METABOLISME MIKROBA

- Metabolisme ➔ trdr katabolisme dan anabolisme

- Selama katabolisme ➔ makanan dibakar melalui
bbrp jalur ➔ u/ lbh mengefisiensikan penggunaan
enzim

- Respirasi aerobik lbh efisien dp respirasi anaerobik

- Katabolisme mikroba unik dlm diversitas nutrien &

mekanisme pemakaian u/ pembuatan energi
- Jalur ➔ glikolisis – Kreb’s cycle – elektron
transport dan fosforilasi oksidatif

- Siklus TCA/Krebs cycle ➔ jalur final u/ oksidasi

nutrien scr aerobik ke CO2

- Rantai transport elektron ➔ serangkaian

pembawa elektron yang bekerja mentransfer
elektron dari donor (NADH & FADH2) ke
aseptor (O2)
 DASAR METABOLISME
DASAR METABOLISME
1. Enzim
2. Jalur metabolik
3. ATP
4. NAD/NADH + H๋ ⁺
 ENZIM
Enzim ➔ protein katalitik ➔ katalis mrpkn bhn
kimia yg mengubah laju reaksi tanpa hrs
dipergunakan o/ reaksi tsb.
 DASAR JALUR METABOLIK DARI
METABOLISME HETEROTROPIK
1. RESPIRASI SEL
- Glikolisis
- Siklus Krebs
- Rantai transport elektron
- Posforilasi oksidatif
2. FERMENTASI
3. KATABOLISME LIPID DAN PROTEIN
- Katabolisme lipid
- Katabolisme protein
 DASAR JALUR METABOLIK DARI
METABOLISME AUTOTROPIK
1. POTOAUTOTROP / POTOSINTESIS
- Potofosforilasi (reaksi tgt sinar)
- Fiksasi karbon (reaksi tdk tgt sinar)→ siklus
Calvin-Benson
2. POTOHETEROTROP
Bakteri yg menggunakan energi dr cahaya tp
memerlukan bhn organik sbg sumber karbon
3. CHEMOAUTOTROP / CHEMOLITOTROP
Mengoksidasi bhn anorganik utk energi
JALUR ANABOLIK
1. Fiksasi karbon
2. Carbohidrat dan glikan
3. As. Lemak – isoprenoid & steroid
4. Protein
5. Sintesis nukleotid
 JALUR METABOLISME
- Dlm proses reaksi terjadi pemecahan glukosa

C6 H12O6 + 6O2 → 6CO2 + 6H2O

- Jalur metabolisme : satu seri langkah-langkah

kecil → bbrp reaksi kimia terjadi bersama &
produk yang satu menjadi substrat
berikutnya → jalur metabolik seperti dibwh ini

A→B→C→D→E
- ATP harus dlm kondisi konstan dlm tubuh
- Mereka harus melengkapi ATP dengan
menggunakan energi dari luar u/ membtk
kembali ATP dari ADP & P
- Sel mendapatkan energi dari mkn dan yg lain
mendapatkan energi dr cahaya atau bhn kimia
ADP + P
Energi digunakan u/ energi dr mkn/ chy mthr
Reaksi dlm sel

ATP
- Aseptor elektron bervariasi ➔ dpt digunakan
dlm katabolisme ➔ O2 (respirasi aerobik) –
mol organik (fermentasi) - oksidasi mol
anorganik selain O2 (respirasi anaerob) –
reduksi mol anorg ➔ mol org sbg donor
elektron u/ transport elektron dan sintesis ATP

- Katabolisme mikroba unik dlm diversitas nutrien

& mekanisme pemakaian u/ pembuatan energi
- Respirasi aerobik lbh efisien dp resp. anaerobik

- Respirasi anaerobik ➔ proses pembentukan

ATP dg transport elektron o/ penerima elektron
terminal ➔ oksidasi mol anorg selain O2

- Tanpa oksigen ➔ mikroba mengoksidasi

molekul organik sbg penerima elektron u/
reoksidasi pembentukan NADH slm glikolisis
- Proses katabolis yg menggunakan mol organik
sbg penerima elektron ➔ dsbt fermentasi

- Mikroba banyak memecah karbohidrat

ekstraseluler ➔ polysakharida eksternal
dihidrolisis / posforolisis ➔ monosakharida ➔
produknya di absorbsi

- Glikogen ekstrasel dan tepung diubah jd 1-

posfat o/ posforolisis
- Lemak dikatabolis jadi as lemak dan dioksidasi
ke acetil-CoA dalam jalur β-oksidasi

- Protein dihidrolisis jadi as amino yg kmd

diaminasi ➔ masuk dlm siklus TCA
Glikolisis
- Jalur glikolisis /Embden Meyerhof  mengubah
glukose jadi 2 mol piruvat, membentuk 4 ATP
dan 2 ATP digunakan, 2 mol NAD⁺ direduksi
ke NADH

- Kegiatan glikolisis dlm sitoplasma

- Terjadi pd sebag. besar mikroorg baik ada / tanpa

O₂
- Jalur glikolisis (amphibolik) dan siklus asam
trikarboksilat ➔ fungsi ana & katabolisme

- Glikolisis scr anaerob ➔ 2 ATP & respirasi

aerobik pd eukariot ➔ 38 ATP
GLIKOLISIS / EMBDEN-MEYERHOF

6 carbon stage
GLIKOLISIS LANJUTAN

3 carbon stage

Subtrat – level
posforilation

Subtrat – level
posforilation
glukoneogenesis
Entner- Doudoroff
- Kebanyakan bakteri mempunyai jalur glikolisis
& pentose posfat tapi bbrp menggunakan jalur
Entner-Doudoroff (Pseudomonas, Rhizobium,
Azotobacter, Agrobacterium)
- Jalur Entner-Doudoroff ➔ dimulai dg reaksi
sama dg jalur pentose fosfat ialah formasi glukosa
6-fosfat & 6-fosfoglukonat
- Jalur Entner-Doudoroff memecah 1 mol glukosa
menggunakan enzim yang berbeda dg glikolisis
➔ piruvat +1 ATP + 1 NADPH + 1 NADH
ENTNER-DOUDOROFF PATHWAY
Jalur Pentose phosfat
- energi yg ditangkap melalui jalur ini lebih kecil
dari pd glikolisis
- Memproduksi ribulose 5-phosfat  utk sintesis
glukose pd potosintesis
- Menghasilkan NADPH  pembawa elektron
utk reaksi anabolik
- Jalur pentose fosfat dimulai dr glukose 6-fosfat
➔ dioksidasi 2 X ➔ pentose dan gula ➔ sumber
NADPH - ATP - Pentose – Tetrase
- Memproduksi erytrose 4-phosfat sintesis
nukleotid dan as amino ttt
- Menghasilkan prekursor metabolit (6-
phosfoglukonik acid & 2-keto-3 deoksi-6-
phosfoglukonic acid)
- Menghasilkan 1 mol NADPH (tdk dihasilkan
oleh glikolisis )
- NADPH  biosintesis reduksi  mis jadi
ribonukleotid reduktase  enzim yg
menggunakan NADPH  merubah
ribonukleotid ke deoksiribonukleotid
Siklus Tri karboksilat / siklus Kreb’s
- Siklus trikarboksilat ➔ step lanjutan setelh
glikolisis.
- Katabolisme pd kebanyakan sel aerob
 sumber energi penting

- Asam Tri karboksilat / siklus Kreb’s ➔

pemecahan piruvat ➔ CO₂ + acetil coA (hsl
katabolisme KH, lipid & as amino) ➔ produk
intermediate ➔ oksaloasetat ➔ as sitrat ➔ iso
sitrat ➔ α ketoglutarat ➔ succinil coA ➔ as
fumarat ➔ as malat ➔ oksaloasetat
- Proses ini mengoksidasi acetil coA ke CO2 ➔
tiap 1 acetil coA membtk 1 GTP - 3 NADH2 –
1FADH2

- NADH & FADH2 diproduksi dr karbohidrat - as

lemak – nutrien lain yg dpt dioksidasi dlm rantai
transport elektron

- Enzim siklus TCA scr luas didistribusi diantara

mikroba aerob – protozoa yg hdp bebas –
algae – fungi
TRICARBOXILIC ACID CYCLE
Buatlah ringkasan dari respirasi sel :
1. Phase (glikolisis dst)
2. Lokasi di dalam sel (prokariote :
3. Jenis substrat (glukosa
4. Produk per glukosa
5. Event mayor (oksidasi/ reduksi)
- Jika tdk dterdapat O₂ dlm sel ➔ piruvat
difermentasi ➔ ditambah 2 H dari NADH ➔
alkohol + CO₂ (yeast) / as laktat (sel otot)
- NADH ➔ NAD+
 SIFAT MIKROBA FOTOSINTESIS

Pigmen fotosintesis : bacteriochlorofil

Potosistem II : tidak ada
Donor elektron fotosintetik : H₂, H₂S, S, bhn organik
Pola produksi O₂ : anoksigen
Produk energi : ATP
Sumber karbon : organik &/ CO₂
- Fotosintesis menangkap energi cahaya ➔
meningkatkan elektron
- Energi elektron ➔ u/ membentuk ATP &
NADPH atau NADH selama transport elektron

- Khemolitotrop /khemoautotrop mensintesis ATP

dg oksidasi reduksi mol anorg ➔ O2 sbg
aseptor elektron direduksi nitrogen dan sulfur
atau ion ferro ➔ rantai transport elektron
- Khemolitotrop menggabungkan CO2 melalui
siklus Calvin & memproduksi NADH dg
membalikkan transport elektron
- Pada fotosintesis ➔ eukariot & cyanobacteria
menangkap energi dg klorofil & pigmen asesoris
kmd memindahkan elektron melalui fotosintesis I &
II u/ membuat ATP dan NADPH

- Fotosintesis bakteri hijau & biru berbeda dg

eukariot & cyanobacteria dlm memproses
bakterioklorofil & tdk ada fotositem II ➔ tdk
menggunakan jalur non siklik u/ membtk NADPH
dan O2 ➔ anoksigenik
 TRANSPORT ELEKTRON DAN
POSFORILASI OKSIDATIF
- Rantai transport elektron ➔ serangkaian
pembawa elektron yang bekerja mentransfer
elektron dari donor (NADH & FADH₂) ke
aseptor (O₂)
- Transport elektron ➔ terjadi pd plasma
membran
- Perbedaan potensial antara O₂ dan NADH ➔
besar ➔ kemungkinan melepaskan energi
- Rantai transport elektron pd bakteri berbeda dg
eukariot

- Pd eukariot ratio P/O u/ NADH ± 3 ➔ u/

FADH2 ± 2 ➔ bakt lbh rendah

- Sintesis ATP bakt ➔ terjd pd bag dlm permukaan

membran plasma

- Penerima elektron umumnya ➔ nitrat - sulfat –

CO2
- Transport elektron melepas energi
- Proses pembentukan ATP dr transport elektron
➔ posforilasi oksidatif
- 1ps elektron dr NADH ke O₂ ➔ ADP +
Pi ➔ 3ATP
- Ratio Posfor/Oksigen = 3
- Elektron dr FADH₂ ke O₂ ➔2ATP
- Ratio Posfor/Oksigen = 2
- Proses posforilasi oksidatif terjadi saat elektron
meloncat ➔ proton bergerak keluar melewati
plasma membran
- Sintesis ATP terjadi saat proton masuk dalam
sel
- Banyak bhn kimia yg menghambat sintesis ATP

- Hambatan terjadi dg bloking transport elektron

atau mengubah aliran elektron

- Anaerobik ➔ tdk ada transport elektron oksidatif

& 2ATP terbtk selama degradasi glukosa ke
piruvat
Masalah
1. Dalam reaksi gelap, unsur apa saja yang
ditambahkan pada siklus Calvin ?
2. Bagaimana aliran elektron yang terjadi selama
fotosintesis ?
3. Apa perbedaan antara fotofosforilasi siklik dan
nonsiklik
4. Jelaskan proses apa yang terjadi dlm kloroplas
dg adanya inhibitor yg menghalangi H+
melewati kompleks ATP sintase ?
5. Dalam persamaan fotosintesis tidak termasuk
ATP. Mengapa ATP diperlukan ?
6. Dalam metabolisme utamanya katabolisme
mikroba ada berapa tahapan yang harus
dilalui untuk menghasilkan energi. Jelaskan
tahapan-tahapan tersebut dan berapa ATP
yang dihasilkan pada tiap tahapan tsb
7. Jalur pentose posfat berbeda dengan
glikolisis walaupun sama-sama memecah
glukosa. Apa perbedaannya, apa yang spesifik
dari jalur ini ?
8.Tidak semua bakteri menggunakan jalur
Entner Doudoroff dalam memecah glukosa.
Tetapi bakteri patogen (P. aeruginosa dan
Enterococcus faecalis ) menggunqakannya.
Dapatkah sdr mengidentifikasi hadirnya
komponen organik yg spesifik pada jalur
tersebut ?
9. Glikolisis juga diketahui sbg jalur Embden
Meyerhof. Berapa banyak as piruvat dihasilkan
dalam memecah1 glukosa ? Apa saja yang
dihasilkan dari jalur ini dan brp banyak ?
10. Cyanida adalah racun yang melakukan
bloking pada cytochrom a3. Apa efek yang
terjadi pada rantai transport elektron ?
11. Kita tahu bhw 2 jalur yang membentuk ATP
via chemiosmosis ialah photoposforilasi dan
posforilasi oksidatif. Mengapa posforilasi
aksidatif tidak melalui siklus ?