BIOMOLÉCULAS Métodos de análisis de proteínas • Las proteínas se pueden separar en base a su solubilidad, tamaño, carga, capacidad de unión.
• Para esto se pueden usar una serie de técnicas, entre
las siguientes: – In vivo: Anticuerpos monoclonales – Físicos: Cristalografía de rayos X, Resonancia magnética nuclear (NMR), electroforesis, etc. Purificación de proteínas
• “Nunca desperdicies un pensamientos puros en una
proteína impura”.
• ¿Cómo separar las proteínas del material de
estudio? – Bibliografía – Ensayo-error • Como obtener las proteínas? – Squash? – Licuadora? – Centrifuga? – Estufa? • Luego de obtener el precipitado se somete a diferentes separaciones basadas en diferentes propiedades. • En cada paso se ensaya la actividad proteica deseada y se determina su concentración TÉCNICAS DE PURIFICACION • PRECIPITACIÓN SALINA – La mayoría de proteínas son menos solubles a concentraciones altas de sal. – Sales utilizadas: Sulfato amónico SO4(NH4)2 – Ejemplos: SO4(NH4)2 0.8M para precipitar Fibrinógeno SO4(NH4)2 2.4M para precipitar Albumina del suero. • DIÁLISIS TÉCNICAS DE PURIFICACION • CROMATOGRAFÍA DE FILTRACIÓN EN GEL Se usan columnas rellenas de polímeros insolubles, como pueden ser: Carbohidratos: Dextrano, Agarosa. Comerciales: Poliacrilamida, Sephadex, Sepharosa, Biogel. Tamaño: 0.1mm TÉCNICAS DE PURIFICACION • CROMATOGRAFÍA DE INTERCAMBIO IÓNICO • Se basa en la carga neta de la proteína y el uso de grupos carboxilato (COO-) • Las proteínas cargadas positivamente se pueden separa en columnas de CM- celulosa cargadas negativamente. Se usa DEAE- celulosa cargada positivamente para el caso contrario. TÉCNICAS DE PURIFICACION • CROMATOGRAFÍA DE AFINIDAD • Esta técnica se basa en interacciones bioespecíficas gracias a las cuales la columna de cromatografía de afinidad absorbe únicamente de la muestra los componentes que presentan afinidad con los ligandos acoplados al soporte cromatográfico. • Ejemplo: Para aislar factores de trascripción, proteínas que regulan la expresión génica mediante la unión a secuencias de ADN TÉCNICAS DE PURIFICACION • CROMATOGRAFÍA LIQUIDA DE ALTA EFICIENCIA (HPLC) • En la cromatografía líquida, la fase móvil es un líquido que fluye a través de una columna que contiene a la fase fija. La separación cromatográfica en HPLC es el resultado de las interacciones específicas entre las moléculas de la muestra en ambas fases, móvil y estacionaria. • La HPLC es capaz de separar macromoléculas y especies iónicas, productos naturales lábiles, materiales poliméricos y una gran variedad de otros grupos polifuncionales de alto peso molecular. TÉCNICAS DE PURIFICACION TÉCNICAS DE PURIFICACION • ELECTROFORESIS TÉCNICAS DE PURIFICACION • ISOELECTROENFOQUE • Punto isoeléctrico (pl) de una proteína es el pH en el que su carga neta es cero. • Cada proteína se desplazará hasta que alcance una posición en el gel en el que el pH es igual al pl TÉCNICAS DE PURIFICACION • ELECTROFORESIS BIDIMENSIONAL TÉCNICAS DE PURIFICACION A nivel de proteínas se estudia o se busca medir lo sgte: PROTEINA TOTAL: La cantidad de proteína presente en una fracción se obtiene determinando la concentración de proteína en una alícuota de cada fracción y multiplicándola por el volumen total de la fracción.
ACTIVIDAD TOTAL: La actividad enzimática de la fracción se
obtiene midiendo la actividad enzimática en una alícuota de cada fracción y multiplicándola por el volumen total de la fracción.
ACTIVIDAD ESPECIFICA: Este parámetro se obtiene
dividiendo la actividad total por la proteína total. TÉCNICAS DE PURIFICACION RENDIMIENTO: Este parámetro es una medida de la actividad existente después de cada paso de purificación expresada como porcentaje de la actividad del extracto crudo. la actividad del extracto inicial se toma como el 100%
GRADO DE PURIFICACION: este parámetro mide el
incremento en pureza y se obtiene dividiendo la actividad especifica, calculada después de cada paso de purificación, por la actividad especifica del extracto inicial. TÉCNICAS DE PURIFICACION ultra centrifugación
CENTRIFUGACIÓN: masa, densidad, formas de
moléculas, investigar interacciones moleculares. para deducir estas propiedades a partir de los datos de centrifugación, necesitamos una descripción matemática de como se comporta una partícula en una fuerza centrifuga.
Velocidad de movimiento: se realiza calculando el coef. de
sedimentación s. TÉCNICAS DE PURIFICACION TÉCNICAS DE PURIFICACION Los coeficientes de sedimentación se expresan normalmente en unidades Svedber (S), equivalentes a 10−13 s
Cuanto menor sea el valor S, la molécula se moverá mas
lentamente por la fuerza centrifuga. TÉCNICAS DE PURIFICACION Hay diferentes tipos de centrífugas según el rango de velocidades de giro:
A. Centrífugas de baja velocidad, de sobremesa o clínicas. De pequeño
tamaño y sin refrigeración. Alcanzan una velocidad máxima de 5000 rpm. Útiles para la separación de partículas grandes como células o precipitados de sales insolubles. Las centrífugas micrófugas son una variante de las anteriores que permiten llegar a velocidades de más de 10.000 rpm, siendo los volúmenes de trabajo muy pequeños. Son útiles en el campo de la biología molecular. B. Centrífugas de alta velocidad. Alcanzan velocidades de entre 18.000 y 25.000 rpm. Son refrigeradas y algunas tienen sistema de vacío para evitar el calentamiento del rotor a causa del rozamiento con el aire. Son útiles en la separación de fracciones celulares, pero insuficientes para la separación de ribosomas, virus o macromoléculas en general. C. Ultracentrífugas. Superan las 50.000 rpm, por lo que tienen sistemas auxiliares de refrigeración i de alto vacío. Hay ultracentrífugas analíticas que permiten la obtención de datos precisos de propiedades de sedimentación (coeficientes de sedimentación, pesos moleculares), y preparativas, útiles para aislar partículas de bajo coeficiente de sedimentación (microsomas, virus, macromoléculas).
ENSAYOS DE RECONOCIMIENTO Las Saponinas Esteroides Se Pueden Reconocer Fácilmente en Los Análisis Fitoquímicos Preliminares Mediante Los Ensayos de La Espuma