CH
2
O P
O
-
O
O
O
O
O
O
Polinucletido
Enlace
fosfodister
Enlace
b-glicosdico
N
N
N
NH
1
2
3
4
5
6
7
8
9
N
N
1
2
3
4
5
6
Purinas
Pirimidinas
N
N
N
NH
NH
2
N
HN
N
NH
O
H
2
N
Adenina: 6-amino purina
Guanina: 2-amino 6-oxo purina
N
HN
N
NH
O
NH
HN
N
NH
O
O
N
N
N
NH
OH
HO
OH
Hipoxantina:
6-oxo purina
Xantina:
2,6 dioxo purina
cido rico:
2,6,8 trioxo purina
N
N
O
NH
2
N
HN
O
O
N
HN
O
O
CH
3
Citosina:
2-oxo 4-amino
pirimidina
Uracilo:
2,4-dioxo
pirimidina
Timina:
2,4-dioxo
5-metil
pirimidina
Propiedades de las bases
1. Carcter levemente bsico
2. Solubilidad escasa en agua
3. Espectro de absorcin con mximo a 260 nm
4. Posibilidad de formas tautomricas
5. Todos los reactivos de las bases son potencialmente
mutagnicos
HN
NH O
O
N
N
HO
OH
Forma
ceto
Forma
enol
Formas tautomricas
del uracilo
N
N
N
NH
NH
2
N
HN
N
NH
O
+ NH
3
HNO
2
Reaccin de desaminacin por cido nitroso:

Adenina se desamina a hipoxantina; por ello todos los
nitrosocompuestos son mutgenos qumicos potentes.
N
N
N
NH
NH
2
H
3
C
N
HN
N
NH
O
N
H
3
C
CH
3
N
N
N
NH
N
CH
2
H
C
H
2
C CH
2
CH
3
N
HN
S
O
N
HN
O
S
1-Metiladenina
2-Dimetilaminoguanina
Isopenteniladenina
4-Tiouracilo
2-Tiouracilo
Bases
modificadas
N
N
N
NH
O
O
H
3
C
CH
3
CH
3
N
N
N
NH
O
O
H
3
C
CH
3
N
N
N
NH
OH
O
CH
3
CH
3
Cafena
Teofilina
Teobromina
Productos naturales: metilxantinas
Inhibidores de la cAMP fosfodiesterasa
N
N
N
NH
SH
N
HN
O
O
Br
N
N
N
NH
H
2
N
N
HN
N
N
NH
O
H
2
N
6-Mercaptopurina
5-Bromouracilo
2-Aminopurina
8-Azaguanina
Anlogos sintticos de bases: antimetabolitos
Nuclesidos, 1

Unin de una base a una pentosa a travs de un enlace de tipo
b-N-glicosdico:
O
HOCH
2
OH OH
N
N
N
N
H
2
N
O
HOCH
2
OH
N
N
N
N
H
2
N
H
Adenosina
(pentosa es ribosa)
Desoxiadenosina
(pentosa es desoxirribosa)
Enlace
b-N-glicosdico
Purinas: enlace entre carbono anomrico (1) y N9 de la base
Citidina Desoxicitidina
O
HOCH
2
OH OH
N
N
O
NH2
O
HOCH
2
OH H
N
N
O
NH2
Nuclesidos, 2
Pirimidinas: enlace entre carbono anomrico (1) y N1 de la base
O
HOCH
2
OH OH
N
N
N
N
H
2
N
1
2
3
4
5
6
7
8
9
1'
2' 3'
4'
5'
Numeracin
Base Nuclesido

Adenina Adenosina
Guanina Guanosina
Hipoxantina Inosina

Citosina Citidina
Uracilo Uridina
Timina Timidina
Nomenclatura
Uridina
1
2
3
4
5
O
HOCH
2
OH OH
N
HN
O
O
1'
2'
3'
4'
5'
Numeracin de tomos en los nuclesidos
Propiedades qumicas de los nuclesidos
1. Incremento marcado en solubilidad con respecto a la de la base

2. Reacciones propias de la pentosa: Reaccin del orcinol (ribo-)
y de la difenilamina (desoxirribo-)

3. Absorcin a 260 nm como las bases aisladas
Adenosina (anti-)
Adenosina (syn-)
Conformacin de nuclesidos
O
HOCH
2
OH OH
NH
HN
O
O
Pseudouridina
Enlace C-C en lugar
del C-N habitual
O
N
N
N
N
NH
2
OH HOCH
2
O
N
N
N
N
NH
2
OH
HOCH
2
NH
C O CH
NH
2
CH
2
O H
3
C
Antibiticos nucleosdicos
Cordicepina
Puromicina
Citosin arabinsido
(Vidarabin)
Antivirales
O
HOCH
2
OH
N
N
O
NH
2
OH
O
N
HN
O
O
CH
3
HOCH
2
N
3
AZT, Zidovudina
D4T, Estavudina
C
O
N
HN
O
O
CH
3
HOCH
2
C
Antirretrovirales
O
HOCH
2
OH
N
N
O
NH
2
O
P O
O
-
O
-
O
HOCH
2
O
N
N
O
NH
2
OH
P O O
-
O
-
O
CH
2
OH
N
N
O
NH
2
OH
O P
O
-
O
O
-
Nucletidos
(ribonucletidos)
5-nucletido
(5-CMP)
3-nucletido
(3-CMP)
2-nucletido
(2-CMP)
O
HOCH
2
O
N
HN
O
P O O
-
O
-
O
H
O
CH
2
OH
N
HN
O
O P
O
-
O
O
-
H
O
CH
3
Nucletidos (desoxirribonucletidos)
5-dTMP
3-dCMP
O
N
N
N
N
NH
2
OH
O
P
O
O
-
O
Nucletidos cclicos
3,5 Adenosin monofosfato cclico, cAMP
O
N
N
N
N
NH
2
OH OH
CH
2
O P
O
-
O
O
-
O
N
N
N
N
NH
2
OH OH
CH
2
O P
O
O
O
-
P
O
O
O
-
O
N
N
N
N
NH
2
OH OH
CH
2
O P
O
O
O
-
P
O
O
O
-
P
O
-
O
O
-
Nuclesido polifosfatos
5-Adenosina
monofosfato, AMP
5-Adenosina
difosfato, ADP
5-Adenosina
trifosfato, ATP
Propiedades de los nucletidos
1. Carcter cido debido al fosfato
2. Solubilidad incrementada respecto al nuclesido
3. Mximo de absorbancia UV a 260 nm
4. Misma reactividad que bases y nuclesidos
O
N
N
N
N
NH
2
OH OH
CH
2
O P
O
O
O
-
P
O
O
O
-
O
N
N
N
N
NH
2
OH OH
CH
2
O P
O
O
O
-
P
O
O
O
-
P
O
-
O
O
-
H
2
O
Pi
G = -7.6 kcal/mol
ATP
ADP
ATP como
donador de energa
O
CH
2
N
N
N
N
NH
2
OH OH
O P O P O P
-
O
O O O
O
-
O
-
O
-
b

ATP
O P O P O
O O
O
-
O
-
O P O
O
O
-
CH
2
Configuracin de alta energa (anhdrido)
Configuracin de baja energa (ster)
O
OH OH
N
HN
O
O
CH
2
O P O P O
O O
O
-
O
-
O
HOCH
2
OH
OH
OH
O
OH OH
N
N
O
CH
2
O P O P O
O O
O
-
O
-
NH
2
CH
2
CH
2
N
+
CH
3
CH
3
H
3
C
Uridindifosfato glucosa (UDPG)
Citidindifosfato colina (CDP-colina)
O
CH
2
N
N
N
N
NH
2
OH
O P O
O
O
-
S
O
O
-
O
O
P O
-
O
O
-
O
CH
2
N
N
N
N
NH
2
OH
S
+
CH
3
CH
2
CH
2
CH
NH
3
+
-
OOC
OH
3-Fosfoadenosina
5-fosfosulfato, PAPS
S-adenosil
metionina, SAM
O
CH
2
N
N
N
N
NH
2
OH OH
O P O P
O O
O
-
O
-
O CH
2
HCOH
HCOH
HCOH
CH
2
N
N
NH
N O
H
3
C
H
3
C
O
O
CH
2
N
N
N
N
NH
2
OH OH
O P O P
O O
O
-
O
-
O CH
2
O
N
+
OH OH
Nicotinamido
adenin dinucletido,
NAD
+

Flavin adenin
dinucletido,
FAD
O
H
H
OH
H
OH
CH
2
H
N
N
N
N
NH
2
O P
O
O
-
O P
O
O
-
O
H
3
C CH
3
HO H
C
N
C
N
HS
O
H
O
H
ADP
Pantetena
Coenzima A