Introducción a la microbiología clínica

Patógenos principales
Clasificación de bacterias de importancia médica
Microbioma de la piel, del tracto respiratorio,
intestinal y genitourinario

Dra. Gloria Levicán

Dr. (c) Gerardo Retamal
 Definiciones según su patogenicidad
• Patógeno: m.o. que causa una enfermedad infecciosa (estricto o no)

• Saprófito: m.o. que no produce enfermedad

• Patógeno oportunista: m.o. que están presentes en la flora normal,

pero frente al cambio en la proporción de m.o., infectan provocando
enfermedad

• Patógeno facultativo: m.o. que produce la infección si se traslada a un

sitio específico (ej. E. coli en infecciones urinarias)

• Patogenicidad: capacidad de un patógeno de producir daño al

hospedero

• Virulencia: es un término cuantitativo para indicar el grado de

patogenicidad
 Definiciones según su ubicación

• Microorganismo transiente: llegan al

lugar, pero son incapaces de multiplicarse y
mueren

• Microorganismos residentes: son capaces

de multiplicarse en el lugar
 Infección  Enfermedad

¿Por qué?

Infección Enfermedad
Proceso en el cual organismos Infección que produce síntomas en
patógenos que se establecen en el el hospedero
cuerpo de un hospedero
¿Dónde se encuentran los MO?
 ¿Dónde se encuentran los MO?

Underhill & Iliev, 2014 6

Flora normal o Microbiota
BACTERIUM Skin Conjunctiva Nose Pharynx Mouth Lower Intestine Anterior urethra Vagina
Staphylococcus epidermidis (1) ++ + ++ + ++ + ++ ++
Staphylococcus aureus* (2) + +/- + + + ++ +/- +
Streptococcus mitis - - - + ++ +/- + +
Streptococcus salivarius ++ ++ -
Streptococcus mutans* (3) + ++
Enterococcus faecalis* (4) +/- + ++ + +
Streptococcus pneumoniae* (5) +/- +/- + + +/-
Streptococcus pyogenes* (6) +/- +/- + + +/- +
Neisseria sp. (7) + + ++ + + +
Neisseria meningitidis* (8) + ++ + +
Veillonellae sp. + +/-
Enterobacteriaceae* (Escherichia coli) (9) +/- +/- +/- + ++ + +
Proteus sp. +/- + + + + + +
Pseudomonas aeruginosa* (10) +/- +/- + +/-
Haemophilus influenzae* (11) +/- + + +
Bacteroides sp.* + + ++ + +/-
Bifidobacterium bifidum (12) ++
Lactobacillus sp. (13) + ++ ++ ++
Clostridium sp.* (14) +/- ++
Clostridium tetani (15) +/-
Corynebacteria (16) ++ + ++ + + + + +
Mycobacteria + +/- +/- + +
Actinomycetes + +
Spirochetes + ++ ++
Mycoplasmas + + + +/- +
¿Por qué el cuerpo humano es un buen
hábitat microbiano?

• Rico en nutrientes
• Rico en factores de crecimiento
• Crecen bien m.o. Organotróficos
• pH es relativamente constante
• Presión osmótica es m/m constante
• Temperatura es constante
• Diversidad de ambientes
Factores que afectan la Flora comensal
 ¿Dónde NO se encuentran los MO?

• Sangre
• Órganos
• Sistema linfático
• Líquido céfalo raquídeo (LCR)
• Orina
• Tejidos

Si hay presencia de MO en estos sitios, se producirá enfermedad

 Pasos de la infección
1.- Entrada
Dosis infectante
Puerta de entrada
2.- Sobrevivencia
Paso por el estómago, tolerancia a la bilis,
cambios de pH, etc.
3.- Competencia con la flora residente
4.- Adherencia
5.- Colonización

Adherencia Colonización y Producción de toxinas Invasión y Diseminación

 ¿Por qué hay MO en la piel?
• Superficie de la piel es de 2 m2
• La epidermis no favorece el crecimiento de m.o., es muy
seco
• sí favorecen: el cuero cabelludo, cara, oídos, axilas,
región génitourinaria, región anal, palmas, zona
interdigital de los pies
• el sudor es rico en cloruro de
sodio, haciendo el ambiente
hiperosmótico.
• los m.o. están asociados a las
glándulas sudoríparas directa o
indirectamente: tienen alto
número de m.o., son húmedos y
tibios
 Glándulas de la piel

Ecrinas (sudor): Apocrinas (sudor, grasa): Sebáceas:

• No asociadas al • Axilas, regiones • Secreta fluido lubricante
folículo piloso genitales, pezones y • Asociado al folículo
• Distribución irregular ombligo piloso
• Hábitat atractivo para
• Alta densidad en • Se activan en la
m.o. aeróbicos y
palmas, yema de los pubertad
anaeróbicos.
dedos y planta de los • Ambiente húmedo y • rico en nutrientes:
pies tibio • urea
• Escasez de m.o. por el • Olor axilar por • aminoácidos
flujo actividad microbiana • sales
• Si se bloquea el flujo, • La secreción apocrina • ácido láctico
se infecta es inodora, pero lo • lípidos
adquiere si se inocula • pH acídico 4 -
con bacterias 6
 Microbiota de la piel

• Los m.o. de la piel son transientes o residentes

• Staphylococcus coagulasa-negativos
• Difteroides (incluido el Propionibacterium acnes)
• Staphylococcus aureus
• Streptococcus sp. (varias especies)
• Bacillus sp.
• Acinetobacter sp.
• Malassezia furfur (levadura)
• Candida sp.
• Mycobacterium sp. (ocasionalmente)
 Microbiota de la piel
• La mayoría de las bacterias se encuentran en las capas
superficiales de la epidermis y la parte más externa de
los folículos pilosos.
• Micrococos (Streptococcus epidermidis y Micrococcus
spp.) y Corynebacterium asociados a glándulas
sebáceas y sudoríparas
• Bacterias G(-) se localizan en las zonas húmedas
• Las levaduras Pityrosporum ovale y P. orbiculare se
encuentran en el cuero cabelludo
• Considerados como comensales, aunque también se les
ha asignado un rol mutualístico y parasítico
 Interacción de la microbiota y la piel
• Las glándulas sebáceas de la piel secretan lípidos
complejos que son degradados parcialmente por
enzimas de algunas bacterias G(+) (P. acnes),
transformándolos en ác. grasos insaturados, como el ác.
oleico, con una actividad antimicrobiana intensa frente
a bacterias G- y algunos hongos
• Algunos de estos ác. grasos son volátiles y desprenden
un fuerte olor
• Los desodorantes corporales tienen antimi-crobianos
que actúan selectivamente frente a bacterias G+
 Propionibacterium acnes
• Suele ser inocua, pero se relaciona con el acné
común.
En la adolescencia cuando
el sist. endocrino está muy
activo. Aumenta la
secreción sebácea,
ambiente ideal para la
bacteria
 Propionibacterium acnes
La acumulación de sebo desencadena la respuesta
inflamatoria  enrojecimiento, hinchazón del
conducto glandular  comedón (tapón del sebo y
queratina)  lesiones inflamatorias (pápulas,
pústulas, nódulos = puntos negros o espinillas)
Factores que alteran la flora de la piel

• Clima: temperatura, humedad

• Edad: niños tienen flora Gram – en mayor
cantidad que adultos  mayor probabilidad de
patógenos
• Hábitos de higiene

En la piel existen más bacterias Gram + que Gram -, porque están

mejor adaptadas a la sequedad.

Si se eliminan las bacterias Gram + con antibióticos, aparecen las

bacterias Gram -.
 Tejido linfoide asociado a la piel
• Conjunto de células especializadas (SALT: Skin-
associated lymphoid tissues )
• Tiene células presentadoras de antígenos que ayudan
a los linfocitos a producir los anticuerpos y también
producen citokinas que estimulan al sistema inmune,
además de otros efectos
• Tiene keratocitos que componen la mayor parte de la
epidermis, mantienen las condiciones acídicas,
producen citokinas y son capaces de fagocitar y matar
bacterias
• SALT es destruido en caso de quemaduras, en muchos
de esos casos se producen infecciones con
Pseudomonas aeruginosa y Staphylococcus aureus
Defensas de las membranas mucosas
Presentes principlmente en los tactos gastrointestinal,
respiratorio, urogenital

Contienen múltiples tipos celulares:

 Células secretoras
 Células absortivas
 Células productoras de mucus (goblet cells)
 Células M (microfold): presentación de antígenos a
las células que se encuentran más adentro del sistema
inmune
 Células ciliadas: empujan el mucus fuera del área
Defensas de las membranas mucosas

El mucus también contiene componentes no celulares:

 sIgA: inmunoglobulina A secretora

 lisozima
 lactoferrina
 lactoperoxidasa
 capa de mucina
 células unidas por ¨tight junctions¨
 FLORA DE LA CAVIDAD ORAL

Es el hábitat más heterogéneo y complejo del cuerpo

Dientes + lengua + espacio central

 Ambiente de la saliva
– 0,5 % sólidos disueltos
– 50% son inorgánicos:
» Cl-, HCO3-, PO43-, Na+, Ca2+, K+
– 50% son orgánicos:
» proteínas, enzimas salivales, mucoproteínas, proteínas
séricas
– baja concentración de urea, amonio, aminoácidos,
vitaminas
– factores antibacterianos: lisozima, lactoperoxidasa
– pH 5,7 a 7,0
 Ambiente de los dientes
• Dientes:
– matriz mineral de cristales de fosfato (esmalte)
– al interior está la dentina y pulpa, tejidos vivos

• Primer año de vida (sin dientes):

– Anaerobios aerotolerantes (Streptococcus, Lactobacillus)
– Aerobios en bajo número
• Con dientes:
– Aumentan Anaerobios estrictos
– Desarrollo de bacterias especializadas en crecer en
superficie por formación de biofilms
 Ambiente de los dientes
• Los dientes se cubren de una película de glicoproteínas
acídicas de la saliva. Adherencia a esta película es
específica formando una placa:
– Streptococccus sanguis
– S. sobrinus
– S. mutans
– S. mitis
• Después se incorporan:
– Fusobacterium (bacteria filamentosa)
– Espiroquetas como Borrelia
– bacilos G+
– Cocaceas G-
– Actinomyces
 Caries
• Enfermedad infecciosa producida comúnmente por:
• Streptococcus sobrinus, Streptococcus mutans
• Ambas producen ácido láctico
• Tienen alta afinidad por las glicoproteínas acídicas de la saliva
• Producen un dextrano polisacárido, siempre que haya sacarosa
(azúcar de comer)
Microbiota del tracto respiratorio
• Flora residente
– Staphylcoccus
– Streptococcus
– Bacilos difteroide
– Cocáceas G(–)

• En nasofaringe • En la nariz
– S. aureus – S. aureus
– S. Pneumoniae – S. pneumoniae
– S. pyogenes
– C. diphteriae
 Tráquea, bronquios, pulmones

• Esencialmente estériles
• Epitelio ciliado
• Entran partículas de un
diámetro menor a 10 m
a los pulmones
 Ojos

colonizados por:
– Staphylococcus coagulasa (–)
– organismos encontrados en la nasofaringe
como Haemophilus spp, Neisseria spp,
Streptococcus viridans

La acción mecánica del pestañeo y la acción de lavado de las

lágrimas que contienen lisozima, lactoferrina, sIgA, ayudan a
controlar la colonización por MO
 Oído

• Externo:
– Staphylococcus
coagulasa (–)
– Potenciales patógenos
provenientes de la piel
(S. pneumoniae, P.
aeruginosa y
enterobacterias)
 Tracto Gastro-Intestinal

• Ambiente ácido en el estómago

• Enzimas proteolíticas
• Alto contenido en sales biliares en intestino delgado y
grueso
• Flujo rápido en intestino delgado
• En colon el flujo es de baja velocidad, alta densidad
bacteriana, flora residente adquirida en el crecimiento
• Bifidobacterium spp. por alimentación materna
 Estómago
• Baja densidad bacteriana
• Son ácido-tolerantes
• Lactobacillus y Streptococcus se establecen en la
primera semana de vida
• Helicobacter pylori es un patógeno que produce
úlcera gástrica.
• la flora cambia cuando hay tratamiento con
drogas que neutralizan o reducen la producción
de ácidos gástricos
 Intestino delgado
• Duodeno
– levemente ácido, flora similar al estómago

• Íleon
– menos acídico
– mayor número de bacterias
– íleon bajo tiene 105 – 107 bacterias/gramo

• la mayoría de las bacterias son anaerobias

 Intestino grueso
• Es un fermentador
• > 1011 bacterias/gramo
• < 107 baterias/gramo aerobias facultativas
• relación bacterias aerobias:anaerobias =
1 : 1000
• Anaerobios
– bacilos G- con extremos planos  fusiformes
– Clostridium
– Bacteroides
– Lactobacillus
1/3 del peso de las deposiciones son bacterias
 Modificación de la flora intestinal
Alimentación Tratamiento con antibióticos:
• Afecta la composición de la • altera la población
flora intestinal • aumentan organismos
• personas que comen mucha resistentes como Enterococcus,
carne: Pseudomonas, Candida
albicans, Clostridium difficile
– mayor nº de Bacteroides
– menor nº de coliformes
– menor nº de bacterias ácido-
lácticas
 Reacciones metabólicas de la flora intestinal

• Síntesis de vitaminas: tiamina, riboflavina, piridoxina,

B12, K
• Producción de gas: CO2, H2, CH4
• Producción de olor: H2S, NH3, aminas, indol, esteatol,
ác. butírico
• Producción de ác. orgánicos: acético, propiónico,
butírico

Los ercutos también son resultado de la acción fermentativa y

metanogénica, por producción de H2 por fermentación y por
producción de CO2.
Hay bacterias metanógenas en más de 1/3 de los adultos
 Tejido linfoide asociado al sistema gastrointestinal

• Está presente en todas las mucosas, por lo que se le

llama MALT (Mucose-associated Lymphoid Tissues)
• Son folículos de células M (fagocitosis) con células
linfoides:
T (estimula linfocitos B)
B (produce IgA, anticuerpos)
• El conjunto de folículos se llama
PLACAS DE PEYER
• En la mucina también se encuentra IgG e IgM en
bajos niveles
 Tracto Génito-Urinario
• Sólo están colonizados
– uretra anterior: con bacilos y cocos G- aerobios facultativos
– vagina
• la vejiga urinaria puede ser colonizada transientemente
con bacterias que migran desde la uretra, son eliminadas
por la actividad bactericida de las células uroepiteliales y
el flujo de la orina
• el útero es estéril
• el riñón es estéril
 Uretra anterior

• Normal
• bacilos G- y cocos aeróbicos facultativos
• lactobacilos
• corinebacterias
• estáfilococos coagulasa negativo
• Patológico
• Neisseria gonorrhoeae
• Chlamydia trachomatis (uretritis)
 Patógenos oportunistas

• Escherichia coli
• Proteus mirabilis (otras enterobacterias)
• Se produce la infección por:
– cambios de pH
– baja en el sistema inmune
• en mujeres es más común
 Vagina
• Tevemente acídica y alta en glicógeno
• Lactobacillus acidophilus: fermenta el glicógeno, produce
ácido, se acidifica
• Presencia de levaduras: Torulopsis, Candida
• Presencia de bacterias: E. coli, Streptococcus
• Composición de la flora influenciada fuertemente por las
hormonas
• También la actividad sexual
• recién nacido
– lactobacilos por 6 semanas
– después disminuyen estrógenos de la madre, aparecen
estáfilococos, estreptococos, enterobacterias
 Vagina

• Pubertad • Post-menopausia
• la vagina es alcalina, no hay Desaparece glicógeno
producción de glicógeno, no el pH sube
hay Lactobacillus la flora es casi la misma que
– Staphylococcus en la pubertad
– Streptococcus
– Enterococcus
– Gardnerella vaginalis
– Mycoplasma y Ureaplasma
– Enterobacterias
 Proceso Inflamatorio

• Se produce por la combinación de la

activación del complemento y el ataque de
células inmunes a la bacteria invasora
• Enrojecimiento, hinchazón: movimiento de
fagocitos desde la sangre al tejido, pasa algo
de sangre también
• Dolor: destrucción localizada de tejido
• Induce una respuesta específica
 Robert Koch
1. Los microorganismos se encuentran presentes
en los animales enfermos, pero ausentes en los
animales sanos.

2. Los microorganismos son cultivables en forma

pura.

3. Los microorganismos cultivados reproducen la

enfermedad en animales cuando son
inyectados. 1843-1910

4. El microorganismo puede ser re-aislado desde

el animal experimental.
 Consideraciones de los postulados de Koch
• Se referían a enfermedades epidémicas como cólera, tuberculosis,
plaga.

• Sus postulados han sido cuestionados, ya que considera que la

virulencia depende sólo de la bacteria.

• También considera que el m.o. sea cultivable, lo cual no siempre

es posible.

• Supone que un mismo m.o. produce la misma enfermedad.

Cuando los mismos síntomas pueden ser producidos por m.o.
diferentes o por infecciónes polimicrobianas.
 Versión molecular de los
postulados de Koch
1. El gen (o su producto) tendría que ser
encontrado en cepas bacterianas que
causan la enfermedad y no en las que son
no virulentas. Si el gen se encuentra, está
mutado o no se expresa.
2. Al modificar el gen en una cepa virulenta,
se reduciría la virulencia. Si se introduce
el gen a una cepa no-virulenta, se
transforma en virulenta.
3. Se debe demostrar que el gen se expresa
cuando está en el voluntario humano o en
el modelo animal durante alguna etapa de
la infección.
4. Anticuerpos contra el producto del gen
deberían ser protectores a la infección.