ENZIMAS

PALABRA GRIEGA ; ZYME

EN FERMENTO

ENZIMAS
POLIMEROS BIOLOGICOS

Catalizadores; aceleran la velocidad

de las reacciones bioqumicas y no se
altera de forma permanente por la
reaccin

Reaccin bioqumica; cuando las

molculas que chocan poseen una
cantidad mnima de energa (energa
de activacin ( Ea) o energa libre de
activacin AG)

Energa de activacin (AG): cantidad

de energa que se requiere para
convertir 1 mol de molculas (sustrato
o reactante) desde el estado basal (la
forma basal de baja energa) al estado
de transicin

Estado de transicin: intermediario

transitorio en el que no existe sustrato
libre ni producto

ENZIMAS
AUMENTO DE LA VELOCIDAD DE REACCION

Depende:

1.

Molculas con energa cintica suficiente

2.

Orientacin correcta para reaccionar (aproximacin

entre si a la distancia de formacin de enlace)

3.

Concentracin de los reactivos

4.

Las enzimas

ENZIMAS
Sustratos

(reactante) ; molculas sobre las

cuales actan las enzimas

Productos

; las molculas resultantes

Complejo

enzima-sustrato ( ES); conformacin

intermedia y transitoria que se da como
resultado de la interaccin enzima (E) con su
sustrato (S )

E+S

ES

E+P

ENZIMAS
CONSTANTE DE EQUILIBRIO (Keq)

Es igual al producto de las

concentraciones de los
productos de la reaccin ,
dividido entre el producto de
los sustratos
En el equilibrio las
concentraciones globales de
reactivos y productos
permanecen constantes
La velocidad de conversin de
sustratos en productos es
igual a la velocidad a la que
los productos se convierten en
sustratos
Relacin constantes de
velocidad

A+ B
P+Q
Keq = [ P ] [ Q ]
[ A] [ B ]
A+A
Keq = [ P ]
[ A] 2
Keq = K1
K2

ENZIMAS
PROPIEDADES
A.

Velocidades de las reacciones que catalizan

extraordinariamente elevadas ( aumento de la velocidad
10 a la 6 veces mayor)

B.

Muy especificas para las reacciones que catalizan

( extremadamente selectivos ; tipo de reaccin, sustrato
o conjunto pequeos de sustratos), poco habitual
productos secundarios

C.

Estructuras complejas

D.

Pueden regularse

ENZIMAS
CATALIZADORES
Lugar activo; superficie de unin
de forma enrevesada y nica
Funcin del lugar activo:

1.

Es el sito de unin del sustrato a

la enzima (pequea hendidura o
grieta)

2.

Los aminocidos presentes

participan activamente en el
proceso cataltico

3.

La informacin dentro del lugar

activo; su forma y distribucin de
carga se utiliza para orientar de
forma optima al sustrato

4.

Reduce la energa necesaria para

que se produzca la reaccin hasta
el producto

ENZIMAS
CATALIZADORES
Proporcionan

una ruta de reaccin que requiere

de menos energa de activacin que la reaccin
sin catalizar

No

altera el equilibrio si no que aumenta la

velocidad hacia el equilibrio

El

equilibrio se alcanza en segundos o minutos

en lugar de horas o das

ENZIMAS
ESPECIFICIDAD

Caracterstica de mayor relevancia

Determinante en la regulacin del metabolismo celular
Reduce la variedad de sustratos sobre los que una
enzima puede actuar

Tipos de especificidad:

a)

La especificidad ptica; solo sobre isomeros de la serie

L (catabolismo de aminocidos), sobre los de la serie D
( metabolismo de carbohidratos)

b)

Especificidad de grupo; sobre un grupo determinado de

molculas

ENZIMAS
ESPECIFICIDAD
1.

Modelo llave-cerradura ( Emil Fischer)

2.

Modelo de ajuste inducido

(Daniel Koshland)

ENZIMAS
ESPECIFICIDAD
Modelo llave-cerradura (lugar
activo rgido);

Cada enzima se une a un

nico tipo de sustrato
El lugar activo de la enzima
y el sustrato poseen
estructuras complementarias
El sustrato entra e
interacciona con el lugar
activo (forma global y
distribucin de carga)

ENZIMAS
ESPECIFICIDAD
Modelo de ajuste inducido
(estructura flexible de las
protenas):

El sustrato no se ajusta con

precisin a un lugar activo
rgido

Las interacciones no covalentes

entre la enzima y el sustrato
modifican la estructura
tridimensional del lugar activo

Conforman la forma del lugar

activo con la forma del sustrato
en la conformacin del estado
de transicin

ENZIMAS
MODELO DE AJUSTE INDUCIDO

La enzima y el sustrato
sufren cambos
conformacionales en el
estado de transicin

El sitio cataltico no es un
lugar esttico y rgido,
dinmico y transitorio

Al final de la reaccin la
enzima recupera su
estructura original

ENZIMAS
ACTIVIDAD ENZIMATICA
Depende :
1.

Interaccin entre los aminocidos del lugar activo y el sustrato

2.

Componentes no proteicos; (cofactores enzimticos)

apoenzima : componente proteico de una enzima que carece de
un cofactor esencial
holoenzima: enzimas intactas con sus cofactores unidos

a)
b)

c)

Iones; Mg, Zn, Fe , K, Co, Cu, Se,(mtaloenzimas)

Coenzimas; molculas orgnicas complejas presentes en el medio
enzimtico con enlaces transitorios y disociables a la enzima o a un
sustrato
Grupos prostticos; incorporacin de la cofactor fuerte y estable a la
estructura proteica

COENZIMAS Y VITAMINAS DE
PROCEDENCIA

ENZIMAS
ACTIVIDAD ENZIMATICA
3.

Control directo del organismo a travs

de la unin de activadores o inhibidores

4.

Modificacin covalente de la molcula

enzimtica

5.

Regulacin gentica (sntesis proteica)

CLASIFICACION
UNION INTERNACIONAL DE BIOQUIMICA
(UIB)
ESQUEMA DE DENOMINACION SISTEMATICA

Categoras; reaccin que catalizan

Oxidoreductasas

Catalizan reacciones de
oxidacin reduccin

Deshidrogenasas,oxidas
as,oxigenasas,
reductasas, peroxidasas
hidrolasas

Transferasas
prefijo.;Trans

Catalizan reacciones en
las que hay transferencia
de grupos de una
molcula a
otra(metilo,fosforilo y
acilo)

Transcarboxilasas
transmetilasas
transaminasas

Hidrolasas

Catalizan reacciones en
las que se produce la
rotura de enlaces por
adicin de agua

Esterasas, fosfatasa y
peptidasas

CLASIFICACION
UNION INTERNACIONAL DE BIOQUIMICA
(UIB)
CATEGORIA : REACCION QUE CATALIZAN

Liasas

Catalizan reacciones en las

que se eliminan
grupos(H2O,C02,NH3),
para formar un doble enlace
o se aade a un doble
enlace

Isomerasas

Catalizan varios tipos de

reordenamiento molecular
Inversin de tomos de
carbono asimtricos
Transferencia
intramolecular de grupos
funcionales

a)

Epimerasas

b)

Mutasas

Ligasas

Catalizan la formacin de
un enlace entre dos
molculas de sustrato

Descarboxilasas,
hidratasas,
deshidratasas
desaminasas
Desaminasas
sintasas

Los nombres incluyen los

trminos:
Sintetasas,carboxilasas

ENZIMAS
CINETICA ENZIMATICA
Relacionada con:

Determinacin cuantitativa de las reacciones que catalizan las

enzimas
Estudio sistemtico de los factores que afectan dichas velocidades
Miden la afinidad de las enzimas por los sustratos y los inhibidores
Mecanismos de reaccin

Velocidad de una reaccin bioqumica;

El cambio de la concentracin de un reactante o producto por
unidad de tiempo

ENZIMAS
CINETICA ENZIMATICA
Orden de la reaccin:

Relaciona la concentracin del reactante, la

saturacin de la enzima con la velocidad de la
reaccin

A.

Cintica de primer orden

Cintica de segundo orden
Cintica de cero orden

B.
C.

ENZIMAS
CINETICA DE PRIMER ORDEN

Cuando la velocidad depende de la

primera potencia de la concentracin
de un nico reactante y sugiere que el
paso limitante de la velocidad es una
reaccin un molecular (no se
requieren colisiones moleculares)
A

La velocidad de la reaccin es
directamente proporcional a la
concentracin del sustrato, solo
cuando la concentracin del sustrato
es baja

La concentracin del reactante es

funcin del tiempo ( t ; se consume
la mitad del reactante)

ENZIMAS
CINETICA DE SEGUNDO ORDEN
o

la velocidad de la reaccin depende de la

concentracin de los dos reactantes
A+B
P
Las molculas A y B deben de chocar
para que se forme el producto (reaccin
biomolecular )
La velocidad de la reaccin depende de
las concentraciones de los dos reactantes

ENZIMAS
CINETICA PSEUDOPRIMER ORDEN
En

ocasiones las reacciones de segundo orden

implican reactantes como el agua, que estn
presentes en exceso

A + H20

Como el agua se encuentra en exceso, la

reaccin parece de primer orden

Las reacciones de hidrlisis

ENZIMAS
CINETICA DE ORDEN CERO

Cuando la adicin de un
reactante no altera la
velocidad de la reaccin

La velocidad es constante
debido a que la concentracin
del reactante es lo
suficientemente elevada para
saturar todos los lugares
catalticos en la molcula de la
enzima

Cuando la concentracin del

sustrato se hace lo
suficientemente elevada de
forma que la enzima se satura

ENZIMAS
CINETICA DE MICHAELIS-MENTEN

Cuando se une el sustrato S en el

lugar activo de una enzima E se
forma un complejo intermediario ( ES)

Durante el estado de transicin, el

sustrato se convierte en el producto

Tras un breve espacio de tiempo , el

producto se disocia de la enzima

Constantes de velocidad:
K1 : constante de velocidad de
formacin de ES
K2 : constante de velocidad de
disociacin ES
K3: constante de velocidad de
la formacin y liberacin del producto
del lugar activo

ENZIMAS
MODELO DE MICHAELIS -MENTEN

K2 es despreciable en comparacin
con K1

La velocidad de formacin de ES es
igual a la velocidad de su degradacin
durante la mayor parte del curso de la
reaccin (suposicin del estado
estacionario)

La velocidad de formacin de ES es
igual a K1 [E] [S]

La velocidad de disociacin de ES es
igual a (K2 + K3)

La suposicin del estado estacionario

iguala estas dos velocidades

ENZIMAS
CONSTANTE DE MICHAELIS Y MENTEN (Km)

Define algunos aspectos del

comportamiento enzimtico
( constante de afinidad)

Se considera una constante

que es caracterstica de la
enzima y del sustrato en
condiciones especificas

Cuando menor es la Km,

mayor es la afinidad de la
enzima por la formacin del
complejo ES

Km =

K2 + K3
K1

ENZIMAS
CONSTANTE Km
Km :indicador de la afinidad de la
enzima por el sustrato
concentracin de sustrato a la que
la enzima tiene la mitad de la
velocidad mxima
Km grande: se necesitara una
concentracin mayor de sustrato
para alcanzar la mitad de la
velocidad mxima
Km pequea: es menor la
cantidad del sustrato para
alcanzar la mitad de la velocidad
mxima de la enzima ( enzima
mas afn a su sustrato)

ENZIMAS
VELOCIDAD MAXIMA DE REACCION
Vmax: punto de la reaccin en
el que no importa con cuanto
sustrato se realice la medicin
de la actividad enzimtico ,
pues la velocidad de la
reaccin no aumenta mas
Vmax ; corresponde al punto
de saturacin de la enzima
Punto de saturacin; todos los
sitios catalticos de las
enzimas estn ocupados y por
lo tanto no pueden interactuar
con mas molculas de sustrato

ENZIMAS
ECUACION DE MICHAELIS-MENTEN
Vmax :

velocidad que
puede alcanzar la
reaccin

V= Vmax [ S ]
[ S ] +Km
Grafica hiperblica

Km : cada enzima
tiene un valor de Km
caracterstico en
condiciones
especificas

ENZIMAS
ECUACION DE MICHAELIS-MENTEN
Condicin;

Cuando [ s ] es mucho menor que

Km ( condiciones fisiolgicas)
El termino Km + [ s] es
esencialmente igual que Km

Vi = Vmax [ S ] = Vmax [ S ]
Km + [ S ]
Km
Vi = ( Vmax)[ S ]
Km
Cuando [ S ] es menor que Km ; la
velocidad inicial de la reaccin es
directamente proporcional a la
concentracin del sustrato

ENZIMAS
ECUACION DE MICHAELIS-MENTEN
condicin;

Cuando [ S] es mucho mayor que Km

El termino Km + [ S] es igual a [ S ]
Al sustituir Km +[ S ] por [ S ]

Vi = Vmax [ S ] = Vi = Vmax [ S ]
Km + [ S ]
[S]
Vi= Vmax
la velocidad de la reaccin es mxima
( Vmax) y es invariable con los incrementos
adicionales con La [ S ]
cuando menor es el valor de Km mayor es
la afinidad de la enzima por La formacin
del complejo ES

ENZIMAS
ECUACION DE MICHALIS- MENTEN
Condicin:
Cuando la [ S ] = Vmax
Vi = Vmax [ S ] = V max [ S ]
Km + [ S ]
2 [S ]
Vi = Vmax
2
la velocidad inicial es igual
a la mitad de la Vmax

ENZIMAS
PROPIEDADES CINETICAS
NUMERO DE RECAMBIO (TRANSFERENCIA))

K cat = Vmax
[ ET ]
Kcat = numero de molculas de sustrato
convertidas en producto por unidad de tiempo
por una molcula enzimtica en condiciones
optimas ( saturada por el sustrato)
[ ET ] = concentracin total de la enzima

ENZIMAS
PROPIEDADES CINETICAS
Vmax = Kcat [ ET ]

NUMERO DE RECAMBIO
EFICACIA CATALITICA

V = Kcat [ET ] [ S]
Km + [ S ]
Cuando la [ S ] es menor que Km : ET = E
V = ( Kcat/ Km) [ E ] [ S ]
( Kcat/ Km ) = constante de velocidad para una reaccin
donde la [ S ] es < que Km ( constante de especificidad)

ENZIMAS
EFICACIA CATALITICA
Perfeccin cataltica:
cuando las enzimas convierten el
difunde en el lugar activo

sustrato en producto cada vez que el sustrato

Complejos multienzimaticos ;
organizacin de las enzimas en los seres vivos para alcanzar este grado elevado de
eficacia
Actividad enzimtica:
se mide en unidades internacionales ( UI)
1 UI la cantidad de la enzima que produce 1 micromol de producto por minuto
Actividad especifica de una enzima : numero de UI por mg de protena
1 Katal ( Kat ) ; cantidad de enzima que transforma 1 mol de sustrato por segundo
( 6 por 10 a la 7 UI )

ENZIMAS
REPRESENTACIONES DOBLES INVERSAS DE
LINEWEAVER-BURK

La ecuacin de Michaelis Menten

puede ordenarse obteniendo su
inversa o reciproca
1 = Km
1 + 1
V Vmax [ S ] Vmax

Inversa de las velocidades

iniciales frente a las inversa de
las concentraciones del sustrato
Grafica de lnea recta
La pendiente de la lnea es
Km/Vmax
La interseccin en el eje vertical
es 1 / Vmax
La interseccin en el eje horizontal
es 1 / Km

ENZIMAS
ECUACION DE HILL
COMPORTAMIENTO COOPERATIVO

Enzimas multimericas; se
unen al sustrato en varios
sitios.

Cooperatividad positiva en la
unin del sustrato

La forma de la curva es una

recta
La grafica determina la
concentracin de sustrato que
produce la mitad de la
velocidad mxima y el grado
de cooperatividad