conceptos básicos: clasificación ,nomenclatura e identificación. La clasificación es el proceso de división sistemática de los organismos en grupos; la especie es el nivel de división mínimo y el más definitivo. La clasificación también se refiere al agrupamiento de las especies descritas en géneros mediante familias, órdenes, clases y filos. Denominación de las bacterias: las prioridades y las reglas para la denominación de una bacteria se establecieron en principio el 1° de mayo de 1953; el 1° de enero de 1980 se publicó la primera “Lista aprobada de nombres bacterianos” en el International Journal of Systematic Bacteriology (IJSB). Las ediciones trimestrales del IJSB (ahora llamado International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, IJSEM)difunden listas con los nombres de las nuevas especies (listas de validación) Al comienzo del nuevo milenio han aparecido 4,314 nombres de especies procariontes en la “Lista aprobada de nombres bacterianos”de IJSEM o en las Listas de validación de IJSEM. Cualquier investigador puede proponer designaciones de nuevas especies debiendo indicar la descripción detallada de las características genéticas, bioquímicas y morfológicas del microorganismo y la designación de un cultivo vivo como la cepa de referencia. La cepa de referencia se deposita en las colecciones de cultivos de referencia ( p. ej. La American Type Culture Collection ATCC y la National Type Culture Collection NTCC) así las muevas especies estarán disponibles para otros investigadores. Identificación fenotípica de las bacterias: los métodos para la caracterización de microorganismos incluyen los siguientes: Morfología celular: tamaño y forma Características de tinción: tinción de Gram y ácido-alcohol resistente. Movilidad: preparación húmeda o medios de movilidad semisólidos. Presencia o ausencia de esporas Características de crecimiento: rapidez, morfología de las colonias, condiciones atmosféricas, temperatura óptima, morfología de las colonias en medios diferenciales y selectivos. Características bioquímicas: se refieren a la formación de distintos productos finales de sustratos conocidos, la producción de ácido a partir de varios hidratos de carbono y la presencia de ciertas enzimas bacterianas. Pruebas serológicas: detección de antígenos mediante inmunoanálisis enzimáticos o fluorescentes, serotipificación de antígenos flagelares y somáticos mediante antisueros específicos de grupo y tipo. Análisis de los productos finales metabólicos o de componentes estructurales del microorganismo. Análisis de genética molecular: técnicas de amplificación (reacción en cadena de la polimerasa) Las especies están asignadas a los géneros definidos morfológica y bioquímicamente que a su vez están asignados a familias, cada una de las cuales también tiene características morfológicas, fisiológicas y bioquímicas determinadas. Criterios filogenéticos para la clasificación de las bacterias: dado que la secuencia de nucleótidos de DNA es única para especies individuales de microorganismos, el análisis del parentesco de los ácidos nucleicos microbianos fue reconocido como una posible herramienta para descifrar la taxonomía y la nomenclatura bacterianas. Mediante la hibridación DNA-DNA, una especie bacteriana puede definirse como un grupo de bacterias que muestran un parentesco de DNA mayor del 70-75% con 5% o menos de divergencia en las secuencias de nucleótidos. Mediante el análisis de secuencias de nucleótidos del r RNA se pudieron determinar las relaciones filogenéticas y la evolución de diversos organismos a partir de tipos antecesores comunes. Las cepas de la misma especie por lo general muestran similitudes mayores del 97% en las secuencias del r RNA. Los microorganismos del dominio Eubacteria se dividen en 23 divisiones o filos. La mayoría de estos filos se componen de especies medioambientales. Los patógenos humanos se distribuyen en siete filos diferentes. La mayoría de bacterias gramnegativas de importancia clínica pertenecen al filo Proteobacteria, que está dividido en cinco clases, designadas alfa, beta, gamma, delta y épsilon Proteobacteria. Incluyen bacterias de importancia clínica los siguientes: Filo Firmicutes: clostridios, micoplasmas, Bacillus, estafilococos Filo Actinobacteria: actinomicetos, cocos grampositivos y bacilos grampositivos facultativos. Filo Chlamydiae: clamidias Filo Spirochaetes: Treponema y Leptospira Filo Bacteroidetes: Bacteroides Filo Fusobacteria: Streptobacillus