Traduo / Sntese de Protenas

Cdigo Gentico

Dicionrio correspondncia da seqncia de nucleotdeos levando seqncia de aminocidos; Cdon 3 bases nucleotdicas no RNAm que codificam cada aminocido (palavra);

Cdon:
RNAm A, G, C e U; escrita da direo 5 para 3; 64 combinaes diferentes de bases;

Cdigo Gentico

1 cdon 3 nucleotdeos no RNAm

7 cdons 21 nucleotdeos

Cdigo Gentico

61 dos 64 cdons possveis codificam os 20 aminocidos padro

UAG / UGA / UAA

Cdons de terminao ou de parada ou sem sentido; no codificam AA.

Cdigo Gentico
Caractersticas: Especificidade um determinado cdon sempre codifica o mesmo AA; Universalidade conservado em todas as espcies;
Degenerao do cdigo

Redundncia ou Degenerao um AA pode ter mais de 1 trinca que o codifica;

Contnuo sempre lido de 3 em 3 bases.

Mutaes no Cdigo Gentico

Mutao silenciosa: Cdon com 1 base alterada ainda codifica o mesmo AA; Mutao com perda de sentido: Cdon com 1 base alterada codifica um AA diferente; Mutao sem sentido: Cdon com 1 base alterada se torna um dos cdons de terminao;

Outras Mutaes no Cdigo Gentico

Expanso de repeties trinucleotdicas:

Inseres de vrias repeties de 1 cdon. Ex: doena de Huntington;

Mutaes em stios de corte-juno: Alterao de ntrons removidos; Mutaes com alterao de mdulo de leitura:

1 ou 2 nucleotdeos perdidos ou adicionados seqncia de AAs altera radicalmente.

Componentes da Traduo
AAs: Dieta AAs essenciais; RNAt ou molculas adaptadoras: Em humanos existem em torno de 50 espcies de RNAt, enquanto bactrias possuem em torno de 30-40 espcies; Stios de ligao ao AA extremidade 3 do RNAt se liga ao grupo carboxila do AA; Anticdon seqncia de 3 nucleotdeos que reconhece o cdon especfico do RNAm; Pode estar carregado ou descarregado.

Componentes da Traduo
RNAt:
50 tipos de RNAt para 20 aa: alguns aas possuem mais de um RNAt especfico
AA ligado aqui

Estrutura secundria: folha de trevo 1 anticdon pode reconhecer mais de um cdon

O pareamento cdon-anticdon complementar e antiparalelo

Componentes da Traduo
Aminoacil-RNAt sintetase:
Famlia de enzimas que ligam AA aos seus RNAt especificidade que aumenta a fidelidade da traduo da mensagem gentica;

 RNAm (molde);
Ribossomos:

Componentes da Traduo

Ribossomos: grandes complexos de RNAr protenas compostos por duas subunidades.

So as estruturas responsveis pela sntese protica (local da sntese). Livres ou no RER.

Ribossomo de eucariotos: subunidades 60S (5S, 5.8S e 28S/49 protenas) + 40S (18S/33 protenas) Em procariotos: subunidades 50S (5S e 23S/36 protenas) + 30S (16S/21 protenas)
RNAr: responsveis pela estabilizao do complexo de iniciao e dos demais participantes da traduo

Componentes da Traduo
Ribossomos:

Stio P: neste stio, o cdon de iniciao posicionado para seu pareamento com o anticdon do RNAt que transposta metionina primeiro aa da traduo. Stio A: neste stio, o cdon adjacente posicionado para seu pareamento com o anticdon do RNAt que transposta o prximo aa da cadeia polipeptdica. Stio E: depois de ser traduzido, o cdon posicionado no stio E (ou stio de sada) para seu desligamento com o RNAt, agora descarregado.

Fatores proticos:

Fatores de iniciao, terminao ou liberao. ATP e GTP.

alongamento

Reconhecimento dos Cdons pelo RNAt

A ligao entre cdon do RNAm e anticdon do RNAt antiparalela;

O cdon lido de 5 para 3; o anticdon tambm deve ser lido de 5 para 3. Portanto a primeira base do cdon pareia com a ltima base do anticdon;

Reconhecimento dos Cdons pelo RNAt

Hiptese da Oscilao:
Se a trinca do anticdon reconhecesse apenas 1 trinca do cdon por pareamento, as clulas deveriam ter 1 RNAt para cada cdon de AA NO O QUE OCORRE!; As 2 primeiras bases do cdon formam pares de bases Watson-Crick com fortes pontes de hidrognio do especificidade da codificao;

A terceira base do cdon que pareia com a primeira

base do anticdon forma pontes de hidrognio mais fracas e a primeira base do anticdon pode parear

com mais de 1 base.

Hiptese da Oscilao
1 anticdon pareia com mais de 1 cdon!

Lig. + especfica

Lig. - especfica

OBS: I (inosina) contm base hipoxantina pode ser encontrado como a primeira base do anticdon base oscilante que pareia com mais de 1 base

As interaes cdon-anticdon otimizam tanto a exatido quanto a velocidade de sntese protica

Etapas da Sntese Protica Etapa 1

Ativao dos AAs: Ligao dos AAs aos seus RNAt ocorre no

citosol

pelas

aminoacil-RNAt sintetases. Duas lig. de alta energia

Aminoacilao do RNAt
Requer:

20 aas
20 aminoacil-tRNA sintetases Energia ATP RNAt

Etapas da Sntese Protica Etapa 2

Iniciao:
O RNAm liga-se a menor das 2 subunidades ribossmicas e ao aminoacil-RNAt de iniciao; Na E. coli, a seqncia reconhecida no RNAm pelo ribossomo chamada de seqncia de Shine-Dalgarno (nos eucariotos o quepe do RNAm reconhecido pelo ribossomo) 6 a 10 bases longe do cdon de iniciao AUG;

Etapas da Sntese Protica Etapa 2

Iniciao: O aminoacil-RNAt de iniciao pareia com o cdon AUG, que o cdon que sinaliza o incio da protena a ser sintetizada; Em bactrias e na mitocndria, esse RNAt de iniciao carrega uma metionina N-formilada (grupo formila adicionado pela enzima transformilase). Nos eucariotos, a metionina no est formilada;

Etapa 2

Iniciao

Requer:
RNAm aminoacil-tRNA de iniciao Subunidade 30S e 50S Fatores de iniciao metionina GTP cdon de iniciao - AUG

Cofator enzimtico Mg+2

Formao do complexo de iniciao em eucariotos

Etapas da Sntese Protica Etapa 3

Alongamento: Fatores de alongamento so necessrios (EF-Tu, EF-Ts, EF-G);

Peptidiltransferase (ribozima) liga o peptdeo em formao e o

AA a ser adicionado; Aps a ligao peptdica se formar, o ribossomo avana 3

nucleotdeos na direo 3Translocao (requer energia, GTP) .

O RNAt no-carregado vai para o stio E antes de ser liberado e o RNAt carregando o peptdeo vai para o stio P .

Etapa 3
Alongamento
Requer: Complexo de iniciao aminoacil-tRNA especificados pelos cdons Fatores de alongamento Peptidiltransferase GTP

Etapa 3

Alongamento Tanslocao

O ribossomo se move em direo extremidade 3do mRNA, o peptidil-tRNA est, agora, no stio P deixando o stio A aberto para o terceiro aminoacil-tRNA. O tRNA nocarregado deslocado para o stio E, desligando-se imediatamente do ribossomo. A translocao envolve o complexo fator de elongao EF-G-GTP.

Etapa 4
Terminao:
Ocorre quando 1 dos 3 cdons (UAA, UAG, UGA) de terminao colocado no stio A; Na

E.

coli,

os

fatores

de

terminao

ou

liberao reconhecem esses cdons e ocorre a liberao do complexo ribossomal.

Etapa 4
Terminao
-Hidrlise da lig. peptidil-RNAt terminal; -Liberao do peptdeo livre e do RNAt;

-Dissociao do ribossomo 70S.

Requer: Cdons de terminao Fatores de liberao

Etapas da Sntese Protica

Polissomos ou Polirribossomos: Complexo de 1 RNAm e vrios ribossomos.

Estrutura Tridimensional Aps a traduo, algumas protenas, antes de assumirem a sua conformao nativa, tm a sua estrutura primria alterada por modificaes ps-translacionais, como por exemplo:
Fosforilao
Carboxilao

Etapa 5: Modificaes Ps-translacionais e a

Protrombina

Etapa 5: Modificaes Ps-translacionais e a

Estrutura Tridimensional
Metilao

Outras Modificaes

Monometil e dimetilisina-Protenas musculares e citocromoc

Trimetilisina- Calmodulina

Etapa 5: Modificaes Ps-translacionais e a

Estrutura Tridimensional

As protenas assumem a sua conformao nativa com o auxlio das chaperonas ou protenas do estresse ou protenas do choque trmico (heat shock proteins).
Ajudam as protenas a se moldar, associar a outras protenas de maneira estvel e tornarem-se estruturas ativas, evitando a associao de protenas ainda no dobradas corretamente

Conformao Desnaturada

Conformao Nativa

Diferenas entre procariotos e eucariotos

EUCARIOTOS
Ligao do mRNA subunidade menor ribossomal Primeiro Aminocido O 5-CAP do mRNA liga-se aos fatores de iniciao e subunidade 40S. O mRNA lido a partir do cdon de iniciao Metionina (no formilada)

Fatores de iniciao

eIFs (8 ou mais)

Fatores de terminao

eRF

Fatores de alongamento

EF1 a (EF-Tu) EFbg (EF-Ts) EF2 (EF-G) 80S (40S + 60S) ausncia de stio E (exit traduo no simultnea com transcrio

Ribossomo

Diferenas e semelhanas entre eucariotos e procariotos O esquema geral o mesmo, e a sntese em si ocorre em estruturas similares: os ribossomos

Mas, em eucariotos a transcrio est separada da sntese de protenas (traduo) pela membrana nuclear

Sntese protica no retculo endoplasmtico rugoso daquelas protenas que sero localizadas na membrana plasmtica ou nos lisossomos, ou sero secretadas.

Sntese Protica no Retculo Endoplasmtico Rugoso

Sntese proteca no reticulo endoplasmtico rugoso daquelas protenas que sero localizadas na membrana plasmtica ou nos lisossomos, ou sero secretadas

Sntese Protica no RER

Estreptomicina: Liga-se subunidade 30S e distorce sua estrutura inibindo a iniciao

Inibidores de Sntese Protica

Tetraciclina: bloqueia o stio A ribossomal

X X

Inibidores de Sntese Protica

Cloranfenicol: Inibe a atividade de peptidiltransferase procaritica

Clindamicina e Eritromicina: Ligam-se de maneira irreversvel subunidade 50S do ribossomo bacteriano, inibindo o deslocamento.

X X

Bibliografia:
Voet, D., Voet, J.G., Pratt, C.W. Fundamentos de Bioqumica (2000). Champe, P.C.; Harvey, R.A.; Ferrier, D.R. Bioqumica Ilustrada (3a ed, 2006). Nelson, D.L., Cox, M.M. Lehninger, Princpios de Bioqumica. Quarta edio (2004).