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Facultad de Medicina
Escuela de Medicina Jos Mara Vargas
Estructura y Propiedades de
Aminocidos y Protenas
Fabin Rodrguez
Mdico Cirujano - UCV
1.
Aminocidos
2.
Estructura de un aminocido
Clasificacin de los aminocidos
Aminocidos modificados
Estereoqumica de los aminocidos
Zwitterion
Curvas de titulacin de aminocidos
Pptidos
3.
Enlace peptdico
Estructura del enlace peptdico
Protenas
-Hlice.
Conformacin
Giros
Estructuras Suprasecuendarias
Estructura terciaria
Dominios
Reglas de Plegado
Termodinmica del Plegado
Factores que afectan el plegado
Chaperonas moleculares
Estructura Cuaternaria
Protenas de Importancia Fisiolgica
4.
Contenido
Queratinas
Colgeno
Protenas plasmticas
AMINOCIDOS
Aminocidos
Estructura de un Aminocido
Un aminocido es una molcula
orgnica con un grupo amino y un grupo
carboxilo.
Al Carbono se unen:
Un grupo amino (NH2)
Un grupo carboxilo (COOH)
Un hidrgeno (H+)
Una cadena lateral o grupo R
Aminocidos
No Esenciales
Valina (Val, V)
Alanina (Ala, A)
Leucina (Leu, L)
Prolina (Pro, P)
Treonina (Thr, T)
Glicina (Gly, G)
Lisina (Lys, K)
Serina (Ser, S)
Triptfano (Trp, W)
Cistena (Cys,C)
Histidina (His, H)
Asparagina (Asn, N)
Fenilalanina (Phe, F)
Glutamina (Gln, Q)
Isoleucina (Ile, I)
Tirosina (Tyr, Y)
Arginina (Arg, R)
Aspartato (Asp, D)
Metionina (Met, M)
Glutamato (Glu, E)
Aminocidos
Triptfano
Leucina
Valina
Treonina
Lisina
Isoleucina
Histidina
Fenilalanina
Arginina
Aminocidos
Polares
con Carga
Negativa
Polares
con Carga
Positiva
Aromticos
De
acuerdo a
sus
Grupos R
Polares sin
Carga
Aminocidos
La glicina es el aminocido
ms pequeo
La Glicina y la Prolina
dificultan
el
plegado
proteico.
La Metionina
azufre.
contiene
Aminocidos
Absorben fuertemente la
luz UV
La Tirosina contiene un
grupo
OH,
es
un
aminocido hidroxilado.
Aminocidos
son
Aminocidos
Aminocidos
Aminocidos
Aminocidos modificados
Cumplen funciones especiales o son
intermediarios importantes.
4-Hidroxiprolina e 5-Hidroxilisina:
forman parte del colgeno.
6-N-metil lisina: constituyente de la
miosina.
-carboxiglutamato: se encuentra en
varias protenas de la cascada de
coagulacin.
Desmosina: integra la elastina.
Ornitina y Citrulina: intermediarios
de la biosntesis de Arginina y el
Ciclo de la Urea.
Aminocidos
Aminocidos
H
H
Aminocidos
Aminocidos
Aminocidos
Zwitterion
In dipolar de un aminocidos
que se forma al disolverse en
agua.
Aminocidos
Zwitterion
El punto isoelctrico (pI) de un aminocido es el pH al cual el aa tiene carga neta 0.
Escala de pH
0
10
11
12
13
14
Punto Isoelctrico
H+
H+
H+
H+
H+
H+ H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+ H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+ H +
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+
H+ H+
H+
H+
H+
H+
H+
Un AA tiene carga positiva a un pH por debajo de su pI y tiene carga negativa a un pH por encima de su pI.
Aminocidos
Zwitterion
El punto isoelctrico (pI) de un aminocido es el pH al cual el aa tiene carga neta 0.
Un AA tiene carga positiva a un pH por debajo de su pI y tiene carga negativa a un pH por encima de su pI.
Aminocidos
Zwitterion
El punto isoelctrico (pI) de un aminocido es el pH al cual el aa tiene carga neta 0.
Se coloca una molcula de Glicina cuyo pI es 5,97 en un medio acuoso a pH 7. La molcula migrar
hacia el nodo (electrodo positivo) o al ctodo (electrodo negativo)?
R= La molcula migrar hacia el nodo
Un AA tiene carga positiva a un pH por debajo de su pI y tiene carga negativa a un pH por encima de su pI.
Aminocidos
Aminocidos
Aminocidos
Aminocidos
Zwitterion
Aminocidos
Por ejemplo:
pI=
2,34 + 9,60
2
= 5,97
Aminocidos
Por ejemplo:
pKa vecinos al Zwitterion
pI=
2,19 + 4,25
2
= 3,22
PPTIDOS
Pptidos
Enlace Peptdico
Pptidos
Enlace Peptdico
Pptidos
Pptidos
Pptidos
Es un enlace amida
Tiene carcter parcial de doble
enlace
Predomina la configuracin
trans
PROTENAS
Macromolculas ms abundantes
Clasificacin
Simples Albmina
Conjugadas
Nucleoprotenas Ribosomas
Lipoprotenas HDL
Hemoprotenas Hemoglobina
Flavoprotenas Succinato Deshidrogenasa
Glicoprotenas Inmunoglobulinas
Metaloprotenas Ceruloplasmina
Fosfoprotenas Caseina
Clasificacin
Fibrosas Colgeno
Clasificacin
Oligomricas Hemoglobina
Clasificacin
Segn su Funcin:
Defensa Inmunoglobulinas
Hormonal Insulina
Transporte Transferrina
Reserva Ferritina
ESTRUCTURA PRIMARIA
Estructura Primaria
Estructura Primaria
Sucesin de residuos de aminocidos en la
cadena polipeptdica, que a su vez esta
determinada por la secuencia de bases en el gen
ESTRUCTURA SECUNDARIA
Estructura Secundaria
Estructura Secundaria
Conformacin de los residuos de
aminocidos adyacentes en la cadena
polipeptdica, es decir el plegado
regular local de la estructura
primaria
Estructura Secundaria
- Hlice
Hlice Dextrgira
Grupos R externos
Estructura Secundaria
- Hlice
La estructura es estabilizada por:
Puentes de hidrgeno
intracatenarios cada 4 residuos
Estructura Secundaria
Conformacin (Lmina )
Cadenas Extendidas en zig-zag,
formando pliegues
Estructura Secundaria
Giros
Conectan tramos sucesivos de
hlices o conformaciones
Usualmente se encuentran
residuos de Glicina y Prolina
Estructura Secundaria
ESTRUCTURA TERCIARIA
Estructura Terciaria
Estructura Terciaria
Estructura Terciaria
Dominios
Parte de una cadena polipeptdica que es estable de manera independiente y que
puede moverse como una entidad nica con respecto al resto de la protena.
Habitualmente 40 400 AA
Estructura Terciaria
Estructura Terciaria
Reglas de Plegado
En medio acuoso, los aminocidos
hidrofbicos se disponen en el interior y
los hidroflicos en el exterior
Estructura Terciaria
Reglas de Plegado
Varios tipos de estructura secundaria
(hlices y conformaciones ) y
estructuras al azar unidos por varios giros.
Lminas
dextrgiro.
torsionadas
en
sentido
Estructura Terciaria
Reglas de Plegado
Hlices y Lminas separadas en
capas estructurales diferentes
Estructura Terciaria
Por tanto para que G sea negativo la entalpia debe disminuir (H ) y/o la entropa
aumentar S+
Interacciones carga-carga
Enlaces de hidrgeno
Estructura Estable
S+
Efecto Hidrofbico
Los enlaces disulfuro estabilizan aun ms la estructura tridimensional
La estructura nativa de una protena es aquella en la que es ms
estable y en la cual es biolgicamente activa.
Estructura Terciaria
pH
Temperatura
Molculas orgnicas
Alcohol, acetona
Urea
Cloruro de Guanidino
Dtergentes
Agentes reductores (mercaptoetanol)
Estructura Terciaria
Rutas de Plegado
Estructura Terciaria
Chaperonas Moleculares
Protenas que interaccionan con polipptidos parcial o incorrectamente plegados, facilitando
rutas de plegado correctas o aportando microentornos donde pueda ocurrir el plegado
Protegen a las protenas desnaturalizadas por el calor y los pptidos que se estn sintetizando
Estructura Terciaria
Chaperonas Moleculares
Chaperoninas GroEL/GroEs
ESTRUCTURA CUATERNARIA
Estructura Cuaternaria
Estructura Cuaternaria
ALGUNAS PROTENAS DE
IMPORTANCIA FISIOLGICA
Queratinas
- queratinas
AA Principales
Estructura
Secundaria
Pequeos sin
carga
Cisteina
-hlice
Estructura
Suprasecundaria
Protofilameneto
Protofibrilla
Filamneto Intermedio
Funciones
Estructura de piel,
pelo, lana, uas,
plumas, pinzas, etc
- queratinas
AA Principales
Estructura
Secundaria
Estructura
Suprasecundaria
Funciones
Muy pequeos
sin carga
No hay
Cisteina
Conformacin
Lmina plegada
antiparalela
Estructura de seda
e hilos de araa
Colgeno
Glicina = 35%
Alanina = 11%
Gly X Y
Prolina e Hidroxiprolina (Hyp) = 21%
Hyp es sintetizada por la Prolil 4-hidroxilasa
que requiere A. ascrbico. Deficiencia Escorbuto
Elastina
La unidad bsica se llama tropoelastina, rica en
glicina y alanina.
Protenas Plasmticas
Fracciones
Principales Protenas
Funciones
Albmina
55
HDL
Transcobalamina
Protrombina
Transporte reverso de
colesterol
Transporte de Vit B12
Factor de Coagulacin
Haptoglobina
Ceruloplasmina
VLDL
Fijadora de hemoglobina
Transporte de cobre
Transporte de Lpidos (TG)
13
Transferrina
Hemopexina
LDL
Transporte de hierro
Unin con grupo hemo
Transporte de Lpidos (CE)
Fibringeno
11
Coagulacin sangunea
A, D, E, G, M
Anticuerpos
Otras Protenas
Mioglobina Hemoprotena
oxgeno en los msculos
fijadora
de
Uso de detergentes
Permite solubilizar las protenas
Salting Out
Precipita las protenas utilizando altas
concentraciones de sales.
Dilisis
Separa las protenas de otras molculas
como sales utilizando una membrana
semipermeable.
Cromatografa de afinidad
Separa protenas por su unin selectiva
Utiliza lechos especiales como sustratos, enzimas, etc.
ESTRUCTURA BIOQUMICA
DE LA CLASE
Aminocidos
Estructura bsica de
un aminocido
Estructura bsica de
un aminocido
Grupo R H
Grupo R CH2OH
(1 solo C en el grupo R)
Estructura bsica de
un aminocido
Grupo R Unido al
grupo amino
Bibliografa
Alemn, I (2010). Estructura de las Protenas. Presentacin en Power Point.
Ctedra de Bioqumica, Escuela de Medicina Jos Mara Vargas UCV
Campos, Y (2007). Protenas. Presentacin en Power Point. Ctedra de
Bioqumica, Escuela de Medicina Jos Mara Vargas UCV
Ciarletta, E (2004). Las Protenas. Gua de Estudio Ctedra de Bioqumica,
Escuela de Medicina Jos Mara Vargas UCV pp 5- 48
Mathews, C; van Holde, K y Ahern, K (2003). Bioqumica, 3a Edicin, Pearson
Educacin; Madrid, Espaa
Gracias