ENZIMA

S
BIOCATALIZADORES

1
Condiciones fundamentales para la vida:

Poder de auto replicacin

Capacidad de catalizar reacciones qumicas eficiente y
selectivamente

C6H12O6 + O2 CO2 +
H2O

Reaccin termodinmicamente favorable, pero

muy lenta.

En el cuerpo humano, una vez que se 2

Las enzimas tienen un gran poder cataltico, a
menudo muy superior al de los catalizadores
sintticos o inorgnicos.

Poseen un elevado grado de especificidad

respecto a sus sustratos.

Aceleran cuantiosamente las reacciones qumicas

especficas.

Llevan a cabo su funcin en solucin acuosa, en

condiciones muy suaves de temperatura y pH.

Existen pocos catalizadores no biolgicos

que tengan todas estas propiedades.
3
 Enzima (del griego enzymos, en
levadura) 1930 John
1897 Edward Northrop y Mose
Buchner no se Kunitzen
S. XIX conversin requiere de la Cristalizacin de
del almidn en clula completa. la pepsina, la
azcar por la Los extractos tripsina y otros
saliva pueden fermentar enzimas
azcar a alcohol. digestivos

1850 Louis 1926 James S.XX. Se han

Pasteur Summer purificado miles
postula la aislamiento y de enzimas en
teora del cristalizacin de las ltimas
Vitalismo la ureasa dcadas
4
Con excepcin de un pequeo grupo de molculas
de ARN cataltico, todos los enzimas son protenas.
La actividad cataltica depende de la
integridad de su conformacin proteica
nativa. Por lo que las estructuras primaria,
secundaria, terciaria y cuaternaria de las protenas
enzimticas son esenciales para su actividad
cataltica.
Estructura Estructura Estructura Estructura
primaria secundaria terciaria cuaternaria

5
asas moleculares relativas que van de 12,000 hasta ms de 1,000,0

lgunas enzimas no requieren ms que su propia secuencia para ser activ

Algunas requieren un componente adicional llamado cofactor.

Uno o varios iones inorgnicos como: Fe2+, Mg2+, Mn2+, Zn2+.

Molcula orgnica
Coenzimas
Molcula metaloorgnica

Un coenzima
Algunos enzimas requieren
Uno o ms iones metlicos

6
 Algunos elementos inorgnicos que actan
como cofactores enzimticos
ION ENZIMA
Cu2+ Citocromo oxidasa
Fe2+ o Fe3+ Citocromo oxidasa, catalasa, peroxidasa
K+ Piruvato cinasa
Mg2+ Hexocinasa, glucosa 6-fosfatasa,
piruvato cinasa
Mn2+ Arginasa,ribonucleotido reductasa
Mo Dinitrogenasa
Ni2+ Ureasa
Se Glutation peroxidasa
Zn2+ Carbonico anhidrasa, alcohol
deshidrogenasa, carboxipeptidasa A y B 7
Algunos coenzimas que actan como portadores transitorios
de tomos o grupos funcionales
Coenzima Grupo qumico Precursor de la dieta
transferido para los mamferos
Biocitina CO2 Biotina
Coenzima Grupo acilo cido pantotnico y
otras molculas
5- tomo de H y Vitamina B12
desoxiadenosilcobalamina grupos alquilo
(coenzima B12)
Flavina adenina Electrones Riboflavina (vitamina B2
dinucleotido
Lipoato Electrones y No se requiere en la
grupos acilo dieta
Nicotinamida adenina In hidruro cido nicotnico (niacina)
dinucleotido (:H-)
Piridoxal fosfato Grupo amino Piridoxina (vitamina B6)
Tetrahidrofolato Grupos Folato
monocarbona 8
Grupo prosttico: coenzima o in metlico unido
covalentemente o de manera muy fuerte a la protena
enzimtica
Parte proteica
Apoenzima o
apoprotena

Holoenzima:
un enzima
completo y
catalticamente
activo junto con
su coenzima y/o
iones metlicos

Algunos son modificados por fosforilacin, glucosilacin, y

otros procesos, gran parte de ellas intervienen en la
regulacin de la actividad enzimtica 9
 CLASIFICACIN
Las enzimas se clasifican segn la reaccin que
catalizan.

Muchas han sido bautizadas aadiendo el sufijo asa

al nombre del sustrato o a una palabra o frase que
Nombre Reaccin que cataliza
describe su actividad:
Ureasa Hidrlisis de la urea
ADN polimerasa Polimerizacin de nucleotidos en la sntesis de
ADN
amilasa Hidrlisis del almidn
lipasa Hidrlisis de lpidos
A otras enzimas se les asignaron nombres muy
generales por parte de sus descubridores , antes de
que se supiera cual era su reaccin especfica
Nombr Actividad Origen
e
pepsina Acta en la digestin de la Del griego pepsis
comida digestin 10
A veces el mismo enzima tiene dos o ms nombres, o
dos enzimas diferentes tienen el mismo nombre.

Por acuerdo internacional un sistema de nomenclatura

y clasificacin de las enzimas.

El sistema distribuye a los enzimas en seis clases, cada

una de ellas con diferentes subclases segn el tipo de
reaccin catalizada.

A cada enzima se le asigna un nmero clasificatorio que

consta de cuatro partes y un nombre sistemtico que
identifica la reaccin catalizada

11
 CLASIFICACIN INTERNACIONAL DE LOS ENZIMAS
No Clase Tipo de reaccin catalizada
Transferencia d e electrones (iones
1 Oxidorreductasas
hidruro o tomos de H)
Reacciones de transferencia de
2 Transferasas
grupos
Reacciones de hidrlisis
3 Hidrolasas (transferencia de grupos
funcionales al agua)
Rotura de C-C, C-O, C-N u otros
enlaces por eliminacin, dejando
4 Liasas
dobles enlaces o anillos o adicin
de grupos a dobles enlaces
Transferencia de grupos dentro de
5 Isomerasas molculas dando formas
isomricas
Formacin de enlaces C-C, C-S, C-O
12
+ D-glucosa ADP + D-glucosa 6-fo

La enzima que cataliza esta reaccin es la ATP: glucosa

fosfotransferasa, que indica que cataliza la
transferencia de un grupo fosforilo desde el ATP a la
glucosa
El nmero de clasificacin de ste enzima
(nmero E.C., por Enzyme Commission) es:
2.7.1.1.
Nombre de la clase:
Transferasa D-glucosa como
aceptor del
Subclase: grupo fosforilo
fosfotransferasa Fosfotransferasa con
un grupo hidroxilo
como aceptor 13
En muchos casos se utiliza un nombre comn de
uso ms frecuente (en este caso hexocinasa)

La lista y la descripcin completa de los enzimas

conocidos se mantiene actualizada por el Comit
de Nomenclatura de la International Union of
Biochemistry and Molecular Biology

(WWW.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme)

14
 FUNCIONAMIENTO DE LAS ENZIMAS

La catlisis enzimtica de las reacciones es esencial

para los sistemas vivos.

En condiciones no biolgicas, las reacciones no

catalizadas tienden a ser lentas.

La mayora de las molculas biolgicas son muy

estables en las condiciones de
pH neutro
Temperatura suave
Ambiente acuoso en el interior de la clula.

15
 FUNCIONAMIENTO DE LAS ENZIMAS

Muchos procesos qumicos comunes son

desfavorables o poco probables en el ambiente
celular.

Las reacciones necesarias para digerir los alimentos,

enviar seales nerviosas, contraer el musculo no se
dan a una velocidad til sin catlisis.

Un enzima soluciona este inconveniente

al proporcionar un ambiente especfico
dentro del cual una reaccin
determinada puede transcurrir ms
rpidamente.
16
Una reaccin catalizada
enzimticamente tiene
lugar dentro de una bolsa
del enzima denominada
sitio activo.

La molcula fijada en el
sitio activo y sobre la que
acta la enzima se 17
18
La superficie del sitio activo del enzima est
revestida con residuos aminocidos con
grupos sustituyentes que se unen al sustrato y
catalizan su transformacin qumica.

19
A menudo el sitio activo recubre al sustrato y lo
secuestra completamente de la disolucin.

El complejo enzima-sustrato, propuesto por

primera vez en 1880 por Charles-Adolphe Wurtz,
es de importancia central en la accin de los
enzimas. Y es el punto de partida de los
tratamientos matemticos que definen el
comportamiento cintico de las reacciones
catalizadas por enzimas, as como de las 20
 LOS ENZIMAS ALTERAN LAS VELOCIDADES DE REACCIN,
PERO NO LOS EQUILIBRIOS

E + S ES EP E + P

E= Enzima
S= Sustrato
P= Producto
ES=complejo transitorio del enzima con el sustrato
EP=complejo transitorio del enzima con el producto

quilibrio de reaccin vs Velocidad de reacci

21
 La funcin de un catalizador es aumentar la velocidad de una
reaccin.
Los catalizadores no modifican los equilibrios de reaccin.

El equilibrio entre S y P refleja la diferencia en energa libre de sus

estados basales.
La energa libre del estado basal de P es inferior a la de S, por lo que
G10 de la reaccin es negativo (la reaccin es exotrmica) y en el
equilibrio hay ms P que S (el equilibrio favorece a P). 22
 La posicin y la direccin de este equilibrio no estn
afectadas por ningn catalizador.
Un equilibrio favorable, no indica que la conversin
de S P tenga lugar a una velocidad detectable.
velocidad de una reaccin depende de un parmetro totalmente diferent
Existe una barrera energtica
entre S y P que representa la
energa requerida para :
el alineamiento de los grupos
reactivos,
La formacin de cargas transitorias
inestables,
Los reordenamientos de enlaces
Otras transformaciones que se
requieren para que la reaccin
tenga lugar
Para que haya reaccin, las molculas en superar
han de cualquiera de las
esta
dos
barrera, por lo que deben llegar direcciones.
a un nivel energtico superior23
 En la parte superior de la colina energtica existe un
punto en el que la cada hacia el estado de "S" o "P"
es igualmente probable (en los dos casos, el camino
es de bajada). Es lo que se denomina el estado de
transicin.
El estado de transicin:
no es una especie qumica con estabilidad significativa.
Es un momento molecular fugaz en el que
acontecimientos tales como:
Rotura de enlace
Formacin de enlaces
Desarrollo de cargas,
han llegado al momento preciso en el que el colapso
hacia sustrato o producto es igualmente probable.

Estado de transicin

24
Energa de activacin G: es la diferencia de energa
entre el estado basal y el estado de transicin.

La velocidad de una reaccin refleja sta energa de

activacin

A una energa de activacin ms elevada corresponde

una reaccin ms lenta.
Reaccin ms lenta

Reaccin ms rpida

Las velocidades de reaccin pueden aumentarse

incrementando la temperatura y/o la presin que
aumentan el nmero de molculas con energa suficiente
25
De modo alternativo, es posible disminuir la energa
de activacin mediante un catalizador.
Los enzimas no modifican el equilibrio de la reaccin,
su papel es acelerar la interconversin de S y P, no se
gasta enzima en el proceso y el punto de equilibrio no
queda afectado. Sin embargo, la reaccin alcanza el
equilibrio de una manera mucho ms rpida cuando se
haya presente el enzima adecuado ya que incrementa
la velocidad de la reaccin.

26


La reaccin tiene un G muy grande y negativo,

por lo que la cantidad de sacarosa presente en el
equilibrio es despreciable, sin embargo, la sacarosa
en un compuesto muy estable ya que la barrera de
activacin energtica que debe superar antes de
reaccionar con el oxigeno es muy alta.
Las enzimas no solo aceleran las reacciones sino
que las organizan y controlan de tal manera que
gran parte de la energa liberada en el proceso
se recupera en otras formas qumicas accesibles
a la clula para que realice sus funciones.

27
 Intermediario de reaccin: cualquier especie
producida en el transcurso de la reaccin que tenga
un tiempo de vida qumico finito (y mayor que el de
una vibracin molecular, ~10-12 segundos)
Cuando la reaccin
S P
Est catalizada por un enzima

Los complejos ES y EP pueden ser considerados

intermediarios a pesar de que S y P sean especies
qumicas estables
s complejos ES y EP ocupan vallen en el diagrama de reacci

28
Cuando en una reaccin existen varios pasos, la
velocidad global viene determinada por el paso (o
pasos) cuya energa de activacin sea ms elevada. A
este paso se le llama paso limitante de velocidad.
El paso limitante de velocidad puede cambiar con las
condiciones de reaccin y en el caso de muchos
enzimas puede haber varios pasos con energa de
activacin similares
Las energas de activacin son barreras energticas
para las reacciones qumicas, estas barreras son
cruciales para la propia vida. La velocidad a la que una
molcula se transforma en una reaccin qumica
desciende al aumentar la barrera de activacin.

Sin estas barreras energticas, las macromolculas

complejas revertiran a formas moleculares mucho ms
sencillas y no podran existir las estructuras complejas
y altamente ordenadas ni los procesos metablicos que29
 Parmet Definicin termodinmica
ro
Equilibrio Variacin de la energa libre G0
de estndar de la reaccin
reaccin
Velocidad Energa de activacin G
de
Un equilibrio de la forma
reaccin

est descrito por una constante de equilibrio, k eq, o K

En las condiciones estndar utilizadas para comparar los

procesos bioqumicos, una constante de equilibrio se
denota por keq (o K):

30
La descripcin entre Keq y G0 puede describirse:

Constante de los gases Temperatura

(8.315 J/mol.K) absoluta 298 K
(25C)

valor negativo grande de refleja un equilibrio de reaccin

Un
favorable (la cantidad de producto en el equilibrio es mucho
mayor que la de sustrato) este hecho no significa que la
reaccin transcurra a una velocidad conveniente para la
clula.

31
 La velocidad de una reaccin viene determinada por la
concentracin de reactivo (o reactivos) y por una constante de
velocidad general k.

Tipo de Reaccin Ecuacin Uni

reacci de dad
n velocidad es
1er unimolecular S-1
orden
2do concentraci M-1S-
orden n de dos 1

compuestos

K es una constante de proporcionalidad que refleja la probabilidad

de reaccin bajo un conjunto de condiciones (pH, temperatura, etc.)

mplo:
una reaccin de primer orden tiene una constante de velocidad k de 0.03S -1
puede interpretar cualitativamente: 3% de sustrato accesible ser convertido en
n 1s.

32


Constante de Boltzmann Constante de Plank

mentos de velocidad conseguidos por los enzimas son de 5 a 17 rdenes de ma

Los enzimas son tambin muy especficos, discriminando fcilmente

entre sustratos con estructuras muy similares

Reordenamiento de los enlaces covalentes durante una reaccin catalizada

por enzimas entre sustratos y grupos funcionales de los enzimas (los
grupos funcionales catalticos de las enzimas pueden formar enlaces
covalentes transitorios con un sustrato, activndolo para la reaccin, o
bien transferirse momentneamente un grupo del sustrato al enzima.
Interaccin no covalente entre el enzima y el sustrato 33
La interaccin entre la enzima y el sustrato en el complejo ES, est
mediada por las mismas fuerzas que estabilizan la estructura
proteica:
Puentes de hidrgeno
Interacciones hidrofbicas
Interacciones inicas
Fuerzas de Van del Waals

El establecimiento de cada interaccin dbil en el complejo ES se

asocia a una liberacin de una pequea cantidad de energa libre
que estabiliza la interaccin.

Energa de fijacin GB: la energa procedente de la interaccin

enzima-sustrato.
Es la primera fuente de energa libre utilizada por las enzimas para
disminuir su energa de activacin de las reacciones

34