Acidos Nucleicos (bioqumica y

biofsica)
IBt/UNAM

Nomenclatura.
Reactividad del esqueleto.
Desnaturalizacin.
Dao y reparacin.
Enzimologa bsica de Acidos
Nucleicos.
Secuenciacin y sntesis de
Acidos Nucleicos.
IBt/UNAM
Acidos Nuclicos (estructuras)

Papel moderno de DNA y RNA.

Fuerzas que intervienen.
Flexibilidad y polimorfismo del
DNA.
Topologa.
Acidos Nuclicos y Genomas.
IBt/UNAM

Acidos Nucleicos

Bioqumica y Biofsica
 Acidos Nucleicos (bioqumica y
biofsica)
IBt/UNAM

Nomenclatura.
Notacin. Tipos de
bases. RNA vs.
DNA

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

 Acidos Nucleicos (bioqumica y
biofsica)
IBt/UNAM

Tautomera
Bases Raras

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

 Acidos Nucleicos (bioqumica y
biofsica)
IBt/UNAM

Reactividad del
esqueleto.

H+, OH- (RNA vs. DNA).

Fragilidad mecnica y sus

implicaciones.

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

 Acidos Nucleicos (bioqumica y
biofsica)
IBt/UNAM

Reactividad del
esqueleto.
Despurinacin.
Metilacin.
Desaminacin.
Implicaciones de
sustitucin en anillo
en la reactividad del
esqueleto.

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

 Acidos Nucleicos (bioqumica y
biofsica)
IBt/UNAM

Desnaturalizacin. Tm (Composicin de bases, efecto

de sal).

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

 Acidos Nucleicos (bioqumica y
biofsica)
IBt/UNAM

Desnaturalizacin. UV. Hipercromicidad

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

 Acidos Nucleicos (bioqumica y
biofsica)
IBt/UNAM Hibridacin. Fenmeno notable.
Utilizacin.

PNA

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

 Hibridacin multiple en chips
IBt/UNAM

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

IBt/UNAM

Secuenciacin y sntesis de Acidos

Nucleicos.
Sntesis: Problema bsico resuelto (fase
slida, grupos protectores, automatizacin.
Dinmica de la sntesis comercial). DNA vs.
RNA.
Secuenciacin: Mtodos originales. Mtodo
actual. Mtodos futuros.

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

IBt/UNAM

Sntesis Qumica de DNA

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

IBt/UNAM

Secuenciacin
Enzimtica

Estado del arte:

electroforesis capilar

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

IBt/UNAM Desarrollos futuros
Degradacin enzimtica (procesiva) de moleculas
individuales. Depende de la deteccin de una sola
molcula

Deteccin electroqumica (canales en membranas)

del paso de una sola molcula.

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

 Dao y reparacin. Enzimologa
IBt/UNAM
importante. Motor de la evolucin.

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

IBt/UNAM

Enzimologa bsica de Acidos

Nucleicos.
Nucleasas (inespecficas, restriccin,
dependientes de estructura o estado). Nick.
Gap.
Fosfatasas, cinasas.
Ligasas
Metilasas.

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

IBt/UNAM

Papel moderno de DNA y RNA. (Papel

primitivo. Por qu la pregunta?)
Estructura clsica del DNA. (Cmo
sabemos que es as? Watson y Crick fu un
modelo satisfactorio.)
Medidas.
Complementaria.
Antiparalela.
Implicaciones de la estructura propuesta.

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

IBt/UNAM
Libertad Conformacional

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

 Estructura de Acidos
IBt/UNAM
Nuclicos: Fuerzas que
intervienen.
(Sern las mismas que en protenas?).
Hidrofobicidad y apilamiento (stacking).
Puentes de hidrgeno (complementaridad
estrica y direccin). Implicaciones que
perfilan estructuras alternativas.
Fuerzas electrostticas. Realmente
desestabilizan. (Pensar consecuencias)

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

 Stacking
IBt/UNAM

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

 Apareamiento de Bases
IBt/UNAM

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

 Flexibilidad y polimorfismo del
IBt/UNAM
DNA.
DNA A.
DNA Z.
DNA H.
Bending y kinking.
Polimorfismo e interaccin protena-DNA.
(Contenido informacional de los surcos).

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

IBt/UNAM DNA B DNA A

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

IBt/UNAM

DNA B

DNA A

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

 DNA Z
IBt/UNAM

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

IBt/UNAM Telmeros

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

 Interaccin Protena-DNA
IBt/UNAM

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

 Topologa.
IBt/UNAM
Loops. Cruciformes.

Lineal vs. circular (crculos efectivos).

Superenrrollamiento.

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

 Superenrrollamiento
IBt/UNAM

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

 Superenrrollamiento
IBt/UNAM

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

 Superenrrollamiento
IBt/UNAM

Al disminuir L, se facilitan
los procesos de replicacin
y transcripcin.

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

 Superenrrollamiento
IBt/UNAM

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

IBt/UNAM

Estructura de RNAs (tRNA y

rRNA)
 RNA de transferencia
IBt/UNAM

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

 RNA ribosomal
IBt/UNAM

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)

 Acidos Nuclicos y Genomas
IBt/UNAM Diversidad de tipos y tamaos.
Avance sostenido de la ciencia genmica

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)