Dr.

MIGUEL ZALDÍVAR ARIAS

Profesor Principal
Facultad de Medicina
UNFV
 PROTEÍNAS
 Moléculas operadoras que llevan adelante el
programa de actividades codificado por los
genes.
 Representa el 10 a 20 % de la composición
química celular. El proteoma en humanos
(catálogo general de proteínas) es de
aproximadamente 32000, cinco veces más que
la levadura. (Biol.Cel. y Mol. Lodish, Berk. 5ta ed)
 Sus actividades derivan de la estructura
tridimensional, la cual depende directamente de
la secuencia de aminoácidos.
FUNCIONES DE LAS PROTEÍNAS
•Catalizadora: enzimas (aumentan la velocidad de
una reacción química).

•Estructural: queratina de la piel, las fibras de

colágeno en los tejidos de sostén (conjuntivo).

•Contráctiles: actina y miosina (contracción

muscular), movimientos de cilios y flagelos.

•Transportadora: hemoglobina, albúmina sérica

transferrina, transporte a través de membrana
(proteína glut).
 Defensa: anticuerpos, interferón, endonucleasas de
restricción

 Función reguladora: proteínas que se unen al ADN

(factores de transcripción).

 Transducción de señales: un receptor hormonal

(proteína) convierte una señal química (hormona) en
una serie de cambios en las funciones de la célula.

 Hormonal: insulina , hormona del crecimiento.

FUNCIONES DE LAS PROTEINAS
CLASIFICACIÓN DE PROTEÍNAS
SIMPLES:
Contienen solamente aminoácidos: albúminas,
globulinas, escleroproteínas (colágeno,
queratina), protaminas (muy pequeñas pm 5000,
ricas en arginina), prolaminas (en cereales,
responsables de la enfermedad celíaca).

CONJUGADAS:
Además de aminoácidos posee un grupo
orgánico o inorgánico (grupo prostético).
apoproteína + grupo prostético = holoproteína
Ej. Metaloproteína, glucoproteína, lipoproteína,
nucleoproteína.
 PROTEÍNAS CONJUGADAS
 Superóxido dismutasa Citocromo P450

 Citocromo c oxidasa
 POR SU FORMA
Proteína globular: albúmina, globulinas. Solubles
en agua. Fibrosas: queratina, colágeno, elastina.
POR SU VALOR NUTRICIONAL
Completas: Contienen todos los aa esenciales:
caseina de la leche.
Incompletas: Carecen de un aa esencial. En
legumbres falta metionina y en cereales lisina.
Pobres: carecen de varios aa esenciales. La zeina
del maíz carece de triptófano y lisina.
 AMINOÁCIDO: unidad proteíca
 Posee grupo amino y carboxilo unidos al carbono
asimétrico (α), al cual también se une el grupo R
(cadena lateral) y un H.
 Hay una variedad de 20 aa codificados en el ARNm,
identificados por el grupo R.
 Son dextrorotatorio, debido al C asimétrico
 Todos son de la forma L, comparable con el L
gliceraldehido.
 AMINOÁCIDOS 21 Y 22
 SELENOCISTEINA (SeCis ; SeC)
En lugar del grupo –SH contiene selenio (-
SeH). La mayoría de las selenoproteinas
poseen actividad enzimática con este aa
en el centro activo. En eucariotes tienen
función antioxidante y anabólica.

PIRROLISINA (PyL)
Lisina unida mediante un enlace amida a la
pirrolidina.
Está presente en la metiltransferasa de
ciertas bacteria arqueas metanógenas.
La SeC como la PyL responden a codones
que normalmente funcionan como
señales de terminación.
 :
CLASIFICACIÓN DE AMINOÁCIDOS
según el resto molecular (R)
Alifáticos: glicina, alanina, valina, leucina,
isoleucina.
Hidroxiaminoácidos: serina y treonina.
Dicarboxílicos y sus aminas: ácido áspartico y
asparagina, ácido glutámico y glutamina.
Aminoácidos con función básica : lisina, arginina,
histidina.
Aromáticos: fenilalanina, tirosina, triptófano
Azufrados: cisteina, metionina.
Iminoácidos: prolina, que está N-sustituido por su
propia cadena lateral (anillo pirrolidínico)
 AMINOÁCIDOS (Continuación)
 Aminoácidos (aa) polares se localizan en la
superficie de la proteína favoreciendo la solubilidad .
 La histidina a pH 5,8 tiene carga (+) a pH 7,8 es
neutro.
 Asparagina y glutamina poseen un resto amido que
posibilita enlaces de H, lo mismo que serina y
treonina por su grupo hidroxilo (-OH)
 La cisteina contiene grupo sulfhidrilo (–SH) que al
oxidarse forma enlace disulfuro (-S-S-)
 La glicina ( R=H) se inserta en espacios pequeños.
 La prolina conjuntamente con glicina permite un giro
o doblez rígido en una cadena proteica.
 Aminoácidos esenciales
 Aquellos que nuestro organismo no puede
sintetizarlos: arginina, histidina, isoleucina, leucina,
lisina, metionina, fenilalanina, treonina, triptófano,
valina.
 La hist es no esencial, pero en recién nacidos no ha
madurado su capacidad de síntesis. Arg es esencial
en niños muy pequeños.
 Los vegetarianos pueden tener dificultad para obtener
algunos de estos aa. Cereales: pobres en lis y treo
(aa limitantes) pero ricos en met y tript, lo contrario
sucede en legumbres.
Aminoácidos proteicos modificados
 En la proteína sintetizada los aa
pueden ser modificados:
 Hidroxilación: 4-hidroxiprolina,
5-hidroxilisina (colágeno).

 Carboxilación: gamma
carboxiglutámico.
 Adición de iodo: en la
tiroglobulina, la tirosina sufre
reacciones de iodación
(monoiodotirosina,
diiodotirosina, triiodotirosina)
 Fosforilación: las quinasas
permiten la fosforilación de aa
(serina, tirosina) de una proteína
modificando su actividad. Ej la
glucógeno fosforilasa

 Glicosilación: Mediante enlace O-

glucosídico un oligosacárido se
une a la serina de una proteína.
(glucoproteína).

 Condensación: la cistina resulta

de la unión de dos cisteina (puente
disulfuro).

(depa.fquim.unam.mex)
 Aminoácidos no Proteicos
 B alanina(W-aa) , componente del ác. Pantoténico
 Acido gamma aminobutírico (GABA)
 Ornitina y citrulina (ciclo de la urea)
 Histamina, serotonina, epinefrina o adrenalina
(derivado de la tirosina)
 Penicilamina
 Hormonas tiroideas (T3 y T4)
 Serotonina

 Adrenalina
 COMPOSICIÓN ÁCIDO BÁSICO
DE LOS AMINOÁCIDOS
 Son compuestos anfóteros.
 Tanto el grupo amino como el grupo carboxilo se
encuentran ionizados en solución neutra : ión
dipolar (Zwiterion).
 Ión dipolar o zwiterion


 EFECTO TAMPÓN DE LOS
AMINOÁCIDOS
 Este efecto se explica por la capacidad de disociación
del grupo -COOH, -NH2 y grupos ionizables de sus
cadenas laterales (carboxilo, amino, imidazol, guanidino).

 Los grupos ácido-base débiles presentan una capacidad

tamponada máxima en la zona próxima al pKa.
 El único grupo lateral con un pKa próximo al pH
fisiológico es la histidina (pK 6,1), por lo tanto efectivo
como amortiguador. Lo que explica el efecto tampón de
la Hb
 PUNTO ISOELÉCTRICO (pI)
Se define como aquel ph donde no hay carga
eléctrica neta. Se calcula como la semisuma de los
pK ( Pk COOH y pK NH3 ). El pK es aquel pH donde la
[COOH] = [COO] o también la [NH3] = [NH2]

En la glicina:
pK1 (2,34) + pK2 (9,60)/2 = 5,97

En los dicarboxílicos y básicos, es la semisuma del

pk del grupo de la cadena lateral y el pk del grupo
alfa con valor más próximo a este pK del grupo
lateral.
pI de la Glicina
 pK en monoaminodicarboxilo y
diaminomonocarboxilo
 pk1 pk2 pkR

 Ac. Aspártico 2,09 9,82 3,86

 Ac. Glutámico 2,19 9,67 4,20

 Lisina 2,18 8,95 10,53

 Si a la solución del pI se le agrega HCl , a un pH
particular el 50% de las moléculas se encuentran en
forma de catión y 50% en forma de zwiterion; este
pH es el pK1, con respecto del –COOH.

 Si se agrega NaOH, a un pH particular el 50% se

encuentran en forma de anión y el resto es
zwiterion, este pH es el pK2 con respecto al NH3.

 A pH fisiológico de 7,4 tanto el –COOH como el

-NH3 están completamente ionizados.
 pI (continuación)
 En los aa con resto neutro el pI es cercano al pH
fisiológico, pero no cristalizan por la distribución
ordenadas de cargas comportándose como
dipolos.

 La cistina (pI 5,0) origina cristales por lo que

forman parte de cálculos renales.
Tratamiento: alcalinizar la orina y
penicilamina que forma un
complejo soluble (quelación)
 pI EN PROTEÍNAS

REACCIONES QUÍMICAS DE LOS
AMINOACIDOS
Ninhidrina (hidrato de tricetohidindreno)
Ninh.+ aa Hidridantina+RCHO+NH3+C02

Hidridantina+NH3 + Ninhidrina Complejo coloreado (Azul,540nm)

Reactivo de Sanger (Fluordinitrobenceno)

FDB + NH2-R FDD + HF
FDD :

Derivado de color amarillo, separado por cromatografía y

determinado cuantitativamente por espectrofotometría.
Es resistente a la hidrólisis ácida.
ACCIÓN DE LA NINHIDRINA
 Reacciones químicas
Reactivo de Edman (Fenilisotiocianato)
Reacciona con los aa originando ácido
feniltiohidantoico, luego se produce la ciclación de este
ácido originándose la feniltiohidantoina que es
separado e identificado por cromatografía.
Reacciones de los Grupos R
El grupo tiol (-SH ) de la cisteina (ácido débil) con traza
de iones metálicos forma mercáptidos.
R-SH + Ag R-SAg
R-SH + Hg R-SHg

Los iones metálicos inactivan enzimas en cuyo centro

activo tienen grupo sulfhidrilo.
Reacciones de los grupos R (2 )
•El grupo tiol (-SH) se oxida con facilidad, las sales de Fe
favorecen la reacción, los puentes disulfuros formados
ayudan a mantener la estructura terciaria de la proteína
R-SH + HS-R R-S-S-R (cistina)
Transmetilación: donación de –CH3 de la metionina a un
aceptor (ac. Ncleico, proteína, lípido)
Metionina + aceptor ----> aceptor metilado + homocisteina
Formación de ésteres por el grupo –OH de serina, con
ác. fosfórico o también enlace O-glucosídico con CHO
(glicoproteínas)
 Enlace peptídico
 La reacción es entre el grupo
carboxilo de un aa y el grupo
amino del otro aa, liberándose
una molécula de agua.
PÉPTIDOS (Continuación)
La cadena peptídica se lee del extremo amino (N-
terminal) al extremo carboxil (C-terminal): N---------C

Los aa se señalan como residuos y se indican las 3

primeras letras:
Ejemplo: Ala-Val-Ser-Gli

El oligopéptido tiene hasta 10 aa y los polipéptidos

un mayor número.

La proteína contiene más de 80 aa.

Formación de enlace peptídico
 Funciones de los Péptidos
 Antibióticos: Gramicidina, valinomicina, son
péptidos cíclicos. La valinomicina es un ionóforo,
transporta K.
 Hormonas: Oxcitocina (provoca contracción del
útero), HAD, insulina.
 Funciones de los péptidos
 Neurotrasmisores: encefalinas (pentapéptido),
endorfinas (31 aa).
 Agentes vasoactivos. Agente hipertensor:
angiotensina II (octapéptido); Agente hipotensor con
actividad vasodilatadora: bradiquinina (nonapéptido)
proviene de la hidrólisis de la proteína quininógeno.

 Antioxidante: glutation (Glu-Cis-Gli)

GSH GSSG (glutatión reducido)
Enzima: glutation reductasa
Síntesis del glutation
Estructura primaria de la proteína
 Corresponde al número y secuencia de aminoácidos
que tiene una proteína, controlado directamente por
los genes a través del ARNm , según el dogma
central de la biología:
ADN ARNm Proteína

Determina los niveles superiores de organización.

El número de aa varía entre 80 a 300.
 Determinación de la secuencia de
Aminoácidos (estructura primaria)
Identificación de los restos NH2 terminales.
- Aminopeptidasa
- Reactivo de Sanger (Fluordinitrobenceno)
- Reactivo de Edman (Fenilisotiocianato)
Utilización de la hidracina (NH2 NH2): reaccionan
con el C carbonilo de cada resto formando
derivados, a excepción del último, que de esta
manera es identificado.
Identificación del extremo carboxilo:
carboxipeptidasa.
 Fragmentación de péptidos
Tripsina: Corta lado carbonilo de lisina y arginina.
Quimotripsina: Lado carbonilo de AA aromáticos.

Pepsina: Lado amino de aromáticos y ácidos.

Bromuro de cianógeno: Lado carbonilo de
metionina.
Hidroxilamina: Lado carbonilo de asparagina y
glicina.
Proteasa estafilocósica: Lado carbonilo de ácido
aspártico y glutámico.
 Características del enlace peptídico
Unidad planar rígida . El O y el
H tienen posición trans.

El enlace (1,32 Aº) no tiene

libre rotación, en un momento
tiene el carácter de doble enlace
(estabilización por resonancia).

El ángulo psi (Ψ ):rotación del

enlace carbono alfa-carbono.

El ánglulo fi (Φ) : Rotación del

enlace N- carbono.
Rotación en los ángulos
 La rotación en los ángulos psi (Ψ) y fi (Φ) son
importantes para la determinación de estructuras
secundarias del polipéptido.

 Se considera como estructuras periódicas:

α helix, Hoja β o plegada (estructuras secundarias) y
hélice del colágeno.

 Hay configuración no secundaria (ni alfa ni beta) o

regiones de estructuras al “azar” (random coil).
Estructura secundaria. Hélice α
Rotación hacia la derecha del polipéptido.
Las cadenas laterales se orientan al exterior.
Se considera 3,6 aa por cada vuelta
completa.
que representa una distancia de 0,54nm.
Cada 4 aa hay un acercamiento de enlaces
peptídicos y se establecen puentes de H.
No es estable con aa polares o restos muy
grandes.
La prolina interrumpe la estructura ya que
su Cα no tiene libertad de giro, interfiriendo
en la formación de puentes de H.
HELICE α (α HÉLIX)
Estructura secundaria: Hoja Plegada
(Hoja β)
La cadena se estira al máximo; forma de Zig-Zag en el
sentido paralelo o antiparalelo (lo más común)
Se mantiene por puentes de H intercadena. Típica de
proteínas fibrosas , también aparece en proteínas
globulares.
Las cadenas laterales se sitúan alternativamente hacia
arriba y hacia abajo.
Pierde estabilidad con los aa
polares o de restos muy grandes.
Los iminoácidos no permiten
esta estructura.
HOJA PLEGADA
Alfa queratina en piel, cabello y uña
Hélice del Colágeno
Proteína fibrosa del tejido conectivo.
Contiene glicina (33%), prolina (10%), cada 3
residuos hay glicina: Gli-Pro-X
El tropocolágeno contiene 3 polipéptidos que
se pliegan en forma de hélice retorcida debido
a la rigidez de la prolina.
Hay puentes de H entre las cadenas.
Hay enlaces covalentes entre las moléculas del
tropocolágeno para formar el colágeno.
ESTRUCTURA DEL COLÁGENO
 Distribución del Colágeno
 El colágeno tiene amplia distribución en el
organismo: hígado (4%), pulmón (10%), aorta (12 a
24%), cartílago (50%), córnea 64%), hueso cortical
(23%), piel (74%).

 La anormalidad en su síntesis o estructura produce

aneurisma aórtico, propensión a fracturas, artritis,
síndrome de Ehlers-Danlos, osteogénesis
imperfecta, escorbuto.
Síndrome de Ehlers-Danlos
Osteogénesis imperfecta
ARTRITIS REUMATOIDE
Esclerodermia
Lupus eritematoso
Estructura Supersecundaria
 Se encuentra en la estructura terciaria y se conocen
como motivos estructurales. Se les ha reconocido en
proteínas de unión al ADN, como por ejemplo:
- Hélice giro hélice
- Cremallera de leucina
- Dedos de Zn
- Mano E-F
 Hélice-giro-hélice. En proteínas que interactúan
con ADN
 Cremallera de leucina.
Dos helice α y que interaccionan
mediante cadenas laterales de
Leucina.
También en proteínas que
interactúan con ADN
 Dedos de Zn: Presentes en proteínas de unión
al DNA. Ayudan a regular la transcripción. Un ión
Zn se mantiene entre un par de hebras beta y
una hélice alfa mediante un par de residuos de
cisteina e histidina.
 MANO E-F
 2 Hélice α conectadas con un giro.Es un motivo de
unión del ión Ca, hay ciertos restos hidrófilos en
posiciones invariables en el bucle. Se ha encontrado
en calmodulina y troponina C.
Estructura terciaria
Aspecto globular. Plegamiento completo del
polipéptido.
Contiene porciones de alfa hélix, hoja beta y
arrollamiento al azar.
Hay zonas de plegamiento
con entidad propia: dominio.
Se mantiene principalmente
por enlaces débiles; así
como enlace covalente
(puente disulfuro)
Dominios estructurales
 Las proteínas de Pm mayores a 15000 está
subdividida en regiones o dominios.
 Un dominio es un polipéptido plegado en forma
compacta.
 Los dominios están conectados por intermediarios
de la cadena polipeptídica.
Calmodulina: dominio a unión a calcio
ESTRUCTURA TERCIARIA
Información para el plegamiento de la
proteína
 Es evidente que la secuencia de aa o estructura
primaria, contiene suficiente información para dirigir
su plegamiento completo.

 El plegamiento adecuado permite a la proteína

realizar su actividad.
“Plegamiento erróneo” y enfermedad
 La evidencia reciente sugiere que un error en el
plegamiento, debido a mutación o modificación
postraduccionales, conduce a una pérdida de
actividad y ser sensibles a la degradación
proteolítica.
 La acumulación de fragmentos explica la
aparición de placas proteicas en enfermedades
degenerativas: Alzheimer, Parkinson, encefalitis
espongiforme.
 Enfermedad de Alzheimer
 Mutación en el gen que codifica la proteína amiloide
(cromosoma 21) explica la formación de placas
insolubles compuestas de proteína amiloide (cùmulo
de filamentos).

 Mutación en gen que codifica la proteína Tau

(cromosoma 17) provoca una fosforilación
irreversible que facilita la autoagregación formando
ovillos neurofibrilares.
ALZHEIMER
Estructura Cuaternaria
Se le conoce como oligómero y a
sus unidades protómeros.
En la interacción proteína-
proteína predominan enlaces
débiles.
Ejemplos:
-Hemoglobina (4 polipéptidos)
- Aspartato transcarbamilasa
(12 polipéptidos).
-Piruvato deshidrogenasa ( 60
polipéptidos).
-La cápside de los virus.
 En proteínas con estructura terciaria de tipo
fibroso, la estructura cuaternaria resulta de la
asociación de varias hebras para formar una
fibra. La miosina consta de 2 hebras hélice α
arrollada en una fibra levógira.

 La α queratina del cabello y el fibrinógeno de la

sangre presenta 3 hebras en cada fibra levógira.

 El colágeno con 3 hebras helicoidales levógiras

que forman una fibra dextrógira.
Mioglobina
Proteína transportadora de oxígeno, a
nivel muscular.
Aspecto globular, el polipéptido
contiene 153 AA. Tiene 8 segmentos
helicoidales (A H), las regiones
interhelicoidales se designan AB, BC,
etc.
Mayormente la superficie es
hidrofílica para impedir la asociación
con otra molécula.
MIOGLOBINA
 HEMO
Anillo tetrapirrólico.
Cuatro enlaces unen el
Fe2+ a la porfirina, el quinto
enlace con la histidina
proximal (F8) y el sexto
para el O2
El O2 se encuentra entre el
Fe2+ y un segundo imidazol
(histidina distal, E7 ).
 Hemoglobina
Proteína cuaternaria ( 2 
2), trasporta O 2.
La cadena  con 141 aa y 7
segmentos helicoidales.La
 146 aa y 8 segm.
Helicoidales.
El hemo se une al igual que
en la Hb.
Hay 80 interacciones entre
15 aa y el hemo.
Las cuatro cadenas están
unidas por puentes salinos.
Estructura de la Hemoglobina
His proximal

His distal
Fijación del O2 a la Mioglobina
Las propiedades de una
proteína fijadora de O2 se
caracteriza usando una curva
de saturación:
y = Número de centros de
fijación ocupados / número
total de centros de fijación
en solución.
La curva de saturación del O2
es una hipérbole.
El p50 =1, lo que demuestra
gran afinidad.
Fijación del O2 a la Hb
La Hb fija cuatro moléculas de O2 por un proceso
cooperativo.
La curva de saturación del O2 es sigmoide.
La curva sigmoide indica cooperatividad en la
asociación del O2
El p50 = 27 mmHg (3,60 kPa).
De acuerdo a la gráfica de Hill, la pendiente o
coeficiente de Hill (n) es igual a 2,8 (en la Mb n = 1).
 CENTROS
OCUPADOS
Mb

Hb

SATURACIÓN
()

CENTROS
VACÍOS

PRESIÓN PARCIAL DE O2
Coeficiente de Hill
 Mecanismo molecular de la
cooperatividad del O2
En la HbO2 el Fe se mueve hacia el plano de la
porfirina en 0,75 Å.
Hay cambio en la estructura terciaria que
desestabiliza la cuaternaria.

La desoxihemoglobina es una molécula compacta.

El O2 se fija al romperse algunos puentes salinos.
La desoxihemoglobina tiene conformación tensa
(T).
La oxihemoglobina tiene conformación relajada
(R).
Estado T

Estado R
Hemo en la desoxihemoglobina
Hemo en la oxihemoglobina
Movimientos de Hystidina y Hem
Comportamiento alostérico
Hay efectores que tienen influencia en su
actividad.
El pH, CO2 y DPG (BPG) disminuye la afinidad
por el O2.
Efecto Bohr: el H+ y CO2 promueve la
liberación de O2 .
Importancia: Los tejidos metabólicamente
activos requieren constantemente de O2.
Comportamiento alostérico de la Hb
LA ACIDEZ ESTIMULA LA LIBERACIÓN DE O2
BPG
EL BPG DISMINUYE 26 VECES LA AFINIDAD POR EL O2
EL EFECTO BOHR
HEMOGLOBINOPATIAS
 Hb glucosilada. Hay una glucosa unida a valina
terminal en cadena beta. En diabéticos la cantidad
es mayor.
 Hb S, anemia falciforme o drepanocítica. La valina
reemplaza al glutamato en B6.
 Hb C, anemia hemolítica. La lisina reemplaza al
glutamato en B6.
 HbM, meta Hb. La tirosina reemplaza a la Histidina
F8: el Fe2+ pasa a Fe3 + y el O2 no se puede unir.
 Talasemia. Defecto en algunas de las subunidades
de la Hb. ( alfa talasemia y beta talasemia). Se
produce anemia y en ocasiones hemólisis
(Talasemia mayor).
Hemoglobina glucosilada (Hb A1c)
La Hb S interacciona entre sí
generando una agregación de
proteínas intraeritrocitarias a través
de la formación de fibrillas.

La formación de estas fibrillas

provoca la atracción anormal de
los eritrocitos lo que conlleva a
insuficiencia en el transporte de O2
Hemoglobina S