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Clase 4
Heredabilidad
• La heredabilidad mide importancia
relativa de variación genética
1
X X X
1 2 2 3 3
o 1 o 1 o 1
o 2 o 2 o 2
o. 3 o. 3 o. 3
.. .. ..
o k o k o k
Medios Hermanso (HS)
1 Hermanos Completos (FS) n
1 2 n 1 2 n
o* o*2 2 o* 2 o* o*2 2 o* 2
o. * o. *
3 3 o. * 3 o. * o. *
3 3 o. * 3
.. .. .. .. .. ..
o* o*k k o* k o* o*k k o* k
Semejanza entre parientes
• La similitud entre parientes para un rasgo
es indicativa de la cantidad de variación
genética que hay en un rasgo
• Componentes de VF se denominan
– “Componentes Causales” (letra V)
• Partición de varianza por diseño
– “Componentes observacionales” (σ2 ó s2)
ANDEVA
• ANDEVA estima dos cantidades
– Varianza total = Varianza entre grupos +
varianza dentro de grupos
– Var(B) = cov(W)
• Modelo de análisis de variancia:
zij = µ + αi + εij
s2(α) = σ2B
s2(ε) = σ2W
• Similitud enwun
σ 2 = cov( , wgrupo
) implica diferencia entre grupos
B
zij = µ + α i + ε ij ∧ zik = µ + α i + ε ik
[
cov( zij , zik ) = cov (α i + ε ij ); ( α i + ε ik ) ]
⇒ cov(α i , α j ) + cov(α i , ε ik ) + cov(α i , ε ij ) + cov(ε ij , ε ik )
cov( zij , zik ) = cov(α i , α j ) = σ 2 (α ) = σ B2
• Varianza entre grupos
puede ser estimada a
partir de tabla de análisis
de varianza (ANDEVA)
• Se puede interpretar s (α )
2
σ 2
• También se calcula la
correlación intraclase (t)
Situación 1 Situación 2
1 2 3 4 1 2 3 4
1
P = ( As + Ad )
2
1
( )
cov( O, P ) = cov A, G = cov 1 A, ( A + D )
2 2
1 1 1
= cov( A, A) + cov( A, D ) ⇒ VA = cov( O, P )
2 2 2
• En promedio padres e
hijos comparten la mitad
de los genes
• Regresión padre hijo
sirve para estimar
heredabilidad
cov( O, P ) 2 V A 1 2
1
bOP = = = 2h
VF VF
Padre promedio
⇒ cov( O, P ) = cov( O, P ) = VA
1
2
Padre Promedio
1 1 1 1
VA VA VA VA
VA
bOP = 2
= 2
= 2
=2
=
VP V 1 ( P + P′ ) 1
4
(VP + VP′ ) 1
2
VP VP
2
VA
bOP = =h 2
VP
Medios Hermanos
(HS) ♂
• Promedio hijos es por
definición ½ A ♀ ♀ ♀
• Cov(HS) es varianza entre
hermanos
Hijo Hijo Hijo
• Varianza del promedio
covW ( HS ) = σ B2 = σ x2 = σ 2 ( A) =
1
2
1
4
VA
1 HS
σ 2
VA
t= 2 B
= =41 2
h
σ B + σW
2
VF 4
Hermanos completos
(FS)
• Covarianza más compleja
porque incluye dominancia ♂ ♀
• Hermanos comparten
ambos padres
• Promedio hijos es promedio
de A de padres. Hijo Hijo
1
xO = ( As + Ad )
2
covW ( FS ) = σ 2
BFS = V1
( As + Ad )
1
(
= VAs + VAd
4
)
2 FS
1
si : VAs = VAd ⇒ cov( FS ) = VA + efecto dominante
2
Full-sibs
Father Mother
Cada hermano
recibe un alelo
de cada padre
Full Sibs
Alelo paternal
Pr(un no
alelo IBDIBD
IBD) [ Prob
[ =Prob
1/2 = 1/2
= 1/2 ] ]
Alelo maternal
= 1- no IBD
IBD
Pr(0 IBD) - [Pr(2[ Prob
Prob = 1/2
= 1/2
IBD) ] ]
Pr(cero alelos
-> Prob(both IDB)
alleles = 1/2*1/2
IDB) = 1/2*1/2= 1/4
= 1/4
Covarianza entre hermanos
completos (FS)
• FS heredan
desviaciones por
1
VA + VD
1
t= 2 4
φ +φ '
r=
2
u =φ φ '
Mediciones de parentesco entre dos individuos:
Coeficiente de parentesco= r
Coeficiente de identidad = u
r : coeficiente de parentesco. Correlación entre valores fenotípicos en su
componente ADITIVO
u : la correlación entre valores fenotípicos en su componente
DOMINANTE
φ +φ'
r=
2
φ = probabilidad de que un alelo paternal en un pariente sea
idéntico por descendencia a un alelo paternal en el otro pariente
φ ' = probabilidad de que un alelo maternal sea i.b.d. a un alelo maternal
en el otro pariente.
u =φ φ'
A1 A2 A3 A4 Caso de hermanos completos (FS)
φ = Probabilidad de i.b.d. de los
alelos paternales =2(1/4) =1/2
A1 A1
φ =φ’
A1 A1
A2 A1
rxy = (½ + ½)/2 = ½
A1 A2
A2 A2 uxy = (½)(½)= ¼
Caso medios hermanos (HS)
A1A2 A3A4 A5A6
φ = Probabilidad de i.b.d. de los
x y
alelos paternales = 0
φ’ = ½
A1A3 A3A5
Parentesco r u Covarianza
Gemelos monocigóticos 1 1 VA+VD
Gemelos dicigóticos o hermanos ½ VA+ ¼ VD
completos ½ ¼
Medios hermanos 0 ¼ VA
¼
Primos (1 abuelo común) 1/8 0 ⅛ VA
Primos (2 abuelos comunes) 1/16 ¼ VA+ 1/16VD
¼
Padre-hijos 0 ½ VA
½
Abuelo-nieto 0 ¼ VA
¼
Tio-sobrino 0 ¼ VA
¼
Semejanza fenotípica entre parientes
Par 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Total
Gem 1 85.7 121.7 66.5 129.5 183.1 119.7 118 24.2 27 135.4 1010.8
Gem 2 108.1 85.3 106 181.3 172.9 116.2 148.2 29.8 64 176.8 1188.6
∑∑ z 2 −
1
( ∑∑ z ) 2
an
CM B − CM W
σ =
2
B = 2104.0
2
σ W = CM W = 510.6
2
σ 2
t= 2 B
= 0 . 8
σ B + σW
2
Gemelo 2