AMINOACIDO, PEPTIDOS Y PROTENAS

Las protenas son polmeros formados por monmeros

llamados aminocidos.
Hay 20 aminocidos en la naturaleza, que se combinan
para formar miles de protenas (muchos grupos
funcionales: alcoholes, tioles, carboxiamidas, etc.)
Son las macromolculas ms verstiles de los seres
vivos.
 ESTRUCTURA DE LOS -AMINOCIDOS

C(central) R
Grupo amino
Grupo carboxilo CH
tomo de Hidrgeno
Cadena lateral R NH2 COOH
AMINOCIDOS
PRESENTES
EN LAS
PROTENAS

Bioqumica Mathews,
van Holde y Ahern
Addison Wesley 2002
 AMINOCIDOS ALIFTICOS

El ms pequeo
Flexibilidad estr. Hidrofobicidad
(interior de prot.)

Dificulta el plegamiento

Bioqumica Mathews, van Holde y Ahern Addison Wesley 2002

 AMINOCIDOS AROMTICOS

Ligeramente hidrfobos
Hidrfobo Interacciones hidrofbicas
Puentes de Hidrgeno
Actividad Enzimtica
Absorben la luz en el UV (280 nm)
Bioqumica Mathews, van Holde y Ahern Addison Wesley 2002
 AMINOCIDOS CON OH O S

Cadenas dbilmente polares (algo hidrfilos)

Pueden formar puentes de H con el agua
Dos cys pueden formar un puente o enlace disulfuro

Bioqumica Mathews, van Holde y Ahern Addison Wesley 2002

 AMINOCIDOS BSICOS

El menos bsico Carga + a pH fisiolgico

Cat. Enzimt. (H+)
Bioqumica Mathews, van Holde
Muy polares, en la superficie de protenas y Ahern Addison Wesley 2002
 AMINOCIDOS CIDOS Y SUS AMIDAS

Carga - a pH fisiolgico Polares, cadena lateral sin carga

Hidrfilos, en la superficie de protenas

Bioqumica Mathews, van Holde y Ahern Addison Wesley 2002

 Aminocidos Esenciales y no Esenciales

Esenciales No esenciales
Valina Glicina
Leucina Alanina
Isoleusina Serina
Treonina Cisteina
Metionina Tirosina
Fenilalanina cido Aspartico
Triptofano cido Glutamico
Arginina * Asparragina
Lisina ** Glutamina
Histidina * Prolina

* Esencial para los jovenes y todos los

animales en crecimiento
** Esencial para los adultos
Ciclo del Nitrgeno
 Ciclo del nitrgeno

+ reducido Fijacin
Amonificacin
de N2
Nitrgeno Amonio
orgnico N2
Nitrgeno
Nitrificacin molecular
por bacterias
N2 O

NO
Nitrito
Nitrificacin NO2 Desnitrificacin por
por bacterias bacterias en ausencia de
oxgeno
Nitrato
+ oxidado NO3-
 ORGANISMOS FIJADORES DE NITRGENO

- Cianobacterias o algas verdeazules

- Bacterias libres del suelo

- Bacterias asociadas a races de plantas leguminosas

Actinomicetes, hongos asociados con races de rboles

maderables
 Aminocidos

Animales
Plantas N2 Superiores
Superiores Nitrgeno atmosfrico

Nitrato Bacterias Amonaco, urea

NO -
3 fijadoras de
Nitrgeno NH3

Bacterias
Bacterias
nitrificantes
nitrificantes
(Nitrobacter)
(Nitrosomonas)

Nitrito
Ciclo del Nitrgeno NO-2 L.G.H.M.
 Aminocidos como precursor de
compuestos nitrogenados

Protenas Dietticas

Sntesis de aminocidos
Protenas corporales
no esenciales

Reserva de Aminocidos
 Sntesis de molculas nitrogenadas de
importancia
Porfirinas (compuesto cclico que atraen iones
metlicos) forma el grupo Hem que se encuentra en:
Hb, Mioglobina, Citocromos y la
Catalasa
Creatina (gli y arg)
Purina y Pirimidina (cidos nucleicos)
Agentes Neurotransmisores, como:
Dopamina, Norepinefrina, Adrenalina,
Serotonina
Melamina
ESTEREOQUMICA DE LOS AMINOCIDOS

Los aminociods son

estructuras tetradricas

Bioqumica Stryer, Berg y

ISMEROS Tymoczko Ed. Revert, S.A. 2003
La estructura tridimensional es de crucial importancia para la
funcin
Representacin:

a) Tridimensional

b) En perspectiva

Bioqumica Mathews, van Holde y Ahern Addison Wesley 2002

 CADENAS LATERALES DE LOS AA

ALIFTICOS (Gli, Ala, Val, Leu, Ileu, Pro)

AROMTICOS (Phe, Tyr, Trp)

GRUPOS OH, S (Ser, Treo, Cys, Met)

BSICOS (His, Arg, Lys)

CIDOS Y SUS AMIDAS (Asp, Glu, Apn, Gln)

AA RAROS AA NO PROTEICOS
4-hidroxiprolina Ac. -aminobutrico
-hidroxilisina D-Ala, D-Glu
 AA MODIFICADOS AA NO PROTEICOS
D-Ala, D-Glu
OH
+
H3N-CH2-CH2-CH2-COO-
Ac. -aminobutrico

OH

4-OH prolina ( )2

L-Homoserina

-hidroxilisina

Bioqumica Mathews, van L-Ornitina

Holde y Ahern. Addison Wesley
MODIFICACIONES DE LAS CADENAS LATERALES DE AA

Fosforilacin
Carboxilacin
Hidroxilacin
Metilacin
Acetilacin

(Voet)
Algunos aminocidos modificados postraduccionalmente
AMINOCIDOS QUE NO ESTN EN PROTENAS
PROPIEDADES INICAS DE LOS AA
(comportamiento cido-base)

CURVAS DE TITULACIN

PUNTO ISOELCTRICO
CURVAS DE TITULACIN
Gli
Curva de titulacin del Glu
Curva de titulacin de la His
Los procesos bioqumicos se producen in vivo, en
el margen de pH fisiolgico prximo a 7

pKa de los grupos carboxilo 2 (a pH 7 ha

perdido el protn)

pKa de los grupos amino 10 (a pH 7 est

protonado)
Bioqumica Stryer, Berg y Tymoczko Ed. Revert, S.A. 2003
SEPARACIN Y PURIFICACIN DE AMINOACIDOS Y
PROTENAS

Se basa en la diferente:

Solubilidad

Tamao

Carga elctrica

Densidad

Afinidad por otras molculas

 SEPARACIN DE PROTENAS

CROMATOGRAFA EN COLUMNA
Las diferentes protenas se retrasan segn sus interacciones con la
matriz, de acuerdo a su carga, hidrofobicidad, tamao o unin a
grupos qumicos El solvente se aplica
Muestra contnuamente a la
aplicada boca de la columna

Matriz
slida

Tapn Molculas fraccionadas

poroso eludas y recogidas

Tubo de
ensayo
tiempo
http://www.accessexcellence.org/AB/GG/cellBreak1.html
TRES CLASES DE CROMATOGRAFA EN COLUMNA
A) Intercambio inico: B) Filtracin en gel: C) de Afinidad:
en base a la carga en base al tamao
Depende del pH y
de la fuerza inica

Flujo de solvente Flujo de solvente Flujo de solvente

Partcula cargada Partcula con
positivamente sustrato unido
Partculas porosas covalentemente

Molcula cargada Molcula de

negativamente Molcula pequea enzima unida
unida retrasada
Molcula cargada Molcula grande Otras protenas
positivamente no retrasada pasan de largo
libre

http://www.accessexcellence.org/AB/GG/cellBreak1.html
 A: CROMATOGRAFA DE INTERCAMBIO INICO
(Ej: intercambio catinico)
Las protenas se separan segn
su carga a un pH determinado
B: CROMATOGRAFA DE FILTRACIN O EXCLUSIN
MOLECULAR

Las protenas se separan

segn su tamao
ELECTROFORESIS EN ACETATO DE CELULOSA
 ELECTROFORESIS EN GEL
Electroforesis en SDS-PAGE
ELECTROFORESIS EN GEL:
Tras aplicar un campo elctrico las
protenas migran en funcin del
tamao y de la carga

(solubiliza
protenas)

http://www.accessexcellence.org/AB/GG/cellBreak1.html
Determinacin de la masa molecular de una
protena por la tcnica del SDS-PAGE
 PPTIDOS Y ENLACE PEPTDICO

Los pptidos se forman por la unin de los aminocidos

mediante enlaces covalentes de tipo amida llamados
enlaces peptdicos

OLIGOPPTIDOS (<20 aa)

POLIPPTIDOS (20-50 aa)

PROTENAS (>50 aa)

 ESTRUCTURA DEL ENLACE PEPTDICO

El enlace peptdico tiene algunas propiedades muy

importantes para la estructura de las protenas

Ms rgido y corto que un enlace C-N simple

Los tomos que participan (O, C, N, H) son coplanares
El grupo de tomos alrededor del enlace peptdico puede
darse en dos configuraciones posibles: trans y cis
Carcter parcial de doble enlace:
Se le puede considerar un hbrido de resonancia
No se permite giro alrededor del enlace -C-N-
Carcter parcial de doble enlace

tomos coplanares

Carcter parcial de doble enlace

Bioqumica Mathews, van
Holde y Ahern. Addison Wesley
TETRAPPTIDO
 Enlaces peptdico
LIBRE ROTACION EN TORNO AL CARBONO
 HIDRLISIS DE LOS ENLACES PEPTDICOS

Calentando a ebullicin (110C) en medio cido (HCl 6M) o

base fuerte

Hidrlisis especfica
Qumica: BrC=N (-Met-CO-)

Enzimtica (Proteasas):
Tripsina (-Arg -CO-, -Lys-CO-)
Quimotripsina (-aa hidrfobos-CO-)
Carboxipeptidasa A (libera el aa C-terminal)

Todas estas enzimas son muy tiles en investigacin

bioqumica para la fragmentacin controlada de
polipptidos
 PPTIDOS CON ACTIVIDAD BIOLGICA

HORMONAS: Insulina y glucagn (metab. de la glucosa)

ANTIBITICOS: Gramicidina S

VENENOS: -amanitina

NEUROPPTIDOS: Encefalinas

ANTIOXIDANTE: Glutation (-glutamil-cisteinil-glicina)

INSULINA L-Leu D-Phe

L-Orn L-Pro

L-Pro L-Val

D-Phe L-Orn
L-Leu
Gramicidina S
Tyr-Gly-Gly-Phe-Met Met-encefalina

Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu Leu-encefalina
GLUTATION
 Pptidos No Proteicos

Carnosina, - alanilhistidina y Anserina,

- alanil-N-metilhistidina
Dipptido presentes en los tejidos
musculares de los vertebrados.Participan
en el amortiguamiento del pH en las
clulas musculares.
 Glutatin, gama-glutamilcisteinilglicina
Presente en todos los organismos. Es el
pptido simple ms abundante en los sistemas
biolgicos. Funciones:
Esencial en el hombre para la activacin de varias
enzimas y de la insulina.

Ayuda a mantener la integridad y funcionalidad de

los eritrocitos.

Participa en el transporte de AA a travs de las

membranas celulares.

Participa en el mantenimiento del estado de

oxidacin del Fe en la Hg.
Acta como un agente antioxidante.
Gramicidina S
Penicilina benclica
Aspartame
Dipptido sinttico con propiedades Edulcorante
 Pptidos Proteicos
Bradicina (nonapptido) y Calidina (decapptido)
Agentes hipotensores liberados de protenas plasmticas
especficas y actan sobre el msculo liso.

Oxitocina y Vasopresina (dos nonapptidos cclicos)

Secretados como hormonas por la pituitaria.
La Oxitocina estimula la contraccin del msculo uterino en las
mujeres embarazadas y la contraccin de los msculos lisos de
las glndulas mamarias.
La Vasopresina estimula la constricin de los vasos sanguneos,
aumenta la presin sangunea, y tiene un efecto antidiurtico al
estimular la reabsorcin de agua en los riones. Se le conoce
como la Hormona antidiurtica.
 Angiotesina I un decapptido que se deriva del extremo N
terminal de una -globulina especfica del plasma producida
en el hgado y conocida como el sustrato de la renina. La
renina es una enzima protoeltica producida en el rion y
secretada al plasma.
Angiotesina II un octapptido con una mayor actividad
vasopresora.
Ambos pptidos elevan la presin sangunea por su potente
actividad vasoconstrictora.

-globulina plasmtica
Renina
Angiotesina I (decapptido)
Enzima Convertidora
Angiotesina II (octapptido)
Pptidos Neurotransmisores u opiceos tienen efectos
analgsicos que mimetiza el efecto de la morfina y
otros derivados del opio.
Leu-encefalina y Met-encefalina pentapptidos
Dinorfinas con 13 residuos de AA
Endorfinas (, y )
La secuencia de AA de las tres endorfinas y de la
met-encefalina estn presentes en la regin del
extremo C terminal, del residuo 61 al 91, de la
-Lipotropina, una hormona que estimula la
liberacin de cidos grasos del tejido adiposo.
 CLASIFICACIN DE LAS PROTENAS
Se basa en cuatro criterios:
Qumico (composicin)
Simples
Conjugadas
(holoprotena = apoprotena + grupo prosttico)
- Glico-, lipo-, nucleoprotenas
- metalo-, hemo-, flavo-protenas
Estructural (forma)
Globulares
Fibrosas
Funcin
Fsico (solubilidad)
 CLASIFICACIN EN BASE A LA FUNCIN
BIOLGICA
Protena catalticas: Enzimas
Protenas almacenadoras: Casena, reserva AA, Ca y P.
Ovoalbmina, reserva AA para el embrin. Ferritina,
almacena Fe en el bazo y el hgado.
Protenas de transporte: Hb, transporta O2.
Sueroalbmina, transporta cidos grasos.
Protenas contrctiles: Miosina y Actina que participan en
la contraccin muscular.
Protenas de defensa: Anticuerpos, Interferones.
Protena reguladoras: Insulina, Somatotropina, la hormona
del crecimiento.
 Protenas estructurales: -Queratina presente en la
piel, cabello, uas, plumas, etc. Colgeno presente en
tendones, tejidos conectivos, cartlagos y matriz sea.
Elastina presente en tejidos conjuntivos.
Protenas respiratorias o de transferencia de
electrones. Citocromos que forman parte de la cadena
de transporte electrnico.
Protenas de la visin: Rodopsina sensible a la luz y
participa en los fenmenos moleculares asociados con
el proceso de la visn.
Protena txicas o toxinas:
 Clases de protenas en funcin de su
estructura

FIBROSAS:
Forman largos filamentos u hojas
Poseen un solo tipo de estructura
secundaria (laminar helicoidal)

GLOBULARES:
Se pliegan en forma esfrica o globular
Poseen varios tipos de estructura secundaria
Suelen presentar otro tipo de estructura
secundaria (codos o giros )
 PROTENAS FIBROSAS
Tienen forma filamentosa o alargada

Su funcin es estructural:
Mantienen unidos diferentes elementos
celulares o de tejidos animales.
Son las principales protenas de la piel, tejido
conjuntivo, y de las fibras animales (pelo,
seda)

Confieren fuerza y/o elasticidad

Son insolubles en agua (predominan aa hidrfobos)

LAS PROTENAS POSEEN 4 NIVELES DE ORGANIZACIN
ESTRUCTURAL:

PRIMARIA: Secuencia de aminocidos. Enlaces covalentes

(enlaces peptdicos y localizacin de puentes disulfuro)

SECUNDARIA: Plegado local (no incluye cadenas laterales)

TERCIARIA: Plegado global

CUATERNARIA: Asociacin de cadenas

2 NIVELES ESTRUCTURALES ADICIONALES:

ESTRUCTURA SUPERSECUNDARIA

DOMINIO
 ESTUDIO DE LA SECUENCIA PEPTDICA

No todas las protenas contienen los 20AA naturales. La

Ribonucleas no contiene Trp, el Colgeno carece de varios AA.
Algunos AA estn presentes en las protenas con menor
frecuencia que otros, caso del Trp, His y Met.
En la mayora de las protenas del 30 al 40% de los residuos
son AA con grupos R no polares. Las protenas de membrana
tienen un contenido aun mayor de AA no polares.
Las protenas bsicas, Histonas, tienen carga + a pH 7,
mientras que las protenas cidas, Pepsina, tienen carga a pH 7.
Las protenas animales son de mayor valor nutritivo, tienen
proporciones adecuadas de los AA esenciales.
 ESTUDIO DE LA SECUENCIA PEPTDICA

Las protenas son polipptidos con una secuencia

nica de aminocidos definida genticamente

Los enlaces covalentes que se encuentran entre los

residuos de AA son enlaces peptdico y puentes de
disulfuro.

La estructura primaria determina los otros niveles

estructurales y la funcin biolgica de las protenas.

La secuencia de una protena es similar entre especies

pero no es idntica
Variacin en la Secuencia de aminocidos en una
protena
 LA INFORMACIN QUE CONTIENE LA SECUENCIA DE
AMINOCIDOS DICTA EL MODO EN QUE LA PROTENA SE
PLIEGA EN SU ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL, LA CUAL A
SU VEZ DETERMINA LA FUNCIN DE LA PROTENA

CONFORMACIN PROTEICA:
DISPOSICIN ESPACIAL DE LOS TOMOS DE UNA
PROTENA

La cadena de aminocidos se encuentra parcialmente

enrollada en regiones de estructura regular. A este
plegado regular local se denomina ESTRUCTURA
SECUNDARIA

Estas regiones se pliegan a su vez formando una

estructura compacta especfica. Este nivel superior de
plegado es la ESTRUCTURA TERCIARIA
 ESTRUCTURAS SECUNDARIAS REGULARES

Diferentes tipos de
hlices (Hlice )
Fi () C-N = - 57
Psi () C-C = - 47

Dos tipos de lmina

plegada (Lmina )
Fi () C-N = - 119, -139
Psi () C-C = 113, 135

Bioqumica Mathews, van Holde y Ahern.

Addison Wesley 2002
 DISPOSICIN EN HLICE-
El esqueleto
polipeptdico se
encuentra enrollado
alrededor del eje
longitudinal de la
molcula

Los grupos R de
los aminocidos
sobresalen hacia
el exterior
Bioqumica Stryer, Berg y
Tymoczko Ed. Revert, S.A. 2003
Es dextrgira
Tiene 3,6 residuos/vuelta
Tiene 1,5 Amstrong (0,15 nm) entre vuelta y vuelta
 ESTABILIZACIN DE LA HLICE-
Enlaces de hidrgeno paralelos al eje: entre el O
del carbonilo (C=O) y el H de la amida (NH) del 4
residuo hacia adelante de la hlice

Interacciones entre cadenas laterales

Estabilizan:
Q+ prximas (3 residuos) a Q-
Aminocidos aromticos prximos (3-4)
Aminocidos pequeos sin carga (Ala, Leu)
Desestabilizan:
Grupos R voluminosos
Secuencias con densidad de carga del mismo
signo
Prolina (es rara)
DISPOSICIN EN LMINA PLEGADA U HOJA
El esqueleto de la cadena polipeptdica se
encuentra extendido y dispuesto en zig-zag
FUERZAS QUE LA ESTABILIZAN

Puentes de hidrgeno intercatenarios entre

cadenas distintas o regiones alejadas de una
misma cadena que se pliega

Se establecen de forma perpendicular al eje de

la cadena
Las cadenas implicadas forman una hoja o
plano plegado como un acorden
Los grupos R de los aminocidos sobresalen
Bioqumica Mathews, van
de la estructura en direcciones opuestas,
Holde y Ahern. Addison
Wesley 2002 alternando arriba y abajo
 AMINOCIDOS QUE FAVORECEN LAS
ESTRUCTURAS

Secuencias con restos poco voluminosos

(Gly, Ala)

TIPOS DE LMINA

PARALELAS: las cadenas estn en el mismo sentido

ANTIPARALELAS: las cadenas estn en sentido inverso

 2. COLGENO
Principal constituyente del tejido conjuntivo
Principal protena estructural del reino animal (presente
en tendones, cartlagos, matriz orgnica de los huesos y
crnea del ojo)
Forma aprox. un 30% de la protena total del cuerpo
Poco valor alimenticio
ESTRUCTURA:
Tiene 3,3 residuos/vuelta (muy extendida):
Gly 33%
Ala 11%
Pro e Hyp 21%
Hidroxi-Lys en menor proporcin (lugar de unin a
polisacridos)
Fragmentos comunes: Gly-Pro-Hyp Gly-X-Pro Gly-X-Hyp
Hlice simple y nica
Es levgira
 ESTRUCTURA DE LAS FIBRAS DE COLGENO
Tropocolgeno
ESTABILIZADA POR:

Puentes de H
intercatenares

Repulsiones entre
Pro e OH-Pro

Enlaces cruzados
(Lys-OHLys)(Lys-Lys)
Dan dureza

Bioqumica Mathews, van Holde y Ahern. Addison Wesley 2002

 Estructuras secundarias y propiedades de protenas
fibrosas

Estructura Caractersticas Ejemplos de ocurrencia

hlice, entrecruzada Rgido, estructuras queratina del pelo,

plumas
por puentes disulfuro protectoras insolubles uas
de dureza y flexibilidad
variables

Conformacin Filamentos suaves y Fibrona de la seda

flexibles

Colgeno hlice Resistencia a la alta Colgeno de los tendones,

triple tensin, sin estiramiento matriz de los huesos.
Las protenas fibrosas son insolubles en agua.
 ESTRUCTURA TERCIARIA: PROTENAS GLOBULARES

Las protenas globulares realizan la mayora del trabajo

qumico de la clula (sntesis, transporte, metablico, etc.)

Gracias a la tcnica de difraccin de rayos X se conocen

muchos detalles estructurales de estas protenas:

Poseen regiones con estructuras secundarias

(hlice , lmina ) (mioglobina 70% de hlice )

Estas regiones se pliegan unas sobre otras dando

una estructura terciaria densamente empaquetada
de aspecto globular

Pueden quedar huecos internos en donde se sitan

grupos prostticos (Ej. Grupo hemo en la mioglobina)
 ESTRUCTURA TERCIARIA
Se debe a la formacin de enlaces dbiles entre grupos de
las cadenas laterales de los aminocidos
ESTRUCTURAS CARACTERSTICAS DE LAS PROTENAS
GLOBULARES
PLEGAMIENTO O ENSAMBLAMIENTO
DE PROTENAS

Una protena recin sintetizada posee solamente

su estructura primaria. Para que sea plenamente
funcional ha de plegarse correctamente en una
forma tridimensional nica.
1. Autoensamblamiento
La protena se pliega sin ninguna otra ayuda

2. Ensamblamiento dirigido
La protena se pliega gracias a la accin de
otras protenas
 FACTORES QUE DETERMINAN EL PLEGADO DE LAS
PROTENAS GLOBULARES

La secuencia de aminocidos de una protena determina

su estructura tridimensional nativa o natural

El plegado de una protena est favorecido

energticamente en condiciones fisiolgicas (G<0)

Una protena tiende a plegarse de modo cooperativo,

mediante interacciones que se forman o rompen de
manera concertada

In vivo, el plegado ocurre a veces con ayuda de otras

protenas denominadas chaperoninas:
Ayudan a plegarse
Impiden que se plieguen o asocien prematuramente
Los defectos en el plegamiento de protenas pueden ser fatales.

Ej: La enfermedad de los priones (Enfermedad de las vacas locas en

bovinos y Creutzfeldt-Jakob en humanos). En general, se trata de
encefalopatas enpongiformes.

Son causadas por la protena prion.

 FUNCIN Y EVOLUCIN DE LAS PROTENAS:
MIOGLOBINA Y GRUPO HEMO
MIOGLOBINA: protena que almacena oxgeno en el
msculo rojo en prcticamente todas las especies
ESTRUCTURA:
Posee una cadena polipeptdica nica
Contiene 8 segmentos con estructura secundaria de
hlice (nombrados de la A a la H), separados por
segmentos no helicoidales.
Se pliega dando una molcula prcticamente esfrica
muy compacta con un hueco en el interior donde se sita
el grupo prosttico hemo, lugar de unin al oxgeno
El hemo se une de forma no covalente en la hendidura
hidrofbica o bolsillo hemo.
COORDINACIN DEL HIERRO EN LA OXIMIOGLOBINA
Coordinacin octadrica Bolsillo del hemo
del tomo de hierro

Bioqumica Mathews,
van Holde y Ahern.
Addison Wesley 2002
DESNATURALIZACIN DE LAS PROTENAS GLOBULARES

Determinados cambios ambientales producen la

desnaturalizacin desplegado de la protena, con prdida
de sus propiedades especficas.

FACTORES QUE INFLUYEN:

Calentamiento por encima de su temperatura de
desnaturalizacin trmica
pH fuertemente cido bsico
Presencia de alcohol urea

RENATURALIZACIN: Restaurando las condiciones

fisiolgicas se revierte el proceso
DESNATURALIZACIN DE LAS PROTENAS
Consiste en la prdida de todas las estructuras de
orden superior (secundaria, terciaria y cuaternaria)
quedando la protena reducida a un polmero estadstico.

Consecuencias inmediatas son:

- Disminucin drstica de la solubilidad de la

protena, acompaada frecuentemente de
precipitacin

- Prdida de todas sus funciones biolgicas

- Alteracin de sus propiedades hidrodinmicas

 DESNATURALIZACIN TRMICA DE LA RIBONUCLEASA

Molcula nativa Molcula desnaturalizada

Desnaturalizacin

Renaturalizacin

Bioqumica Stryer, Berg y Tymoczko Ed. Revert, S.A. 2003

 ESTRUCTURA CUATERNARIA

Unin de varias cadenas polipeptdicas

(subunidades monmeros)

Especialmente enlaces dbiles

La protena completa se llama

oligomrica polimrica

Posibilita la existencia de fenmenos de

cooperatividad y alosterismo
 LA HEMOGLOBINA

Se encuentra en clulas especializadas,

los eritrocitos

Une oxgeno en los pulmones y lo

transporta, va sangre arterial, a los tejidos
donde lo libera

Adems, une CO2 procedente del

metabolismo en los tejidos, y lo transporta,
va sangre venosa, a los pulmones para
ser eliminado

Bioqumica Mathews, van Holde y Ahern. Addison Wesley 2002

 ESTRUCTURA DE LA HEMOGLOBINA (Hb)

Tetrmero (,)2 cuyas subunidades son similares a la Mb

Bioqumica Mathews, van Holde y Ahern. Addison Wesley 2002

 TRANSPORTE DE OXGENO POR LA HEMOGLOBINA

La Hb capta oxgeno cuando es abundante (pulmones PO2

100 mm Hg) y lo cede cuando disminuye (capilares PO2 30
mm Hg)
La curva de unin del oxgeno a la Hb es SIGMOIDEA:

Este comportamiento se debe a

fenmenos de COOPERATIVIDAD
en la unin de oxgeno. Cada
molcula de Hb tiene 4 lugares de
unin de O2. La unin del primer
PO2 en los pulmones
O2 produce un cambio
PO2 en los tejidos
conformacional en la molcula, lo
que facilita la unin de los
siguientes y viceversa
Bioqumica Mathews, van Holde y Ahern. Addison Wesley 2002
 FENMENOS DE COOPERATIVIDAD

En el tetrmero de Hb ()2, las cadenas / establecen

interacciones fuertes.

Al pasar del estado desoxigenado al oxigenado se

produce un cambio estructural que afecta, sobre todo, a
la interaccin entre subunidades (estructura
cuaternaria). Un par / rota y se desliza respecto al
otro

En menor medida
cambia la estructura
terciaria de cada
subunidad

Bioqumica Mathews, van Holde y Ahern. Addison Wesley 2002

 CAMBIOS ESTRUCTURALES QUE ACOMPAAN A LA
UNIN DEL OXGENO
El paso de la forma desoxigenada a la oxigenada explica la
unin cooperativa del oxgeno:

1. Se rompen una serie de puentes salinos y enlaces de

hidrgeno que afectan a los C-terminales

2. Se crean otros enlaces dando lugar a la conformacin

ms laxa llamada forma relajada (R)

Por tanto, la entrada del primer O2 es ms difcil porque

han de romperse enlaces inicos entre subunidades. El
resto de las molculas de O2 encuentran los enlaces rotos
y la situacin espacial es ms favorable

Cuando sale el O2 la Hb vuelve a su conformacin desoxi o

 CMO SE COMUNICA LA ENERGA DE LA UNIN DE O2
AL CAMBIO CONFORMACIONAL

Bioqumica Mathews, van Holde y Ahern. Addison Wesley 2002

Existe un reordenamiento
de la estructura terciaria y
tambin de la cuaternaria

Bioqumica Mathews, van Holde y Ahern. Addison Wesley 2002

 EFECTOS ALOSTRICOS DE OTROS LIGANDOS SOBRE LA Hb

La Hb es una protena alostrica (=otro sitio), es decir, su

afinidad por el O2 se altera por determinados efectores que
no actan directamente sobre el grupo hemo sino que
interaccionan en otro lugar de la protena

EFECTORES ALOSTRICOS:
1. CO2
2. H+
3. 2,3-bisfosfoglicerato (2,3-BPG)

Todos ellos disminuyen la afinidad de la Hb por el O2

(desplazan las curvas de saturacin hacia la derecha)
LA Hb RESPONDE A LOS CAMBIOS DE pH MEDIANTE EL EFECTO BOHR

Adems de la liberacin de CO2 por los tejidos que

respiran, la falta de O2 (msculo en ejercicio) puede dar
lugar a la formacin anaerobia de cido lctico que
tambin reduce el pH
El aumento de H+ ( pH) es una seal de la demanda de O2
y reduce la afinidad de la Hb por el O2
Hb 4O2 + nH+ Hb nH+ + 4O2
En los capilares: hacia la derecha (liberacin de O2)
En los pulmones: hacia la izquierda
(liberacin de H+ y, como consecuencia, de CO2)
Este mecanismo puede explicarse porque los sitios de
unin de H+ presentan ms afinidad en la forma desoxiHb
que en la oxiHb
 BISFOSFOGLICERATO (BPG)

El CO2 y la [H+] actan de forma rpida para facilitar el

intercambio de O2 y CO2

El BPG es un efector que acta a ms largo plazo,

permitiendo la adaptacin a cambios graduales de la
disponibilidad de O2.
El BPG reduce la afinidad de la Hb por el O 2:
Se une a la Hb en una cavidad existente entre las
cadenas donde establece interacciones con los grupos
(+) que rodean esta cavidad
En la forma oxiHb la cavidad es pequea y no puede
unirse el BPG
En la forma desoxiHb se une estabilizando esta
conformacin.
Unin del 2,3-BPG a la desoxihemoglobina

Bioqumica Mathews, van Holde y Ahern. Addison Wesley 2002