INTRODUO TAXONOMIA MICROBIANA: CONCEITOS

Os seres vivos so classificados por meio de critrios preestabelecidos, isto , usamos regras de classificao de acordo com a necessidade e com o sistema de classificao adotado.

A rea da Biologia que estuda a classificao dos seres vivos denominada taxonomia.

HISTRICO
A primeira tentativa de classificao foi feita pelo filsofo grego Aristteles (384 - 322 a.C.). Na metade do sculo XVII, o ingls John Ray (16271705) tentou catalogar e dispor sistematicamente todos os organismos do mundo. Foi tambm o primeiro a usar o termo espcie para designar um certo tipo de organismo.

HISTRICO
SISTEMAS ARTIFICIAIS Sistemas de classificao que utilizam um nico critrio para separar os organismos em grupos. Neste caso uso era apenas dos caracteres macroscpicos.

HISTRICO
SISTEMA NATURAL Entretanto, a partir do sculo XVIII, os sistemas de classificao tornaram-se naturais, usando critrios objetivos com dados fornecidos pela morfologia, fisiologia, ecologia e embriologia.

HISTRICO
Carlos Linnaeus, ou simplesmente Lineu (1707 1778), foi um dos primeiros pesquisadores a propor um sistema de classificao natural. Em 1758, no seu Systema Naturae, dividiu os animais conhecidos em mamferos, aves, anfbios (incluram os rpteis), peixes, insetos e vermes (que incluam todos os outros invertebrados), subdividindo cada grupo at as espcies. Props tambm regras para a nomenclatura dos seres vivos com o uso de palavras latinas.

 A histria evolutiva dos organismos que apareceram aps o perodo Pr-Cambriano pode ser estudada atravs da anlise de fsseis. Os microrganismos existiram antes deste perodo. Foram descobertos em rochas sedimentrias, fsseis microbianos com aproximadamente 3,5 bilhes de anos. Anlises moleculares podem fornecer evidncias sobre o curso evolutivo dos microrganismos.

OS CINCO REINOS DE WHITTAKER (1969)

A FILOGENIA MOLECULAR REVELOU NO CINCO REINOS MAS TRS DOMINIOS, DOIS DELES EXCLUSIVAMENTE MICROBIANOS.

A taxonomia abrange trs reas interrelacionadas:

Classificao
Arranjo ordenado dos organismos com caracteres similares e separados daqueles dissimilares em grupos denominados de taxa (no singular, taxon).

Taxa O sistema de classificao biolgica est baseado na chamada hierarquia taxonmica, que permite o ordenamento dos grupos de organismos em categorias ou posies a saber:

 Nomenclatura
Designa nomes aos grupos taxonmicos, de acordo com preceitos estabelecidos em regras internacionais. O objetivo primordial da indicao de nomes aos taxa possibilitar uma forma de referncia simples e sem ambiguidades, evitando a necessidade de descrio das caractersticas dos organismos.

REGRAS DE NOMENCLATURA
a) Na designao cientfica, os nomes devem ser latinos de origem ou, ento, latinizados. b) Em obras impressas, todo nome cientfico deve ser escrito em itlico (tipo de letra fina e inclinada), diferente do corpo tipogrfico usado no texto corrido. Em trabalhos manuscritos, esses nomes devem ser grifados.

c) Cada organismo deve ser reconhecido por uma designao binominal, onde o primeiro termo identifica o seu gnero e o segundo, sua espcie.
d) O nome relativo ao gnero deve ser um substantivo simples ou composto, escrito com inicial maiscula. e) O nome relativo espcie deve ser um adjetivo escrito com inicial minscula.

REGRAS DE NOMENCLATURA
f) Em seguida ao nome do organismo facultado colocar, por extenso ou abreviadamente, o nome do autor que primeiro o descreveu e denominou, sem qualquer pontuao intermediria, seguindo-se depois uma vrgula e a data em que foi publicado pela primeira vez. g) No confundir o nome do autor, mencionado aps a espcie, com subespcie, uma vez que esta ltima grafada com inicial minscula e escrita com o tipo itlico, enquanto o nome do autor tem sempre inicial maiscula e no grafado em itlico. h) o subgnero aparece entre o gnero e a espcie entre parntese e iniciando em letra maiscula. i) Em Zoologia, o nome da famlia dado pela adio do sufixo - idae ao radical correspondente ao nome do gnero-tipo. Para subfamlia, o sufixo usado inae. As plantas levam a terminao - aceae.

 Identificao
Consiste na comparao dos organismos em estudo com aqueles conhecidos, visando determinar sua identidade ou nome. Portanto, trata-se de verificar se um dado organismo pertence a um grupo taxonmico estabelecido.

Conceito de espcie
Grupo de organismos capazes de cruzamento gentico frtil com membros do mesmo grupo, sendo distinto de outros indivduos de grupos similares. Microrganismos: maioria haplide, reproduo assexuada e morfologia pouco diferenciada. Como fica o conceito de espcie ?

 Conceito de espcie em microbiologia

Populaes clonais que apresentam alto grau de similaridade fenotpica e genotpica, juntamente com dissimilaridade com outros grupos relacionados. Espcie microbiana representa um grupo de biotipos semelhantes estirpe padro e diferente de outras. Para cada espcie designada uma estirpe padro ou type strain, que mantida em colees especializadas.

CARACTERIZAO E IDENTIFICAO FENOTPICA - MTODOS TRADICIONAIS DESVANTAGENS: - Procedimentos podem ser longos - Ambguos; - Afetados pelas condies do meio; - Espcies filogeneticamente distintas; - Problemas tcnicos que dificultam a interpretao dos resultados (crescimento no suficiente para degradar o substrato que se est testando, algumas caractersticas so instveis meios de cultura utilizado) - Culturas mistas no permitem a diferenciao de espcies

CARACTERIZAO E IDENTIFICAO GENOTPICA

MTODOS GENOTPICOS IDENTIFICAM ATRAVS DO GENOMA, AO CONTRRIO DOS MTODOS BIOLGICOS E IMUNOLGICOS (FENOTPICOS) QUE DETECTAM OS PRODUTOS CODIFICADOS PELO GENOMA.

cidos nuclicos so universais em biologia celular, e a seqncia de bases de nucleotdeos das molculas no so influenciadas pelas condies de cultivo. Anlises dos cidos nuclicos deste modo, provem a base dos mtodos de identificao e possuem a vantagem da reprodutibilidade. Mtodos genticos so mais promissores para uma rpida e acurada identificao.