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ENZIMAS
Son Protenas altamente especializadas que tienen como
funcin la catlisis o regulacin de la velocidad de las
reacciones qumicas que suceden en la clula.
Proceso enzimtico
Aminocidos de fijacin.
Son los que establecen enlaces dbiles
con el sustrato y lo fijan.
Se encuentran en el centro activo de la
enzima
Aminocidos catalizadores.
Son los que al establecer enlaces, con el
sustrato, provocan la reaccin.
Son los responsables de su
transformacin. Centro activo
Tambin estn en el centro activo
MODELOS DE INTERACCIN
(ESPECIFICIDAD)
Hay dos modelos sobre la forma en que el sustrato se une
al centro activo del enzima: el modelo llave-cerradura, y el
modelo del ajuste inducido
a.- Modelo de llave y cerradura.
La estructura del sustrato y la del centro activo son
complementarias
Este modelo es vlido en muchos casos, pero no es
siempre correcto
b.- Modelo del ajuste inducido
El centro activo adopta la conformacin idnea slo en
presencia del sustrato.
La unin del sustrato al centro activo del enzima
desencadena un cambio conformacional que da lugar a la
formacin del producto.
COFACTORES Y COENZIMAS
Segn su composicin, las enzimas se clasifican en dos
grupos:
Enzimas holoprotenas: Constituidos solamente por
secuencias de aminocidos. Son poco frecuentes, ejemplo: la
ribonucleasa y la lisozima.
puede ser abordado como la suma de los efectos que usan las
enzimas en dos fases:
.
MECANISMO DE CATLISIS ENZIMTICA
1.-En cuanto a la energa de fijacin: es la suma de dos
factores; proximidad y orientacin favorable de los reactantes
Efecto de proximidad. La enzima puede fijarse a las molculas
reaccionantes (sustratos) de manera que queden muy prximas entre
s sobre el centro activo y a su vez prximos a eventuales grupos
catalticos del propio enzima.
Efecto de orientacin. La enzima se fija a las molculas de sustrato
de manera que quedan no slo prximas, sino adems orientadas en
la relacin geomtrica ms favorable para que la reaccin tenga lugar
con los R aminoacdicos reactivos.
a.Catlisis cido-base.
El mecanismo de la accin de donadores y aceptores de
protones (cidos y bases), puede quedar explicitado
observando la hidrlisis de sacarosa en glucosa y
fructosa por la accin de iones hidronio.
En esta hidrlisis, el enlace acetal que compromete al
oxgeno exterior a los anillos se hidroliza tomado una
molcula de agua del entorno.
MECANISMO DE CATLISIS ENZIMTICA
b. Catlisis en complejos. Un ejemplo es la hidrlisis del
acetato de m-clorofenil catalizada por la ciclohexamilosa
La molcula de ciclohexamilosa es no polar y esta formada
por seis molculas de glucosa unidas en la forma de una
rosca, en la que calza un grupo fenilo.
El grupo m-clorofenilo no polar, puede entrar en la cavidad de
la ciclohexamilosa y formar un complejo.
En este complejo el grupo ster del sustrato queda prximo a
uno de los muchos hidroxilo de la ciclohexamilosa y tienen
lugar la accin nucleoflica mediante el grupo hidroxilo, libera
el acetato.
NOMENCLATURA
Hay varias formas de nombrar una enzima:
Nombres particulares
Nombre sistemtico
Cdigo de la comisin de enzimas
NOMBRES PARTICULARES.
Antiguamente, los enzimas reciban nombres particulares,
asignados por su descubridor.
Ejemplos: amilasa, pepsina.
NOMBRE SISTEMATICO
Consta de 3 partes:
el sustrato preferente, el tipo de reaccin realizado y la
terminacin "asa. ejemplo: la glucoquinasa
Descarboxilacin de Histidina
Clase 5: ISOMERASAS
Catalizan la interconversin de ismeros:
A B
Ejemplo: la fosfotriosa isomerasa que cataliza las reaccin:
gliceraldehdo-3-fosfato dihidroxiacetona-fosfato
5. ISOMERASAS
1.Racemosas y epimerasas
2.Isomerasas cis-trans
3.Oxidorreductasas
intramoleculares
4.Transferasas intramoleculares
5.Liasas intramoleculares
6. Ligasas.
EC 6.1, incluye ligasas usadas para formar
unionesoxgeno-carbono.
EC 6.1.1 Ligasas forman aminoacil-ARNt y compuestos
relacionados.
EC 6.1.2 Ligasas cido-alcohol (sintasas ster).
EC 6.2, ligasa usadas para formar uniones carbono-azufre.
EC 6.2.1 Ligasas cido-tiol.
EC 6.3, incluye ligasas usadas para crear uniones carbono-
nitrgeno.
EC 6.3.1 cido-amoniaco (o amina) ligasas (sintasas
amida).
EC 6.3.2 Ligasas cido-aminocidos (pptido sintasas).
EC 6.3.3 Ciclo-ligasas.
EC 6.3.4 Otras ligasas carbono-nitrgeno.
EC 6.3.5 Carbono-nitrgeno ligasas con glutamina como
amido-N-donador.
EC 6.4, abarca ligasas que forman uniones carbono-
carbono.
EC 6.5, incluye ligasa que formansteresfosfricos.
EC 6.6, ligasa usadas como unin nitrgeno-metal.
EC 6.6.1 Formando complejos de coordinacin
BASES DE LA CINETICA ENZIMATICA
Estudia la velocidad de las reacciones catalizadas
enzimticamente
Los principios generales de las reacciones qumicas se
aplican tambin a las reacciones enzimticas
En el efecto de la temperatura
hay dos componentes:
1.Aceleracin de la reaccin
segn la ecuacin de
Arrhenius. (dentro del margen
de actividad)
k = A exp (-Ea/RT)
Al aumentar la temperatura, la
velocidad de reaccin aumenta
y, para casi todas las enzimas,
un incremento de 10C duplica
e incluso triplica la velocidad de
reaccin.
2. Desnaturalizacin trmica de
la protena.
Para muchas enzimas la regin
de inactivacin trmica est
CINETICA ENZIMATICA
Cintica de reacciones con un slo substrato
Michaelis y Menten propusieron un modelo para
relacionar la velocidad de reaccin con la concentracin
de substrato. Suponiendo la existencia de un solo
complejo central, el esquema de reaccin sera:
Velocidad de reaccin VS
concentracin
La ecuacin de
Michaelis-Menten
describe como vara la
velocidad de las
reacciones catalizadas
por enzimas de acuerdo
a la concentracin de
sustrato:
Vmax = Km.vi + vi
[S]
Ordenando:
vi = Vmax - Km.vi
[S]
Pendiente= Km,
Ordenada en el origen= Vmax.
Ploteo de Hanes- Wolf
Vmax = vi + vi. Km
[S]
Limitaciones de Cintica
Michaeliana
Para utilizar la ecuacin de Michaelis-Menten deben asumirse:
Concentraciones relativas de E y S: La concentracin de
sustrato [S] es mucho mayor que la concentracin de enzima
[E], de manera que la proporcin de ES es relativamente
pequea.
La reaccin esta en equilibrio: [ES] no cambia en el
tiempo (la velocidad de formacin de ES, es igual a la
velocidad de su transformacin en E + S y en E + P).
Deben usarse velocidades iniciales (v o). Esto significa
que la velocidad de la reaccin debe determinarse tan pronto
como el sustrato y la enzima se mezclan. En dicho tiempo, la
concentracin de productos es despreciable y, por lo tanto, la
reaccin inversa de productos a sustratos puede ser ignorada
Hay 3 tipos:
Competitiva
No Competitiva
Acompetitiva (Alostrica)
Inhibidores competitivos
Los inhibidores competitivos tienen gran parecido estructural
con el sustrato natural.
Compiten con el sustrato por ocupar el sitio activo de la
enzima.
Esta unin es reversible y aumentando la concentracin de
sustrato aumentamos el nmero de molculas de enzima libre.
Una caracterstica de este inhibidor es que puede ser revertida
aumentando la concentracin de sustrato. Si ste predomina
en la mezcla, tiende a desplazar al inhibidor de su unin con la
enzima.
Estos han encontrado aplicacin farmacolgica.
Ejemplo1:
efecto
antibitico de
sulfas
Las bacterias sensibles requieren
del (para amino benzoico) PABA
para producir cido
dihidroflico, un paso en la
produccin de purinas y la
sntesis de cidos nucleicos.
Las sulfamidas son anlogos
estructurales del PABA, inhibiendo
competitivamente a la enzima
dihidropteroato sintasa, y bloquea
la sntesis del cido flico
Ejemplo 2. Efecto reversible
metanol/etanol
El alcohol metlico, se produce durante la obtencin de
bebidas alcoholicas fermentadas, especialmente cuando
proceden de frutas con alto contenido de pectina,
generando as una mezcla de etanol y metanol, que en
ltima instancia va al consumidor.
La dosis txica de metanol presenta variaciones
individuales; algunas personas han muerto con dosis de 15
ml y otros han sobrevivido con 500-600 ml.
Los sntomas se inician entre los 40 minutos y 72 horas
postingesta al formarse los metabolitos txicos
(formaldehdo y el cido frmico) y consisten en
embriaguez, cefalea, nuseas; dolor abdominal;
disminucin de la agudeza visual, visin borrosa, y
ceguera, disminucin de la fuerza, insuficiencia renal
aguda, depresin del SNC, hipotensin; finalmente las
convulsiones, coma y muerte.
Ejemplo 2. Efecto reversible
metanol/etanol
El metanol es metabolizado por la enzima alcohol
deshidrogenasa, la misma que metaboliza el etanol, pero esta
enzima es 22 veces ms afn por el etanol que por el metanol,
razn por la cual se utiliza el etanol como antdoto de esta
intoxicacin, ya que al preferir la enzima como sustrato el
etanol estamos evitando la formacin de los metabolitos
txicos del metanol. (fuente: Llins Chica, Vladimir)
Cintica competitiva
En la Inhibicin competitiva el sustrato (S) y el I compiten por la enzima
libre, pudiendo unirse uno o el otro, pero no ambos simultneamente,
hay una interaccin mutuamente excluyente del S y de I con la enzima.
La unin de E a I conduce a la formacin de un complejo no productivo.
Ejemplo 3: inhibicin de la succinato
deshidrogenasa por malonato
Esta enzima cataliza la eliminacin de 2H de 2 carbonos metilnicos
del succinato en el ciclo de Krebs. El malonato es similar al succinato
en que posee 2 COO- ionizados a pH 7, pero no es deshidrogenado
por la enzima.
Adems tienen la misma accin otros cidos con dos grupos
aninicos como el pirofosfato.
APLICACIONES:
Muchos medicamentos son inhibidores
enzimticos.
b.- Inhibidores irreversibles:
Los gases nerviosos.Venenos
(sarn, tabn, somn)
Organofosforados. El fluorofosfato de di-isopropilo DIPF
Carbamatos.
Inhiben la enzima acetilcolinesterasa del sistema nervioso que
en el sitio activo contiene residuos de serina que se unen a la
acetilcolina cortando los impulsos nerviosos.
Plaguicidas organofosforados
Organofosforados: malathion
Carbamatos: como el carbaril
(Sevin).
Organofosforados: Esteres de
fosfato con O sustituidos con S u
otros radicales.
Con enlace P-C fosfonato,
Con enlace P-N fosforamido,
Con enlace P-S fosfotiolato
Inhiben la acetilcolinesterasa
Neurotransmisin intoxicacin
Circuito elctrico de transmisin
de seal entre una sensacin
(nervio sensitivo) y un movimiento
muscular (nervio motor).
Acetilcolina --- colina + acetato
Enzima: acetilcolinesterasa
hexoquinasa
Glucosa + ATP ----------> Glucosa-6-fosfato + ADP
_
E acta como inhibidor del primer enzima.
Ello impide:
La utilizacin innecesaria del primer sustrato
La acumulacin del producto final
Se evita la acumulacin de intermedios
Ejemplos de cintica.
1. En una reaccin enzimtica que transcurre con una
concentracin de enzimas de 0,015g/l, se obtienen
los siguientes datos:
[S] (g/l) 20 15 10 7.0 5.0 4.0
3.0 2.5
v(g/l-min 1.14 1.01 0.87 0.72 0.59 0.5
0.44 0.35
Intercepto.= 1/vmax=0.614
vmax = 1.628 g/l-min.
Pendiente: Km/vmax. = 5.387
Km = 8.776 g/l
El modelo ser.
V = Vmax.S/(Km+S)
V = 1.628S/(8.776+S)
Comprobar por Eadi-Hostie
Linearizacin de Eadie-Hostfee
V = Vmax Km.V/S
Ejercicio 2
Se investig el efecto de un inhibidor I sobre la velocidad
de una reaccin catalizada enzimticamente sobre un
solo sustrato, obtenindose los siguientes resultados