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Gli Organismi
dalla Inesplorata Biodiversit
alla Biotecnologia del Futuro
Mos Rossi
Dipartimento di Biologia Strutturale e
Funzionale
Universit Federico II Napoli
Istituto di Biochimica delle Proteine
CNR Napoli
permesso
di
valutare
la
diversit
CATALOGAZIONE DEI
MICRORGANISMI
Mesofili: temperature moderate
Termofili / Ipertermofili: alte temperature
Acidofili / Alcalofili: condizioni acide/
basiche
Alofili: alte concentrazioni saline
Psicrofili: basse temperature
Barofili: alte pressioni
The highest and lowest temperature for each major taxon is given. Archaea are in red, Bacteria in blue, algae in
light green, fungi in brown, protozoa in yellow, plants in dark green and animals in purple.
Hydrothermal vents
Marine Black smokers
Pozze di fango
bollente
Fumarola
S. solfataricus
home
Sorgenti calde
Sulfolobussolfataricus80C
Archaeoglobusfulgidus80C
Black smokers
Pyrodictiumoccultum110C
Pyrococcusfuriosus90C
Methanopyruskandleri90C,2000m
- T= 40-90 C
- pH molto basico
- camini di carbonato bianco
- Archaea metanogeni
Proteobacteria0C,
Proteobacteria0C,3000m
FerroplasmaacidophilumpH1
Bacillussp.pH10.5
Halobacterium salinarium
20% NaCl
Halobacterium japonicum
30% NaCl
Methanobacter4060C
Un po di numeri: dimensioni
Parvovirus
(ilpipiccolovirus)
20nm
Nanoarchaeumequitans
(ilpipiccoloarchaeon)
400nm
Pelagibacterubique
(ilbatteriopiabbondante)
500nm
Nanobacterium
(ilpipiccolobatterio)
20150nm
Mimivirus
(ilpigrandevirus)
400nm
Escherichiacoli
20006000nm
Un po di numeri
Numero e biomassa di procarioti nel mondo
HABITAT
Numero di cellule
(x1028 )
Acque
12
2.2
Sottosuolo oceanico
355
303
Suolo
26
26
Sottosuolo terrestre
25-250
25-215
Totale
415-640
353-546
Un po di numeri
Abbondanza dei procarioti in differenti ecosistemi
HABITAT
Numero di cellule
5x105 cellule/ml
5x104 cellule/ml
Acqua dolce
1x106 cellule/ml
Suolo
1x107 cellule/g
Rumine
1x1015 cellule/individuo
Intestino umano
1x1015 cellule/individuo
Un po di numeri
Coltivabilit dei procarioti da differenti ecosistemi
HABITAT
Coltivabilit (% di specie
coltivabili sul totale)
Acqua di mare
0.001-0.1
Fiumi
0.25
Laghi
0.1-1
Fanghi attivati
1-15
Sedimenti
0.25
Suolo
0.3
Bacteria
Archaea
Eucarya
COLTIVAZIONE
Strategie Selettive
di isolamento
METAGENOMICA
Biodiversit e Biotecnologie
Nelle Biotecnologie, sono le caratteristiche dei sistemi
biologici usati, in relazione alla loro specificit funzionale e
stabilit, a fissare i limiti operazionali di un processo.
La scoperta di nuovi organismi che vivono in maniera ottimale
in ambienti particolari, con il conseguente adattamento delle
biomolecole indispensabili alla loro vita, allargano i limiti delle
condizioni operative nellindustria sia per implementare
processi tradizionali, sia per disegnarne nuovi per prodotti
innovativi.
Un approccio importante lutilizzo della biodiversit poich la
diversit dei microrganismi, le molecole che contengono ed i
processi che essi svolgono sono realmente immensi.
ENZIMI
Gli enzimi da ipertermofili sono termostabili e attivi ad alte
temperature (termoattivi)
geneticamente codificate
le
loro
propriet
sono
Enzimi candidati
Evoluzione in vitro
ingegneria enzimatica
Enzimi con le
propriet richieste
Applicazione degli
enzimi nei processi
biocatalitici
screening secondario
Enzimi da estremofili
FONTE
CRESCITA
ENZIM I
APPLICAZIONI
Termofili/
60-80
C (termofili)
80 C
(ipertermofili)
Proteasi
ipertermofili
Glicosil idrolasi
Lipasi, esterasi
DNA polimerasi
Deidrogenasi
Psicrofili
15 C
Proteasi
Glicosil idrolasi
Lipasi
Alofili
2-5 M NaCl
Proteasi
Deidrogenasi
Produzione di peptidi
Biocatalisi in solventi organici
Alcalofili
pH 9
Proteasi, cellulasi
Acidofili
pH 3
Amilasi
Proteasi, cellulasi
Ossidasi
Degradazione di amido
industria alimentare
Desulfurizzazione del carbone
Piezofili
Idrolasi
Vari
Industria alimentare
Produzione di antibiotici
LAPOLYMERASECHAINREACTION(PCR)
L amplificazione dei frammenti di DNA con questa tecnologia ha portato ad una
rapida espansione della Conoscenza nelle scienze della vita, in particolare nella
biologia molecolare e cellulare, nell ingegneria genetica e nelle biotecnologie.
21
22
23
24
OH
O
HO
(1,4)
amilosio
OH
OH
O
HO
OH
OH
(1,4)
amilopectina
HO
O
OH
O
O
(1,4)
O
O
(1,4)
(1,4)
(1,6)
OH
(1,4)
O
O
1 -amilasi
2 -amilasi
3 pullulanasi
glucoamilasi
glucosio
-amylase
Gelatinization
103 - 105C; 3 - 7 min
Dextrine Syrup
8-15% DE
Dextrinization
95C; 1 - 3 hrs
fungal
-amylase
Maltose syrup
glucoamylase
SACCHARIFICATION
60C; pH 4.2 - 4.5; 48 hrs
Glucose syrup
95-96% DE
100
70
130
40
16
30,000
20,000
Una soluzione al 42% di fruttosio ha lo stesso potere dolcificante di una al 100% di saccarosio
xylose
isomerase
xylose
ma ad alta temperatura
(90-95 C)
glucose
xylulose
xylose
isomerase
fructose
Il
crescente
aumento
nellatmosfera
della
concentrazione della anidride carbonica (CO2)
prodotta dalle attivit antropiche ritenuta una delle
principali cause dei cambiamenti climatici della terra.
Pertanto lo sviluppo e limpiego di tecnologie per
ridurne la concentrazione, mediante cattura e
stoccaggio, avranno un ruolo essenziale a livello
internazionale per poter produrre lenergia necessaria
allo sviluppo di ogni paese riducendo il danno
ambientale.
Essa brucia circa 125 tonnellate di carbone per ora, circa 3000 T
al giorno.
Produce circa 290 tonnellate di CO2 per ora (2,32 T di CO2 per T di
carbone) cio 6960 T al giorno.
Anidrasi carbonica
CO2 + H2O
HCO3- + H+
Biodiversity
Gene library
Discovery
Screen
Recover clone
Evolution
Enzyme
Small molecule
Production