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ENZIMAS

Son biomolculas cuya funcin es


aumentar la velocidad de las reacciones
bioqumicas, actan por lo tanto como
catalizadores biolgicos.

Cul es su naturaleza qumica?

La gran mayora de las enzimas son protenas.

Sin embargo existen algunos ARN que pueden actuar como enzimas
(ribozimas)

Cul es la estructura de una protena?

Las protenas son macromolculas, polmeros de aminocidos

Analizando estas palabras


Makrs: grande
Polymers: compuesto de varias partes

Son cadenas simples, no ramificadas, de aminocidos unidos unos a otros.

Cul es la estructura de un
aminocido?

Todos los aminocidos estn formados por un grupo amino y un grupo


carboxilo.

Amino

Carboxilo

Cmo actan las enzimas?

Las enzimas son catalizadores y como tales aumentan la


velocidad de la reaccin qumica, sin modificar su
resultado.

No modifican la energa de los reactivos ni de los


productos pero s disminuyen la energa de activacin,
una especie de barrera energtica que deben pasar los
reactivos para convertirse en productos.

Una misma enzima cataliza las


distintas reacciones?

No, las enzimas son especficas, cada una cataliza una determinada
reaccin.

La alta especificidad se debe a que su estructura terciaria le permite


formar cavidades llamadas sitios activos, lugar donde se ubica el
sustrato durante el proceso de catlisis.

La enzima se une especficamente a


las molculas denominadas sustratos,
formando un complejo enzimasustrato y favoreciendo su
transformacin en productos

sustrato

Complejo
enzima-sustrato

productos

Una Reaccin
Enzimtica:

La velocidad de una reaccin


catalizada por una enzima es
siempre la misma?
No, depende de muchos factores entre los que se cuentan:

Concentracin del sustrato

Temperatura

pH

Concentracin de sustrato

A mayor concentracin de sustrato es mayor la velocidad.

Pero no aumenta indefinidamente, cuando no hay ms enzima para unirse


al sustrato se alcanza la velocidad mxima

pH

Cada enzima tiene un pH ptimo en el cual la actividad enzimtica es


mxima

Temperatura

Cada enzima tiene una temperatura ptima en la cual


su actividad es mxima

De modo que

si variamos el pH o la temperatura, la velocidad de la reaccin catalizada


por una enzima tambin vara.

Los valores de pH y temperatura ptima son aquellos a los cuales se


alcanza la mxima actividad enzimtica o la mayor velocidad de reaccin

Desnaturalizacin de una Protena


Estado Nativo

Estado Desnaturalizado

Se llama desnaturalizacin de las protenas a la prdida de las


estructuras de orden superior (secundaria, terciaria y
cuaternaria), quedando la cadena polipeptdica reducida a un
polmero estadstico sin ninguna estructura tridimensional fija

Desnaturalizacin de
la ribonucleasa. En
general, la
desnaturalizacin fuerte
produce una destruccin
permanente de la
molcula
Agentes desnaturalizantes: Se
distinguen agentes fsicos (calor) y
qumicos (detergentes, disolventes
orgnicos, pH, fuerza inica).

Cofactores Enzimticos
Cofactor (Coenzima): tomo, ion o molcula que participa en el
proceso cataltico sin ser enzima ni substrato.
Los cofactores participan de dos maneras distintas:
1. A travs de una fijacin muy fuerte a la protena y salen
sin ser modificados del ciclo cataltico
2. Como un segundo substrato; salen modificados del ciclo
cataltico y por lo general requieren otra enzima para volver
al estado original.

Aminocido

LAO

R CH COO- + O2 + H2O

Cetocido
R CO COO- + H2O2 + NH4+

NH3+

LAO: L-aminocido oxidasa: es una flavoprotena


Las flavoprotenas tienen un grupo prosttico flavnico,
que interviene en el proceso cataltico sin salir modificado
del mismo
O
H3C

H3C

NH

NH
N

Los cofactores enzimticos suelen ser molculas complejas,


que nuestro organismo no puede sintetizar, por lo general.
Por esa razn muchos cofactores enzimticos deben ser, en
todo en parte, ingresados con la dieta; muchos de ellos son, por
lo tanto, vitaminas.
Ni todos los cofactores son vitamnicos ni todas las vitaminas
son cofactores enzimticos

Cofactores de naturaleza vitamnica; ejemplos


1. Hidrosolubles
Tiamina
Tiamina pirofosfato
B1
Riboflavina
Flavinas: FAD, FMN
B2
Piridoxal
Piridoxal fosfato
B6
Cobalamina
Coenzimas cobamdicos
B12
c.Ascrbico
Ac. Ascrbico
C
Nicotinamida
NAD+, NADP+
PP
c.Lipoico
Lipoamida
c.Flico
Coenzimas folnicos
c.Pantotnico Pantetenas (CoA, p.e.)
2. Liposolubles
Naftoquinonas

-Carboxilacin

Cofactores de naturaleza no vitamnica: ejemplos


Hemo
Hemoenzimas, citocromos
Complejos Fe-S Ferredoxinas
Quinonas
Tr.electrnico mitocondrial y fotosinttico
Glutatin
Redox; transporte de aminocidos
ATP
Transf.de fosfato y/o de energa
UTP
Transf.de grupos glicosdicos
PAPS
Transf.de grupos sulfato
S-AM
Transf.de grupos metilo
Carnitina
Transportador de grupos acil-

Vitaminas que no forman parte de cofactores enzimticos


Liposolubles
Retinoides
Calciferoles
Tocoferoles

vit. A
vit. D
vit. E

Teoras de la Accin
Enzimtica
Modelo de Llave y Cerradura (Emil Fischer)
Substrato y enzima se acoplan de
forma estereospecfica,
de la misma manera que una
llave se ajusta a su cerradura.
Modelo aceptado durante mucho
tiempo; hoy se considera
insuficiente al no explicar
algunos fenmenos de la inhibicin enzimtica.

Modelo de Ajuste Inducido (Koshland)


Tanto la enzima como el
substrato sufren una
alteracin en su estructura
por el hecho fsico de la
unin.
Est mucho ms de
acuerdo con todos los
datos experimentales
conocidos hasta el
momento.

La teora del Ajuste Inducido se ampla en la actualidad


definiendo la accin enzimtica como
Estabilizacin del Estado de Transicin

Segn lo cual, el Centro Activo enzimtico es en realidad


complementario no al substrato o al producto, sino al
estado de transicin entre ambos.

O
R C O R'

OR C O R'
O-

Substrato: un ster

Estado de transicin:
intermediario tetradrico,
inestable

O
-

R C O

HO R'

Productos

Clasificacin y
Nomenclatura de
Enzimas

Nombre sistemtico:

Grupo transferido

ATP: hexosa fosfotransferasa


Donador

Aceptor
Grupo Subgrupo

Nmero sistemtico
Enzyme
Comission

EC 2.7.1.1

Nombre comn: Hexokinasa

Sub-subgrupo

Enzima

Clasificacin de enzimas: Grupos

1. Oxidorreductasas
2. Transferasas

grupos aldehidos
gupos acilos
grupos glucosilos
grupos fosfatos (kinasas)

3. Hidrolasas
Transforman polmeros en monmeros.
Actuan sobre:
enlace ster
enlace glucosdico
enlace peptdico
enlace C-N

4. Liasas
(Adicin a los dobles
enlaces)
Entre C y C
Entre C y O
Entre C y N

5. Isomerasas
(Reacciones de
isomerizacin)

6. Ligasas
(Formacin de enlaces, con
aporte de ATP)
Entre C y O
Entre C y S

Inhibicin Enzimtica
Inhibidor:
Efector que hace disminuir la actividad enzimtica, a travs de
interacciones con el centro activo u otros centros especficos
(alostricos).
Esta definicin excluye todos aquellos agentes que inactivan a
la enzima a travs de desnaturalizacin de la molcula enzimtica

De esta forma, habr dos tipos de inhibidores:


I.

Isostricos: ejercen su accin sobre el centro activo

II. Alostricos: ejercen su accin sobre otra parte de la molcula,


causando un cambio conformacional con repercusin negativa en la
actividad enzimtica.
Activador alostrico:
favorece la unin del
sustrato

Inhibidor alostrico:
impide la unin del
sustrato

Los inhibidores isostricos pueden ser de dos tipos:

1. Inhibidor reversible: establece un equilibrio con la enzima libre,


con el complejo enzima-substrato o con ambos:
E+I

EI

ES + I

ESI

2. Inhibidor irreversible: modifica qumicamente a la enzima:


E+I

Inhibicin reversible
(a) El inhibidor se fija al centro activo
de la enzima libre, impidiendo la
fijacin del substrato: Inhibicin
Competitiva
(b) El inhibidor se fija a la enzima
independientemente de que lo
haga o no el substrato; el inhibidor,
por tanto, no impide la fijacin del
substrato a la enzima, pero s impide
la accin cataltica: Inhibicin No
Competitiva
(c) El inhibidor se fija nicamente al complejo enzima-substrato
una vez formado, impidiendo la accin cataltica; este tipo
se
conoce como Inhibicin Anticompetitiva

S
E
I

ES

E+P

Inhibicin
Competitiva

EI
Las fijaciones de substrato e inhibidor son
mutuamente exclusivas; el complejo EI no es productivo

S
E

ES

Inhibicin
No Competitiva

S
EI
El inhibidor se fija
indistintamente a la enzima
libre E y al complejo
enzima-substrato ES; ni el
complejo EI ni el complejo
ESI son productivos

E+P

ESI

S
E

ES

E+P

I
ESI

Inhibicin
Anticompetitiva

El inhibidor slo puede


fijarse al complejo ES;
el complejo ESI no es
productivo

Inhibicin Competitiva

S
E

ES

E+P

I
EI

Se define una constante de


equilibrio de disociacin del
inhibidor:

[E] [I]
Ki =
[EI]

Caractersticas:
- Las fijaciones de substrato e inhibidor son mutuamente exclusivas
- A muy altas concentraciones de substrato desaparece la inhibicin
- Por lo general, el inhibidor competitivo es un anlogo qumico del
substrato.
- El inhibidor es tan especfico como el substrato

O
H 2N

C
O-

H2 N

NH2

4-aminobenzoato
4-aminobenceno
sulfonamida

H2N

N
N

N
N

H
N

CO OH

OH

CH2

c. Flico

CH2
C NH C H
O
H2N

N
N

N
N

COOn

CH3
N

CO OH
CH2

Methotrexate

CH2
C NH C H
O

COOn

O
CH3

HN
O

Anlogos de base

NH

Timina

O
Br

HN
O

NH

5-Bromouracilo

NH2
O
HOCH2

Citidina
OH

OH

NH2
O
HOCH2

N
OH

OH

Citosina
arabinsido

Anlogos de
nuclesido

Inhibicin Irreversible
- Los inhibidores irreversibles reaccionan con un grupo
qumico de la enzima, modificndola covalentemente
- Su accin no se describe por una constante de equilibrio Ki,
sino por una constante de velocidad ki:

E+I

- A diferencia de la inhibicin reversible, el efecto de los


inhibidores irreversibles depende del tiempo de actuacin
del inhibidor.
- Los inhibidores irreversibles son, por lo general, altamente
txicos.

Algunos tipos de inhibidores irreversibles

1. Reactivos de grupos -SH


2. Organofosfricos
3. Ligandos de metales
4. Metales pesados

Regulacin de la Actividad
Enzimtica

Regulacin alostrica
Procesos a nivel celular; regulacin de ajuste fino
de la actividad enzimtica, a travs de efectos de
retroalimentacin (negativa o positiva)

Regulacin por modificacin covalente


Procesos a nivel supracelular (orgnico); regulacin
a gran escala de actividades enzimticas, a travs de
modificacin covalente de enzimas, provocadas por
seales (transduccin de seales)

Regulacin alostrica
Retroalimentacin negativa en vas metablicas, 1
Sntesis de Isoleucina
Thr

Treonina
desaminasa

-cetobutirato

Ile

El producto final de la ruta, Isoleucina, inhibe a la primera


enzima de la misma, Treonina desaminasa

Regulacin por modificacin covalente


Suele haber fenmenos de modificacin covalente de
enzimas en la respuesta celular a seales qumicas:
1. Neurotransmisores
2. Hormonas
3. Factores de crecimiento
4. Estmulos morfogenticos y de diferenciacin
5. Muerte celular programada (apoptosis)
6. Estmulos antignicos
7. Luz y otros agentes fsico-qumicos

EFECTO DE LA MODIFICACIN COVALENTE


SOBRE LA ACTIVIDAD ENZIMTICA
Elementos de la reaccin

La Enzima no
La enzima fosforilada
fosforilada es inactiva
es activa

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